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LOGs for ID: 260913185738117947

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260913185738117947.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260913185738117947.atom to be opened. Openam> File opened: 260913185738117947.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1540 First residue number = 1 Last residue number = 385 Number of atoms found = 12288 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.361696 +/- 20.184525 From: -45.229000 To: 47.812000 = -0.018049 +/- 20.111357 From: -52.155000 To: 50.137000 = -0.611570 +/- 20.062748 From: -48.443000 To: 48.136000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 0.6949 % Filled. Pdbmat> 4721866 non-zero elements. Pdbmat> 516547 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 84.07 +/- 21.24 Maximum number = 127 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 1.033094E+07 Pdbmat> Larger element = 523.051 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1540 non-zero elements, NRBL set to 8 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260913185738117947.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 8 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260913185738117947.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260913185738117947.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 12288 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 8 residue(s) per block. Blocpdb> 1540 residues. Blocpdb> 55 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 63 atoms in block 2 Block first atom: 56 Blocpdb> 68 atoms in block 3 Block first atom: 119 Blocpdb> 57 atoms in block 4 Block first atom: 187 Blocpdb> 55 atoms in block 5 Block first atom: 244 Blocpdb> 58 atoms in block 6 Block first atom: 299 Blocpdb> 59 atoms in block 7 Block first atom: 357 Blocpdb> 66 atoms in block 8 Block first atom: 416 Blocpdb> 52 atoms in block 9 Block first atom: 482 Blocpdb> 65 atoms in block 10 Block first atom: 534 Blocpdb> 60 atoms in block 11 Block first atom: 599 Blocpdb> 68 atoms in block 12 Block first atom: 659 Blocpdb> 60 atoms in block 13 Block first atom: 727 Blocpdb> 70 atoms in block 14 Block first atom: 787 Blocpdb> 65 atoms in block 15 Block first atom: 857 Blocpdb> 70 atoms in block 16 Block first atom: 922 Blocpdb> 58 atoms in block 17 Block first atom: 992 Blocpdb> 66 atoms in block 18 Block first atom: 1050 Blocpdb> 75 atoms in block 19 Block first atom: 1116 Blocpdb> 65 atoms in block 20 Block first atom: 1191 Blocpdb> 57 atoms in block 21 Block first atom: 1256 Blocpdb> 68 atoms in block 22 Block first atom: 1313 Blocpdb> 76 atoms in block 23 Block first atom: 1381 Blocpdb> 65 atoms in block 24 Block first atom: 1457 Blocpdb> 60 atoms in block 25 Block first atom: 1522 Blocpdb> 70 atoms in block 26 Block first atom: 1582 Blocpdb> 66 atoms in block 27 Block first atom: 1652 Blocpdb> 63 atoms in block 28 Block first atom: 1718 Blocpdb> 76 atoms in block 29 Block first atom: 1781 Blocpdb> 65 atoms in block 30 Block first atom: 1857 Blocpdb> 57 atoms in block 31 Block first atom: 1922 Blocpdb> 68 atoms in block 32 Block first atom: 1979 Blocpdb> 62 atoms in block 33 Block first atom: 2047 Blocpdb> 66 atoms in block 34 Block first atom: 2109 Blocpdb> 63 atoms in block 35 Block first atom: 2175 Blocpdb> 58 atoms in block 36 Block first atom: 2238 Blocpdb> 75 atoms in block 37 Block first atom: 2296 Blocpdb> 64 atoms in block 38 Block first atom: 2371 Blocpdb> 65 atoms in block 39 Block first atom: 2435 Blocpdb> 67 atoms in block 40 Block first atom: 2500 Blocpdb> 66 atoms in block 41 Block first atom: 2567 Blocpdb> 73 atoms in block 42 Block first atom: 2633 Blocpdb> 67 atoms in block 43 Block first atom: 2706 Blocpdb> 56 atoms in block 44 Block first atom: 2773 Blocpdb> 57 atoms in block 45 Block first atom: 2829 Blocpdb> 56 atoms in block 46 Block first atom: 2886 Blocpdb> 67 atoms in block 47 Block first atom: 2942 Blocpdb> 56 atoms in block 48 Block first atom: 3009 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 3065 Blocpdb> 55 atoms in block 50 Block first atom: 3073 Blocpdb> 63 atoms in block 51 Block first