***  PROTEIN FIBRIL 27-JUN-18 6A6B  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260913220433158305.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260913220433158305.atom to be opened.
Openam> File opened: 260913220433158305.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 756
First residue number = 37
Last residue number = 99
Number of atoms found = 5256
Mean number per residue = 7.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 132.056476 +/- 17.138821 From: 87.966000 To: 176.025000
= 131.976670 +/- 22.468285 From: 77.686000 To: 186.168000
= 131.373468 +/- 8.405653 From: 114.578000 To: 148.149000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.6051 % Filled.
Pdbmat> 1995509 non-zero elements.
Pdbmat> 218262 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 83.05 +/- 21.40
Maximum number = 126
Minimum number = 17
Pdbmat> Matrix trace = 4.365240E+06
Pdbmat> Larger element = 458.754
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
756 non-zero elements, NRBL set to 4
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260913220433158305.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 4
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260913220433158305.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260913220433158305.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 5256 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 4 residue(s) per block.
Blocpdb> 756 residues.
Blocpdb> 34 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 26 atoms in block 2
Block first atom: 35
Blocpdb> 29 atoms in block 3
Block first atom: 61
Blocpdb> 28 atoms in block 4
Block first atom: 90
Blocpdb> 24 atoms in block 5
Block first atom: 118
Blocpdb> 34 atoms in block 6
Block first atom: 142
Blocpdb> 32 atoms in block 7
Block first atom: 176
Blocpdb> 23 atoms in block 8
Block first atom: 208
Blocpdb> 26 atoms in block 9
Block first atom: 231
Blocpdb> 23 atoms in block 10
Block first atom: 257
Blocpdb> 30 atoms in block 11
Block first atom: 280
Blocpdb> 27 atoms in block 12
Block first atom: 310
Blocpdb> 23 atoms in block 13
Block first atom: 337
Blocpdb> 22 atoms in block 14
Block first atom: 360
Blocpdb> 31 atoms in block 15
Block first atom: 382
Blocpdb> 26 atoms in block 16
Block first atom: 413
Blocpdb> 34 atoms in block 17
Block first atom: 439
Blocpdb> 26 atoms in block 18
Block first atom: 473
Blocpdb> 29 atoms in block 19
Block first atom: 499
Blocpdb> 28 atoms in block 20
Block first atom: 528
Blocpdb> 24 atoms in block 21
Block first atom: 556
Blocpdb> 34 atoms in block 22
Block first atom: 580
Blocpdb> 32 atoms in block 23
Block first atom: 614
Blocpdb> 23 atoms in block 24
Block first atom: 646
Blocpdb> 26 atoms in block 25
Block first atom: 669
Blocpdb> 23 atoms in block 26
Block first atom: 695
Blocpdb> 30 atoms in block 27
Block first atom: 718
Blocpdb> 27 atoms in block 28
Block first atom: 748
Blocpdb> 23 atoms in block 29
Block first atom: 775
Blocpdb> 22 atoms in block 30
Block first atom: 798
Blocpdb> 31 atoms in block 31
Block first atom: 820
Blocpdb> 26 atoms in block 32
Block first atom: 851
Blocpdb> 34 atoms in block 33
Block first atom: 877
Blocpdb> 26 atoms in block 34
Block first atom: 911
Blocpdb> 29 atoms in block 35
Block first atom: 937
Blocpdb> 28 atoms in block 36
Block first atom: 966
Blocpdb> 24 atoms in block 37
Block first atom: 994
Blocpdb> 34 atoms in block 38
Block first atom: 1018
Blocpdb> 32 atoms in block 39
Block first atom: 1052
Blocpdb> 23 atoms in block 40
Block first atom: 1084
Blocpdb> 26 atoms in block 41
Block first atom: 1107
Blocpdb> 23 atoms in block 42
Block first atom: 1133
Blocpdb> 30 atoms in block 43
Block first atom: 1156
Blocpdb> 27 atoms in block 44
Block first atom: 1186
Blocpdb> 23 atoms in block 45
Block first atom: 1213
Blocpdb> 22 atoms in block 46
Block first atom: 1236
Blocpdb> 31 atoms in block 47
Block first atom: 1258
Blocpdb> 26 atoms in block 48
Block first atom: 1289
Blocpdb> 34 atoms in block 49
Block first atom: 1315
Blocpdb> 26 atoms in block 50
Block first atom: 1349
Blocpdb> 29 atoms in block 51
Block first atom: 1375
Blocpdb> 28 atoms in block 52
Block first atom: 1404
Blocpdb> 24 atoms in block 53
Block first atom: 1432
Blocpdb> 34 atoms in block 54
Block first atom: 1456
Blocpdb> 32 atoms in block 55
Block first atom: 1490
Blocpdb> 23 atoms in block 56
Block first atom: 1522
Blocpdb> 26 atoms in block 57
Block first atom: 1545
Blocpdb> 23 atoms in block 58
Block first atom: 1571
Blocpdb> 30 atoms in block 59
Block first atom: 1594
Blocpdb> 27 atoms in block 60
Block first atom: 1624
