***  test  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260913185738117947.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260913185738117947.atom to be opened.
Openam> File opened: 260913185738117947.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1540
First residue number = 1
Last residue number = 385
Number of atoms found = 12288
Mean number per residue = 8.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= -0.361696 +/- 20.184525 From: -45.229000 To: 47.812000
= -0.018049 +/- 20.111357 From: -52.155000 To: 50.137000
= -0.611570 +/- 20.062748 From: -48.443000 To: 48.136000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.6949 % Filled.
Pdbmat> 4721866 non-zero elements.
Pdbmat> 516547 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 84.07 +/- 21.24
Maximum number = 127
Minimum number = 9
Pdbmat> Matrix trace = 1.033094E+07
Pdbmat> Larger element = 523.051
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1540 non-zero elements, NRBL set to 8
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260913185738117947.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 8
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260913185738117947.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260913185738117947.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 12288 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 8 residue(s) per block.
Blocpdb> 1540 residues.
Blocpdb> 55 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 63 atoms in block 2
Block first atom: 56
Blocpdb> 68 atoms in block 3
Block first atom: 119
Blocpdb> 57 atoms in block 4
Block first atom: 187
Blocpdb> 55 atoms in block 5
Block first atom: 244
Blocpdb> 58 atoms in block 6
Block first atom: 299
Blocpdb> 59 atoms in block 7
Block first atom: 357
Blocpdb> 66 atoms in block 8
Block first atom: 416
Blocpdb> 52 atoms in block 9
Block first atom: 482
Blocpdb> 65 atoms in block 10
Block first atom: 534
Blocpdb> 60 atoms in block 11
Block first atom: 599
Blocpdb> 68 atoms in block 12
Block first atom: 659
Blocpdb> 60 atoms in block 13
Block first atom: 727
Blocpdb> 70 atoms in block 14
Block first atom: 787
Blocpdb> 65 atoms in block 15
Block first atom: 857
Blocpdb> 70 atoms in block 16
Block first atom: 922
Blocpdb> 58 atoms in block 17
Block first atom: 992
Blocpdb> 66 atoms in block 18
Block first atom: 1050
Blocpdb> 75 atoms in block 19
Block first atom: 1116
Blocpdb> 65 atoms in block 20
Block first atom: 1191
Blocpdb> 57 atoms in block 21
Block first atom: 1256
Blocpdb> 68 atoms in block 22
Block first atom: 1313
Blocpdb> 76 atoms in block 23
Block first atom: 1381
Blocpdb> 65 atoms in block 24
Block first atom: 1457
Blocpdb> 60 atoms in block 25
Block first atom: 1522
Blocpdb> 70 atoms in block 26
Block first atom: 1582
Blocpdb> 66 atoms in block 27
Block first atom: 1652
Blocpdb> 63 atoms in block 28
Block first atom: 1718
Blocpdb> 76 atoms in block 29
Block first atom: 1781
Blocpdb> 65 atoms in block 30
Block first atom: 1857
Blocpdb> 57 atoms in block 31
Block first atom: 1922