atom: 3128 Blocpdb> 68 atoms in block 52 Block first atom: 3191 Blocpdb> 57 atoms in block 53 Block first atom: 3259 Blocpdb> 55 atoms in block 54 Block first atom: 3316 Blocpdb> 58 atoms in block 55 Block first atom: 3371 Blocpdb> 59 atoms in block 56 Block first atom: 3429 Blocpdb> 66 atoms in block 57 Block first atom: 3488 Blocpdb> 52 atoms in block 58 Block first atom: 3554 Blocpdb> 65 atoms in block 59 Block first atom: 3606 Blocpdb> 60 atoms in block 60 Block first atom: 3671 Blocpdb> 68 atoms in block 61 Block first atom: 3731 Blocpdb> 60 atoms in block 62 Block first atom: 3799 Blocpdb> 70 atoms in block 63 Block first atom: 3859 Blocpdb> 65 atoms in block 64 Block first atom: 3929 Blocpdb> 70 atoms in block 65 Block first atom: 3994 Blocpdb> 58 atoms in block 66 Block first atom: 4064 Blocpdb> 66 atoms in block 67 Block first atom: 4122 Blocpdb> 75 atoms in block 68 Block first atom: 4188 Blocpdb> 65 atoms in block 69 Block first atom: 4263 Blocpdb> 57 atoms in block 70 Block first atom: 4328 Blocpdb> 68 atoms in block 71 Block first atom: 4385 Blocpdb> 76 atoms in block 72 Block first atom: 4453 Blocpdb> 65 atoms in block 73 Block first atom: 4529 Blocpdb> 60 atoms in block 74 Block first atom: 4594 Blocpdb> 70 atoms in block 75 Block first atom: 4654 Blocpdb> 66 atoms in block 76 Block first atom: 4724 Blocpdb> 63 atoms in block 77 Block first atom: 4790 Blocpdb> 76 atoms in block 78 Block first atom: 4853 Blocpdb> 65 atoms in block 79 Block first atom: 4929 Blocpdb> 57 atoms in block 80 Block first atom: 4994 Blocpdb> 68 atoms in block 81 Block first atom: 5051 Blocpdb> 62 atoms in block 82 Block first atom: 5119 Blocpdb> 66 atoms in block 83 Block first atom: 5181 Blocpdb> 63 atoms in block 84 Block first atom: 5247 Blocpdb> 58 atoms in block 85 Block first atom: 5310 Blocpdb> 75 atoms in block 86 Block first atom: 5368 Blocpdb> 64 atoms in block 87 Block first atom: 5443 Blocpdb> 65 atoms in block 88 Block first atom: 5507 Blocpdb> 67 atoms in block 89 Block first atom: 5572 Blocpdb> 66 atoms in block 90 Block first atom: 5639 Blocpdb> 73 atoms in block 91 Block first atom: 5705 Blocpdb> 67 atoms in block 92 Block first atom: 5778 Blocpdb> 56 atoms in block 93 Block first atom: 5845 Blocpdb> 57 atoms in block 94 Block first atom: 5901 Blocpdb> 56 atoms in block 95 Block first atom: 5958 Blocpdb> 67 atoms in block 96 Block first atom: 6014 Blocpdb> 56 atoms in block 97 Block first atom: 6081 Blocpdb> 8 atoms in block 98 Block first atom: 6137 Blocpdb> 55 atoms in block 99 Block first atom: 6145 Blocpdb> 63 atoms in block 100 Block first atom: 6200 Blocpdb> 68 atoms in block 101 Block first atom: 6263 Blocpdb> 57 atoms in block 102 Block first atom: 6331 Blocpdb> 55 atoms in block 103 Block first atom: 6388 Blocpdb> 58 atoms in block 104 Block first atom: 6443 Blocpdb> 59 atoms in block 105 Block first atom: 6501 Blocpdb> 66 atoms in block 106 Block first atom: 6560 Blocpdb> 52 atoms in block 107 Block first atom: 6626 Blocpdb> 65 atoms in block 108 Block first atom: 6678 Blocpdb> 60 atoms in block 109 Block first atom: 6743 Blocpdb> 68 atoms in block 110 Block first atom: 6803 Blocpdb> 60 atoms in block 111 Block first atom: 6871 Blocpdb> 70 atoms in block 112 Block first atom: 6931 Blocpdb> 65 atoms in block 113 Block first atom: 7001 Blocpdb> 70 atoms in block 114 Block first atom: 7066 Blocpdb> 58 atoms in block 115 Block first atom: 7136 Blocpdb> 66 atoms in block 116 Block first atom: 7194 Blocpdb> 75 atoms in block 117 Block first atom: 7260 Blocpdb> 65 atoms in block 118 Block first atom: 7335 Blocpdb> 57 atoms in block 119 Block first atom: 7400 Blocpdb> 68 atoms in block 120 Block first atom: 7457 Blocpdb> 76 atoms in block 121 Block first atom: 7525 Blocpdb> 65 atoms in block 122 Block first atom: 7601 Blocpdb> 60 atoms in block 123 Block first atom: 7666 Blocpdb> 70 atoms in block 124 Block first atom: 7726 Blocpdb> 66 atoms in block 125 Block first atom: 7796 Blocpdb> 63 atoms in block 126 Block first atom: 7862 Blocpdb> 76 atoms in block 127 Block first atom: 7925 Blocpdb> 65 atoms in block 128 Block first atom: 8001 Blocpdb> 57 atoms in block 129 Block