CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  Cry  ***

LOGs for ID: 260915133251740250

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260915133251740250.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260915133251740250.atom to be opened. Openam> File opened: 260915133251740250.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 533 First residue number = 0 Last residue number = 532 Number of atoms found = 4252 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 46.379622 +/- 15.935396 From: 4.583000 To: 82.949000 = -16.058555 +/- 13.599476 From: -47.679000 To: 16.442000 = 42.996110 +/- 12.270790 From: 14.718000 To: 78.575000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.9963 % Filled. Pdbmat> 1624302 non-zero elements. Pdbmat> 177675 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 83.57 +/- 22.75 Maximum number = 132 Minimum number = 16 Pdbmat> Matrix trace = 3.553500E+06 Pdbmat> Larger element = 504.286 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 533 non-zero elements, NRBL set to 3 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260915133251740250.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 3 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260915133251740250.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260915133251740250.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 4252 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 3 residue(s) per block. Blocpdb> 533 residues. Blocpdb> 31 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 28 atoms in block 2 Block first atom: 32 Blocpdb> 27 atoms in block 3 Block first atom: 60 Blocpdb> 26 atoms in block 4 Block first atom: 87 Blocpdb> 24 atoms in block 5 Block first atom: 113 Blocpdb> 23 atoms in block 6 Block first atom: 137 Blocpdb> 29 atoms in block 7 Block first atom: 160 Blocpdb> 19 atoms in block 8 Block first atom: 189 Blocpdb> 23 atoms in block 9 Block first atom: 208 Blocpdb> 24 atoms in block 10 Block first atom: 231 Blocpdb> 25 atoms in block 11 Block first atom: 255 Blocpdb> 22 atoms in block 12 Block first atom: 280 Blocpdb> 27 atoms in block 13 Block first atom: 302 Blocpdb> 24 atoms in block 14 Block first atom: 329 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 353 Blocpdb> 17 atoms in block 16 Block first atom: 379 Blocpdb> 23 atoms in block 17 Block first atom: 396 Blocpdb> 22 atoms in block 18 Block first atom: 419 Blocpdb> 25 atoms in block 19 Block first atom: 441 Blocpdb> 21 atoms in block 20 Block first atom: 466 Blocpdb> 28 atoms in block 21 Block first atom: 487 Blocpdb> 20 atoms in block 22 Block first atom: 515 Blocpdb> 36 atoms in block 23 Block first atom: 535 Blocpdb> 17 atoms in block 24 Block first atom: 571 Blocpdb> 28 atoms in block 25 Block first atom: 588 Blocpdb> 28 atoms in block 26 Block first atom: 616 Blocpdb> 20 atoms in block 27 Block first atom: 644 Blocpdb> 28 atoms in block 28 Block first atom: 664 Blocpdb> 25 atoms in block 29 Block first atom: 692 Blocpdb> 26 atoms in block 30 Block first atom: 717 Blocpdb> 16 atoms in block 31 Block first atom: 743 Blocpdb> 22 atoms in block 32 Block first atom: 759 Blocpdb> 26 atoms in block 33 Block first atom: 781 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 807 Blocpdb> 23 atoms in block 35 Block first atom: 825 Blocpdb> 22 atoms in block 36 Block first atom: 848 Blocpdb> 20 atoms in block 37 Block first atom: 870 Blocpdb> 23 atoms in block 38 Block first atom: 890 Blocpdb> 22 atoms in block 39 Block first atom: 913 Blocpdb> 24 atoms in block 40 Block first atom: 935 Blocpdb> 16 atoms in block 41 Block first atom: 959 Blocpdb> 28 atoms in block 42 Block first atom: 975 Blocpdb> 33 atoms in block 43 Block first atom: 1003 Blocpdb> 21 atoms in block 44 Block first atom: 1036 Blocpdb> 25 atoms in block 45 Block first atom: 1057 Blocpdb> 22 atoms in block 46 Block first atom: 1082 Blocpdb> 27 atoms in block 47 Block first atom: 1104 Blocpdb> 25 atoms in block 48 Block first atom: 1131 Blocpdb> 22 atoms in block 49 Block first atom: 1156 Blocpdb> 24 atoms in block 50 Block first atom: 1178 Blocpdb> 30 atoms in block 51 Block first atom: 1202 Blocpdb> 27 atoms in block 52 Block first atom: 1232 Blocpdb> 24 atoms in block 53 Block first atom: 1259 Blocpdb> 26 atoms in block 54 Block first atom: 1283 Blocpdb> 24 atoms in block 55 Block first atom: 1309 Blocpdb> 23 atoms in block 56 Block first atom: 1333 Blocpdb> 22 atoms in block 57 Block first atom: 1356 Blocpdb> 23 atoms in block 58 Block first atom: 1378 Blocpdb> 26 atoms in block 59 Block first atom: 1401 Blocpdb> 24 atoms in block 60 Block first atom: 1427 Blocpdb> 26 atoms in block 61 Block