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***  TRANSFERASE 26-FEB-07 2OZO  ***

LOGs for ID: 260915025151580210

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260915025151580210.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260915025151580210.atom to be opened. Openam> File opened: 260915025151580210.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 545 First residue number = 2 Last residue number = 613 Number of atoms found = 4225 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 14.916306 +/- 14.509807 From: -27.410000 To: 49.141000 = -12.463556 +/- 13.983615 From: -45.497000 To: 23.794000 = 12.766482 +/- 18.855938 From: -30.607000 To: 55.993000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9414 % Filled. Pdbmat> 1559638 non-zero elements. Pdbmat> 170512 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.72 +/- 23.47 Maximum number = 132 Minimum number = 8 Pdbmat> Matrix trace = 3.410240E+06 Pdbmat> Larger element = 501.387 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 545 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260915025151580210.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260915025151580210.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260915025151580210.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4225 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 545 residues. Blocpdb> 22 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 20 atoms in block 2 Block first atom: 23 Blocpdb> 26 atoms in block 3 Block first atom: 43 Blocpdb> 27 atoms in block 4 Block first atom: 69 Blocpdb> 20 atoms in block 5 Block first atom: 96 Blocpdb> 25 atoms in block 6 Block first atom: 116 Blocpdb> 19 atoms in block 7 Block first atom: 141 Blocpdb> 27 atoms in block 8 Block first atom: 160 Blocpdb> 17 atoms in block 9 Block first atom: 187 Blocpdb> 18 atoms in block 10 Block first atom: 204 Blocpdb> 23 atoms in block 11 Block first atom: 222 Blocpdb> 27 atoms in block 12 Block first atom: 245 Blocpdb> 23 atoms in block 13 Block first atom: 272 Blocpdb> 25 atoms in block 14 Block first atom: 295 Blocpdb> 20 atoms in block 15 Block first atom: 320 Blocpdb> 21 atoms in block 16 Block first atom: 340 Blocpdb> 25 atoms in block 17 Block first atom: 361 Blocpdb> 17 atoms in block 18 Block first atom: 386 Blocpdb> 31 atoms in block 19 Block first atom: 403 Blocpdb> 26 atoms in block 20 Block first atom: 434 Blocpdb> 25 atoms in block 21 Block first atom: 460 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 485 Blocpdb> 24 atoms in block 23 Block first atom: 505 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 529 Blocpdb> 18 atoms in block 25 Block first atom: 546 Blocpdb> 20 atoms in block 26 Block first atom: 564 Blocpdb> 21 atoms in block 27 Block first atom: 584 Blocpdb> 19 atoms in block 28 Block first atom: 605 Blocpdb> 29 atoms in block 29 Block first atom: 624 Blocpdb> 26 atoms in block 30 Block first atom: 653 Blocpdb> 20 atoms in block 31 Block first atom: 679 Blocpdb> 21 atoms in block 32 Block first atom: 699 Blocpdb> 24 atoms in block 33 Block first atom: 720 Blocpdb> 21 atoms in block 34 Block first atom: 744 Blocpdb> 24 atoms in block 35 Block first atom: 765 Blocpdb> 21 atoms in block 36 Block first atom: 789 Blocpdb> 23 atoms in block 37 Block first atom: 810 Blocpdb> 22 atoms in block 38 Block first atom: 833 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 855 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 877 Blocpdb> 26 atoms in block 41 Block first atom: 901 Blocpdb> 24 atoms in block 42 Block first atom: 927 Blocpdb> 27 atoms in block 43 Block first atom: 951 Blocpdb> 31 atoms in block 44 Block first atom: 978 Blocpdb> 22 atoms in block 45 Block first atom: 1009 Blocpdb> 18 atoms in block 46 Block first atom: 1031 Blocpdb> 22 atoms in block 47 Block first atom: 1049 Blocpdb> 23 atoms in block 48 Block first atom: 1071 Blocpdb> 21 atoms in block 49 Block first atom: 1094 Blocpdb> 25 atoms in block 50 Block first atom: 1115 Blocpdb> 21 atoms in block 51 Block first atom: 1140 Blocpdb> 19 atoms in block 52 Block first atom: 1161 Blocpdb> 24 atoms in block 53 Block first atom: 1180 Blocpdb> 29 atoms in block 54 Block first atom: 1204 Blocpdb> 28 atoms in block 55 Block first atom: 1233 Blocpdb> 21 atoms in block 56 Block first atom: 1261 Blocpdb> 29 atoms in block 57 Block first atom: 1282 Blocpdb> 25 atoms in block 58 Block first atom: 1311 Blocpdb> 29 atoms in block 59 Block first atom: 1336 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 1365 Blocpdb> 24 atoms in block 61 Block first atom: 1380 Blocpdb> 24 atoms in block 62 Block first atom: 1404 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1428 Blocpdb> 27 atoms in block 64 Block first atom: 1455 Blocpdb> 22 atoms in block 65 Block first atom: 1482 Blocpdb> 24 atoms in block 66 Block first atom: 1504 Blocpdb> 22 atoms in block 67 Block first atom: 1528 Blocpdb> 24 atoms in block 68 Block first atom: 1550 Blocpdb> 23 atoms in block 69 Block first atom: 1574 Blocpdb> 34 atoms in block 70 Block first atom: 1597 Blocpdb> 22 atoms in block 71 Block first atom: 1631 Blocpdb> 26 atoms in block 72 Block first atom: 1653 Blocpdb> 18 atoms in block 73 Block first atom: 1679 Blocpdb> 26 atoms in block 74 Block first atom: 1697 Blocpdb> 20 atoms in block 75 Block first atom: 1723 Blocpdb> 27 atoms in block 76 Block first atom: 1743 Blocpdb> 23 atoms in block 77 