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***  HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR 01-MAY-12 4EY7  ***

LOGs for ID: 260915142451754435

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260915142451754435.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260915142451754435.atom to be opened. Openam> File opened: 260915142451754435.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1065 First residue number = 4 Last residue number = 542 Number of atoms found = 8344 Mean number per residue = 7.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.880028 +/- 11.140261 From: -29.931000 To: 27.758000 = -51.855188 +/- 17.828826 From: -96.643000 To: -8.178000 = 2.857290 +/- 31.353720 From: -60.632000 To: 69.696000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0744 % Filled. Pdbmat> 3366289 non-zero elements. Pdbmat> 368525 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 88.33 +/- 22.26 Maximum number = 134 Minimum number = 10 Pdbmat> Matrix trace = 7.370500E+06 Pdbmat> Larger element = 536.457 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1065 non-zero elements, NRBL set to 6 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260915142451754435.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 6 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260915142451754435.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260915142451754435.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 8344 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 6 residue(s) per block. Blocpdb> 1065 residues. Blocpdb> 47 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 40 atoms in block 2 Block first atom: 48 Blocpdb> 53 atoms in block 3 Block first atom: 88 Blocpdb> 39 atoms in block 4 Block first atom: 141 Blocpdb> 44 atoms in block 5 Block first atom: 180 Blocpdb> 44 atoms in block 6 Block first atom: 224 Blocpdb> 44 atoms in block 7 Block first atom: 268 Blocpdb> 53 atoms in block 8 Block first atom: 312 Blocpdb> 61 atoms in block 9 Block first atom: 365 Blocpdb> 38 atoms in block 10 Block first atom: 426 Blocpdb> 46 atoms in block 11 Block first atom: 464 Blocpdb> 55 atoms in block 12 Block first atom: 510 Blocpdb> 51 atoms in block 13 Block first atom: 565 Blocpdb> 50 atoms in block 14 Block first atom: 616 Blocpdb> 49 atoms in block 15 Block first atom: 666 Blocpdb> 51 atoms in block 16 Block first atom: 715 Blocpdb> 55 atoms in block 17 Block first atom: 766 Blocpdb> 45 atoms in block 18 Block first atom: 821 Blocpdb> 50 atoms in block 19 Block first atom: 866 Blocpdb> 43 atoms in block 20 Block first atom: 916 Blocpdb> 39 atoms in block 21 Block first atom: 959 Blocpdb> 47 atoms in block 22 Block first atom: 998 Blocpdb> 51 atoms in block 23 Block first atom: 1045 Blocpdb> 49 atoms in block 24 Block first atom: 1096 Blocpdb> 52 atoms in block 25 Block first atom: 1145 Blocpdb> 43 atoms in block 26 Block first atom: 1197 Blocpdb> 41 atoms in block 27 Block first atom: 1240 Blocpdb> 40 atoms in block 28 Block first atom: 1281 Blocpdb> 48 atoms in block 29 Block first atom: 1321 Blocpdb> 51 atoms in block 30 Block first atom: 1369 Blocpdb> 43 atoms in block 31 Block first atom: 1420 Blocpdb> 41 atoms in block 32 Block first atom: 1463 Blocpdb> 43 atoms in block 33 Block first atom: 1504 Blocpdb> 34 atoms in block 34 Block first atom: 1547 Blocpdb> 43 atoms in block 35 Block first atom: 1581 Blocpdb> 45 atoms in block 36 Block first atom: 1624 Blocpdb> 49 atoms in block 37 Block first atom: 1669 Blocpdb> 39 atoms in block 38 Block first atom: 1718 Blocpdb> 45 atoms in block 39 Block first atom: 1757 Blocpdb> 39 atoms in block 40 Block first atom: 1802 Blocpdb> 50 atoms in block 41 Block first atom: 1841 Blocpdb> 47 atoms in block 42 Block first atom: 1891 Blocpdb> 17 atoms in block 43 Block first atom: 1938 Blocpdb> 47 atoms in block 44 Block first atom: 1955 Blocpdb> 48 atoms in block 45 Block first atom: 2002 Blocpdb> 43 atoms in block 46 Block first atom: 2050 Blocpdb> 58 atoms in block 47 Block first atom: 2093 Blocpdb> 46 atoms in block 48 Block first atom: 2151 Blocpdb> 57 atoms in block 49 Block first atom: 2197 Blocpdb> 41 atoms in block 50 Block first atom: 2254 Blocpdb> 47 atoms in block 51 Block first atom: 2295 Blocpdb> 52 atoms in block 52 Block first atom: 2342 Blocpdb> 45 atoms in block 53 Block first atom: 2394 Blocpdb> 42 atoms in