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***  PROTEIN FIBRIL 27-JUN-18 6A6B  ***

LOGs for ID: 260913220433158305

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260913220433158305.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260913220433158305.atom to be opened. Openam> File opened: 260913220433158305.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 756 First residue number = 37 Last residue number = 99 Number of atoms found = 5256 Mean number per residue = 7.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 132.056476 +/- 17.138821 From: 87.966000 To: 176.025000 = 131.976670 +/- 22.468285 From: 77.686000 To: 186.168000 = 131.373468 +/- 8.405653 From: 114.578000 To: 148.149000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.6051 % Filled. Pdbmat> 1995509 non-zero elements. Pdbmat> 218262 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.05 +/- 21.40 Maximum number = 126 Minimum number = 17 Pdbmat> Matrix trace = 4.365240E+06 Pdbmat> Larger element = 458.754 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 756 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260913220433158305.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260913220433158305.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260913220433158305.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5256 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 756 residues. Blocpdb> 34 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 26 atoms in block 2 Block first atom: 35 Blocpdb> 29 atoms in block 3 Block first atom: 61 Blocpdb> 28 atoms in block 4 Block first atom: 90 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 118 Blocpdb> 34 atoms in block 6 Block first atom: 142 Blocpdb> 32 atoms in block 7 Block first atom: 176 Blocpdb> 23 atoms in block 8 Block first atom: 208 Blocpdb> 26 atoms in block 9 Block first atom: 231 Blocpdb> 23 atoms in block 10 Block first atom: 257 Blocpdb> 30 atoms in block 11 Block first atom: 280 Blocpdb> 27 atoms in block 12 Block first atom: 310 Blocpdb> 23 atoms in block 13 Block first atom: 337 Blocpdb> 22 atoms in block 14 Block first atom: 360 Blocpdb> 31 atoms in block 15 Block first atom: 382 Blocpdb> 26 atoms in block 16 Block first atom: 413 Blocpdb> 34 atoms in block 17 Block first atom: 439 Blocpdb> 26 atoms in block 18 Block first atom: 473 Blocpdb> 29 atoms in block 19 Block first atom: 499 Blocpdb> 28 atoms in block 20 Block first atom: 528 Blocpdb> 24 atoms in block 21 Block first atom: 556 Blocpdb> 34 atoms in block 22 Block first atom: 580 Blocpdb> 32 atoms in block 23 Block first atom: 614 Blocpdb> 23 atoms in block 24 Block first atom: 646 Blocpdb> 26 atoms in block 25 Block first atom: 669 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 695 Blocpdb> 30 atoms in block 27 Block first atom: 718 Blocpdb> 27 atoms in block 28 Block first atom: 748 Blocpdb> 23 atoms in block 29 Block first atom: 775 Blocpdb> 22 atoms in block 30 Block first atom: 798 Blocpdb> 31 atoms in block 31 Block first atom: 820 Blocpdb> 26 atoms in block 32 Block first atom: 851 Blocpdb> 34 atoms in block 33 Block first atom: 877 Blocpdb> 26 atoms in block 34 Block first atom: 911 Blocpdb> 29 atoms in block 35 Block first atom: 937 Blocpdb> 28 atoms in block 36 Block first atom: 966 Blocpdb> 24 atoms in block 37 Block first atom: 994 Blocpdb> 34 atoms in block 38 Block first atom: 1018 Blocpdb> 32 atoms in block 39 Block first atom: 1052 Blocpdb> 23 atoms in block 40 Block first atom: 1084 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 1107 Blocpdb> 23 atoms in block 42 Block first atom: 1133 Blocpdb> 30 atoms in block 43 Block first atom: 1156 Blocpdb> 27 atoms in block 44 Block first atom: 1186 Blocpdb> 23 atoms in block 45 Block first atom: 1213 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 1236 Blocpdb> 31 atoms in block 47 Block first atom: 1258 Blocpdb> 26 atoms in block 48 Block first atom: 1289 Blocpdb> 34 atoms in block 49 Block first atom: 1315 Blocpdb> 26 atoms in block 50 Block first atom: 1349 Blocpdb> 29 atoms in block 51 Block first atom: 1375 Blocpdb> 28 atoms in block 52 Block first atom: 1404 Blocpdb> 24 atoms in block 53 