Block first atom: 1770 Blocpdb> 31 atoms in block 78 Block first atom: 1793 Blocpdb> 28 atoms in block 79 Block first atom: 1824 Blocpdb> 25 atoms in block 80 Block first atom: 1852 Blocpdb> 22 atoms in block 81 Block first atom: 1877 Blocpdb> 20 atoms in block 82 Block first atom: 1899 Blocpdb> 26 atoms in block 83 Block first atom: 1919 Blocpdb> 23 atoms in block 84 Block first atom: 1945 Blocpdb> 21 atoms in block 85 Block first atom: 1968 Blocpdb> 18 atoms in block 86 Block first atom: 1989 Blocpdb> 24 atoms in block 87 Block first atom: 2007 Blocpdb> 22 atoms in block 88 Block first atom: 2031 Blocpdb> 25 atoms in block 89 Block first atom: 2053 Blocpdb> 21 atoms in block 90 Block first atom: 2078 Blocpdb> 15 atoms in block 91 Block first atom: 2099 Blocpdb> 22 atoms in block 92 Block first atom: 2114 Blocpdb> 28 atoms in block 93 Block first atom: 2136 Blocpdb> 27 atoms in block 94 Block first atom: 2164 Blocpdb> 24 atoms in block 95 Block first atom: 2191 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2215 Blocpdb> 21 atoms in block 97 Block first atom: 2236 Blocpdb> 15 atoms in block 98 Block first atom: 2257 Blocpdb> 21 atoms in block 99 Block first atom: 2272 Blocpdb> 27 atoms in block 100 Block first atom: 2293 Blocpdb> 23 atoms in block 101 Block first atom: 2320 Blocpdb> 24 atoms in block 102 Block first atom: 2343 Blocpdb> 27 atoms in block 103 Block first atom: 2367 Blocpdb> 23 atoms in block 104 Block first atom: 2394 Blocpdb> 22 atoms in block 105 Block first atom: 2417 Blocpdb> 20 atoms in block 106 Block first atom: 2439 Blocpdb> 14 atoms in block 107 Block first atom: 2459 Blocpdb> 15 atoms in block 108 Block first atom: 2473 Blocpdb> 24 atoms in block 109 Block first atom: 2488 Blocpdb> 25 atoms in block 110 Block first atom: 2512 Blocpdb> 19 atoms in block 111 Block first atom: 2537 Blocpdb> 25 atoms in block 112 Block first atom: 2556 Blocpdb> 27 atoms in block 113 Block first atom: 2581 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 2608 Blocpdb> 27 atoms in block 115 Block first atom: 2631 Blocpdb> 27 atoms in block 116 Block first atom: 2658 Blocpdb> 17 atoms in block 117 Block first atom: 2685 Blocpdb> 23 atoms in block 118 Block first atom: 2702 Blocpdb> 21 atoms in block 119 Block first atom: 2725 Blocpdb> 23 atoms in block 120 Block first atom: 2746 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 2769 Blocpdb> 12 atoms in block 122 Block first atom: 2791 Blocpdb> 25 atoms in block 123 Block first atom: 2803 Blocpdb> 28 atoms in block 124 Block first atom: 2828 Blocpdb> 20 atoms in block 125 Block first atom: 2856 Blocpdb> 25 atoms in block 126 Block first atom: 2876 Blocpdb> 22 atoms in block 127 Block first atom: 2901 Blocpdb> 21 atoms in block 128 Block first atom: 2923 Blocpdb> 22 atoms in block 129 Block first atom: 2944 Blocpdb> 27 atoms in block 130 Block first atom: 2966 Blocpdb> 21 atoms in block 131 Block first atom: 2993 Blocpdb> 21 atoms in block 132 Block first atom: 3014 Blocpdb> 29 atoms in block 133 Block first atom: 3035 Blocpdb> 26 atoms in block 134 Block first atom: 3064 Blocpdb> 28 atoms in block 135 Block first atom: 3090 Blocpdb> 27 atoms in block 136 Block first atom: 3118 Blocpdb> 21 atoms in block 137 Block first atom: 3145 Blocpdb> 23 atoms in block 138 Block first atom: 3166 Blocpdb> 23 atoms in block 139 Block first atom: 3189 Blocpdb> 33 atoms in block 140 Block first atom: 3212 Blocpdb> 22 atoms in block 141 Block first atom: 3245 Blocpdb> 25 atoms in block 142 Block first atom: 3267 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 3292 Blocpdb> 15 atoms in block 144 Block first atom: 3309 Blocpdb> 4 atoms in block 145 Block first atom: 3324 Blocpdb> 24 atoms in block 146 Block first atom: 3328 Blocpdb> 31 atoms in block 147 Block first atom: 3352 Blocpdb> 22 atoms in block 148 Block first atom: 3383 Blocpdb> 27 atoms in block 149 Block first atom: 3405 Blocpdb> 31 atoms in block 150 Block first atom: 3432 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3463 Blocpdb> 21 atoms in block 152 Block first atom: 3486 Blocpdb> 32 atoms in block 153 Block first atom: 3507 Blocpdb> 18 atoms in block 154 Block first atom: 3539 Blocpdb> 31 atoms in block 155 Block first atom: 3557 Blocpdb> 19 atoms in block 156 Block first atom: 3588 Blocpdb> 25 atoms in block 157 Block first atom: 3607 Blocpdb> 28 atoms in block 158 Block first atom: 3632 Blocpdb> 18 atoms in block 159 Block first atom: 3660 Blocpdb> 20 atoms in block 160 Block first atom: 3678 Blocpdb> 24 atoms in block 161 Block first atom: 3698 Blocpdb> 24 atoms in block 162 Block first atom: 3722 Blocpdb> 18 atoms in block 163 Block first atom: 3746 Blocpdb> 28 atoms in block 164 Block first atom: 3764 Blocpdb> 22 atoms in block 165 Block first atom: 3792 Blocpdb> 22 atoms in block 166 Block first atom: 3814 Blocpdb> 23 atoms in block 167 Block first atom: 3836 Blocpdb> 25 atoms in block 168 Block first atom: 3859 Blocpdb> 22 atoms in block 169 Block first atom: 3884 Blocpdb> 28 atoms in block 170 Block first atom: 3906 Blocpdb> 29 atoms in block 171 Block first atom: 3934 Blocpdb> 27 atoms in block 172 Block first atom: 3963 Blocpdb> 26 atoms in block 173 Block first atom: 3990 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 4016 Blocpdb> 25 atoms in block 175 Block first atom: 4042 Blocpdb> 30 atoms in block 176 Block first atom: 4067 Blocpdb> 23 atoms in block 177 Block first atom: 4097 Blocpdb> 26 atoms in block 178 Block first atom: 4120 Blocpdb> 15 atoms in block 179 Block first atom: 4146 Blocpdb> 20 atoms in block 180 Block first atom: 4161 Blocpdb> 15 atoms in block 181 Block first atom: 4181 Blocpdb> 24 atoms in block 182 Block first atom: 4196 Blocpdb> 6 atoms in block 183 Block first atom: 4219 Blocpdb> 183 blocks. Blocpdb> At most, 34 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 4 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1559821 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12675 Prepmat> Matrix trace = 3410240.0000 Prepmat> Last element read: 12675 12675 121.0748 Prepmat> 16837 lines saved. Prepmat> 15081 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4225 RTB> Total mass = 4225.