first atom: 1451 Blocpdb> 23 atoms in block 62 Block first atom: 1477 Blocpdb> 27 atoms in block 63 Block first atom: 1500 Blocpdb> 27 atoms in block 64 Block first atom: 1527 Blocpdb> 24 atoms in block 65 Block first atom: 1554 Blocpdb> 20 atoms in block 66 Block first atom: 1578 Blocpdb> 17 atoms in block 67 Block first atom: 1598 Blocpdb> 22 atoms in block 68 Block first atom: 1615 Blocpdb> 23 atoms in block 69 Block first atom: 1637 Blocpdb> 23 atoms in block 70 Block first atom: 1660 Blocpdb> 25 atoms in block 71 Block first atom: 1683 Blocpdb> 23 atoms in block 72 Block first atom: 1708 Blocpdb> 24 atoms in block 73 Block first atom: 1731 Blocpdb> 20 atoms in block 74 Block first atom: 1755 Blocpdb> 24 atoms in block 75 Block first atom: 1775 Blocpdb> 21 atoms in block 76 Block first atom: 1799 Blocpdb> 27 atoms in block 77 Block first atom: 1820 Blocpdb> 19 atoms in block 78 Block first atom: 1847 Blocpdb> 21 atoms in block 79 Block first atom: 1866 Blocpdb> 19 atoms in block 80 Block first atom: 1887 Blocpdb> 23 atoms in block 81 Block first atom: 1906 Blocpdb> 22 atoms in block 82 Block first atom: 1929 Blocpdb> 23 atoms in block 83 Block first atom: 1951 Blocpdb> 19 atoms in block 84 Block first atom: 1974 Blocpdb> 26 atoms in block 85 Block first atom: 1993 Blocpdb> 26 atoms in block 86 Block first atom: 2019 Blocpdb> 26 atoms in block 87 Block first atom: 2045 Blocpdb> 20 atoms in block 88 Block first atom: 2071 Blocpdb> 17 atoms in block 89 Block first atom: 2091 Blocpdb> 28 atoms in block 90 Block first atom: 2108 Blocpdb> 24 atoms in block 91 Block first atom: 2136 Blocpdb> 28 atoms in block 92 Block first atom: 2160 Blocpdb> 20 atoms in block 93 Block first atom: 2188 Blocpdb> 28 atoms in block 94 Block first atom: 2208 Blocpdb> 21 atoms in block 95 Block first atom: 2236 Blocpdb> 18 atoms in block 96 Block first atom: 2257 Blocpdb> 25 atoms in block 97 Block first atom: 2275 Blocpdb> 18 atoms in block 98 Block first atom: 2300 Blocpdb> 20 atoms in block 99 Block first atom: 2318 Blocpdb> 28 atoms in block 100 Block first atom: 2338 Blocpdb> 26 atoms in block 101 Block first atom: 2366 Blocpdb> 24 atoms in block 102 Block first atom: 2392 Blocpdb> 29 atoms in block 103 Block first atom: 2416 Blocpdb> 27 atoms in block 104 Block first atom: 2445 Blocpdb> 19 atoms in block 105 Block first atom: 2472 Blocpdb> 26 atoms in block 106 Block first atom: 2491 Blocpdb> 16 atoms in block 107 Block first atom: 2517 Blocpdb> 24 atoms in block 108 Block first atom: 2533 Blocpdb> 28 atoms in block 109 Block first atom: 2557 Blocpdb> 33 atoms in block 110 Block first atom: 2585 Blocpdb> 28 atoms in block 111 Block first atom: 2618 Blocpdb> 23 atoms in block 112 Block first atom: 2646 Blocpdb> 25 atoms in block 113 Block first atom: 2669 Blocpdb> 22 atoms in block 114 Block first atom: 2694 Blocpdb> 24 atoms in block 115 Block first atom: 2716 Blocpdb> 23 atoms in block 116 Block first atom: 2740 Blocpdb> 26 atoms in block 117 Block first atom: 2763 Blocpdb> 22 atoms in block 118 Block first atom: 2789 Blocpdb> 22 atoms in block 119 Block first atom: 2811 Blocpdb> 26 atoms in block 120 Block first atom: 2833 Blocpdb> 26 atoms in block 121 Block first atom: 2859 Blocpdb> 28 atoms in block 122 Block first atom: 2885 Blocpdb> 18 atoms in block 123 Block first atom: 2913 Blocpdb> 27 atoms in block 124 Block first atom: 2931 Blocpdb> 25 atoms in block 125 Block first atom: 2958 Blocpdb> 30 atoms in block 126 Block first atom: 2983 Blocpdb> 16 atoms in block 127 Block first atom: 3013 Blocpdb> 19 atoms in block 128 Block first atom: 3029 Blocpdb> 19 atoms in block 129 Block first atom: 3048 Blocpdb> 19 atoms in block 130 Block first atom: 3067 Blocpdb> 28 atoms in block 131 Block first atom: 3086 Blocpdb> 18 atoms in block 132 Block first atom: 3114 Blocpdb> 23 atoms in block 133 Block first atom: 3132 Blocpdb> 21 atoms in block 134 Block first atom: 3155 Blocpdb> 27 atoms in block 135 Block first atom: 3176 Blocpdb> 23 atoms in block 136 Block first atom: 3203 Blocpdb> 22 atoms in block 137 Block first atom: 3226 Blocpdb> 20 atoms in block 138 Block first atom: 3248 Blocpdb> 26 atoms in block 139 Block first atom: 3268 Blocpdb> 29 atoms in block 140 Block first atom: 3294 Blocpdb> 23 atoms in block 141 Block first atom: 3323 Blocpdb> 28 atoms in block 142 Block first atom: 3346 Blocpdb> 27 atoms in block 143 Block first atom: 3374 Blocpdb> 23 atoms in block 144 Block first atom: 3401 Blocpdb> 28 atoms in block 145 Block first atom: 3424 Blocpdb> 18 atoms in block 146 Block first atom: 3452 Blocpdb> 26 atoms in block 147 Block first atom: 3470 Blocpdb> 31 atoms in block 148 Block first