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***  TRANSFERASE 13-JAN-15 4XL4  ***

LOGs for ID: 2609111359183607159

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609111359183607159.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609111359183607159.atom to be opened. Openam> File opened: 2609111359183607159.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 784 First residue number = 1 Last residue number = 392 Number of atoms found = 5837 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 26.312570 +/- 12.684141 From: -10.966000 To: 56.807000 = -5.523524 +/- 13.735572 From: -39.637000 To: 29.796000 = -14.894505 +/- 17.683657 From: -53.277000 To: 23.525000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.5173 % Filled. Pdbmat> 2326457 non-zero elements. Pdbmat> 254645 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.25 +/- 23.91 Maximum number = 130 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 5.092900E+06 Pdbmat> Larger element = 486.239 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 784 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609111359183607159.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609111359183607159.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609111359183607159.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5837 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 784 residues. Blocpdb> 33 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 26 atoms in block 2 Block first atom: 34 Blocpdb> 30 atoms in block 3 Block first atom: 60 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 90 Blocpdb> 31 atoms in block 5 Block first atom: 113 Blocpdb> 32 atoms in block 6 Block first atom: 144 Blocpdb> 27 atoms in block 7 Block first atom: 176 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 203 Blocpdb> 31 atoms in block 9 Block first atom: 227 Blocpdb> 39 atoms in block 10 Block first atom: 258 Blocpdb> 26 atoms in block 11 Block first atom: 297 Blocpdb> 31 atoms in block 12 Block first atom: 323 Blocpdb> 32 atoms in block 13 Block first atom: 354 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 386 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 413 Blocpdb> 29 atoms in block 16 Block first atom: 439 Blocpdb> 32 atoms in block 17 Block first atom: 468 Blocpdb> 31 atoms in block 18 Block first atom: 500 Blocpdb> 24 atoms in block 19 Block first atom: 531 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 555 Blocpdb> 28 atoms in block 21 Block first atom: 586 Blocpdb> 30 atoms in block 22 Block first atom: 614 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 644 Blocpdb> 31 atoms in block 24 Block first atom: 666 Blocpdb> 27 atoms in block 25 Block first atom: 697 Blocpdb> 30 atoms in block 26 Block first atom: 724 Blocpdb> 25 atoms in block 27 Block first atom: 754 Blocpdb> 28 atoms in block 28 Block first atom: 779 Blocpdb> 25 atoms in block 29 Block first atom: 807 Blocpdb> 33 atoms in block 30 Block first atom: 832 Blocpdb> 32 atoms in block 31 Block first atom: 865 Blocpdb> 26 atoms in block 32 Block first atom: 897 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 923 Blocpdb> 31 atoms in block 34 Block first atom: 964 Blocpdb> 32 atoms in block 35 Block first atom: 995 Blocpdb> 33 atoms in block 36 Block first atom: 1027 Blocpdb> 27 atoms in block 37 Block first atom: 1060 Blocpdb> 38 atoms in block 38 Block first atom: 1087 Blocpdb> 38 atoms in block 39 Block first atom: 1125 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 1163 Blocpdb> 30 atoms in block 41 Block first atom: 1190 Blocpdb> 39 atoms in block 42 Block first atom: 1220 Blocpdb> 41 atoms in block 43 Block first atom: 1259 Blocpdb> 35 atoms in block 44 Block first atom: 1300 Blocpdb> 33 atoms in block 45 Block first atom: 1335 Blocpdb> 29 atoms in block 46 Block first atom: 1368 Blocpdb> 32 atoms in block 47 Block first atom: 1397 Blocpdb> 28 atoms in block 48 Block first atom: 1429 Blocpdb> 33 atoms in block 49 Block first atom: 1457 Blocpdb> 32 atoms in block 50 Block first atom: 1490 Blocpdb> 29 atoms in block 51 Block first atom: 1522 Blocpdb> 33 atoms in block 52 Block first atom: 1551 Blocpdb> 27 atoms in block 53 Block first atom: 1584 Blocpdb> 30 atoms in block 54 Block first atom: 1611 Blocpdb> 37 atoms in block 55 Block first atom: 1641 Blocpdb> 28 atoms in block 56 Block first atom: 1678 Blocpdb> 29 atoms in block 57 Block first atom: 1706 Blocpdb> 31 atoms in block 58 Block first atom: 1735 Blocpdb> 32 atoms in block 59 Block first atom: 1766 Blocpdb> 28 atoms in block 60 Block first atom: 1798 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1826 Blocpdb> 23 atoms in block 62 Block first atom: 1849 Blocpdb> 30 atoms in block 63 Block first atom: 1872 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1902 Blocpdb> 29 atoms in block 65 Block first atom: 1927 Blocpdb> 37 atoms in block 66 Block first atom: 1956 Blocpdb> 30 atoms in block 67 Block first atom: 1993 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 2023 Blocpdb> 29 atoms in block 69 Block first atom: 2054 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2083 Blocpdb> 24 atoms in block 71 Block first atom: 2111 Blocpdb> 28 atoms in block 72 Block first atom: 2135 Blocpdb> 27 atoms in block 73 Block first atom: 2163 Blocpdb> 35 atoms in block 74 Block first atom: 2190 Blocpdb> 27 atoms in block 75 Block first atom: 2225 Blocpdb> 27 atoms in block 76 Block first atom: 2252 Blocpdb> 36 atoms in block 77 Block first atom: 2279 Blocpdb> 33 atoms in block 78 Block first atom: 2315 Blocpdb> 31 atoms in block 79 Block first atom: 2348 Blocpdb> 30 atoms in block 80 Block first atom: 2379 Blocpdb> 28 