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4225 RTB> Number of blocks = 183 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 227223.6706 RTB> 60435 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1098 Diagstd> Nb of non-zero elements: 60435 Diagstd> Projected matrix trace = 227223.6706 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1098 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 227223.6706 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.3211120 0.4982790 0.6093697 0.7462958 1.3052866 1.6804191 2.1918249 2.3534387 2.7197392 3.0675581 3.7408317 4.0530907 4.8236761 4.9847028 6.5240854 7.1121065 7.9571212 8.2401665 8.5934674 9.0573046 9.3635364 9.7684880 10.1827545 11.5803198 11.9593868 12.9579560 13.0891863 14.5183327 15.3476261 15.6966829 16.1605563 16.6690824 16.9424657 17.3190444 18.3700728 18.9723812 19.2191417 19.6345758 19.7075693 20.2950967 21.0148430 21.1171071 21.7232808 22.6796028 23.1729573 23.2367606 24.0003789 24.8029097 25.1295728 25.6112256 26.5851722 26.7825560 27.3750292 28.1566198 29.0089699 29.3898601 30.1589423 30.3254297 30.8842015 32.3950505 32.6425330 32.8980604 33.4543805 33.5766772 34.0388640 34.3556264 34.9800599 35.7567605 36.0692179 36.8019247 37.1119722 37.5611917 37.8081688 38.4250592 39.0315903 39.8087631 40.0424962 40.4139532 40.7007922 40.9548067 41.3383721 41.9109421 42.2482402 42.7678779 43.4659907 43.9517954 44.1242740 44.7442644 44.8919870 45.1159232 45.3885623 45.6723384 46.3537201 46.4292631 46.9386617 47.1712199 47.4847097 48.2177291 48.8051911 49.1471680 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034330 0.0034331 0.0034332 0.0034333 0.0034335 61.5351948 76.6534272 84.7687374 93.8103523 124.0646967 140.7680476 160.7674832 166.5891536 179.0848776 190.1917510 210.0290492 218.6192706 238.4977847 242.4459399 277.3671986 289.5972316 306.3185285 311.7190003 318.3314128 326.8095715 332.2884397 339.3977454 346.5196904 369.5349823 375.5344098 390.8980744 392.8724766 413.7649058 425.4180232 430.2285454 436.5393865 443.3545069 446.9753658 451.9155061 465.4260839 472.9946209 476.0606380 481.1783092 482.0718938 489.2049497 497.8039695 499.0137255 506.1252310 517.1458005 522.7403342 523.4594832 531.9910546 540.8123442 544.3620405 549.5541109 559.9058676 561.9805581 568.1625127 576.2162991 584.8728123 588.7000056 596.3528967 597.9966646 603.4808157 618.0656542 620.4220243 622.8456382 628.0898514 629.2368353 633.5527920 636.4938559 642.2521325 649.3432993 652.1742431 658.7650447 661.5341940 665.5258999 667.7103404 673.1355894 678.4274376 685.1483592 687.1568055 690.3366768 692.7821851 694.9406569 698.1873328 703.0059357 705.8291532 710.1566053 715.9291929 719.9189256 721.3301197 726.3801486 727.5782277 729.3906713 731.5912344 733.8746802 739.3287206 739.9309199 743.9789222 745.8196720 748.2938466 754.0474167 758.6269890 761.2801904 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4225 Rtb_to_modes> Number of blocs = 183 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3211 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4983 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6094 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7463 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.305 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.680 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.192 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.720 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.068 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.741 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.053 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.824 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.524 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.112 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.957 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.240 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.593 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.057 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.364 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.768 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.15 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1098 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00005 1.00003 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 0.99995 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 76050 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 1.00001 0.99997 0.99999 0.99999 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99998 1.00004 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00004 1.00002 1.00004 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99997 0.99999 1.00005 1.00003 0.99998 1.00000 0.99998 1.00003 0.99997 1.00002 1.00000 0.99995 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00002 1.00001 1.00004 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99997 1.00001 1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 0.99996 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915025151580210.