Blocpdb> 23 atoms in block 61
Block first atom: 1651
Blocpdb> 22 atoms in block 62
Block first atom: 1674
Blocpdb> 31 atoms in block 63
Block first atom: 1696
Blocpdb> 26 atoms in block 64
Block first atom: 1727
Blocpdb> 34 atoms in block 65
Block first atom: 1753
Blocpdb> 26 atoms in block 66
Block first atom: 1787
Blocpdb> 29 atoms in block 67
Block first atom: 1813
Blocpdb> 28 atoms in block 68
Block first atom: 1842
Blocpdb> 24 atoms in block 69
Block first atom: 1870
Blocpdb> 34 atoms in block 70
Block first atom: 1894
Blocpdb> 32 atoms in block 71
Block first atom: 1928
Blocpdb> 23 atoms in block 72
Block first atom: 1960
Blocpdb> 26 atoms in block 73
Block first atom: 1983
Blocpdb> 23 atoms in block 74
Block first atom: 2009
Blocpdb> 30 atoms in block 75
Block first atom: 2032
Blocpdb> 27 atoms in block 76
Block first atom: 2062
Blocpdb> 23 atoms in block 77
Block first atom: 2089
Blocpdb> 22 atoms in block 78
Block first atom: 2112
Blocpdb> 31 atoms in block 79
Block first atom: 2134
Blocpdb> 26 atoms in block 80
Block first atom: 2165
Blocpdb> 34 atoms in block 81
Block first atom: 2191
Blocpdb> 26 atoms in block 82
Block first atom: 2225
Blocpdb> 29 atoms in block 83
Block first atom: 2251
Blocpdb> 28 atoms in block 84
Block first atom: 2280
Blocpdb> 24 atoms in block 85
Block first atom: 2308
Blocpdb> 34 atoms in block 86
Block first atom: 2332
Blocpdb> 32 atoms in block 87
Block first atom: 2366
Blocpdb> 23 atoms in block 88
Block first atom: 2398
Blocpdb> 26 atoms in block 89
Block first atom: 2421
Blocpdb> 23 atoms in block 90
Block first atom: 2447
Blocpdb> 30 atoms in block 91
Block first atom: 2470
Blocpdb> 27 atoms in block 92
Block first atom: 2500
Blocpdb> 23 atoms in block 93
Block first atom: 2527
Blocpdb> 22 atoms in block 94
Block first atom: 2550
Blocpdb> 31 atoms in block 95
Block first atom: 2572
Blocpdb> 26 atoms in block 96
Block first atom: 2603
Blocpdb> 34 atoms in block 97
Block first atom: 2629
Blocpdb> 26 atoms in block 98
Block first atom: 2663
Blocpdb> 29 atoms in block 99
Block first atom: 2689
Blocpdb> 28 atoms in block 100
Block first atom: 2718
Blocpdb> 24 atoms in block 101
Block first atom: 2746
Blocpdb> 34 atoms in block 102
Block first atom: 2770
Blocpdb> 32 atoms in block 103
Block first atom: 2804
Blocpdb> 23 atoms in block 104
Block first atom: 2836
Blocpdb> 26 atoms in block 105
Block first atom: 2859
Blocpdb> 23 atoms in block 106
Block first atom: 2885
Blocpdb> 30 atoms in block 107
Block first atom: 2908
Blocpdb> 27 atoms in block 108
Block first atom: 2938
Blocpdb> 23 atoms in block 109
Block first atom: 2965
Blocpdb> 22 atoms in block 110
Block first atom: 2988
Blocpdb> 31 atoms in block 111
Block first atom: 3010
Blocpdb> 26 atoms in block 112
Block first atom: 3041
Blocpdb> 34 atoms in block 113
Block first atom: 3067
Blocpdb> 26 atoms in block 114
Block first atom: 3101
Blocpdb> 29 atoms in block 115
Block first atom: 3127
Blocpdb> 28 atoms in block 116
Block first atom: 3156
Blocpdb> 24 atoms in block 117
Block first atom: 3184
Blocpdb> 34 atoms in block 118
Block first atom: 3208
Blocpdb> 32 atoms in block 119
Block first atom: 3242
Blocpdb> 23 atoms in block 120
Block first atom: 3274
Blocpdb> 26 atoms in block 121
Block first atom: 3297
Blocpdb> 23 atoms in block 122
Block first atom: 3323
Blocpdb> 30 atoms in block 123
Block first atom: 3346
Blocpdb> 27 atoms in block 124
Block first atom: 3376
Blocpdb> 23 atoms in block 125
Block first atom: 3403
Blocpdb> 22 atoms in block 126
Block first atom: 3426
Blocpdb> 31 atoms in block 127
Block first atom: 3448
Blocpdb> 26 atoms in block 128
Block first atom: 3479
Blocpdb> 34 atoms in block 129
Block first atom: 3505
Blocpdb> 26 atoms in block 130
Block first atom: 3539
Blocpdb> 29 atoms in block 131
Block first atom: 3565
Blocpdb> 28 atoms in block 132
Block first atom: 3594
Blocpdb> 24 atoms in block 133
Block first atom: 3622
Blocpdb> 34 atoms in block 134
Block first atom: 3646
Blocpdb> 32 atoms in block 135
Block first atom: 3680
Blocpdb> 23 atoms in block 136
Block first atom: 3712
Blocpdb> 26 atoms in block 137
Block first atom: 3735
Blocpdb> 23 atoms in block 138
Block first atom: 3761
Blocpdb> 30 atoms in block 139
Block first atom: 3784
Blocpdb> 27 atoms in block 140
Block first atom: 3814
Blocpdb> 23 atoms in block 141
Block first atom: 3841
Blocpdb> 22 atoms in block 142
Block first atom: 3864
Blocpdb> 31 atoms in block 143
Block first atom: 3886
Blocpdb> 26 atoms in block 144
Block first atom: 3917
Blocpdb> 34 atoms in block 145
Block first atom: 3943
Blocpdb> 26 atoms in block 146
Block first atom: 3977