Block first atom: 1432 Blocpdb> 34 atoms in block 54 Block first atom: 1456 Blocpdb> 32 atoms in block 55 Block first atom: 1490 Blocpdb> 23 atoms in block 56 Block first atom: 1522 Blocpdb> 26 atoms in block 57 Block first atom: 1545 Blocpdb> 23 atoms in block 58 Block first atom: 1571 Blocpdb> 30 atoms in block 59 Block first atom: 1594 Blocpdb> 27 atoms in block 60 Block first atom: 1624 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1651 Blocpdb> 22 atoms in block 62 Block first atom: 1674 Blocpdb> 31 atoms in block 63 Block first atom: 1696 Blocpdb> 26 atoms in block 64 Block first atom: 1727 Blocpdb> 34 atoms in block 65 Block first atom: 1753 Blocpdb> 26 atoms in block 66 Block first atom: 1787 Blocpdb> 29 atoms in block 67 Block first atom: 1813 Blocpdb> 28 atoms in block 68 Block first atom: 1842 Blocpdb> 24 atoms in block 69 Block first atom: 1870 Blocpdb> 34 atoms in block 70 Block first atom: 1894 Blocpdb> 32 atoms in block 71 Block first atom: 1928 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1960 Blocpdb> 26 atoms in block 73 Block first atom: 1983 Blocpdb> 23 atoms in block 74 Block first atom: 2009 Blocpdb> 30 atoms in block 75 Block first atom: 2032 Blocpdb> 27 atoms in block 76 Block first atom: 2062 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 2089 Blocpdb> 22 atoms in block 78 Block first atom: 2112 Blocpdb> 31 atoms in block 79 Block first atom: 2134 Blocpdb> 26 atoms in block 80 Block first atom: 2165 Blocpdb> 34 atoms in block 81 Block first atom: 2191 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 2225 Blocpdb> 29 atoms in block 83 Block first atom: 2251 Blocpdb> 28 atoms in block 84 Block first atom: 2280 Blocpdb> 24 atoms in block 85 Block first atom: 2308 Blocpdb> 34 atoms in block 86 Block first atom: 2332 Blocpdb> 32 atoms in block 87 Block first atom: 2366 Blocpdb> 23 atoms in block 88 Block first atom: 2398 Blocpdb> 26 atoms in block 89 Block first atom: 2421 Blocpdb> 23 atoms in block 90 Block first atom: 2447 Blocpdb> 30 atoms in block 91 Block first atom: 2470 Blocpdb> 27 atoms in block 92 Block first atom: 2500 Blocpdb> 23 atoms in block 93 Block first atom: 2527 Blocpdb> 22 atoms in block 94 Block first atom: 2550 Blocpdb> 31 atoms in block 95 Block first atom: 2572 Blocpdb> 26 atoms in block 96 Block first atom: 2603 Blocpdb> 34 atoms in block 97 Block first atom: 2629 Blocpdb> 26 atoms in block 98 Block first atom: 2663 Blocpdb> 29 atoms in block 99 Block first atom: 2689 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 2718 Blocpdb> 24 atoms in block 101 Block first atom: 2746 Blocpdb> 34 atoms in block 102 Block first atom: 2770 Blocpdb> 32 atoms in block 103 Block first atom: 2804 Blocpdb> 23 atoms in block 104 Block first atom: 2836 Blocpdb> 26 atoms in block 105 Block first atom: 2859 Blocpdb> 23 atoms in block 106 Block first atom: 2885 Blocpdb> 30 atoms in block 107 Block first atom: 2908 Blocpdb> 27 atoms in block 108 Block first atom: 2938 Blocpdb> 23 atoms in block 109 Block first atom: 2965 Blocpdb> 22 atoms in block 110 Block first atom: 2988 Blocpdb> 31 atoms in block 111 Block first atom: 3010 Blocpdb> 26 atoms in block 112 Block first atom: 3041 Blocpdb> 34 atoms in block 113 Block first atom: 3067 Blocpdb> 26 atoms in block 114 Block first atom: 3101 Blocpdb> 29 atoms in block 115 Block first atom: 3127 Blocpdb> 28 atoms in block 116 Block first atom: 3156 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 3184 Blocpdb> 34 atoms in block 118 Block first atom: 3208 Blocpdb> 32 atoms in block 119 Block first atom: 3242 Blocpdb> 23 atoms in block 120 Block first atom: 3274 Blocpdb> 26 atoms in block 121 Block first atom: 3297 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 3323 Blocpdb> 30 atoms in block 123 Block first atom: 3346 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 3376 Blocpdb> 23 atoms in block 125 Block first atom: 3403 Blocpdb> 22 atoms in block 126 Block first atom: 3426 Blocpdb> 31 atoms in block 127 Block first atom: 3448 Blocpdb> 26 atoms in block 128 Block first atom: 3479 Blocpdb> 34 atoms in block 129 Block first atom: 3505 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 3539 Blocpdb> 