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* CYTOSOLIC PROTEIN 02-JUN-18 6DLO *

LOGs for ID: 2609102222013259469

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:

CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
 Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
 Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.    

 Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.

 Pdbmat> Coordinate filename     = 2609102222013259469.atom

 Pdbmat> Distance cutoff         =       8.00
         Force constant          =      10.00
         Origin of mass values   =       CONS
 Pdbmat> Levelshift              =    1.0E-09
         PRINTing level          =          2

 Pdbmat> Coordinate file 2609102222013259469.atom to be opened.

 Openam> File opened: 2609102222013259469.atom

 Pdbmat> Coordinate file in PDB format.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:      0

 Rdatompdb> Number of residues found =    621
            First residue number     =   2141
            Last  residue number     =   2496
            Number of atoms found    =   4825
            Mean number per residue  =      7.8

 Pdbmat> Coordinate statistics: 
 =     3.390468 +/-    24.591987 From:   -46.254000 To:    53.646000
 =    -0.105231 +/-    16.876839 From:   -37.905000 To:    38.719000
 =    11.029667 +/-    11.331479 From:   -16.447000 To:    42.903000
 Pdbmat> Masses are all set to one.

 Openam> File opened: pdbmat.xyzm
 Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.

 Openam> File opened: pdbmat.sdijb

 Pdbmat> Matrix statistics:

 Pdbmat> The matrix is   1.7131 % Filled.
 Pdbmat>      1794846  non-zero elements.
 Pdbmat>       196239 atom-atom interactions.

 Pdbmat> Number per atom=     81.34 +/-     21.68
         Maximum number =    125
         Minimum number =      9

 Pdbmat> Matrix trace   = 3.924780E+06
 Pdbmat> Larger element =  482.313    
 Pdbmat>      0 elements larger than +/-  1.0E+10

 Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
621 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
 Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
 Diagrtb> Version 2.52, November 2004. 
 Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.

 Diagrtb> Options taken into account:

 MATRix filename          = pdbmat.sdijb
 COORdinates filename     = 2609102222013259469.atom
 Eigenvector OUTPut file  = matrix.eigenrtb
 Nb of VECTors required   =        106
 EigeNVALues chosen       =       LOWE
 Type of SUBStructuring   =       NONE
 Nb of residues per BLOck =          4
 Origin of MASS values    =       CONS
 MATRix FORMat            =       BINA
 Temporary files cleaning =       ALL 
 Output PRINting level    =          2

 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.

 Blocpdb> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.xyzm   

 Blocpdb> Coordinate file 2609102222013259469.atom to be opened.

 Openam> file on opening on unit     11:
 2609102222013259469.atom                                                                                                        

 Blocpdb> Coordinate file in PDB format.

 Blocpdb>  4825 atoms picked in pdb file.
 Blocpdb>   All masses set to unity.
 Blocpdb> Coordinate file is rewritten.