atom: 3496 Blocpdb> 24 atoms in block 149 Block first atom: 3527 Blocpdb> 15 atoms in block 150 Block first atom: 3551 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 3566 Blocpdb> 23 atoms in block 152 Block first atom: 3589 Blocpdb> 17 atoms in block 153 Block first atom: 3612 Blocpdb> 27 atoms in block 154 Block first atom: 3629 Blocpdb> 30 atoms in block 155 Block first atom: 3656 Blocpdb> 24 atoms in block 156 Block first atom: 3686 Blocpdb> 28 atoms in block 157 Block first atom: 3710 Blocpdb> 28 atoms in block 158 Block first atom: 3738 Blocpdb> 22 atoms in block 159 Block first atom: 3766 Blocpdb> 28 atoms in block 160 Block first atom: 3788 Blocpdb> 33 atoms in block 161 Block first atom: 3816 Blocpdb> 24 atoms in block 162 Block first atom: 3849 Blocpdb> 25 atoms in block 163 Block first atom: 3873 Blocpdb> 24 atoms in block 164 Block first atom: 3898 Blocpdb> 23 atoms in block 165 Block first atom: 3922 Blocpdb> 27 atoms in block 166 Block first atom: 3945 Blocpdb> 23 atoms in block 167 Block first atom: 3972 Blocpdb> 21 atoms in block 168 Block first atom: 3995 Blocpdb> 22 atoms in block 169 Block first atom: 4016 Blocpdb> 20 atoms in block 170 Block first atom: 4038 Blocpdb> 17 atoms in block 171 Block first atom: 4058 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 4075 Blocpdb> 22 atoms in block 173 Block first atom: 4099 Blocpdb> 26 atoms in block 174 Block first atom: 4121 Blocpdb> 26 atoms in block 175 Block first atom: 4147 Blocpdb> 29 atoms in block 176 Block first atom: 4173 Blocpdb> 30 atoms in block 177 Block first atom: 4202 Blocpdb> 21 atoms in block 178 Block first atom: 4231 Blocpdb> 178 blocks. Blocpdb> At most, 36 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 15 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1624480 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 12756 Prepmat> Matrix trace = 3553500.0000 Prepmat> Last element read: 12756 12756 108.1273 Prepmat> 15932 lines saved. Prepmat> 14068 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 4252 RTB> Total mass = 4252.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 4252 RTB> Number of blocks = 178 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 234686.8212 RTB> 64398 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1068 Diagstd> Nb of non-zero elements: 64398 Diagstd> Projected matrix trace = 234686.8212 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1068 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 234686.8212 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.6941985 2.3589631 3.4685990 4.1067348 5.0883487 5.5356242 5.9705820 7.0730290 7.8984264 8.4239033 9.3715217 9.6475541 9.8582435 10.3104583 10.8296559 11.1113724 11.5999860 12.1245723 13.1620905 13.2548693 13.8531386 15.0961011 15.5209321 16.3479382 16.6196616 18.0287193 18.3119634 18.9660779 20.2762517 20.8603219 21.6472060 22.1912606 22.6404993 23.1395224 23.4565150 24.6623027 25.2010292 25.8644914 26.6146331 27.2560935 27.8962749 28.3798643 28.6823753 29.1603973 30.0226373 30.6841599 30.8849449 32.6600604 33.4528517 34.0329605 34.3138100 34.6932006 35.1152683 35.2922191 35.7296911 36.5793211 36.9258032 37.7911689 38.4755333 38.7125781 39.2709916 39.6059893 39.9338932 40.8757787 41.3796769 41.7286872 42.2880756 42.6337025 43.0522985 43.2778277 43.5778176 44.4761188 44.8312746 45.4424628 46.2976456 46.9383593 48.1382126 48.4737848 48.7702842 49.2833377 49.7720148 50.4479880 50.5892820 51.5707301 51.7011421 51.8349358 52.3078899 53.0241145 53.5739937 53.9681858 54.3996622 54.8141480 54.9486821 55.3167318 55.8915543 56.2648767 56.7251925 56.8615960 57.6784911 57.9035178 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034334 0.0034337 0.0034338 0.0034339 0.0034341 0.0034350 141.3440161 166.7845653 202.2424549 220.0612666 244.9535368 255.4927488 265.3405429 288.8005394 305.1866754 315.1751486 332.4300982 337.2903305 340.9534198 348.6858028 357.3572599 361.9754632 369.8486285 378.1189950 393.9650696 395.3511486 404.1749279 421.9176354 427.8131989 439.0629331 442.6967858 461.0815223 464.6893676 472.9160404 488.9777718 495.9704285 505.2382306 511.5478541 516.6997845 522.3630821 525.9288860 539.2772407 545.1354427 552.2646581 560.2160181 566.9269274 573.5461739 578.4961026 581.5711272 586.3973498 595.0037465 601.5232235 603.4880788 620.5885698 628.0755001 633.4978496 636.1063796 639.6132680 643.4921829 645.1114701 649.0974623 656.7696885 659.8728433 667.5602100 673.5775506 675.6492943 680.5048331 683.4011624 686.2243210 694.2698407 698.5360564 701.4757165 706.1618335 709.0417451 712.5140814 714.3778943 716.8495532 724.2003349 727.0860687 732.0255012 738.8813988 743.9765260 