Blocpdb> 29 atoms in block 147
Block first atom: 4003
Blocpdb> 28 atoms in block 148
Block first atom: 4032
Blocpdb> 24 atoms in block 149
Block first atom: 4060
Blocpdb> 34 atoms in block 150
Block first atom: 4084
Blocpdb> 32 atoms in block 151
Block first atom: 4118
Blocpdb> 23 atoms in block 152
Block first atom: 4150
Blocpdb> 26 atoms in block 153
Block first atom: 4173
Blocpdb> 23 atoms in block 154
Block first atom: 4199
Blocpdb> 30 atoms in block 155
Block first atom: 4222
Blocpdb> 27 atoms in block 156
Block first atom: 4252
Blocpdb> 23 atoms in block 157
Block first atom: 4279
Blocpdb> 22 atoms in block 158
Block first atom: 4302
Blocpdb> 31 atoms in block 159
Block first atom: 4324
Blocpdb> 26 atoms in block 160
Block first atom: 4355
Blocpdb> 34 atoms in block 161
Block first atom: 4381
Blocpdb> 26 atoms in block 162
Block first atom: 4415
Blocpdb> 29 atoms in block 163
Block first atom: 4441
Blocpdb> 28 atoms in block 164
Block first atom: 4470
Blocpdb> 24 atoms in block 165
Block first atom: 4498
Blocpdb> 34 atoms in block 166
Block first atom: 4522
Blocpdb> 32 atoms in block 167
Block first atom: 4556
Blocpdb> 23 atoms in block 168
Block first atom: 4588
Blocpdb> 26 atoms in block 169
Block first atom: 4611
Blocpdb> 23 atoms in block 170
Block first atom: 4637
Blocpdb> 30 atoms in block 171
Block first atom: 4660
Blocpdb> 27 atoms in block 172
Block first atom: 4690
Blocpdb> 23 atoms in block 173
Block first atom: 4717
Blocpdb> 22 atoms in block 174
Block first atom: 4740
Blocpdb> 31 atoms in block 175
Block first atom: 4762
Blocpdb> 26 atoms in block 176
Block first atom: 4793
Blocpdb> 34 atoms in block 177
Block first atom: 4819
Blocpdb> 26 atoms in block 178
Block first atom: 4853
Blocpdb> 29 atoms in block 179
Block first atom: 4879
Blocpdb> 28 atoms in block 180
Block first atom: 4908
Blocpdb> 24 atoms in block 181
Block first atom: 4936
Blocpdb> 34 atoms in block 182
Block first atom: 4960
Blocpdb> 32 atoms in block 183
Block first atom: 4994
Blocpdb> 23 atoms in block 184
Block first atom: 5026
Blocpdb> 26 atoms in block 185
Block first atom: 5049
Blocpdb> 23 atoms in block 186
Block first atom: 5075
Blocpdb> 30 atoms in block 187
Block first atom: 5098
Blocpdb> 27 atoms in block 188
Block first atom: 5128
Blocpdb> 23 atoms in block 189
Block first atom: 5155
Blocpdb> 22 atoms in block 190
Block first atom: 5178
Blocpdb> 31 atoms in block 191
Block first atom: 5200
Blocpdb> 26 atoms in block 192
Block first atom: 5230
Blocpdb> 192 blocks.
Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 22 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1995701 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 15768
Prepmat> Matrix trace = 4365240.0000
Prepmat> Last element read: 15768 15768 54.3909
Prepmat> 18529 lines saved.
Prepmat> 16673 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5256
RTB> Total mass = 5256.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 5256
RTB> Number of blocks = 192
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 248411.8917
RTB> 63900 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1152
Diagstd> Nb of non-zero elements: 63900
Diagstd> Projected matrix trace = 248411.8917
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1152 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 248411.8917
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.5835918 0.6393461 0.6870964 0.6933519
0.9667669 1.1137483 1.4894799 1.5408330 1.7427204
1.8981456 2.0498753 2.6665519 3.2791232 3.4557271
4.9778380 5.3206245 6.3267910 6.3579378 6.3649270
6.8860545 6.9001199 7.5103755 9.1749859 9.9518224
10.0757969 10.8501156 11.1408276 11.3348915 11.4838136
12.2118533 12.8323525 12.9339002 13.4021837 14.6924804
15.2066172 16.3602879 17.1075087 18.0663664 18.3044983
18.7622910 18.9641266 19.5318456 20.2775394 20.7769757
20.8783849 21.2898019 21.5395835 21.9096578 22.3695000
22.9334504 23.2000094 23.5846247 23.7296330 24.5459314
25.8650090 26.5776868 26.7827706 27.2534706 27.5663417
27.7645300 28.3949546 29.0446623 29.5510838 29.8229978
29.9779750 30.5181444 30.7721306 31.0484900 32.3637543
32.9407393 33.0184290 33.4050851 34.4472463 34.8597186
35.0333420 36.2789805 37.4608629 37.5314388 37.9055284
38.3199903 38.3953728 38.9842360 39.3485338 39.9087321
40.1233992 40.7871838 41.0280430 41.3971817 41.7070784
41.9152186 42.1891946 42.3576779 43.6237810 43.7113016
44.3119851 44.8393736 44.9206839 45.5413420 45.8499487
46.8546412
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034316 0.0034318 0.0034326 0.0034336 0.0034342
0.0034342 82.9563954 86.8287008 90.0127688 90.4215873