block 54 Block first atom: 2439 Blocpdb> 43 atoms in block 55 Block first atom: 2481 Blocpdb> 54 atoms in block 56 Block first atom: 2524 Blocpdb> 42 atoms in block 57 Block first atom: 2578 Blocpdb> 47 atoms in block 58 Block first atom: 2620 Blocpdb> 50 atoms in block 59 Block first atom: 2667 Blocpdb> 38 atoms in block 60 Block first atom: 2717 Blocpdb> 44 atoms in block 61 Block first atom: 2755 Blocpdb> 39 atoms in block 62 Block first atom: 2799 Blocpdb> 62 atoms in block 63 Block first atom: 2838 Blocpdb> 56 atoms in block 64 Block first atom: 2900 Blocpdb> 51 atoms in block 65 Block first atom: 2956 Blocpdb> 41 atoms in block 66 Block first atom: 3007 Blocpdb> 44 atoms in block 67 Block first atom: 3048 Blocpdb> 42 atoms in block 68 Block first atom: 3092 Blocpdb> 38 atoms in block 69 Block first atom: 3134 Blocpdb> 48 atoms in block 70 Block first atom: 3172 Blocpdb> 54 atoms in block 71 Block first atom: 3220 Blocpdb> 43 atoms in block 72 Block first atom: 3274 Blocpdb> 55 atoms in block 73 Block first atom: 3317 Blocpdb> 49 atoms in block 74 Block first atom: 3372 Blocpdb> 51 atoms in block 75 Block first atom: 3421 Blocpdb> 44 atoms in block 76 Block first atom: 3472 Blocpdb> 52 atoms in block 77 Block first atom: 3516 Blocpdb> 51 atoms in block 78 Block first atom: 3568 Blocpdb> 64 atoms in block 79 Block first atom: 3619 Blocpdb> 47 atoms in block 80 Block first atom: 3683 Blocpdb> 43 atoms in block 81 Block first atom: 3730 Blocpdb> 19 atoms in block 82 Block first atom: 3773 Blocpdb> 56 atoms in block 83 Block first atom: 3792 Blocpdb> 39 atoms in block 84 Block first atom: 3848 Blocpdb> 49 atoms in block 85 Block first atom: 3887 Blocpdb> 53 atoms in block 86 Block first atom: 3936 Blocpdb> 59 atoms in block 87 Block first atom: 3989 Blocpdb> 49 atoms in block 88 Block first atom: 4048 Blocpdb> 54 atoms in block 89 Block first atom: 4097 Blocpdb> 19 atoms in block 90 Block first atom: 4151 Blocpdb> 47 atoms in block 91 Block first atom: 4170 Blocpdb> 40 atoms in block 92 Block first atom: 4217 Blocpdb> 53 atoms in block 93 Block first atom: 4257 Blocpdb> 39 atoms in block 94 Block first atom: 4310 Blocpdb> 44 atoms in block 95 Block first atom: 4349 Blocpdb> 44 atoms in block 96 Block first atom: 4393 Blocpdb> 44 atoms in block 97 Block first atom: 4437 Blocpdb> 53 atoms in block 98 Block first atom: 4481 Blocpdb> 52 atoms in block 99 Block first atom: 4534 Blocpdb> 38 atoms in block 100 Block first atom: 4586 Blocpdb> 46 atoms in block 101 Block first atom: 4624 Blocpdb> 55 atoms in block 102 Block first atom: 4670 Blocpdb> 51 atoms in block 103 Block first atom: 4725 Blocpdb> 50 atoms in block 104 Block first atom: 4776 Blocpdb> 49 atoms in block 105 Block first atom: 4826 Blocpdb> 51 atoms in block 106 Block first atom: 4875 Blocpdb> 55 atoms in block 107 Block first atom: 4926 Blocpdb> 45 atoms in block 108 Block first atom: 4981 Blocpdb> 50 atoms in block 109 Block first atom: 5026 Blocpdb> 43 atoms in block 110 Block first atom: 5076 Blocpdb> 39 atoms in block 111 Block first atom: 5119 Blocpdb> 47 atoms in block 112 Block first atom: 5158 Blocpdb> 51 atoms in block 113 Block first atom: 5205 Blocpdb> 49 atoms in block 114 Block first atom: 5256 Blocpdb> 52 atoms in block 115 Block first atom: 5305 Blocpdb> 43 atoms in block 116 Block first atom: 5357 Blocpdb> 41 atoms in block 117 Block first atom: 5400 Blocpdb> 40 atoms in block 118 Block first atom: 5441 Blocpdb> 48 atoms in block 119 Block first atom: 5481 Blocpdb> 51 atoms in block 120 Block first atom: 5529 Blocpdb> 43 atoms in block 121 Block first atom: 5580 Blocpdb> 41 atoms in block 122 Block first atom: 5623 Blocpdb> 43 atoms in block 123 Block first atom: 5664 Blocpdb> 34 atoms in block 124 Block first atom: 5707 Blocpdb> 43 atoms in block 125 Block first atom: 5741 Blocpdb> 45 atoms in block 126 Block first atom: 5784 Blocpdb> 49 atoms in block 127 Block first atom: 5829 Blocpdb> 39 atoms in block 128 Block first atom: 5878 Blocpdb> 45 atoms in block 129 Block first atom: 5917 Blocpdb> 39 atoms in block 130 Block first atom: 5962 Blocpdb> 50 atoms in block 131 Block first atom: 6001 Blocpdb> 47 atoms in block 132 Block first atom: 6051 Blocpdb> 24 atoms in block 133 Block first atom: 6098 Blocpdb> 38 atoms in block 134 Block first atom: 6122 Blocpdb> 43 atoms in block 135 Block first atom: 6160 Blocpdb> 50 atoms in