29 atoms in block 131 Block first atom: 3565 Blocpdb> 28 atoms in block 132 Block first atom: 3594 Blocpdb> 24 atoms in block 133 Block first atom: 3622 Blocpdb> 34 atoms in block 134 Block first atom: 3646 Blocpdb> 32 atoms in block 135 Block first atom: 3680 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 3712 Blocpdb> 26 atoms in block 137 Block first atom: 3735 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3761 Blocpdb> 30 atoms in block 139 Block first atom: 3784 Blocpdb> 27 atoms in block 140 Block first atom: 3814 Blocpdb> 23 atoms in block 141 Block first atom: 3841 Blocpdb> 22 atoms in block 142 Block first atom: 3864 Blocpdb> 31 atoms in block 143 Block first atom: 3886 Blocpdb> 26 atoms in block 144 Block first atom: 3917 Blocpdb> 34 atoms in block 145 Block first atom: 3943 Blocpdb> 26 atoms in block 146 Block first atom: 3977 Blocpdb> 29 atoms in block 147 Block first atom: 4003 Blocpdb> 28 atoms in block 148 Block first atom: 4032 Blocpdb> 24 atoms in block 149 Block first atom: 4060 Blocpdb> 34 atoms in block 150 Block first atom: 4084 Blocpdb> 32 atoms in block 151 Block first atom: 4118 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 4150 Blocpdb> 26 atoms in block 153 Block first atom: 4173 Blocpdb> 23 atoms in block 154 Block first atom: 4199 Blocpdb> 30 atoms in block 155 Block first atom: 4222 Blocpdb> 27 atoms in block 156 Block first atom: 4252 Blocpdb> 23 atoms in block 157 Block first atom: 4279 Blocpdb> 22 atoms in block 158 Block first atom: 4302 Blocpdb> 31 atoms in block 159 Block first atom: 4324 Blocpdb> 26 atoms in block 160 Block first atom: 4355 Blocpdb> 34 atoms in block 161 Block first atom: 4381 Blocpdb> 26 atoms in block 162 Block first atom: 4415 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 4441 Blocpdb> 28 atoms in block 164 Block first atom: 4470 Blocpdb> 24 atoms in block 165 Block first atom: 4498 Blocpdb> 34 atoms in block 166 Block first atom: 4522 Blocpdb> 32 atoms in block 167 Block first atom: 4556 Blocpdb> 23 atoms in block 168 Block first atom: 4588 Blocpdb> 26 atoms in block 169 Block first atom: 4611 Blocpdb> 23 atoms in block 170 Block first atom: 4637 Blocpdb> 30 atoms in block 171 Block first atom: 4660 Blocpdb> 27 atoms in block 172 Block first atom: 4690 Blocpdb> 23 atoms in block 173 Block first atom: 4717 Blocpdb> 22 atoms in block 174 Block first atom: 4740 Blocpdb> 31 atoms in block 175 Block first atom: 4762 Blocpdb> 26 atoms in block 176 Block first atom: 4793 Blocpdb> 34 atoms in block 177 Block first atom: 4819 Blocpdb> 26 atoms in block 178 Block first atom: 4853 Blocpdb> 29 atoms in block 179 Block first atom: 4879 Blocpdb> 28 atoms in block 180 Block first atom: 4908 Blocpdb> 24 atoms in block 181 Block first atom: 4936 Blocpdb> 34 atoms in block 182 Block first atom: 4960 Blocpdb> 32 atoms in block 183 Block first atom: 4994 Blocpdb> 23 atoms in block 184 Block first atom: 5026 Blocpdb> 26 atoms in block 185 Block first atom: 5049 Blocpdb> 23 atoms in block 186 Block first atom: 5075 Blocpdb> 30 atoms in block 187 Block first atom: 5098 Blocpdb> 27 atoms in block 188 Block first atom: 5128 Blocpdb> 23 atoms in block 189 Block first atom: 5155 Blocpdb> 22 atoms in block 190 Block first atom: 5178 Blocpdb> 31 atoms in block 191 Block first atom: 5200 Blocpdb> 26 atoms in block 192 Block first atom: 5230 Blocpdb> 192 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 22 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1995701 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 15768 Prepmat> Matrix trace = 4365240.0000 Prepmat> Last element read: 15768 15768 54.3909 Prepmat> 18529 lines saved. Prepmat> 16673 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5256 RTB> Total mass = 5256.