753.4254060 756.0469150 758.3556445 762.3340827 766.1042846 771.2891201 772.3684728 779.8245801 780.8099674 781.8196157 785.3782693 790.7368761 794.8264140 797.7451814 800.9278253 803.9732780 804.9592971 807.6506315 811.8361277 814.5429068 817.8680999 818.8508478 824.7118322 826.3190302 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 4252 Rtb_to_modes> Number of blocs = 178 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.694 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.359 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.469 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.107 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.536 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.971 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.073 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.898 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.424 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.372 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.648 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.858 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.16 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.90 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1068 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00004 0.99999 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 76536 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 1.00002 0.99997 0.99997 1.00000 0.99998 1.00001 1.00004 0.99999 0.99997 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 0.99999 0.99996 1.00004 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 1.00003 0.99997 0.99999 0.99999 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99998 1.00001 1.00001 1.00001 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915133251740250.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915133251740250.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260915133251740250.atom Openam> file on opening on unit 11: 260915133251740250.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 533 First residue number = 0 Last residue number = 532 Number of atoms found = 4252 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9968E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9987E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9993E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9998E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.694 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.359 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.469 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.107 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.536 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.971 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.073 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.898 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.424 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.372 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.648 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.858 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.16 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.90 Bfactors> 106 vectors, 12756 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.694000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.717 for 533 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.02 Bfactors> = 19.655 +/- 17.63 Bfactors> Shiftng-fct= 19.636 Bfactors> Scaling-fct= 856.909 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915133251740250.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915133251740250.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4337E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 141.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 166.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 244.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 255.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 265.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 332.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 340.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 357.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 393.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 395.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 404.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 427.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 442.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 472.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 495.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 511.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 522.