block 136 Block first atom: 6203 Blocpdb> 49 atoms in block 137 Block first atom: 6253 Blocpdb> 55 atoms in block 138 Block first atom: 6302 Blocpdb> 55 atoms in block 139 Block first atom: 6357 Blocpdb> 45 atoms in block 140 Block first atom: 6412 Blocpdb> 45 atoms in block 141 Block first atom: 6457 Blocpdb> 44 atoms in block 142 Block first atom: 6502 Blocpdb> 44 atoms in block 143 Block first atom: 6546 Blocpdb> 46 atoms in block 144 Block first atom: 6590 Blocpdb> 42 atoms in block 145 Block first atom: 6636 Blocpdb> 50 atoms in block 146 Block first atom: 6678 Blocpdb> 39 atoms in block 147 Block first atom: 6728 Blocpdb> 51 atoms in block 148 Block first atom: 6767 Blocpdb> 44 atoms in block 149 Block first atom: 6818 Blocpdb> 44 atoms in block 150 Block first atom: 6862 Blocpdb> 45 atoms in block 151 Block first atom: 6906 Blocpdb> 39 atoms in block 152 Block first atom: 6951 Blocpdb> 56 atoms in block 153 Block first atom: 6990 Blocpdb> 59 atoms in block 154 Block first atom: 7046 Blocpdb> 47 atoms in block 155 Block first atom: 7105 Blocpdb> 47 atoms in block 156 Block first atom: 7152 Blocpdb> 44 atoms in block 157 Block first atom: 7199 Blocpdb> 42 atoms in block 158 Block first atom: 7243 Blocpdb> 42 atoms in block 159 Block first atom: 7285 Blocpdb> 36 atoms in block 160 Block first atom: 7327 Blocpdb> 54 atoms in block 161 Block first atom: 7363 Blocpdb> 52 atoms in block 162 Block first atom: 7417 Blocpdb> 50 atoms in block 163 Block first atom: 7469 Blocpdb> 50 atoms in block 164 Block first atom: 7519 Blocpdb> 53 atoms in block 165 Block first atom: 7569 Blocpdb> 46 atoms in block 166 Block first atom: 7622 Blocpdb> 52 atoms in block 167 Block first atom: 7668 Blocpdb> 47 atoms in block 168 Block first atom: 7720 Blocpdb> 52 atoms in block 169 Block first atom: 7767 Blocpdb> 61 atoms in block 170 Block first atom: 7819 Blocpdb> 42 atoms in block 171 Block first atom: 7880 Blocpdb> 24 atoms in block 172 Block first atom: 7922 Blocpdb> 51 atoms in block 173 Block first atom: 7946 Blocpdb> 42 atoms in block 174 Block first atom: 7997 Blocpdb> 48 atoms in block 175 Block first atom: 8039 Blocpdb> 50 atoms in block 176 Block first atom: 8087 Blocpdb> 50 atoms in block 177 Block first atom: 8137 Blocpdb> 52 atoms in block 178 Block first atom: 8187 Blocpdb> 63 atoms in block 179 Block first atom: 8239 Blocpdb> 43 atoms in block 180 Block first atom: 8301 Blocpdb> 180 blocks. Blocpdb> At most, 64 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 17 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3366469 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 25032 Prepmat> Matrix trace = 7370500.0000 Prepmat> Last element read: 25032 25032 178.2169 Prepmat> 16291 lines saved. Prepmat> 14616 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 8344 RTB> Total mass = 8344.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 8344 RTB> Number of blocks = 180 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 220138.1560 RTB> 57564 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1080 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57564 Diagstd> Projected matrix trace = 220138.1560 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1080 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 220138.1560 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.2097053 0.3386696 0.4780714 1.5632414 1.8871147 2.6355136 4.7077260 5.7375852 7.4757301 7.5431791 9.5321908 9.7011898 9.9277401 10.1303499 10.5108937 10.9476511 11.7178630 11.9788142 12.9916923 13.0766408 13.8290242 14.1542502 15.5774896 15.9777221 16.7211624 17.1740570 17.9789731 18.5198334 19.0971522 19.3896361 20.1118394 20.5527115 21.4643122 21.8780989 22.1174742 22.4430548 22.7743781 22.8943016 23.5125111 24.3555007 25.5349745 25.9763561 26.0809573 26.8101608 27.6028889 28.0393062 28.1195295 29.3593943 30.0420560 30.4869437 30.9682363 31.6326187 32.4368429 32.6829211 33.0194833 33.5871436 34.1437362 34.9097482 35.0243169 35.7378989 37.0404487 37.3470127 37.4550858 38.0792431 38.9100024 39.3714864 39.6614829 40.2366660 40.8918881 41.3993233 42.3174175 42.5807611 42.7592926 43.1812028 43.8677412 44.0850100 44.4520364 45.0273745 45.3137609 45.8511550 46.3304795 46.5006125 46.8899051 47.4551457 47.5231089 48.7490482 49.2984938 49.9225720 50.2714580 50.7591982 51.1479618 51.4317515 51.6446457 51.9684429 52.1128354 