 Blocpdb> Substructuring:
 Blocpdb>     4 residue(s) per block.
 Blocpdb>   621 residues.
 Blocpdb>    36 atoms in block      1
 Block first atom:      1
 Blocpdb>    32 atoms in block      2
 Block first atom:     37
 Blocpdb>    30 atoms in block      3
 Block first atom:     69
 Blocpdb>    30 atoms in block      4
 Block first atom:     99
 Blocpdb>    22 atoms in block      5
 Block first atom:    129
 Blocpdb>    33 atoms in block      6
 Block first atom:    151
 Blocpdb>    22 atoms in block      7
 Block first atom:    184
 Blocpdb>    36 atoms in block      8
 Block first atom:    206
 Blocpdb>    27 atoms in block      9
 Block first atom:    242
 Blocpdb>    35 atoms in block     10
 Block first atom:    269
 Blocpdb>    28 atoms in block     11
 Block first atom:    304
 Blocpdb>    34 atoms in block     12
 Block first atom:    332
 Blocpdb>    29 atoms in block     13
 Block first atom:    366
 Blocpdb>    33 atoms in block     14
 Block first atom:    395
 Blocpdb>    27 atoms in block     15
 Block first atom:    428
 Blocpdb>    32 atoms in block     16
 Block first atom:    455
 Blocpdb>    34 atoms in block     17
 Block first atom:    487
 Blocpdb>    35 atoms in block     18
 Block first atom:    521
 Blocpdb>    26 atoms in block     19
 Block first atom:    556
 Blocpdb>    25 atoms in block     20
 Block first atom:    582
 Blocpdb>    31 atoms in block     21
 Block first atom:    607
 Blocpdb>    28 atoms in block     22
 Block first atom:    638
 Blocpdb>    39 atoms in block     23
 Block first atom:    666
 Blocpdb>    33 atoms in block     24
 Block first atom:    705
 Blocpdb>    29 atoms in block     25
 Block first atom:    738
 Blocpdb>    28 atoms in block     26
 Block first atom:    767
 Blocpdb>    26 atoms in block     27
 Block first atom:    795
 Blocpdb>    36 atoms in block     28
 Block first atom:    821
 Blocpdb>    26 atoms in block     29
 Block first atom:    857
 Blocpdb>    26 atoms in block     30
 Block first atom:    883
 Blocpdb>    32 atoms in block     31
 Block first atom:    909
 Blocpdb>    33 atoms in block     32
 Block first atom:    941
 Blocpdb>    33 atoms in block     33
 Block first atom:    974
 Blocpdb>    21 atoms in block     34
 Block first atom:   1007
 Blocpdb>    33 atoms in block     35
 Block first atom:   1028
 Blocpdb>    28 atoms in block     36
 Block first atom:   1061
 Blocpdb>    27 atoms in block     37
 Block first atom:   1089
 Blocpdb>    30 atoms in block     38
 Block first atom:   1116
 Blocpdb>     6 atoms in block     39
 Block first atom:   1146
 Blocpdb>    33 atoms in block     40
 Block first atom:   1152
 Blocpdb>    21 atoms in block     41
 Block first atom:   1185
 Blocpdb>    34 atoms in block     42
 Block first atom:   1206
 Blocpdb>    33 atoms in block     43
 Block first atom:   1240
 Blocpdb>    35 atoms in block     44
 Block first atom:   1273
 Blocpdb>    34 atoms in block     45
 Block first atom:   1308
 Blocpdb>    31 atoms in block     46
 Block first atom:   1342
 Blocpdb>    34 atoms in block     47
 Block first atom:   1373
 Blocpdb>    33 atoms in block     48
 Block first atom:   1407
 Blocpdb>    28 atoms in block     49
 Block first atom:   1440
 Blocpdb>    30 atoms in block     50
 Block first atom:   1468
 Blocpdb>    29 atoms in block     51
 Block first atom:   1498
 Blocpdb>    33 atoms in block     52
 Block first atom:   1527
 Blocpdb>    31 atoms in block     53
 Block first atom:   1560
 Blocpdb>    27 atoms in block     54
 Block first atom:   1591
 Blocpdb>    38 atoms in block     55
 Block first atom:   1618
 Blocpdb>    34 atoms in block     56
 Block first atom:   1656
 Blocpdb>    27 atoms in block     57
 Block first atom:   1690
 Blocpdb>    30 atoms in block     58
 Block first atom:   1717
 Blocpdb>    36 atoms in block     59
 Block first atom:   1747
 Blocpdb>    20 atoms in block     60
 Block first atom:   1783
 Blocpdb>    32 atoms in block     61
 Block first atom:   1803
 Blocpdb>    31 atoms in block     62
 Block first atom:   1835
 Blocpdb>    29 atoms in block     63
 Block first atom:   1866
 Blocpdb>     9 atoms in block     64
 Block first atom:   1895
 Blocpdb>    35 atoms in block     65
 Block first atom:   1904
 Blocpdb>    19 atoms in block     66
 Block first atom:   1939
 Blocpdb>    30 atoms in block     67
 Block first atom:   1958
 Blocpdb>    32 atoms in block     68
 Block first atom:   1988
 Blocpdb>    35 atoms in block     69
 Block first atom:   2020
 Blocpdb>    34 atoms in block     70
 Block first atom:   2055
 Blocpdb>    39 atoms in block     71
 Block first atom:   2089
 Blocpdb>    27 atoms in block     72
 Block first atom:   2128
 Blocpdb>    34 atoms in block     73
 Block first atom:   2155
 Blocpdb>    29 atoms in block     74
 Block first atom:   2189
 Blocpdb>    27 atoms in block     75
 Block first atom:   2218
 Blocpdb>    31 atoms in block     76
 Block first atom:   2245
 Blocpdb>    31 atoms in block     77
 Block first atom:   2276
 Blocpdb>     8 atoms in block     78
 Block first atom:   2307
 Blocpdb>    32 atoms in block     79
 Block first atom:   2315
 Blocpdb>    28 atoms in block     80
 Block first atom:   2347
 Blocpdb>    30 atoms in block     81