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 545.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 552.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 560.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 581.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 586.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 603.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 667.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 683.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 686.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 694.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 714.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 724.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 727.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 753.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 756.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 762.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 780.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 781.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 797.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 803.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 804.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 818.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 824.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.3 Chkmod> 106 vectors, 12756 coordinates in file. Chkmod> That is: 4252 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6747 0.0034 0.8693 0.0034 0.9335 0.0034 0.7470 0.0034 0.7148 0.0034 0.7534 141.3297 0.4861 166.7787 0.5885 202.2455 0.4397 220.0589 0.1154 244.9346 0.6047 255.4905 0.4081 265.3384 0.5105 288.7875 0.5271 305.1653 0.3215 315.1634 0.1196 332.4243 0.0387 337.2836 0.3707 340.9346 0.2767 348.6631 0.3649 357.3476 0.2969 361.9376 0.2296 369.8330 0.4067 378.0315 0.3243 393.9169 0.5087 395.2616 0.4075 404.1118 0.2336 421.9540 0.5637 427.7820 0.5586 439.0718 0.3768 442.6823 0.3785 461.0781 0.5179 464.6445 0.4619 472.9446 0.1514 489.0020 0.5594 495.9453 0.4178 505.2491 0.2155 511.5114 0.4113 516.6719 0.3367 522.3460 0.4328 525.9454 0.2874 539.2289 0.4478 545.1009 0.3613 552.1930 0.2793 560.1432 0.3752 566.9432 0.4798 573.5598 0.5931 578.4727 0.4630 581.5221 0.4420 586.3682 0.4020 594.9521 0.4222 601.4566 0.3333 603.4139 0.4573 620.5614 0.5346 628.0218 0.4137 633.4431 0.4253 636.0438 0.4285 639.5563 0.2896 643.5079 0.5039 645.0635 0.4908 649.0724 0.4565 656.7476 0.4744 659.8820 0.5533 667.5212 0.4391 673.5877 0.3685 675.5978 0.4297 680.4670 0.3652 683.4064 0.3559 686.1614 0.3118 694.2759 0.2352 698.5088 0.2372 701.4566 0.4962 706.1476 0.3591 708.9805 0.3619 712.4645 0.4368 714.3652 0.4591 716.8367 0.4014 724.2008 0.5015 727.0445 0.4048 731.9742 0.3520 738.8685 0.3648 743.9576 0.4462 753.4070 0.2809 755.9849 0.4880 758.3209 0.2926 762.2755 0.3650 766.0559 0.1721 771.2714 0.4804 772.3408 0.4499 779.7856 0.4384 780.7678 0.4548 781.7488 0.3637 785.3604 0.5154 790.6723 0.4348 794.7627 0.5003 797.7243 0.4835 800.8959 0.3677 803.9083 0.3442 804.9344 0.5048 807.6398 0.3568 811.7900 0.4717 814.4726 0.3937 817.8676 0.2829 818.8042 0.4835 824.6872 0.4128 826.2585 0.3752 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 260915133251740250 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom making animated gifs 11 models are in 260915133251740250.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260915133251740250 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom making animated gifs 11 models are in 260915133251740250.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 260915133251740250 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom making animated gifs 11 models are in 260915133251740250.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260915133251740250 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom making animated gifs 11 models are in 260915133251740250.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 260915133251740250 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom calculating perturbed structure for DQ=100 260915133251740250.eigenfacs 260915133251740250.atom making animated gifs 11 models are in 260915133251740250.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915133251740250.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260915133251740250.10.pdb 260915133251740250.11.pdb 260915133251740250.7.pdb 260915133251740250.8.pdb 260915133251740250.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m22.316s user 0m22.152s sys 0m0.158s rm: cannot remove '260915133251740250.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.