52.4918341 52.6754094 52.8942749 53.3201519 53.8519303 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034322 0.0034326 0.0034328 0.0034331 0.0034357 0.0034365 49.7278842 63.1950971 75.0830048 135.7714037 149.1744447 176.2900948 235.6138788 260.1116803 296.9081273 298.2445321 335.2676453 338.2266170 342.1530998 345.6268737 352.0587179 359.2987901 371.7230468 375.8393034 391.4065991 392.6841554 403.8229972 408.5438843 428.5919556 434.0629449 444.0465630 450.0199123 460.4449575 467.3194082 474.5473857 478.1675599 486.9912706 492.3000084 503.0993647 507.9255628 510.6966918 514.4418185 518.2252184 519.5878414 526.5562679 535.9124073 548.7354204 553.4576500 554.5708581 562.2700998 570.5222012 575.0146530 575.8366530 588.3948006 595.1961399 599.5870230 604.3012827 610.7491254 618.4642055 620.8057250 623.9940045 629.3348992 634.5280153 641.6063278 642.6582948 649.1720129 660.8964210 663.6257284 664.5852197 670.0997160 677.3699230 681.3749859 683.8797657 688.8208337 694.4066351 698.7018635 706.4067790 708.6013738 710.0853230 713.5799645 719.2302030 721.0091101 724.0042419 728.6745352 730.9881462 735.3099123 739.1433566 740.4992399 743.5924256 748.0608664 748.5963451 758.1905212 762.4512937 767.2621176 769.9384721 773.6644780 776.6215660 778.7730922 780.3832362 782.8258034 783.9125760 786.7579755 788.1325064 789.7681481 792.9411738 796.8854876 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 8344 Rtb_to_modes> Number of blocs = 180 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9920E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.2097 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.3387 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4781 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.563 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.887 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.636 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.708 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.738 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.476 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.543 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.532 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.701 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.928 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.39 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.44 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.97 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.85 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 150192 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 1.00002 1.00000 1.00004 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 1.00001 1.00001 0.99999 1.00004 1.00002 1.00002 1.00002 1.00001 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 0.99998 0.99999 1.00003 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99998 0.99999 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99999 0.99999 0.99999 0.99998 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915142451754435.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915142451754435.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260915142451754435.atom Openam> file on opening on unit 11: 260915142451754435.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1065 First residue number = 4 Last residue number = 542 Number of atoms found = 8344 Mean number per residue = 7.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9895E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9920E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9933E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9951E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0010E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0015E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.2097 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.3387 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4781 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.563 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.887 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.636 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.708 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.738 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.476 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.543 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.532 