Blocpdb> 68 atoms in block 32
Block first atom: 1979
Blocpdb> 62 atoms in block 33
Block first atom: 2047
Blocpdb> 66 atoms in block 34
Block first atom: 2109
Blocpdb> 63 atoms in block 35
Block first atom: 2175
Blocpdb> 58 atoms in block 36
Block first atom: 2238
Blocpdb> 75 atoms in block 37
Block first atom: 2296
Blocpdb> 64 atoms in block 38
Block first atom: 2371
Blocpdb> 65 atoms in block 39
Block first atom: 2435
Blocpdb> 67 atoms in block 40
Block first atom: 2500
Blocpdb> 66 atoms in block 41
Block first atom: 2567
Blocpdb> 73 atoms in block 42
Block first atom: 2633
Blocpdb> 67 atoms in block 43
Block first atom: 2706
Blocpdb> 56 atoms in block 44
Block first atom: 2773
Blocpdb> 57 atoms in block 45
Block first atom: 2829
Blocpdb> 56 atoms in block 46
Block first atom: 2886
Blocpdb> 67 atoms in block 47
Block first atom: 2942
Blocpdb> 56 atoms in block 48
Block first atom: 3009
Blocpdb> 8 atoms in block 49
Block first atom: 3065
Blocpdb> 55 atoms in block 50
Block first atom: 3073
Blocpdb> 63 atoms in block 51
Block first atom: 3128
Blocpdb> 68 atoms in block 52
Block first atom: 3191
Blocpdb> 57 atoms in block 53
Block first atom: 3259
Blocpdb> 55 atoms in block 54
Block first atom: 3316
Blocpdb> 58 atoms in block 55
Block first atom: 3371
Blocpdb> 59 atoms in block 56
Block first atom: 3429
Blocpdb> 66 atoms in block 57
Block first atom: 3488
Blocpdb> 52 atoms in block 58
Block first atom: 3554
Blocpdb> 65 atoms in block 59
Block first atom: 3606
Blocpdb> 60 atoms in block 60
Block first atom: 3671
Blocpdb> 68 atoms in block 61
Block first atom: 3731
Blocpdb> 60 atoms in block 62
Block first atom: 3799
Blocpdb> 70 atoms in block 63
Block first atom: 3859
Blocpdb> 65 atoms in block 64
Block first atom: 3929
Blocpdb> 70 atoms in block 65
Block first atom: 3994
Blocpdb> 58 atoms in block 66
Block first atom: 4064
Blocpdb> 66 atoms in block 67
Block first atom: 4122
Blocpdb> 75 atoms in block 68
Block first atom: 4188
Blocpdb> 65 atoms in block 69
Block first atom: 4263
Blocpdb> 57 atoms in block 70
Block first atom: 4328
Blocpdb> 68 atoms in block 71
Block first atom: 4385
Blocpdb> 76 atoms in block 72
Block first atom: 4453
Blocpdb> 65 atoms in block 73
Block first atom: 4529
Blocpdb> 60 atoms in block 74
Block first atom: 4594
Blocpdb> 70 atoms in block 75
Block first atom: 4654
Blocpdb> 66 atoms in block 76
Block first atom: 4724
Blocpdb> 63 atoms in block 77
Block first atom: 4790
Blocpdb> 76 atoms in block 78
Block first atom: 4853
Blocpdb> 65 atoms in block 79
Block first atom: 4929
Blocpdb> 57 atoms in block 80
Block first atom: 4994
Blocpdb> 68 atoms in block 81
Block first atom: 5051
Blocpdb> 62 atoms in block 82
Block first atom: 5119
Blocpdb> 66 atoms in block 83
Block first atom: 5181
Blocpdb> 63 atoms in block 84
Block first atom: 5247
Blocpdb> 58 atoms in block 85
Block first atom: 5310
Blocpdb> 75 atoms in block 86
Block first atom: 5368
Blocpdb> 64 atoms in block 87
Block first atom: 5443
Blocpdb> 65 atoms in block 88
Block first atom: 5507
Blocpdb> 67 atoms in block 89