atoms in block 81 Block first atom: 2409 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 2437 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 2463 Blocpdb> 33 atoms in block 84 Block first atom: 2499 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 2532 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 2562 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2583 Blocpdb> 24 atoms in block 88 Block first atom: 2610 Blocpdb> 26 atoms in block 89 Block first atom: 2634 Blocpdb> 30 atoms in block 90 Block first atom: 2660 Blocpdb> 30 atoms in block 91 Block first atom: 2690 Blocpdb> 37 atoms in block 92 Block first atom: 2720 Blocpdb> 31 atoms in block 93 Block first atom: 2757 Blocpdb> 24 atoms in block 94 Block first atom: 2788 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 2812 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2838 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 2859 Blocpdb> 32 atoms in block 98 Block first atom: 2887 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 2919 Blocpdb> 26 atoms in block 100 Block first atom: 2952 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 2978 Blocpdb> 23 atoms in block 102 Block first atom: 3008 Blocpdb> 31 atoms in block 103 Block first atom: 3031 Blocpdb> 32 atoms in block 104 Block first atom: 3062 Blocpdb> 27 atoms in block 105 Block first atom: 3094 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 3121 Blocpdb> 31 atoms in block 107 Block first atom: 3145 Blocpdb> 39 atoms in block 108 Block first atom: 3176 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 3215 Blocpdb> 31 atoms in block 110 Block first atom: 3241 Blocpdb> 32 atoms in block 111 Block first atom: 3272 Blocpdb> 27 atoms in block 112 Block first atom: 3304 Blocpdb> 26 atoms in block 113 Block first atom: 3331 Blocpdb> 29 atoms in block 114 Block first atom: 3357 Blocpdb> 32 atoms in block 115 Block first atom: 3386 Blocpdb> 31 atoms in block 116 Block first atom: 3418 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 3449 Blocpdb> 31 atoms in block 118 Block first atom: 3473 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 3504 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 3532 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 3562 Blocpdb> 31 atoms in block 122 Block first atom: 3584 Blocpdb> 27 atoms in block 123 Block first atom: 3615 Blocpdb> 30 atoms in block 124 Block first atom: 3642 Blocpdb> 25 atoms in block 125 Block first atom: 3672 Blocpdb> 28 atoms in block 126 Block first atom: 3697 Blocpdb> 25 atoms in block 127 Block first atom: 3725 Blocpdb> 33 atoms in block 128 Block first atom: 3750 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 3783 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 3815 Blocpdb> 41 atoms in block 131 Block first atom: 3841 Blocpdb> 31 atoms in block 132 Block first atom: 3882 Blocpdb> 32 atoms in block 133 Block first atom: 3913 Blocpdb> 33 atoms in block 134 Block first atom: 3945 Blocpdb> 27 atoms in block 135 Block first atom: 3978 Blocpdb> 38 atoms in block 136 Block first atom: 4005 Blocpdb> 38 atoms in block 137 Block first atom: 4043 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 4081 Blocpdb> 30 atoms in block 139 Block first atom: 4108 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 4138 Blocpdb> 33 atoms in block 141 Block first atom: 4177 Blocpdb> 35 atoms in block 142 Block first atom: 4210 Blocpdb> 33 atoms in block 143 Block first atom: 4245 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 4278 Blocpdb> 41 atoms in block 145 Block first atom: 4307 Blocpdb> 28 atoms in block 146 Block first atom: 4348 Blocpdb> 33 atoms in block 147 Block first atom: 4376 Blocpdb> 32 atoms in block 148 Block first atom: 4409 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 4441 Blocpdb> 33 atoms in block 150 Block first atom: 4470 Blocpdb> 27 atoms in block 151 Block first atom: 4503 Blocpdb> 30 atoms in block 152 Block first atom: 4530 Blocpdb> 37 atoms in block 153 Block first atom: 4560 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 4597 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 4625 Blocpdb> 31 atoms in block 156 Block first atom: 4654 Blocpdb> 32 atoms in block 157 Block first atom: 4685 Blocpdb> 28 atoms in block 158 Block first atom: 4717 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 4745 Blocpdb> 23 atoms in block 160 Block first atom: 4768 Blocpdb> 30 atoms in block 161 Block first atom: 4791 Blocpdb> 25 atoms in block 162 Block first atom: 4821 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 4846 Blocpdb> 28 atoms in block 164 Block first atom: 4875 Blocpdb> 30 atoms in block 165 Block first atom: 4903 Blocpdb> 31 atoms in block 166 Block first atom: 4933 Blocpdb> 29 atoms in block 167 Block first atom: 4964 Blocpdb> 28 atoms in block 168 Block first atom: 4993 Blocpdb> 24 atoms in block 169 Block first atom: 5021 Blocpdb> 28 atoms in block 170 Block first atom: 5045 Blocpdb> 27 atoms in block 171 Block first atom: 5073 Blocpdb> 35 atoms in block 172 Block first atom: 5100 Blocpdb> 27 atoms in block 173 Block first atom: 5135 Blocpdb> 27 atoms in block 174 Block first atom: 5162 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 5189 Blocpdb> 33 atoms in block 176 Block first atom: 5225 Blocpdb> 31 atoms in block 177 Block first atom: 5258 Blocpdb> 30 atoms in block 178 Block first atom: 5289 Blocpdb> 28 atoms in block 179 Block first atom: 5319 Blocpdb> 26 atoms in block 180 Block first atom: 5347 Blocpdb> 36 atoms in block 181 Block first atom: 5373 Blocpdb> 33 atoms in block 182 Block first atom: 5409 Blocpdb> 30 atoms in block 183 Block first atom: 5442 Blocpdb> 