 Block first atom:   2375
 Blocpdb>    36 atoms in block     82
 Block first atom:   2405
 Blocpdb>    32 atoms in block     83
 Block first atom:   2441
 Blocpdb>    30 atoms in block     84
 Block first atom:   2473
 Blocpdb>    30 atoms in block     85
 Block first atom:   2503
 Blocpdb>    12 atoms in block     86
 Block first atom:   2533
 Blocpdb>    27 atoms in block     87
 Block first atom:   2545
 Blocpdb>    32 atoms in block     88
 Block first atom:   2572
 Blocpdb>    29 atoms in block     89
 Block first atom:   2604
 Blocpdb>    32 atoms in block     90
 Block first atom:   2633
 Blocpdb>    33 atoms in block     91
 Block first atom:   2665
 Blocpdb>    32 atoms in block     92
 Block first atom:   2698
 Blocpdb>    29 atoms in block     93
 Block first atom:   2730
 Blocpdb>    30 atoms in block     94
 Block first atom:   2759
 Blocpdb>    33 atoms in block     95
 Block first atom:   2789
 Blocpdb>    27 atoms in block     96
 Block first atom:   2822
 Blocpdb>    33 atoms in block     97
 Block first atom:   2849
 Blocpdb>    32 atoms in block     98
 Block first atom:   2882
 Blocpdb>    37 atoms in block     99
 Block first atom:   2914
 Blocpdb>    24 atoms in block    100
 Block first atom:   2951
 Blocpdb>    26 atoms in block    101
 Block first atom:   2975
 Blocpdb>    31 atoms in block    102
 Block first atom:   3001
 Blocpdb>    32 atoms in block    103
 Block first atom:   3032
 Blocpdb>    33 atoms in block    104
 Block first atom:   3064
 Blocpdb>    34 atoms in block    105
 Block first atom:   3097
 Blocpdb>    32 atoms in block    106
 Block first atom:   3131
 Blocpdb>    26 atoms in block    107
 Block first atom:   3163
 Blocpdb>    34 atoms in block    108
 Block first atom:   3189
 Blocpdb>    17 atoms in block    109
 Block first atom:   3223
 Blocpdb>    37 atoms in block    110
 Block first atom:   3240
 Blocpdb>    27 atoms in block    111
 Block first atom:   3277
 Blocpdb>    24 atoms in block    112
 Block first atom:   3304
 Blocpdb>    30 atoms in block    113
 Block first atom:   3328
 Blocpdb>    37 atoms in block    114
 Block first atom:   3358
 Blocpdb>    31 atoms in block    115
 Block first atom:   3395
 Blocpdb>    23 atoms in block    116
 Block first atom:   3426
 Blocpdb>    32 atoms in block    117
 Block first atom:   3449
 Blocpdb>    28 atoms in block    118
 Block first atom:   3481
 Blocpdb>    28 atoms in block    119
 Block first atom:   3509
 Blocpdb>    29 atoms in block    120
 Block first atom:   3537
 Blocpdb>    23 atoms in block    121
 Block first atom:   3566
 Blocpdb>    33 atoms in block    122
 Block first atom:   3589
 Blocpdb>    21 atoms in block    123
 Block first atom:   3622
 Blocpdb>    34 atoms in block    124
 Block first atom:   3643
 Blocpdb>    33 atoms in block    125
 Block first atom:   3677
 Blocpdb>    35 atoms in block    126
 Block first atom:   3710
 Blocpdb>    34 atoms in block    127
 Block first atom:   3745
 Blocpdb>    31 atoms in block    128
 Block first atom:   3779
 Blocpdb>    34 atoms in block    129
 Block first atom:   3810
 Blocpdb>    33 atoms in block    130
 Block first atom:   3844
 Blocpdb>    28 atoms in block    131
 Block first atom:   3877
 Blocpdb>    30 atoms in block    132
 Block first atom:   3905
 Blocpdb>    29 atoms in block    133
 Block first atom:   3935
 Blocpdb>    33 atoms in block    134
 Block first atom:   3964
 Blocpdb>    31 atoms in block    135
 Block first atom:   3997
 Blocpdb>    27 atoms in block    136
 Block first atom:   4028
 Blocpdb>    38 atoms in block    137
 Block first atom:   4055
 Blocpdb>    34 atoms in block    138
 Block first atom:   4093
 Blocpdb>    27 atoms in block    139
 Block first atom:   4127
 Blocpdb>    30 atoms in block    140
 Block first atom:   4154
 Blocpdb>    36 atoms in block    141
 Block first atom:   4184
 Blocpdb>    20 atoms in block    142
 Block first atom:   4220
 Blocpdb>    32 atoms in block    143
 Block first atom:   4240
 Blocpdb>    31 atoms in block    144
 Block first atom:   4272
 Blocpdb>    29 atoms in block    145
 Block first atom:   4303
 Blocpdb>    33 atoms in block    146
 Block first atom:   4332
 Blocpdb>    35 atoms in block    147
 Block first atom:   4365
 Blocpdb>    19 atoms in block    148
 Block first atom:   4400
 Blocpdb>    30 atoms in block    149
 Block first atom:   4419
 Blocpdb>    32 atoms in block    150
 Block first atom:   4449
 Blocpdb>    35 atoms in block    151
 Block first atom:   4481
 Blocpdb>    34 atoms in block    152
 Block first atom:   4516
 Blocpdb>    39 atoms in block    153
 Block first atom:   4550
 Blocpdb>    27 atoms in block    154
 Block first atom:   4589
 Blocpdb>    34 atoms in block    155
 Block first atom:   4616
 Blocpdb>    21 atoms in block    156
 Block first atom:   4650
 Blocpdb>    31 atoms in block    157
 Block first atom:   4671
 Blocpdb>    31 atoms in block    158
 Block first atom:   4702
 Blocpdb>    19 atoms in block    159
 Block first atom:   4733
 Blocpdb>    32 atoms in block    160
 Block first atom:   4752
 Blocpdb>    28 atoms in block    161
 Block first atom:   4784
 Blocpdb>    14 atoms in block    162
 Block first atom:   4811