Block first atom: 5572
Blocpdb> 66 atoms in block 90
Block first atom: 5639
Blocpdb> 73 atoms in block 91
Block first atom: 5705
Blocpdb> 67 atoms in block 92
Block first atom: 5778
Blocpdb> 56 atoms in block 93
Block first atom: 5845
Blocpdb> 57 atoms in block 94
Block first atom: 5901
Blocpdb> 56 atoms in block 95
Block first atom: 5958
Blocpdb> 67 atoms in block 96
Block first atom: 6014
Blocpdb> 56 atoms in block 97
Block first atom: 6081
Blocpdb> 8 atoms in block 98
Block first atom: 6137
Blocpdb> 55 atoms in block 99
Block first atom: 6145
Blocpdb> 63 atoms in block 100
Block first atom: 6200
Blocpdb> 68 atoms in block 101
Block first atom: 6263
Blocpdb> 57 atoms in block 102
Block first atom: 6331
Blocpdb> 55 atoms in block 103
Block first atom: 6388
Blocpdb> 58 atoms in block 104
Block first atom: 6443
Blocpdb> 59 atoms in block 105
Block first atom: 6501
Blocpdb> 66 atoms in block 106
Block first atom: 6560
Blocpdb> 52 atoms in block 107
Block first atom: 6626
Blocpdb> 65 atoms in block 108
Block first atom: 6678
Blocpdb> 60 atoms in block 109
Block first atom: 6743
Blocpdb> 68 atoms in block 110
Block first atom: 6803
Blocpdb> 60 atoms in block 111
Block first atom: 6871
Blocpdb> 70 atoms in block 112
Block first atom: 6931
Blocpdb> 65 atoms in block 113
Block first atom: 7001
Blocpdb> 70 atoms in block 114
Block first atom: 7066
Blocpdb> 58 atoms in block 115
Block first atom: 7136
Blocpdb> 66 atoms in block 116
Block first atom: 7194
Blocpdb> 75 atoms in block 117
Block first atom: 7260
Blocpdb> 65 atoms in block 118
Block first atom: 7335
Blocpdb> 57 atoms in block 119
Block first atom: 7400
Blocpdb> 68 atoms in block 120
Block first atom: 7457
Blocpdb> 76 atoms in block 121
Block first atom: 7525
Blocpdb> 65 atoms in block 122
Block first atom: 7601
Blocpdb> 60 atoms in block 123
Block first atom: 7666
Blocpdb> 70 atoms in block 124
Block first atom: 7726
Blocpdb> 66 atoms in block 125
Block first atom: 7796
Blocpdb> 63 atoms in block 126
Block first atom: 7862
Blocpdb> 76 atoms in block 127
Block first atom: 7925
Blocpdb> 65 atoms in block 128
Block first atom: 8001
Blocpdb> 57 atoms in block 129
Block first atom: 8066
Blocpdb> 68 atoms in block 130
Block first atom: 8123
Blocpdb> 62 atoms in block 131
Block first atom: 8191
Blocpdb> 66 atoms in block 132
Block first atom: 8253
Blocpdb> 63 atoms in block 133
Block first atom: 8319
Blocpdb> 58 atoms in block 134
Block first atom: 8382
Blocpdb> 75 atoms in block 135
Block first atom: 8440
Blocpdb> 64 atoms in block 136
Block first atom: 8515
Blocpdb> 65 atoms in block 137
Block first atom: 8579
Blocpdb> 67 atoms in block 138
Block first atom: 8644
Blocpdb> 66 atoms in block 139
Block first atom: 8711
Blocpdb> 73 atoms in block 140
Block first atom: 8777
Blocpdb> 67 atoms in block 141
Block first atom: 8850
Blocpdb> 56 atoms in block 142
Block first atom: 8917
Blocpdb> 57 atoms in block 143
Block first atom: 8973
Blocpdb> 56 atoms in block 144
Block first atom: 9030
Blocpdb> 67 atoms in block 145
Block first atom: 9086
Blocpdb> 56 atoms in block 146
