CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  TBC_AF  ***

LOGs for ID: 2609111810563696908

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609111810563696908.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609111810563696908.atom to be opened. Openam> File opened: 2609111810563696908.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 559 First residue number = 1 Last residue number = 559 Number of atoms found = 4427 Mean number per residue = 7.9 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.351153 +/- 17.111137 From: -36.600000 To: 43.807000 = 0.194115 +/- 11.222059 From: -27.846000 To: 29.609000 = 1.391080 +/- 16.500437 From: -40.999000 To: 37.262000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.8634 % Filled. Pdbmat> 1643500 non-zero elements. Pdbmat> 179697 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 81.18 +/- 24.54 Maximum number = 131 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 3.593940E+06 Pdbmat> Larger element = 521.957 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 559 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609111810563696908.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609111810563696908.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609111810563696908.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4427 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 559 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 23 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 25 atoms in block 3 Block first atom: 46 Blocpdb> 24 atoms in block 4 Block first atom: 71 Blocpdb> 25 atoms in block 5 Block first atom: 95 Blocpdb> 18 atoms in block 6 Block first atom: 120 Blocpdb> 25 atoms in block 7 Block first atom: 138 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 163 Blocpdb> 26 atoms in block 9 Block first atom: 182 Blocpdb> 19 atoms in block 10 Block first atom: 208 Blocpdb> 26 atoms in block 11 Block first atom: 227 Blocpdb> 26 atoms in block 12 Block first atom: 253 Blocpdb> 22 atoms in block 13 Block first atom: 279 Blocpdb> 24 atoms in block 14 Block first atom: 301 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 325 Blocpdb> 25 atoms in block 16 Block first atom: 356 Blocpdb> 24 atoms in block 17 Block first atom: 381 Blocpdb> 20 atoms in block 18 Block first atom: 405 Blocpdb> 32 atoms in block 19 Block first atom: 425 Blocpdb> 27 atoms in block 20 Block first atom: 457 Blocpdb> 23 atoms in block 21 Block first atom: 484 Blocpdb> 24 atoms in block 22 Block first atom: 507 Blocpdb> 21 atoms in block 23 Block first atom: 531 Blocpdb> 19 atoms in block 24 Block first atom: 552 Blocpdb> 25 atoms in block 25 Block first atom: 571 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 596 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 619 Blocpdb> 20 atoms in block 28 Block first atom: 640 Blocpdb> 22 atoms in block 29 Block first atom: 660 Blocpdb> 20 atoms in block 30 Block first atom: 682 Blocpdb> 22 atoms in block 31 Block first atom: 702 Blocpdb> 27 atoms in block 32 Block first atom: 724 Blocpdb> 23 atoms in block 33 Block first atom: 751 Blocpdb> 23 atoms in block 34 Block first atom: 774 Blocpdb> 24 atoms in block 35 Block first atom: 797 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 821 Blocpdb> 24 atoms in block 37 Block first atom: 842 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 866 Blocpdb> 28 atoms in block 39 Block first atom: 882 Blocpdb> 22 atoms in block 40 Block first atom: 910 Blocpdb> 21 atoms in block 41 Block first atom: 932 Blocpdb> 27 atoms in block 42 Block first atom: 953 Blocpdb> 22 atoms in block 43 Block first atom: 980 Blocpdb> 24 atoms in block 44 Block first atom: 1002 Blocpdb> 20 atoms in block 45 Block first atom: 1026 Blocpdb> 19 atoms in block 46 Block first atom: 1046 Blocpdb> 21 atoms in block 47 Block first atom: 1065 Blocpdb> 30 atoms in block 48 Block first atom: 1086 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1116 Blocpdb> 23 atoms in block 50 Block first atom: 1138 Blocpdb> 26 atoms in block 51 Block first atom: 1161 Blocpdb> 20 atoms in block 52 Block first atom: 1187 Blocpdb> 27 atoms in block 53 Block first atom: 1207 Blocpdb> 19 atoms in block 54 Block first atom: 1234 Blocpdb> 19 atoms in block 55 Block first atom: 1253 Blocpdb> 30 atoms in block 56 Block first atom: 1272 Blocpdb> 25 atoms in block 57 Block first atom: 1302 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1327 Blocpdb> 25 atoms in block 59 Block first atom: 1352 Blocpdb> 18 atoms in block 60 Block first atom: 1377 Blocpdb> 26 atoms in block 61 Block first atom: 1395 Blocpdb> 20 atoms in block 62 Block first atom: 1421 Blocpdb> 24 atoms in block 63 Block first atom: 1441 Blocpdb> 27 atoms in block 64 Block first atom: 1465 