 Blocpdb>   162 blocks.

 Blocpdb> At most,     39 atoms in each of them.
 Blocpdb> At least,     6 atoms in each of them.

 Blocpdb> Normal end of Blocpdb.

 Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB.
 Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
 Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.

 Prepmat> Entering in.
 Prepmat> Rewriting of the matrix begins.

 Prepmat>      1795008 matrix lines read.

 Prepmat> Matrix order    =      14475

 Prepmat> Matrix trace    =    3924780.0000
 Prepmat> Last element read:   14475  14475       238.5201
 Prepmat>        13204 lines saved.
 Prepmat>        11701 empty lines.
 Prepmat> Number of lines on output is as expected.
 Prepmat> Normal end of Prepmat.

 RTB> Entering in.
 RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file:  4825
 RTB> Total mass =        4825.0000
 RTB> Number of atoms found in matrix:  4825
 RTB> Number of blocks =   162
 RTB> Projection begins.
 RTB> Projected matrix is being saved.
 RTB> Projected matrix trace =  199719.5216
 RTB>     51642 non-zero elements.
 RTB> Normal end of RTB.

 Diagstd> Entering in.

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb                      
 Diagstd> CERFACS matrix format.
 Diagstd> Projected matrix order =      972
 Diagstd> Nb of non-zero elements:    51642
 Diagstd> Projected matrix trace =  199719.5216

 Openam> file on opening on unit     11:
 diagrtb_work.eigenfacs                  
 Diagstd> Diagonalization.

 Diagstd>    972 eigenvectors are computed. 
 Diagstd>    106 of them to be saved. 

 Diagstd> Sum of eigenvalues = 199719.5216
 Diagstd> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000

 Diagstd>      6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to:    0.0000000