first atom: 8066 Blocpdb> 68 atoms in block 130 Block first atom: 8123 Blocpdb> 62 atoms in block 131 Block first atom: 8191 Blocpdb> 66 atoms in block 132 Block first atom: 8253 Blocpdb> 63 atoms in block 133 Block first atom: 8319 Blocpdb> 58 atoms in block 134 Block first atom: 8382 Blocpdb> 75 atoms in block 135 Block first atom: 8440 Blocpdb> 64 atoms in block 136 Block first atom: 8515 Blocpdb> 65 atoms in block 137 Block first atom: 8579 Blocpdb> 67 atoms in block 138 Block first atom: 8644 Blocpdb> 66 atoms in block 139 Block first atom: 8711 Blocpdb> 73 atoms in block 140 Block first atom: 8777 Blocpdb> 67 atoms in block 141 Block first atom: 8850 Blocpdb> 56 atoms in block 142 Block first atom: 8917 Blocpdb> 57 atoms in block 143 Block first atom: 8973 Blocpdb> 56 atoms in block 144 Block first atom: 9030 Blocpdb> 67 atoms in block 145 Block first atom: 9086 Blocpdb> 56 atoms in block 146 Block first atom: 9153 Blocpdb> 8 atoms in block 147 Block first atom: 9209 Blocpdb> 55 atoms in block 148 Block first atom: 9217 Blocpdb> 63 atoms in block 149 Block first atom: 9272 Blocpdb> 68 atoms in block 150 Block first atom: 9335 Blocpdb> 57 atoms in block 151 Block first atom: 9403 Blocpdb> 55 atoms in block 152 Block first atom: 9460 Blocpdb> 58 atoms in block 153 Block first atom: 9515 Blocpdb> 59 atoms in block 154 Block first atom: 9573 Blocpdb> 66 atoms in block 155 Block first atom: 9632 Blocpdb> 52 atoms in block 156 Block first atom: 9698 Blocpdb> 65 atoms in block 157 Block first atom: 9750 Blocpdb> 60 atoms in block 158 Block first atom: 9815 Blocpdb> 68 atoms in block 159 Block first atom: 9875 Blocpdb> 60 atoms in block 160 Block first atom: 9943 Blocpdb> 70 atoms in block 161 Block first atom: 10003 Blocpdb> 65 atoms in block 162 Block first atom: 10073 Blocpdb> 70 atoms in block 163 Block first atom: 10138 Blocpdb> 58 atoms in block 164 Block first atom: 10208 Blocpdb> 66 atoms in block 165 Block first atom: 10266 Blocpdb> 75 atoms in block 166 Block first atom: 10332 Blocpdb> 65 atoms in block 167 Block first atom: 10407 Blocpdb> 57 atoms in block 168 Block first atom: 10472 Blocpdb> 68 atoms in block 169 Block first atom: 10529 Blocpdb> 76 atoms in block 170 Block first atom: 10597 Blocpdb> 65 atoms in block 171 Block first atom: 10673 Blocpdb> 60 atoms in block 172 Block first atom: 10738 Blocpdb> 70 atoms in block 173 Block first atom: 10798 Blocpdb> 66 atoms in block 174 Block first atom: 10868 Blocpdb> 63 atoms in block 175 Block first atom: 10934 Blocpdb> 76 atoms in block 176 Block first atom: 10997 Blocpdb> 65 atoms in block 177 Block first atom: 11073 Blocpdb> 57 atoms in block 178 Block first atom: 11138 Blocpdb> 68 atoms in block 179 Block first atom: 11195 Blocpdb> 62 atoms in block 180 Block first atom: 11263 Blocpdb> 66 atoms in block 181 Block first atom: 11325 Blocpdb> 63 atoms in block 182 Block first atom: 11391 Blocpdb> 58 atoms in block 183 Block first atom: 11454 Blocpdb> 75 atoms in block 184 Block first atom: 11512 Blocpdb> 64 atoms in block 185 Block first atom: 11587 Blocpdb> 65 atoms in block 186 Block first atom: 11651 Blocpdb> 67 atoms in block 187 Block first atom: 11716 Blocpdb> 66 atoms in block 188 Block first atom: 11783 Blocpdb> 73 atoms in block 189 Block first atom: 11849 Blocpdb> 67 atoms in block 190 Block first atom: 11922 Blocpdb> 56 atoms in block 191 Block first atom: 11989 Blocpdb> 57 atoms in block 192 Block first atom: 12045 Blocpdb> 56 atoms in block 193 Block first atom: 12102 Blocpdb> 67 atoms in block 194 Block first atom: 12158 Blocpdb> 56 atoms in block 195 Block first atom: 12225 Blocpdb> 8 atoms in block 196 Block first atom: 12280 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 76 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 4722062 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 36864 Prepmat> Matrix trace = 10330940.0000 Prepmat> Last element read: 36864 36864 277.8338 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17841 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 12288 RTB> Total mass = 12288.