Blocpdb> 20 atoms in block 65 Block first atom: 1492 Blocpdb> 25 atoms in block 66 Block first atom: 1512 Blocpdb> 19 atoms in block 67 Block first atom: 1537 Blocpdb> 23 atoms in block 68 Block first atom: 1556 Blocpdb> 24 atoms in block 69 Block first atom: 1579 Blocpdb> 24 atoms in block 70 Block first atom: 1603 Blocpdb> 31 atoms in block 71 Block first atom: 1627 Blocpdb> 33 atoms in block 72 Block first atom: 1658 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1691 Blocpdb> 23 atoms in block 74 Block first atom: 1715 Blocpdb> 29 atoms in block 75 Block first atom: 1738 Blocpdb> 23 atoms in block 76 Block first atom: 1767 Blocpdb> 26 atoms in block 77 Block first atom: 1790 Blocpdb> 26 atoms in block 78 Block first atom: 1816 Blocpdb> 25 atoms in block 79 Block first atom: 1842 Blocpdb> 24 atoms in block 80 Block first atom: 1867 Blocpdb> 30 atoms in block 81 Block first atom: 1891 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1921 Blocpdb> 25 atoms in block 83 Block first atom: 1939 Blocpdb> 32 atoms in block 84 Block first atom: 1964 Blocpdb> 27 atoms in block 85 Block first atom: 1996 Blocpdb> 18 atoms in block 86 Block first atom: 2023 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 2041 Blocpdb> 20 atoms in block 88 Block first atom: 2065 Blocpdb> 25 atoms in block 89 Block first atom: 2085 Blocpdb> 27 atoms in block 90 Block first atom: 2110 Blocpdb> 25 atoms in block 91 Block first atom: 2137 Blocpdb> 27 atoms in block 92 Block first atom: 2162 Blocpdb> 21 atoms in block 93 Block first atom: 2189 Blocpdb> 20 atoms in block 94 Block first atom: 2210 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 2230 Blocpdb> 26 atoms in block 96 Block first atom: 2256 Blocpdb> 21 atoms in block 97 Block first atom: 2282 Blocpdb> 27 atoms in block 98 Block first atom: 2303 Blocpdb> 28 atoms in block 99 Block first atom: 2330 Blocpdb> 26 atoms in block 100 Block first atom: 2358 Blocpdb> 25 atoms in block 101 Block first atom: 2384 Blocpdb> 22 atoms in block 102 Block first atom: 2409 Blocpdb> 26 atoms in block 103 Block first atom: 2431 Blocpdb> 22 atoms in block 104 Block first atom: 2457 Blocpdb> 22 atoms in block 105 Block first atom: 2479 Blocpdb> 22 atoms in block 106 Block first atom: 2501 Blocpdb> 27 atoms in block 107 Block first atom: 2523 Blocpdb> 19 atoms in block 108 Block first atom: 2550 Blocpdb> 23 atoms in block 109 Block first atom: 2569 Blocpdb> 31 atoms in block 110 Block first atom: 2592 Blocpdb> 25 atoms in block 111 Block first atom: 2623 Blocpdb> 22 atoms in block 112 Block first atom: 2648 Blocpdb> 22 atoms in block 113 Block first atom: 2670 Blocpdb> 28 atoms in block 114 Block first atom: 2692 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2720 Blocpdb> 24 atoms in block 116 Block first atom: 2744 Blocpdb> 28 atoms in block 117 Block first atom: 2768 Blocpdb> 30 atoms in block 118 Block first atom: 2796 Blocpdb> 27 atoms in block 119 Block first atom: 2826 Blocpdb> 27 atoms in block 120 Block first atom: 2853 Blocpdb> 24 atoms in block 121 Block first atom: 2880 Blocpdb> 22 atoms in block 122 Block first atom: 2904 Blocpdb> 24 atoms in block 123 Block first atom: 2926 Blocpdb> 23 atoms in block 124 Block first atom: 2950 Blocpdb> 27 atoms in block 125 Block first atom: 2973 Blocpdb> 22 atoms in block 126 Block first atom: 3000 Blocpdb> 24 atoms in block 127 Block first atom: 3022 Blocpdb> 34 atoms in block 128 Block first atom: 3046 Blocpdb> 24 atoms in block 129 Block first atom: 3080 Blocpdb> 23 atoms in block 130 Block first atom: 3104 Blocpdb> 22 atoms in block 131 Block first atom: 3127 Blocpdb> 24 atoms in block 132 Block first atom: 3149 Blocpdb> 23 atoms in block 133 Block first atom: 3173 Blocpdb> 27 atoms in block 134 Block first atom: 3196 Blocpdb> 17 atoms in block 135 Block first atom: 3223 Blocpdb> 25 atoms in block 136 Block first atom: 3240 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 3265 Blocpdb> 29 atoms in block 138 Block first atom: 3286 Blocpdb> 28 atoms in block 139 Block first atom: 3315 Blocpdb> 19 atoms in block 140 Block first atom: 3343 Blocpdb> 21 atoms in block 141 Block first atom: 3362 Blocpdb> 26 atoms in block 142 Block first atom: 3383 Blocpdb> 20 atoms in block 143 Block first atom: 3409 Blocpdb> 24 atoms in block 144 Block first atom: 3429 Blocpdb> 30 atoms in block 145 Block first atom: 3453 Blocpdb> 25 atoms in block 146 Block first atom: 3483 Blocpdb> 27 atoms in block 147 Block first atom: 3508 Blocpdb> 35 atoms in block 148 Block first atom: 3535 Blocpdb> 22 atoms in block 149 Block first atom: 3570 Blocpdb> 26 atoms in block 150 Block first atom: 3592 Blocpdb> 24 atoms in block 151 Block first atom: 3618 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3642 Blocpdb> 23 atoms in block 153 