 Diagstd> Selected eigenvalues: 
      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000      0.0000000
      0.0000000      0.4365534      0.4899669      0.6605484      2.1613003
      2.4921449      3.0365929      3.4673764      5.2158778      5.3181588
      6.6104701      6.8032740      7.3917655      7.8200215      8.1719553
      8.7970849      9.4754096     11.1404797     11.7986375     12.5111411
     13.0173965     13.7434680     14.6959311     15.3596705     15.7272541
     16.4498076     17.0301826     17.2317606     18.4920749     18.5429135
     19.8566290     20.2156872     21.0660308     21.5277167     22.0542860
     23.0631730     23.5308565     24.2335977     24.8761821     25.0595114
     26.1203021     26.7301602     26.9144000     28.0898917     28.6466904
     29.1103706     30.0475504     30.2043874     30.5770272     31.4485005
     32.2034709     32.9334217     33.4177302     33.6961665     34.1355535
     35.1217507     35.2808602     35.6304353     36.0320961     36.5647117
     37.3065954     37.4122722     37.7882462     38.5622808     38.7893269
     39.5895750     40.1403176     40.6309874     40.8100898     41.2773085
     41.6989278     42.3866706     42.5990969     43.1624117     43.9221216
     44.2138370     44.6942214     45.5590979     45.8232798     45.9420020
     46.6664124     46.8241149     46.9438102     47.8640554     48.4824940
     49.7445169     50.1132964     50.4939272     50.8029332     51.5870291
     52.3963205     53.1353669     53.3530800     53.8423047     54.5572075
     54.8032440     55.2105562     55.7983116     56.5426957     57.2361098
     57.7134658

 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
      0.0034318      0.0034326      0.0034333      0.0034339      0.0034343
      0.0034346     71.7486860     76.0113851     88.2566843    159.6440874
    171.4280653    189.2293785    202.2068073    248.0041698    250.4239897
    279.1974535    283.2397892    295.2360397    303.6681581    310.4261302
    322.0806784    334.2675944    362.4492665    373.0020419    384.0995002
    391.7936078    402.5718919    416.2879438    425.5849184    430.6473032
    440.4287818    448.1309424    450.7752955    466.9690556    467.6105134
    483.8915530    488.2469447    498.4098737    503.8418816    509.9666567
    521.5005960    526.7616483    534.5695629    541.6105857    543.6026678
    554.9890033    561.4305761    563.3621059    575.5331094    581.2092370
    585.8941304    595.2505656    596.8020358    600.4722064    608.9690929
    616.2353696    623.1802885    627.7457117    630.3554732    634.4519765
    643.5515757    645.0076460    648.1952503    651.8385540    656.6385215
    663.2665395    664.2052788    667.5343955    674.3364523    676.3187099
    683.2595336    687.9956345    692.1878443    693.7117575    697.6714737
    701.2255382    706.9845656    708.7539238    713.4246842    719.6758596
    722.0618225    725.9738346    732.9643275    735.0863622    736.0380033
    741.8182057    743.0705830    744.0197230    751.2768847    756.1148306
    765.8926275    768.7263460    771.6402182    773.9977072    779.9478031
    786.0418613    791.5659821    793.1859783    796.8142662    802.0867587
    803.8933083    806.8751517    811.1586598    816.5514139    821.5430661
    824.9618364

 Diagstd> Normal end.

 Rtb_to_modes> Entering in.

 Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file =   4825
 Rtb_to_modes> Number of blocs =    162

 Openam> file on opening on unit     10:
 diagrtb_work.eigenfacs                  

 Openam> file on opening on unit     11:
 matrix.eigenrtb                         

 Rdmodfacs> Entering in.

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     1
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9873E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     2
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9920E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     3
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9960E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     4
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  9.9999E-10

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     5
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     6
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     7
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.4366    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     8
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.4900    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:     9
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:  0.6605    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    10
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.161    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    11
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   2.492    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    12
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.037    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    13
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   3.467    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    14
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.216    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    15
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   5.318    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    16
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.610    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    17
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   6.803    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    18
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.392    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    19
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   7.820    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    20
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.172    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    21
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   8.797    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    22
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   9.475    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    23
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    24
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   11.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    25
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   12.51    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    26
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.02    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    27
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   13.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    28
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   14.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    29
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.36    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    30
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   15.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    31
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   16.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    32
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    33
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   17.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    34
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    35
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   18.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    36
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   19.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    37
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   20.22    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    38
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.07    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    39
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   21.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    40
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   22.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    41
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    42
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   23.53    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    43
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.23    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    44
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   24.88    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    45
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   25.06    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    46
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    47
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.73    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    48
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   26.91    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    49
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.09    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    50
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   28.65    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    51
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   29.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    52
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.05    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    53
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    54
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   30.58    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    55
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   31.45    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    56
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.20    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    57
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   32.93    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    58
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.42    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    59
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   33.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    60
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   34.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    61
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.12    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    62
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    63
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   35.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    64
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.03    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    65
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   36.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    66
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.31    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    67
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.41    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    68
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   37.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    69
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    70
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   38.79    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    71
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   39.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    72
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    73
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.63    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    74
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   40.81    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    75
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.28    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    76
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   41.70    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    77
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.39    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    78
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   42.60    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    79
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.16    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    80
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   43.92    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    81
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    82
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   44.69    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    83
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    84
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    85
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   45.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    86
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.67    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    87
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.82    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    88
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   46.94    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    89
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   47.86    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    90
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   48.48    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    91
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   49.74    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    92
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.11    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    93
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.49    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    94
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   50.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    95
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   51.59    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    96
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   52.40    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    97
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.14    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    98
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.35    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:    99
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   53.84    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   100
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.56    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   101
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   54.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   102
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.21    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   103
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   55.80    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   104
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   56.54    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   105
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.24    