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 12288 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 190184.4324 RTB> 49800 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 49800 Diagstd> Projected matrix trace = 190184.4324 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 190184.4324 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5264399 0.7447460 0.7479337 0.9402701 1.2358954 2.1399227 2.1476609 2.3976161 2.4459660 2.9488987 3.4560852 3.4681327 3.7493270 4.3354106 4.3604383 4.3819962 5.3273538 6.1268165 6.4035860 6.4147180 6.4479367 6.8249682 6.9841217 7.1115403 7.1376675 7.6530992 8.8240500 8.8631761 9.9972659 10.1362804 10.3789115 10.3904929 10.8476484 11.0860850 11.4360771 11.4952030 11.9193560 12.3085893 12.5451519 12.5703722 12.8213351 13.2873803 14.2791497 14.3041767 14.4845251 15.6576900 15.9093496 16.3085614 17.1111242 17.1850026 17.3153831 17.8886367 17.9421763 18.2707180 18.5434147 19.3108796 19.3803733 19.7556423 19.8899866 19.9140174 20.6638706 20.7392065 20.8657569 21.0271663 22.0240374 22.6258030 22.6996216 23.1881702 23.4761132 23.5423004 23.8959353 24.0913912 24.4696397 24.7985076 24.8679548 25.1014662 26.2372972 26.7596508 26.9133372 27.0571433 27.3712285 28.3296465 28.4355599 28.6976076 29.0304478 29.3132778 30.2078369 30.5936176 30.6493156 30.7455039 30.8861191 31.4247708 31.4631270 31.9043686 32.3515717 33.2575610 33.4971177 33.5679031 33.9760878 34.3263065 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034335 0.0034337 0.0034341 0.0034345 0.0034350 0.0034352 78.7897390 93.7128985 93.9132433 105.2983575 120.7219198 158.8525972 159.1395528 168.1454422 169.8323768 186.4769707 201.8773061 202.2288604 210.2673975 226.1051194 226.7568174 227.3166655 250.6403855 268.7897583 274.7937840 275.0325307 275.7437409 283.6910246 286.9797009 289.5857045 290.1171737 300.4096999 322.5739258 323.2882871 343.3490904 345.7280270 349.8413863 350.0365176 357.6539955 361.5633339 367.2263351 368.1744123 374.9053829 380.9775817 384.6212206 385.0076410 388.8319159 395.8357025 410.3424567 410.7019019 413.2828763 429.6938379 433.1332189 438.5338349 449.1946266 450.1632957 451.8677359 459.2867355 459.9735304 464.1657464 467.6168322 477.1954655 478.0533316 482.6594983 484.2978330 484.5903058 493.6295129 494.5285259 496.0350349 497.9499063 509.6168132 516.5320585 517.3739866 522.9118937 526.1485494 526.8897247 530.8322467 532.9987865 537.1666817 540.7643501 541.5210152 544.0575298 556.2305365 561.7401958 563.3509835 564.8540558 568.1230701 577.9840552 579.0634747 581.7255333 585.0892886 587.9325058 596.8361145 600.6350856 601.1815873 602.1242077 603.4995504 608.7392991 609.1106907 613.3669302 617.6507490 626.2395302 628.4909091 629.1546153 632.9683071 636.2221992 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 12288 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5264 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7447 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7479 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.236 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.140 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.148 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.398 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.446 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.949 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.456 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.468 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.749 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.335 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.360 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.382 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.327 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.127 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.404 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.415 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.448 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.825 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.984 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.112 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.138 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.653 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.824 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.863 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.997 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.33 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00005 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 221184 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 1.00000 1.00003 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 0.99998 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 1.00002 1.00005 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260913185738117947.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260913185738117947.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260913185738117947.atom Openam> file on opening on unit 11: 260913185738117947.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1540 First residue number = 1 Last residue number = 385 Number of atoms found = 12288 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9975E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5264 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7447 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7479 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.236 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.140 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.148 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.398 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.446 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.949 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.456 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.468 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.749 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.335 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.360 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.382 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.327 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.127 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.404 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.415 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.448 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.825 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.984 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.112 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.138 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.653 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.863 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.997 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.33 Bfactors> 106 vectors, 36864 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.526400 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.538 for 1540 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.02 Bfactors> = 85.197 +/- 8.42 Bfactors> Shiftng-fct= 85.177 Bfactors> Scaling-fct= 414.445 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260913185738117947.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260913185738117947.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 78.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 120.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 168.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 169.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 226.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 227.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 283.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 290.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 300.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 323.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 343.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 349.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 12288 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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../../bin/get_modes.sh 260913185738117947 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260913185738117947.eigenfacs 260913185738117947.atom 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