Block first atom: 3665 Blocpdb> 19 atoms in block 154 Block first atom: 3688 Blocpdb> 19 atoms in block 155 Block first atom: 3707 Blocpdb> 21 atoms in block 156 Block first atom: 3726 Blocpdb> 21 atoms in block 157 Block first atom: 3747 Blocpdb> 20 atoms in block 158 Block first atom: 3768 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 3788 Blocpdb> 25 atoms in block 160 Block first atom: 3808 Blocpdb> 26 atoms in block 161 Block first atom: 3833 Blocpdb> 21 atoms in block 162 Block first atom: 3859 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 3880 Blocpdb> 21 atoms in block 164 Block first atom: 3909 Blocpdb> 25 atoms in block 165 Block first atom: 3930 Blocpdb> 25 atoms in block 166 Block first atom: 3955 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 3980 Blocpdb> 18 atoms in block 168 Block first atom: 3997 Blocpdb> 22 atoms in block 169 Block first atom: 4015 Blocpdb> 15 atoms in block 170 Block first atom: 4037 Blocpdb> 12 atoms in block 171 Block first atom: 4052 Blocpdb> 22 atoms in block 172 Block first atom: 4064 Blocpdb> 28 atoms in block 173 Block first atom: 4086 Blocpdb> 20 atoms in block 174 Block first atom: 4114 Blocpdb> 23 atoms in block 175 Block first atom: 4134 Blocpdb> 24 atoms in block 176 Block first atom: 4157 Blocpdb> 24 atoms in block 177 Block first atom: 4181 Blocpdb> 26 atoms in block 178 Block first atom: 4205 Blocpdb> 24 atoms in block 179 Block first atom: 4231 Blocpdb> 20 atoms in block 180 Block first atom: 4255 Blocpdb> 28 atoms in block 181 Block first atom: 4275 Blocpdb> 21 atoms in block 182 Block first atom: 4303 Blocpdb> 21 atoms in block 183 Block first atom: 4324 Blocpdb> 23 atoms in block 184 Block first atom: 4345 Blocpdb> 28 atoms in block 185 Block first atom: 4368 Blocpdb> 22 atoms in block 186 Block first atom: 4396 Blocpdb> 10 atoms in block 187 Block first atom: 4417 Blocpdb> 187 blocks. Blocpdb> At most, 35 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 10 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1643687 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 13281 Prepmat> Matrix trace = 3593940.0000 Prepmat> Last element read: 13281 13281 139.8790 Prepmat> 17579 lines saved. Prepmat> 15670 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4427 RTB> Total mass = 4427.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4427 RTB> Number of blocks = 187 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 236026.7077 RTB> 65883 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1122 Diagstd> Nb of non-zero elements: 65883 Diagstd> Projected matrix trace = 236026.7077 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1122 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 236026.7077 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2747462 0.7194389 1.0610990 1.2905300 1.4055792 1.5551444 1.9602980 2.1805678 2.6975556 3.0206846 3.8202126 4.3766870 4.5735730 4.8678376 5.1436283 5.2585868 5.9341912 6.1047271 6.5069568 7.9456894 8.3204509 8.6403938 9.1408117 9.4203928 10.0252560 10.2905980 10.9449102 11.2146147 12.0973287 12.4992668 12.9225278 13.3220490 14.2117294 14.4084077 14.7018492 14.9850756 15.1501570 15.9366645 16.1110085 16.5098464 16.8200371 17.9673113 18.2825237 18.5520778 19.1138239 19.6891716 20.3266773 20.9150097 20.9375383 21.5532110 21.8808085 21.9809958 22.2565457 22.7735150 23.1678612 23.5542264 24.0943792 24.4201324 24.9210696 26.0100816 26.1782581 26.5329764 26.7012917 27.1010178 27.9335367 28.1526742 28.6014101 29.4426352 29.6893856 29.8839033 30.3181640 30.8391773 31.4085522 31.6956027 32.1445653 32.9056666 33.2384833 33.6783547 33.9049880 34.5807463 35.0098104 35.5759334 35.7595375 36.5384667 37.1441407 37.3786469 37.9466399 38.1842169 39.0635637 39.1880752 39.4227512 39.6698354 40.3382393 40.9535945 41.1235414 42.0361875 42.1934097 42.7498783 43.1070771 43.5306019 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034317 0.0034324 0.0034334 0.0034338 0.0034340 0.0034348 56.9195069 92.1069123 111.8595941 123.3614125 128.7427991 135.4193247 152.0394642 160.3541040 178.3530252 188.7330567 212.2457717 227.1789171 232.2325492 239.5870395 246.2805231 249.0174632 264.5306805 268.3047790 277.0028533 306.0984084 313.2338658 319.1993869 328.3126844 333.2957573 343.8294053 348.3498170 359.2538099 363.6532376 377.6939441 383.9171824 390.3633337 396.3517630 409.3725753 412.1955271 416.3717556 420.3632574 422.6723588 433.5048841 435.8696636 441.2317919 445.3574845 460.2956034 464.3156825 467.7260502 474.7544788 481.8468262 489.5854210 496.6201252 496.8875212 504.1401313 507.9570151 509.1185982 512.2997694 518.2153992 522.6828516 527.0231623 533.0318390 536.6230060 542.0990165 553.8168146 555.6043698 559.3559549 561.1273228 565.3118391 573.9290967 576.1759244 580.7497119 589.2283301 