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915025151580210.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260915025151580210.atom Openam> file on opening on unit 11: 260915025151580210.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 545 First residue number = 2 Last residue number = 613 Number of atoms found = 4225 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9911E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9948E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9956E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9963E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9973E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3211 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4983 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6094 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7463 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.305 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.680 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.192 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.720 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.068 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.741 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.053 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.824 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.524 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.112 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.957 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.240 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.593 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.057 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.364 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.768 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.15 Bfactors> 106 vectors, 12675 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.321100 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.337 for 545 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.055 +/- 0.11 Bfactors> = 42.481 +/- 11.75 Bfactors> Shiftng-fct= 42.426 Bfactors> Scaling-fct= 111.363 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915025151580210.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915025151580210.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4323E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4331E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 61.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 84.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 93.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 140.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 160.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 179.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 190.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 210.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 218.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 242.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 306.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 311.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 326.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 339.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 346.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 425.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 436.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 443.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 446.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 476.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 481.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 497.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 499.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 506.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 517.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 523.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 532.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 540.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 568.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 665.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 685.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 687.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 690.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 692.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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Chkmod> That is: 4225 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 51 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 60 is: 0.9999 (instead of 1.0000). 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../../bin/get_modes.sh 260915025151580210 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260915025151580210 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915025151580210.eigenfacs 260915025151580210.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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