 Rdmodfacs> Eigenvector number:   106
 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue:   57.71    

 Rtb_to_modes>  106 vectors, with    972 coordinates in vector file.

 Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99999
 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00002

 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
 Rtb_to_modes>    86850 lines found in RTB file.

 Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000
 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000
 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00002
 0.99999 1.00002 1.00003 1.00001 0.99999
 0.99998 1.00001 1.00000 1.00003 1.00002
 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000
 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001
 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
 1.00000 0.99998 1.00001 0.99999 1.00000
 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 0.99998
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000
 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999
 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002
 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00001
 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
 1.00002 0.99999 0.99997 0.99998 1.00001
 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002
 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
 1.00002

 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
 Vector   2: 0.000
 Vector   3: 0.000 0.000
 Vector   4:-0.000 0.000 0.000
 Vector   5: 0.000-0.000 0.000 0.000
 Vector   6:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
 Vector   7:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
 Vector   8:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
 Vector   9: 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000
 Vector  10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000

 Rtb_to_modes>   106 eigenvectors saved.

 Rtb_to_modes> Normal end.

 Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
 Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2609102222013259469.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2609102222013259469.eigenfacs                                   
 Getnam> Corresponding pdb filename ?
 Getnam> 2609102222013259469.atom

 Openam> file on opening on unit     11:
 2609102222013259469.atom                                        
 Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
 Getnum>            0
 Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
 Getnum>        10000
%Getnum-Err: number larger than    106 This is not allowed. Sorry.

 Rdatompdb> Reading pdb file.
 Rdatompdb> End of file reached.
 Rdatompdb> Number of I/O errors:            0

 Rdatompdb> Number of residues found =    621
            First residue number     =   2141
            Last  residue number     =   2496
            Number of atoms found    =   4825
            Mean number per residue  =      7.8

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9873E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9920E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     3
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9960E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     4
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  9.9999E-10

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     5
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0002E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     6
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  1.0004E-09

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     7
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4366    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     8
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.4900    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     9
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:  0.6605    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    10
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.161    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    11
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   2.492    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    12
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.037    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    13
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   3.467    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    14
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.216    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    15
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   5.318    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    16
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.610    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    17
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   6.803    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    18
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.392    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    19
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   7.820    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    20
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.172    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    21
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   8.797    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    22
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   9.475    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    23
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    24
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   11.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    25
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   12.51    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    26
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.02    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    27
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   13.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    28
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   14.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    29
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.36    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    30
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   15.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    31
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   16.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    32
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    33
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   17.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    34
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    35
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   18.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    36
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   19.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    37
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   20.22    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    38
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.07    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    39
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   21.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    40
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   22.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    41
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    42
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   23.53    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    43
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.23    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    44
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   24.88    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    45
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   25.06    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    46
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    47
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.73    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    48
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   26.91    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    49
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.09    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    50
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   28.65    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    51
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   29.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    52
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.05    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    53
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    54
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   30.58    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    55
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   31.45    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    56
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.20    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    57
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   32.93    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    58
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.42    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    59
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   33.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    60
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   34.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    61
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.12    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    62
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    63
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   35.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    64
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.03    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    65
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   36.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    66
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.31    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    67
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.41    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    68
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   37.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    69
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    70
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   38.79    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    71
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   39.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    72
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    73
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.63    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    74
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   40.81    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    75
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.28    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    76
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   41.70    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    77
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.39    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    78
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   42.60    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    79
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.16    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   43.92    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    81
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    82
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   44.69    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    83
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    84
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    85
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   45.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    86
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.67    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    87
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.82    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    88
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   46.94    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    89
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   47.86    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    90
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   48.48    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    91
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   49.74    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    92
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.11    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    93
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.49    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    94
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   50.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    95
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   51.59    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    96
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   52.40    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    97
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.14    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    98
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.35    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    99
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   53.84    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.56    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   54.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.21    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   55.80    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   56.54    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.24    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture:   57.71    

 Bfactors>  106 vectors,  14475 coordinates in file.