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5256 RTB> Number of blocks = 192 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 248411.8917 RTB> 63900 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1152 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63900 Diagstd> Projected matrix trace = 248411.8917 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1152 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 248411.8917 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5835918 0.6393461 0.6870964 0.6933519 0.9667669 1.1137483 1.4894799 1.5408330 1.7427204 1.8981456 2.0498753 2.6665519 3.2791232 3.4557271 4.9778380 5.3206245 6.3267910 6.3579378 6.3649270 6.8860545 6.9001199 7.5103755 9.1749859 9.9518224 10.0757969 10.8501156 11.1408276 11.3348915 11.4838136 12.2118533 12.8323525 12.9339002 13.4021837 14.6924804 15.2066172 16.3602879 17.1075087 18.0663664 18.3044983 18.7622910 18.9641266 19.5318456 20.2775394 20.7769757 20.8783849 21.2898019 21.5395835 21.9096578 22.3695000 22.9334504 23.2000094 23.5846247 23.7296330 24.5459314 25.8650090 26.5776868 26.7827706 27.2534706 27.5663417 27.7645300 28.3949546 29.0446623 29.5510838 29.8229978 29.9779750 30.5181444 30.7721306 31.0484900 32.3637543 32.9407393 33.0184290 33.4050851 34.4472463 34.8597186 35.0333420 36.2789805 37.4608629 37.5314388 37.9055284 38.3199903 38.3953728 38.9842360 39.3485338 39.9087321 40.1233992 40.7871838 41.0280430 41.3971817 41.7070784 41.9152186 42.1891946 42.3576779 43.6237810 43.7113016 44.3119851 44.8393736 44.9206839 45.5413420 45.8499487 46.8546412 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034316 0.0034318 0.0034326 0.0034336 0.0034342 0.0034342 82.9563954 86.8287008 90.0127688 90.4215873 106.7717041 114.6011080 132.5295134 134.7947779 143.3537769 149.6098004 155.4744391 177.3251369 196.6410334 201.8668483 242.2789363 250.4820358 273.1410820 273.8125918 273.9630516 284.9577731 285.2486500 297.5953266 328.9258331 342.5678393 344.6949992 357.6946658 362.4549259 365.5981287 367.9919739 379.4775340 388.9989424 390.5350639 397.5420420 416.2390684 423.4592139 439.2287423 449.1471670 461.5626803 464.5946403 470.3684828 472.8917124 479.9178698 488.9932984 494.9786263 496.1851125 501.0500271 503.9807298 508.2917700 513.5981126 520.0318941 523.0453685 527.3631323 528.9818743 538.0034223 552.2701845 559.8270384 561.9828091 566.8996487 570.1443797 572.1902365 578.6498827 585.2325137 590.3125104 593.0221680 594.5610111 599.8937570 602.3848822 605.0837950 617.7670323 623.2495183 623.9840426 627.6269321 637.3419953 641.1464156 642.7410899 654.0678728 664.6364706 665.2622607 668.5694960 672.2146540 672.8755141 678.0157681 681.1763440 686.0081029 687.8506306 693.5170459 695.5617340 698.6837913 701.2940663 703.0418016 705.3357512 706.7427335 717.2274989 717.9466109 722.8628130 727.1517414 727.8107399 732.8214829 735.3002394 743.3127610 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5256 Rtb_to_modes> Number of blocs = 192 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9865E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5836 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6871 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6934 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9668 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.114 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.489 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.541 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.743 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.898 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.050 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.667 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.279 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.456 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.978 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.321 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.327 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.358 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.365 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.886 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.900 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.510 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.175 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.952 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.85 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99996 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 1.00005 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 94608 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99996 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001 1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000 1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 1.00005 1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00004 0.99997 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260913220433158305.