Block first atom: 9153
Blocpdb> 8 atoms in block 147
Block first atom: 9209
Blocpdb> 55 atoms in block 148
Block first atom: 9217
Blocpdb> 63 atoms in block 149
Block first atom: 9272
Blocpdb> 68 atoms in block 150
Block first atom: 9335
Blocpdb> 57 atoms in block 151
Block first atom: 9403
Blocpdb> 55 atoms in block 152
Block first atom: 9460
Blocpdb> 58 atoms in block 153
Block first atom: 9515
Blocpdb> 59 atoms in block 154
Block first atom: 9573
Blocpdb> 66 atoms in block 155
Block first atom: 9632
Blocpdb> 52 atoms in block 156
Block first atom: 9698
Blocpdb> 65 atoms in block 157
Block first atom: 9750
Blocpdb> 60 atoms in block 158
Block first atom: 9815
Blocpdb> 68 atoms in block 159
Block first atom: 9875
Blocpdb> 60 atoms in block 160
Block first atom: 9943
Blocpdb> 70 atoms in block 161
Block first atom: 10003
Blocpdb> 65 atoms in block 162
Block first atom: 10073
Blocpdb> 70 atoms in block 163
Block first atom: 10138
Blocpdb> 58 atoms in block 164
Block first atom: 10208
Blocpdb> 66 atoms in block 165
Block first atom: 10266
Blocpdb> 75 atoms in block 166
Block first atom: 10332
Blocpdb> 65 atoms in block 167
Block first atom: 10407
Blocpdb> 57 atoms in block 168
Block first atom: 10472
Blocpdb> 68 atoms in block 169
Block first atom: 10529
Blocpdb> 76 atoms in block 170
Block first atom: 10597
Blocpdb> 65 atoms in block 171
Block first atom: 10673
Blocpdb> 60 atoms in block 172
Block first atom: 10738
Blocpdb> 70 atoms in block 173
Block first atom: 10798
Blocpdb> 66 atoms in block 174
Block first atom: 10868
Blocpdb> 63 atoms in block 175
Block first atom: 10934
Blocpdb> 76 atoms in block 176
Block first atom: 10997
Blocpdb> 65 atoms in block 177
Block first atom: 11073
Blocpdb> 57 atoms in block 178
Block first atom: 11138
Blocpdb> 68 atoms in block 179
Block first atom: 11195
Blocpdb> 62 atoms in block 180
Block first atom: 11263
Blocpdb> 66 atoms in block 181
Block first atom: 11325
Blocpdb> 63 atoms in block 182
Block first atom: 11391
Blocpdb> 58 atoms in block 183
Block first atom: 11454
Blocpdb> 75 atoms in block 184
Block first atom: 11512
Blocpdb> 64 atoms in block 185
Block first atom: 11587
Blocpdb> 65 atoms in block 186
Block first atom: 11651
Blocpdb> 67 atoms in block 187
Block first atom: 11716
Blocpdb> 66 atoms in block 188
Block first atom: 11783
Blocpdb> 73 atoms in block 189
Block first atom: 11849
Blocpdb> 67 atoms in block 190
Block first atom: 11922
Blocpdb> 56 atoms in block 191
Block first atom: 11989
Blocpdb> 57 atoms in block 192
Block first atom: 12045
Blocpdb> 56 atoms in block 193
Block first atom: 12102
Blocpdb> 67 atoms in block 194
Block first atom: 12158
Blocpdb> 56 atoms in block 195
Block first atom: 12225
Blocpdb> 8 atoms in block 196
Block first atom: 12280
Blocpdb> 196 blocks.
Blocpdb> At most, 76 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 4722062 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 36864
Prepmat> Matrix trace = 10330940.0000
Prepmat> Last element read: 36864 36864 277.8338
Prepmat> 19307 lines saved.