106.7717041 114.6011080 132.5295134 134.7947779 143.3537769
149.6098004 155.4744391 177.3251369 196.6410334 201.8668483
242.2789363 250.4820358 273.1410820 273.8125918 273.9630516
284.9577731 285.2486500 297.5953266 328.9258331 342.5678393
344.6949992 357.6946658 362.4549259 365.5981287 367.9919739
379.4775340 388.9989424 390.5350639 397.5420420 416.2390684
423.4592139 439.2287423 449.1471670 461.5626803 464.5946403
470.3684828 472.8917124 479.9178698 488.9932984 494.9786263
496.1851125 501.0500271 503.9807298 508.2917700 513.5981126
520.0318941 523.0453685 527.3631323 528.9818743 538.0034223
552.2701845 559.8270384 561.9828091 566.8996487 570.1443797
572.1902365 578.6498827 585.2325137 590.3125104 593.0221680
594.5610111 599.8937570 602.3848822 605.0837950 617.7670323
623.2495183 623.9840426 627.6269321 637.3419953 641.1464156
642.7410899 654.0678728 664.6364706 665.2622607 668.5694960
672.2146540 672.8755141 678.0157681 681.1763440 686.0081029
687.8506306 693.5170459 695.5617340 698.6837913 701.2940663
703.0418016 705.3357512 706.7427335 717.2274989 717.9466109
722.8628130 727.1517414 727.8107399 732.8214829 735.3002394
743.3127610
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5256
Rtb_to_modes> Number of blocs = 192
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9865E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5836
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6393
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6871
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6934
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9668
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.114
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.489
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.541
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.743
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.898
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.050
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.667
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.279
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.456
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.978
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.321
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.327
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.358
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.365
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.886
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.900
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.510
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.175
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.952
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.48
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.37
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.20
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.94
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.45
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.28
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.79
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.85
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1152 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
0.99999 0.99999 0.99996 0.99997 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000
1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 1.00005
1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00004 0.99997 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 94608 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001
0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998
0.99999 0.99999 0.99996 0.99997 0.99999
0.99999 1.00000 0.99999 0.99997 1.00001
1.00000 1.00002 1.00003 1.00001 1.00001
1.00003 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00004 1.00000
1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000
0.99997 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002
1.00004 0.99998 0.99997 1.00002 1.00001
1.00001 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999
0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 1.00001
1.00001 1.00001 1.00002 1.00003 1.00000
1.00002 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000
1.00002 1.00001 0.99998 0.99998 1.00005
1.00001 1.00003 0.99999 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00004 0.99997 1.00000 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 10: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260913220433158305.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260913220433158305.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260913220433158305.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260913220433158305.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 756
First residue number = 37
Last residue number = 99
Number of atoms found = 5256
Mean number per residue = 7.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9865E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9921E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5836
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6871
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6934
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9668
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.114
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.489
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.541
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.743
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.898
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.050
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.667
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.279
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.456
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.978
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.321
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.327
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.358
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.365
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.886
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.900
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.510
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.175
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.952
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.48
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.37
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.20
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.94
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.45
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.28
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.79
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.85
Bfactors> 106 vectors, 15768 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.583600
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.796 for 756 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.039 +/- 0.06
Bfactors> = 106.662 +/- 23.68
Bfactors> Shiftng-fct= 106.623
Bfactors> Scaling-fct= 393.551
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260913220433158305.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260913220433158305.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 82.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 90.42
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 106.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 134.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 143.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 196.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 250.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 285.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 328.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 344.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 362.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 365.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 367.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 379.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 397.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 423.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 470.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 496.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 504.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 508.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 513.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 529.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 590.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 594.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 605.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 617.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 623.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 664.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 677.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 681.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 703.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.2
Chkmod> 106 vectors, 15768 coordinates in file.