21 atoms in block 184 Block first atom: 5472 Blocpdb> 27 atoms in block 185 Block first atom: 5493 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 5520 Blocpdb> 26 atoms in block 187 Block first atom: 5544 Blocpdb> 30 atoms in block 188 Block first atom: 5570 Blocpdb> 30 atoms in block 189 Block first atom: 5600 Blocpdb> 46 atoms in block 190 Block first atom: 5630 Blocpdb> 31 atoms in block 191 Block first atom: 5676 Blocpdb> 24 atoms in block 192 Block first atom: 5707 Blocpdb> 26 atoms in block 193 Block first atom: 5731 Blocpdb> 21 atoms in block 194 Block first atom: 5757 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 5778 Blocpdb> 32 atoms in block 196 Block first atom: 5805 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 46 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2326653 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 17511 Prepmat> Matrix trace = 5092900.0000 Prepmat> Last element read: 17511 17511 235.9573 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17212 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5837 RTB> Total mass = 5837.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5837 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 267742.6610 RTB> 72444 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72444 Diagstd> Projected matrix trace = 267742.6610 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 267742.6610 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.0155580 1.0564684 1.4580498 1.5864151 2.0831322 2.3241346 2.6299843 3.0818112 3.2075458 3.3778061 3.5733584 5.7518209 6.2792746 6.6169671 6.8016301 7.1524445 7.8356451 8.2603697 8.8365486 9.6526813 9.8716731 10.6449917 10.6928498 11.2492797 12.3553851 12.5740200 12.6920946 15.4276057 15.5089413 16.1078015 16.6098017 16.8260619 17.1446122 17.6061857 17.9392135 18.3443539 18.9968571 19.5135240 19.6485981 19.8714329 20.1755905 20.6948593 21.9942101 22.3340501 23.0469431 24.1208993 24.3785607 25.1924593 25.2680443 25.7289748 26.3908335 26.5291392 27.0633178 27.4247044 27.9654112 28.3289116 29.1864831 30.0170744 30.3194987 30.8885458 31.7963538 32.2775346 32.7496755 32.9803485 33.7084332 35.0542544 35.4089749 35.5921169 36.1704615 36.6685010 37.7807571 38.4408197 38.7500607 39.3382835 39.5611553 39.9544019 40.5513127 41.1394110 41.5176642 41.6334948 42.3806157 42.7451818 43.3631950 44.0583054 44.6241493 45.4330062 45.9247184 46.0244861 46.5190083 47.0721037 47.8612827 48.5245495 48.9671830 49.4644044 49.6296584 49.8711396 50.5575082 50.9321897 51.2916019 52.2921787 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034319 0.0034322 0.0034339 0.0034339 0.0034344 0.0034347 109.4328357 111.6152492 131.1237780 136.7740471 156.7305640 165.5487550 176.1050706 190.6330917 194.4830296 199.5779872 205.2738228 260.4341656 272.1134556 279.3346219 283.2055658 290.4173304 303.9713543 312.1009010 322.8022968 337.3799462 341.1855761 354.2973824 355.0929207 364.2148405 381.7011106 385.0634993 386.8672181 426.5250532 427.6479121 435.8262810 442.5654479 445.4372392 449.6339687 455.6463747 459.9355502 465.1001617 473.2996221 479.6927272 481.3500985 484.0718997 487.7624989 493.9995109 509.2716081 513.1909901 521.3170690 533.3251060 536.1660498 545.0427450 545.8597795 550.8159672 557.8556466 559.3155063 564.9185026 568.6777782 574.2564546 577.9765591 586.6595751 594.9486195 597.9381850 603.5232586 612.3277485 616.9435923 621.4393944 623.6241151 630.4701997 642.9328963 646.1776863 647.8466093 653.0889045 657.5697988 667.4682446 673.2736224 675.9763065 681.0876151 683.0142478 686.4005094 691.5088445 696.5051226 699.6997785 700.6751482 706.9340678 709.9681475 715.0821167 720.7907003 725.4045165 731.9493298 735.8995398 736.6984469 740.6456974 745.0357015 751.2551235 756.4427000 759.8849454 763.7332040 765.0079056 766.8667823 772.1258823 774.9817120 777.7113041 785.2603126 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5837 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9878E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9897E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.016 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.056 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.458 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.586 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.083 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.324 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.630 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.082 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.208 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.378 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.573 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.752 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.279 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.617 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.802 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.152 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.837 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.872 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.29 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00005 1.00004 0.99997 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 105066 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 1.00005 1.00004 0.99997 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00004 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 1.00002 0.99997 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609111359183607159.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609111359183607159.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609111359183607159.