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***  OXIDOREDUCTASE 26-OCT-01 1GOS  ***

LOGs for ID: 260915155804780221

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 260915155804780221.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 260915155804780221.atom to be opened. Openam> File opened: 260915155804780221.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 990 First residue number = 4 Last residue number = 496 Number of atoms found = 7890 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = 38.504239 +/- 19.686574 From: -5.007000 To: 79.431000 = 138.875237 +/- 17.242719 From: 97.411000 To: 182.776000 = 20.810134 +/- 14.639240 From: -17.868000 To: 67.895000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.0987 % Filled. Pdbmat> 3077870 non-zero elements. Pdbmat> 336785 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.37 +/- 21.78 Maximum number = 132 Minimum number = 12 Pdbmat> Matrix trace = 6.735700E+06 Pdbmat> Larger element = 492.556 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 990 non-zero elements, NRBL set to 5 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 260915155804780221.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 5 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 260915155804780221.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 260915155804780221.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 7890 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 5 residue(s) per block. Blocpdb> 990 residues. Blocpdb> 37 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 26 atoms in block 2 Block first atom: 38 Blocpdb> 31 atoms in block 3 Block first atom: 64 Blocpdb> 35 atoms in block 4 Block first atom: 95 Blocpdb> 36 atoms in block 5 Block first atom: 130 Blocpdb> 37 atoms in block 6 Block first atom: 166 Blocpdb> 44 atoms in block 7 Block first atom: 203 Blocpdb> 33 atoms in block 8 Block first atom: 247 Blocpdb> 46 atoms in block 9 Block first atom: 280 Blocpdb> 46 atoms in block 10 Block first atom: 326 Blocpdb> 31 atoms in block 11 Block first atom: 372 Blocpdb> 36 atoms in block 12 Block first atom: 403 Blocpdb> 43 atoms in block 13 Block first atom: 439 Blocpdb> 41 atoms in block 14 Block first atom: 482 Blocpdb> 38 atoms in block 15 Block first atom: 523 Blocpdb> 43 atoms in block 16 Block first atom: 561 Blocpdb> 44 atoms in block 17 Block first atom: 604 Blocpdb> 44 atoms in block 18 Block first atom: 648 Blocpdb> 38 atoms in block 19 Block first atom: 692 Blocpdb> 44 atoms in block 20 Block first atom: 730 Blocpdb> 43 atoms in block 21 Block first atom: 774 Blocpdb> 42 atoms in block 22 Block first atom: 817 Blocpdb> 45 atoms in block 23 Block first atom: 859 Blocpdb> 48 atoms in block 24 Block first atom: 904 Blocpdb> 40 atoms in block 25 Block first atom: 952 Blocpdb> 34 atoms in block 26 Block first atom: 992 Blocpdb> 42 atoms in block 27 Block first atom: 1026 Blocpdb> 45 atoms in block 28 Block first atom: 1068 Blocpdb> 39 atoms in block 29 Block first atom: 1113 Blocpdb> 42 atoms in block 30 Block first atom: 1152 Blocpdb> 44 atoms in block 31 Block first atom: 1194 Blocpdb> 38 atoms in block 32 Block first atom: 1238 Blocpdb> 39 atoms in block 33 Block first atom: 1276 Blocpdb> 36 atoms in block 34 Block first atom: 1315 Blocpdb> 38 atoms in block 35 Block first atom: 1351 Blocpdb> 35 atoms in block 36 Block first atom: 1389 Blocpdb> 59 atoms in block 37 Block first atom: 1424 Blocpdb> 35 atoms in block 38 Block first atom: 1483 Blocpdb> 37 atoms in block 39 Block first atom: 1518 Blocpdb> 36 atoms in block 40 Block first atom: 1555 Blocpdb> 37 atoms in block 41 Block first atom: 1591 Blocpdb> 35 atoms in block 42 Block first atom: 1628 Blocpdb> 32 atoms in block 43 Block first atom: 1663 Blocpdb> 44 atoms in block 44 Block first atom: 1695 Blocpdb> 39 atoms in block 45 Block first atom: 1739 Blocpdb> 44 atoms in block 46 Block first atom: 1778 Blocpdb> 42 atoms in block 47 Block first atom: 1822 Blocpdb> 44 atoms in block 48 Block first atom: 1864 Blocpdb> 39 atoms in block 49 Block first atom: 1908 Blocpdb> 42 atoms in block 50 Block first atom: 1947 Blocpdb> 43 atoms in block 51 Block