Chkmod> That is: 5256 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.9282
0.0034 0.9560
0.0034 0.9003
0.0034 0.7427
0.0034 0.7108
0.0034 0.6632
82.9534 0.3111
86.8218 0.2942
90.0091 0.3122
90.4208 0.1132
106.7689 0.4162
114.6091 0.4808
132.5025 0.1084
134.7963 0.0680
143.3591 0.3085
149.5976 0.1366
155.4725 0.2689
177.3324 0.7087
196.6289 0.5081
201.8662 0.5838
242.2725 0.6586
250.4801 0.7130
273.1339 0.4452
273.8022 0.0563
273.9529 0.0552
284.9444 0.2057
285.2339 0.2168
297.5751 0.5948
328.9120 0.4064
342.5562 0.3947
344.7521 0.5419
357.6774 0.5537
362.4259 0.2879
365.5035 0.1967
367.9151 0.2728
379.4324 0.5045
388.9466 0.7577
390.4594 0.5359
397.4926 0.5321
416.1861 0.5329
423.4881 0.6540
439.2060 0.4386
449.1606 0.3400
461.5893 0.4047
464.5176 0.5487
470.3196 0.4133
472.8200 0.4234
479.8746 0.5417
489.0020 0.6267
494.9934 0.4369
496.1830 0.1358
501.0308 0.4107
503.9640 0.1107
508.2739 0.6220
513.5818 0.4068
519.9705 0.1996
523.0228 0.3431
527.2888 0.2350
528.9633 0.0940
538.0249 0.4091
552.2998 0.5496
559.8274 0.5049
561.9296 0.4850
566.8392 0.5133
570.1577 0.5262
572.1190 0.5228
578.5746 0.4492
585.1604 0.3515
590.2763 0.3079
592.9669 0.4354
594.5556 0.4550
599.8862 0.4450
602.3382 0.3449
605.0725 0.4357
617.7047 0.4101
623.2158 0.4842
623.9721 0.5363
627.6462 0.5739
637.3401 0.6242
641.1215 0.2843
642.6828 0.2774
654.0490 0.5305
664.6003 0.3769
665.2210 0.5073
668.5802 0.2458
672.1859 0.2763
672.8872 0.4121
677.9498 0.5784
681.1598 0.4992
685.9896 0.5867
687.7920 0.5354
693.5112 0.5670
695.5485 0.5466
698.6776 0.4663
701.2885 0.5313
703.0517 0.2516
705.3122 0.2123
706.7318 0.4980
717.1656 0.5301
717.9051 0.4737
722.8156 0.2516
727.1256 0.4839
727.7740 0.4365
732.7792 0.4801
735.2691 0.3555
743.2440 0.5528
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260913220433158305 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
making animated gifs
11 models are in 260913220433158305.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260913220433158305 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
making animated gifs
11 models are in 260913220433158305.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260913220433158305 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
making animated gifs
11 models are in 260913220433158305.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260913220433158305 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
making animated gifs
11 models are in 260913220433158305.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260913220433158305 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260913220433158305.eigenfacs
260913220433158305.atom
making animated gifs
11 models are in 260913220433158305.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260913220433158305.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260913220433158305.10.pdb
260913220433158305.11.pdb
260913220433158305.7.pdb
260913220433158305.8.pdb
260913220433158305.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m32.166s
user 0m32.014s
sys 0m0.140s
rm: cannot remove '260913220433158305.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|