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609111359183607159.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 784 First residue number = 1 Last residue number = 392 Number of atoms found = 5837 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9878E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9897E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9994E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.016 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.056 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.458 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.586 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.083 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.324 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.630 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.082 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.208 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.378 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.573 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.752 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.279 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.617 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.802 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.152 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.837 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.872 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.29 Bfactors> 106 vectors, 17511 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.016000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.408 for 790 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.021 +/- 0.06 Bfactors> = 20.739 +/- 7.91 Bfactors> Shiftng-fct= 20.719 Bfactors> Scaling-fct= 125.423 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609111359183607159.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609111359183607159.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4317E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 109.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 131.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 136.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 156.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 165.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 194.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 205.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 272.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 312.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 355.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 364.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 426.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 455.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 473.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 574.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.9 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vecteur en lecture: 673.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 699.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 700.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 759.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 763.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 765.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 777.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.2 Chkmod> 106 vectors, 17511 coordinates in file. Chkmod> That is: 5837 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 10 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9912 0.0034 0.7533 0.0034 0.7756 0.0034 0.7904 0.0034 0.9221 0.0034 0.9986 109.4519 0.0093 111.5857 0.0074 131.1159 0.0204 136.7503 0.0202 156.7189 0.0189 165.5369 0.1057 176.0980 0.2538 190.6307 0.0175 194.4885 0.0231 199.5751 0.2820 205.2547 0.4449 260.4270 0.1822 272.0958 0.0130 279.3233 0.6891 283.2011 0.4661 290.3958 0.1328 303.9652 0.0315 312.0805 0.3486 322.7967 0.4269 337.3710 0.3698 341.1766 0.2417 354.1991 0.3807 355.0304 0.3491 364.2109 0.2832 381.7560 0.4288 384.9854 0.3394 386.8187 0.4041 426.5398 0.4895 427.6442 0.5155 435.8373 0.1393 442.5491 0.4532 445.4702 0.2144 449.5542 0.5738 455.6762 0.3601 459.9259 0.3064 465.0250 0.1198 473.3185 0.3172 479.6288 0.3378 481.3466 0.3737 484.0337 0.3270 487.7949 0.2408 493.9203 0.4040 509.2010 0.3833 513.1224 0.4157 521.3293 0.4614 533.2923 0.4403 536.1589 0.6942 544.9927 0.3916 545.8575 0.1740 550.8033 0.4362 557.8229 0.3688 559.3006 0.4827 564.8596 0.4826 568.6046 0.3926 574.2789 0.4658 577.9628 0.3143 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DQ=-80 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom making animated gifs 11 models are in 2609111359183607159.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111359183607159.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111359183607159.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609111359183607159 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom making animated gifs 11 models are in 2609111359183607159.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111359183607159.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111359183607159.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609111359183607159 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111359183607159.eigenfacs 2609111359183607159.atom making animated gifs 11 models are in 2609111359183607159.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111359183607159.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111359183607159.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted 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