591.6922562 593.6274039 597.9250233 603.0407661 608.5821909 611.3568566 615.6715125 622.9176361 626.0598881 630.1888481 632.3056725 638.5758075 642.5251918 647.6993061 649.3685136 656.4028219 661.8208393 663.9067259 668.9319557 671.0227188 678.7052533 679.7860479 681.8184433 683.9517724 689.6897145 694.9303726 696.3707710 704.0555729 705.3709854 710.0071487 712.9672289 716.4611012 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4427 Rtb_to_modes> Number of blocs = 187 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9866E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2747 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7194 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.061 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.291 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.555 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.960 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.181 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.698 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.021 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.377 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.574 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.868 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.144 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.259 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.105 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.507 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.946 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.320 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.640 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.141 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.420 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.53 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1122 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 0.99995 0.99999 0.99999 0.99999 1.00005 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 79686 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00001 0.99998 0.99998 0.99998 1.00001 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 0.99999 1.00001 1.00002 1.00003 0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99997 1.00000 1.00003 0.99995 0.99999 0.99999 0.99999 1.00005 1.00004 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 1.00000 1.00003 1.00000 0.99997 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99998 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 7:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609111810563696908.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609111810563696908.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609111810563696908.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609111810563696908.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 559 First residue number = 1 Last residue number = 559 Number of atoms found = 4427 Mean number per residue = 7.9 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9866E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9909E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9989E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9999E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2747 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7194 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.061 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.291 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.555 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.960 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.181 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.698 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.021 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.377 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.574 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.868 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.144 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.259 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.105 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.507 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.946 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.320 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.640 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.141 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.420 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.53 Bfactors> 106 vectors, 13281 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.274700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.531 for 559 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.052 +/- 0.19 Bfactors> = 84.116 +/- 16.74 Bfactors> Shiftng-fct= 84.064 Bfactors> Scaling-fct= 86.830 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609111810563696908.