Prepmat> 17841 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12288
RTB> Total mass = 12288.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 12288
RTB> Number of blocks = 196
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 190184.4324
RTB> 49800 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1176
Diagstd> Nb of non-zero elements: 49800
Diagstd> Projected matrix trace = 190184.4324
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1176 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 190184.4324
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5264399 0.7447460 0.7479337 0.9402701
1.2358954 2.1399227 2.1476609 2.3976161 2.4459660
2.9488987 3.4560852 3.4681327 3.7493270 4.3354106
4.3604383 4.3819962 5.3273538 6.1268165 6.4035860
6.4147180 6.4479367 6.8249682 6.9841217 7.1115403
7.1376675 7.6530992 8.8240500 8.8631761 9.9972659
10.1362804 10.3789115 10.3904929 10.8476484 11.0860850
11.4360771 11.4952030 11.9193560 12.3085893 12.5451519
12.5703722 12.8213351 13.2873803 14.2791497 14.3041767
14.4845251 15.6576900 15.9093496 16.3085614 17.1111242
17.1850026 17.3153831 17.8886367 17.9421763 18.2707180
18.5434147 19.3108796 19.3803733 19.7556423 19.8899866
19.9140174 20.6638706 20.7392065 20.8657569 21.0271663
22.0240374 22.6258030 22.6996216 23.1881702 23.4761132
23.5423004 23.8959353 24.0913912 24.4696397 24.7985076
24.8679548 25.1014662 26.2372972 26.7596508 26.9133372
27.0571433 27.3712285 28.3296465 28.4355599 28.6976076
29.0304478 29.3132778 30.2078369 30.5936176 30.6493156
30.7455039 30.8861191 31.4247708 31.4631270 31.9043686
32.3515717 33.2575610 33.4971177 33.5679031 33.9760878
34.3263065
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034335 0.0034337 0.0034341 0.0034345 0.0034350
0.0034352 78.7897390 93.7128985 93.9132433 105.2983575
120.7219198 158.8525972 159.1395528 168.1454422 169.8323768
186.4769707 201.8773061 202.2288604 210.2673975 226.1051194
226.7568174 227.3166655 250.6403855 268.7897583 274.7937840
275.0325307 275.7437409 283.6910246 286.9797009 289.5857045
290.1171737 300.4096999 322.5739258 323.2882871 343.3490904
345.7280270 349.8413863 350.0365176 357.6539955 361.5633339
367.2263351 368.1744123 374.9053829 380.9775817 384.6212206
385.0076410 388.8319159 395.8357025 410.3424567 410.7019019
413.2828763 429.6938379 433.1332189 438.5338349 449.1946266
450.1632957 451.8677359 459.2867355 459.9735304 464.1657464
467.6168322 477.1954655 478.0533316 482.6594983 484.2978330
484.5903058 493.6295129 494.5285259 496.0350349 497.9499063
509.6168132 516.5320585 517.3739866 522.9118937 526.1485494
526.8897247 530.8322467 532.9987865 537.1666817 540.7643501
541.5210152 544.0575298 556.2305365 561.7401958 563.3509835
564.8540558 568.1230701 577.9840552 579.0634747 581.7255333
585.0892886 587.9325058 596.8361145 600.6350856 601.1815873
602.1242077 603.4995504 608.7392991 609.1106907 613.3669302
617.6507490 626.2395302 628.4909091 629.1546153 632.9683071
636.2221992
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12288
Rtb_to_modes> Number of blocs = 196
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5264
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7447
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7479
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9403
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.236
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.140
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.148
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.398
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.446
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.949
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.456
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.468
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.749
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.335
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.360
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.382
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.327
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.127
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.404
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.415
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.448
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.825
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.984
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.112
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.138
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.653
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.824
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.863
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.997
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.42
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.33
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000
1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002
0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99999 1.00002 1.00005 1.00000
1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 221184 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000
1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000
1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002
0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003
1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002
0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001
1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001
1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002
1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998
1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999
1.00001 0.99999 1.00002 1.00005 1.00000
1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998
1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001
1.00001
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2:-0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4:-0.000-0.000-0.000
Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260913185738117947.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260913185738117947.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260913185738117947.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260913185738117947.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1540
First residue number = 1
Last residue number = 385
Number of atoms found = 12288
Mean number per residue = 8.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5264
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7447
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7479
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9403
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.236
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.140
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.148
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.398
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.446
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.949
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.456
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.468
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.749
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.335
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.360
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.382
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.327
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.127
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.404
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.415
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.448
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.825
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.984
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.112
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.138
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.653
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.824
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.863
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.997
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.33
Bfactors> 106 vectors, 36864 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.526400
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= -0.538 for 1540 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.019 +/- 0.02
Bfactors> = 85.197 +/- 8.42
Bfactors> Shiftng-fct= 85.177
Bfactors> Scaling-fct= 414.445
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260913185738117947.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260913185738117947.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 374.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 384.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 385.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 410.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 429.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 433.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 438.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 459.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 477.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 484.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 509.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 541.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 556.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 564.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 579.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 600.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 608.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.2
Chkmod> 106 vectors, 36864 coordinates in file.