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.701 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.928 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.39 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.44 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.97 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.85 Bfactors> 106 vectors, 25032 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.209700 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.757 for 1071 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.028 +/- 0.02 Bfactors> = 31.225 +/- 8.92 Bfactors> Shiftng-fct= 31.197 Bfactors> Scaling-fct= 496.836 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915142451754435.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915142451754435.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4320E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4324E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4327E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4330E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4355E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4364E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 49.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 63.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 75.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 135.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 176.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 235.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 260.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 296.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 298.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 338.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 342.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 345.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 352.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 371.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 375.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 391.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 408.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 428.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 434.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 460.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 474.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 486.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 503.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 507.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 514.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 526.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 548.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 553.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 575.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 588.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 604.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 649.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.6 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Chkmod> That is: 8344 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915142451754435.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915142451754435.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260915142451754435 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating 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../../bin/get_modes.sh 260915142451754435 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom 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MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 260915142451754435 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915142451754435.eigenfacs 260915142451754435.atom calculating perturbed structure for DQ=40 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be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915142451754435.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 260915142451754435.10.pdb 260915142451754435.11.pdb 260915142451754435.7.pdb 260915142451754435.8.pdb 260915142451754435.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m47.231s user 0m46.920s sys 0m0.286s rm: cannot remove '260915142451754435.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format 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