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609111810563696908.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 56.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 92.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 123.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 152.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 188.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 212.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 232.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 239.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 246.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 333.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 363.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 377.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 383.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 412.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 420.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 441.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 536.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 565.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 589.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 638.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 704.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.4 Chkmod> 106 vectors, 13281 coordinates in file. Chkmod> That is: 4427 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 28 is: 0.9999 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 42 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7017 0.0034 0.8606 0.0034 0.7716 0.0034 0.6495 0.0034 0.8544 0.0034 0.6761 56.9123 0.0205 92.1005 0.0632 111.8496 0.0327 123.3786 0.5970 128.7565 0.5039 135.4072 0.3321 152.0214 0.0221 160.3631 0.0418 178.3601 0.0591 188.7348 0.0114 212.2308 0.0188 227.1773 0.6309 232.2334 0.1016 239.5808 0.4474 246.2788 0.0446 249.0166 0.0511 264.5151 0.1298 268.2993 0.3909 276.9919 0.1077 306.0913 0.1967 313.2119 0.1823 319.1784 0.1481 328.3020 0.1296 333.2745 0.2933 343.8960 0.2203 348.3247 0.1740 359.1578 0.2217 363.5628 0.1596 377.7194 0.1399 383.9120 0.2796 390.3084 0.3692 396.3043 0.1609 409.3301 0.2407 412.2006 0.2043 416.3277 0.2023 420.4143 0.2506 422.6520 0.3080 433.5316 0.3341 435.8373 0.1940 441.2149 0.2872 445.3379 0.4085 460.3103 0.4261 464.2637 0.3475 467.6798 0.1716 474.6866 0.1350 481.8363 0.3735 489.6044 0.4089 496.6580 0.2806 496.8954 0.1286 504.0809 0.1642 507.9258 0.3147 509.0852 0.4187 512.3175 0.2609 518.1532 0.3339 522.6845 0.2605 526.9533 0.3654 532.9605 0.2684 536.5985 0.2784 542.0641 0.3369 553.7922 0.0539 555.5990 0.3624 559.3006 0.1657 561.0897 0.2114 565.2770 0.2540 573.8681 0.1820 576.1238 0.4695 580.7105 0.5059 589.1767 0.5457 591.6730 0.3261 593.5632 0.4819 597.9175 0.4818 603.0229 0.4213 608.5701 0.3652 611.3730 0.3389 615.6014 0.4415 622.9319 0.4130 626.0473 0.3194 630.1772 0.2592 632.2320 0.3622 638.5415 0.3469 642.4993 0.2518 647.7085 0.3870 649.3448 0.3598 656.3884 0.3696 661.7555 0.3763 663.8902 0.4562 668.9329 0.3910 670.9569 0.4039 678.6452 0.4094 679.7736 0.3683 681.7654 0.4021 683.9238 0.2715 689.6752 0.3917 694.8700 0.5041 696.3109 0.4240 704.0573 0.4666 705.3122 0.3872 709.9777 0.3176 712.9608 0.3902 716.4254 0.5294 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2609111810563696908 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom making animated gifs 11 models are in 2609111810563696908.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609111810563696908 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom making animated gifs 11 models are in 2609111810563696908.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609111810563696908 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom making animated gifs 11 models are in 2609111810563696908.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2609111810563696908 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom making animated gifs 11 models are in 2609111810563696908.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2609111810563696908 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609111810563696908.eigenfacs 2609111810563696908.atom making animated gifs 11 models are in 2609111810563696908.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609111810563696908.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2609111810563696908.10.pdb 2609111810563696908.11.pdb 2609111810563696908.7.pdb 2609111810563696908.8.pdb 2609111810563696908.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m25.377s user 0m25.216s sys 0m0.145s rm: cannot remove '2609111810563696908.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.