Chkmod> That is: 12288 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7419
0.0034 0.9252
0.0034 0.9991
0.0034 0.7684
0.0034 0.8938
0.0034 0.7572
78.7834 0.4717
93.7060 0.4703
93.9071 0.4697
105.2955 0.6517
120.7218 0.7220
158.8486 0.6037
159.1453 0.6002
168.1517 0.2742
169.8263 0.4458
186.4722 0.6657
201.8662 0.4470
202.2163 0.4465
210.2492 0.6619
226.0847 0.2898
226.7357 0.2829
227.3070 0.2412
250.6213 0.6073
268.7822 0.7690
274.7909 0.4529
275.0268 0.4708
275.7333 0.5201
283.6795 0.5503
286.9649 0.6418
289.5826 0.4426
290.1115 0.4509
300.3949 0.3198
322.5592 0.4926
323.2712 0.4993
343.3298 0.5218
345.7766 0.3679
349.8447 0.3715
350.0132 0.3586
357.6774 0.3402
361.6116 0.2430
367.2735 0.3168
368.2354 0.3144
374.8994 0.5985
380.9831 0.2887
384.6790 0.4432
384.9854 0.4363
388.7950 0.4692
395.8577 0.5979
410.3371 0.3066
410.6243 0.3024
413.2006 0.4673
429.7071 0.2573
433.1235 0.5464
438.5344 0.3407
449.1606 0.4660
450.2094 0.4721
451.9086 0.4498
459.2845 0.2893
459.9259 0.2858
464.1367 0.4103
467.5537 0.6972
477.1641 0.4602
478.0282 0.4936
482.6920 0.5233
484.2772 0.4213
484.5206 0.4343
493.5621 0.3332
494.5168 0.3143
496.0642 0.3572
497.9621 0.2996
509.5482 0.5687
516.5578 0.2237
517.3561 0.2270
522.9101 0.3777
526.1695 0.3647
526.8414 0.3630
530.8546 0.3953
532.9605 0.3504
537.1476 0.2577
540.7574 0.4489
541.5200 0.4364
544.0183 0.4546
556.2353 0.4555
561.7197 0.3891
563.2919 0.3939
564.8596 0.3793
568.0859 0.3779
577.9628 0.4001
579.0838 0.4501
581.7248 0.4220
585.0597 0.3561
587.8744 0.5333
596.8319 0.5767
600.5738 0.2776
601.1625 0.4727
602.1424 0.4969
603.5116 0.5089
608.6670 0.3639
609.0543 0.3714
613.2986 0.4667
617.6092 0.4565
626.2356 0.5056
628.4910 0.4754
629.1473 0.4959
632.9776 0.3536
636.2291 0.3553
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260913185738117947 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
making animated gifs
11 models are in 260913185738117947.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260913185738117947 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
making animated gifs
11 models are in 260913185738117947.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260913185738117947 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
making animated gifs
11 models are in 260913185738117947.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260913185738117947 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
making animated gifs
11 models are in 260913185738117947.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260913185738117947 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913185738117947.eigenfacs
260913185738117947.atom
making animated gifs
11 models are in 260913185738117947.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913185738117947.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260913185738117947.10.pdb
260913185738117947.11.pdb
260913185738117947.7.pdb
260913185738117947.8.pdb
260913185738117947.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m21.778s
user 1m21.196s
sys 0m0.531s
rm: cannot remove '260913185738117947.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|