 Openam> file on opening on unit     12:
 bfactors.pred                                                   

 Bfactors> Best zero-eigenvalue found  :     0.000000
 Bfactors>     6 eigenvalues less than :     0.000000
 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue  :     0.436600
 Bfactors>   100 eigenvectors will be considered.
 Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.

 Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
          (CHARMM units assumed for eigenvalues)

 Bfactors> Correlation=      0.459 for    621 C-alpha atoms.
 Bfactors> =      0.034 +/-   0.02
 Bfactors> =     34.357 +/-  17.89
 Bfactors> Shiftng-fct=     34.322
 Bfactors> Scaling-fct=    869.025

 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.

 Bfactors> Normal end.
check_modes
 Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.                
 Getnam> Eigenvector filename ?
 Getnam> 2609102222013259469.eigenfacs

 Openam> file on opening on unit     10:
 2609102222013259469.eigenfacs                                   

 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     1
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:  3.4316E-03

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:     2
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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   667.5    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   713.4    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:    80
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   719.6    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   735.0    

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 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   736.0    

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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   100
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   802.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   101
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 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   102
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   806.8    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   103
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   811.1    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   104
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   816.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   105
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   821.5    

 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture:   106
 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture:   824.9    

 Chkmod>  106 vectors,  14475 coordinates in file.
 Chkmod>      That is:   4825 cartesian points.

 Openam> file on opening on unit     11:
 Chkmod.res                                                      
 Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.

 Chkmod> Normal end.
      0.0034      0.8493
      0.0034      0.7835
      0.0034      0.9308
      0.0034      0.8866
      0.0034      0.9352
      0.0034      0.7100
     71.7494      0.7452
     76.0107      0.7915
     88.2497      0.6436
    159.6261      0.8073
    171.4157      0.6037
    189.2339      0.7757
    202.1872      0.6020
    247.9964      0.3829
    250.4095      0.3154
    279.1755      0.4320
    283.2219      0.6411
    295.2280      0.6775
    303.6547      0.6073
    310.4137      0.6875
    322.0653      0.5373
    334.2460      0.6720
    362.4259      0.3698
    373.0076      0.3696
    384.0655      0.4319
    391.8160      0.4780
    402.5038      0.5558
    416.3277      0.5327
    425.5712      0.4908
    430.6664      0.6103
    440.4125      0.5217
    448.1093      0.5016
    450.7329      0.5355
    466.9228      0.3896
    467.5537      0.5911
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    498.4354      0.4306
    503.8470      0.5028
    509.8952      0.4333
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    561.4048      0.4219
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    596.7331      0.5057
    600.4756      0.2849
    608.9575      0.2511
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    651.7916      0.2996
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    663.2683      0.4434
    664.1566      0.2244
    667.5212      0.3958
    674.2876      0.3991
    676.2955      0.4520
    683.2339      0.4184
    687.9634      0.5110
    692.1497      0.4432
    693.6812      0.5283
    697.6643      0.3314
    701.2045      0.2429
    706.9820      0.4714
    708.7310      0.4906
    713.3741      0.4976
    719.6276      0.3101
    721.9995      0.3832
    725.9084      0.3095
    732.9401      0.4490
    735.0285      0.4395
    735.9904      0.3025
    741.8149      0.5028
    743.0060      0.4187
    743.9576      0.4827
    751.2128      0.4565
    756.0629      0.4581
    765.8250      0.5060
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    821.5357      0.4985
    824.9017      0.2542
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2609102222013259469 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2609102222013259469.eigenfacs
2609102222013259469.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2609102222013259469.eigenfacs
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MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
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K. Suhre & Y.H. Sanejouand, ElNemo: a normal mode web-server for protein movement analysis and the generation of templates for molecular replacement. Nucleic Acids Research, 32, W610-W614, 2004.
K. Suhre & Y.H. Sanejouand, On the potential of normal mode analysis for solving difficult molecular replacement problems. Acta Cryst. D vol.60, p796-799, 2004 © International Union of Crystallography.
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