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260913220433158305.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260913220433158305.atom Openam> file on opening on unit 11: 260913220433158305.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 756 First residue number = 37 Last residue number = 99 Number of atoms found = 5256 Mean number per residue = 7.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9865E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5836 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6871 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6934 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9668 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.489 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.541 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.743 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.898 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.050 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.667 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.279 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.456 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.978 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.321 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.327 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.358 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.365 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.886 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.900 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.510 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.175 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.952 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.85 Bfactors> 106 vectors, 15768 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.583600 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.796 for 756 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.039 +/- 0.06 Bfactors> = 106.662 +/- 23.68 Bfactors> Shiftng-fct= 106.623 Bfactors> Scaling-fct= 393.551 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260913220433158305.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260913220433158305.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2 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Chkmod> That is: 5256 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9282 0.0034 0.9560 0.0034 0.9003 0.0034 0.7427 0.0034 0.7108 0.0034 0.6632 82.9534 0.3111 86.8218 0.2942 90.0091 0.3122 90.4208 0.1132 106.7689 0.4162 114.6091 0.4808 132.5025 0.1084 134.7963 0.0680 143.3591 0.3085 149.5976 0.1366 155.4725 0.2689 177.3324 0.7087 196.6289 0.5081 201.8662 0.5838 242.2725 0.6586 250.4801 0.7130 273.1339 0.4452 273.8022 0.0563 273.9529 0.0552 284.9444 0.2057 285.2339 0.2168 297.5751 0.5948 328.9120 0.4064 342.5562 0.3947 344.7521 0.5419 357.6774 0.5537 362.4259 0.2879 365.5035 0.1967 367.9151 0.2728 379.4324 0.5045 388.9466 0.7577 390.4594 0.5359 397.4926 0.5321 416.1861 0.5329 423.4881 0.6540 439.2060 0.4386 449.1606 0.3400 461.5893 0.4047 464.5176 0.5487 470.3196 0.4133 472.8200 0.4234 479.8746 0.5417 489.0020 0.6267 494.9934 0.4369 496.1830 0.1358 501.0308 0.4107 503.9640 0.1107 508.2739 0.6220 513.5818 0.4068 519.9705 0.1996 523.0228 0.3431 527.2888 0.2350 528.9633 0.0940 538.0249 0.4091 552.2998 0.5496 559.8274 0.5049 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260913220433158305.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260913220433158305.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260913220433158305 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260913220433158305 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260913220433158305.eigenfacs 260913220433158305.atom 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