first atom: 1989 Blocpdb> 38 atoms in block 52 Block first atom: 2032 Blocpdb> 37 atoms in block 53 Block first atom: 2070 Blocpdb> 39 atoms in block 54 Block first atom: 2107 Blocpdb> 41 atoms in block 55 Block first atom: 2146 Blocpdb> 42 atoms in block 56 Block first atom: 2187 Blocpdb> 43 atoms in block 57 Block first atom: 2229 Blocpdb> 32 atoms in block 58 Block first atom: 2272 Blocpdb> 38 atoms in block 59 Block first atom: 2304 Blocpdb> 49 atoms in block 60 Block first atom: 2342 Blocpdb> 52 atoms in block 61 Block first atom: 2391 Blocpdb> 39 atoms in block 62 Block first atom: 2443 Blocpdb> 39 atoms in block 63 Block first atom: 2482 Blocpdb> 34 atoms in block 64 Block first atom: 2521 Blocpdb> 39 atoms in block 65 Block first atom: 2555 Blocpdb> 39 atoms in block 66 Block first atom: 2594 Blocpdb> 38 atoms in block 67 Block first atom: 2633 Blocpdb> 36 atoms in block 68 Block first atom: 2671 Blocpdb> 40 atoms in block 69 Block first atom: 2707 Blocpdb> 38 atoms in block 70 Block first atom: 2747 Blocpdb> 44 atoms in block 71 Block first atom: 2785 Blocpdb> 46 atoms in block 72 Block first atom: 2829 Blocpdb> 43 atoms in block 73 Block first atom: 2875 Blocpdb> 33 atoms in block 74 Block first atom: 2918 Blocpdb> 36 atoms in block 75 Block first atom: 2951 Blocpdb> 45 atoms in block 76 Block first atom: 2987 Blocpdb> 49 atoms in block 77 Block first atom: 3032 Blocpdb> 45 atoms in block 78 Block first atom: 3081 Blocpdb> 32 atoms in block 79 Block first atom: 3126 Blocpdb> 44 atoms in block 80 Block first atom: 3158 Blocpdb> 34 atoms in block 81 Block first atom: 3202 Blocpdb> 43 atoms in block 82 Block first atom: 3236 Blocpdb> 42 atoms in block 83 Block first atom: 3279 Blocpdb> 50 atoms in block 84 Block first atom: 3321 Blocpdb> 32 atoms in block 85 Block first atom: 3371 Blocpdb> 42 atoms in block 86 Block first atom: 3403 Blocpdb> 37 atoms in block 87 Block first atom: 3445 Blocpdb> 30 atoms in block 88 Block first atom: 3482 Blocpdb> 41 atoms in block 89 Block first atom: 3512 Blocpdb> 40 atoms in block 90 Block first atom: 3553 Blocpdb> 36 atoms in block 91 Block first atom: 3593 Blocpdb> 48 atoms in block 92 Block first atom: 3629 Blocpdb> 40 atoms in block 93 Block first atom: 3677 Blocpdb> 35 atoms in block 94 Block first atom: 3717 Blocpdb> 36 atoms in block 95 Block first atom: 3752 Blocpdb> 42 atoms in block 96 Block first atom: 3788 Blocpdb> 42 atoms in block 97 Block first atom: 3830 Blocpdb> 34 atoms in block 98 Block first atom: 3872 Blocpdb> 39 atoms in block 99 Block first atom: 3906 Blocpdb> 14 atoms in block 100 Block first atom: 3945 Blocpdb> 37 atoms in block 101 Block first atom: 3959 Blocpdb> 26 atoms in block 102 Block first atom: 3996 Blocpdb> 31 atoms in block 103 Block first atom: 4022 Blocpdb> 35 atoms in block 104 Block first atom: 4053 Blocpdb> 36 atoms in block 105 Block first atom: 4088 Blocpdb> 37 atoms in block 106 Block first atom: 4124 Blocpdb> 44 atoms in block 107 Block first atom: 4161 Blocpdb> 33 atoms in block 108 Block first atom: 4205 Blocpdb> 46 atoms in block 109 Block first atom: 4238 Blocpdb> 46 atoms in block 110 Block first atom: 4284 Blocpdb> 31 atoms in block 111 Block first atom: 4330 Blocpdb> 36 atoms in block 112 Block first atom: 4361 Blocpdb> 43 atoms in block 113 Block first atom: 4397 Blocpdb> 41 atoms in block 114 Block first atom: 4440 Blocpdb> 38 atoms in block 115 Block first atom: 4481 Blocpdb> 43 atoms in block 116 Block first atom: 4519 Blocpdb> 44 atoms in block 117 Block first atom: 4562 Blocpdb> 44 atoms in block 118 Block first atom: 4606 Blocpdb> 38 atoms in block 119 Block first atom: 4650 Blocpdb> 44 atoms in block 120 Block first atom: 4688 Blocpdb> 43 atoms in block 121 Block first atom: 4732 Blocpdb> 42 atoms in block 122 Block first atom: 4775 Blocpdb> 45 atoms in block 123 Block first atom: 4817 Blocpdb> 48 atoms in block 124 Block first atom: 4862 Blocpdb> 40 atoms in block 125 Block first atom: 4910 Blocpdb> 34 atoms in block 126 Block first atom: 4950 Blocpdb> 42 atoms in block 127 Block first atom: 4984 Blocpdb> 45 atoms in block 128 Block first atom: 5026 Blocpdb> 39 atoms in block 129 Block first atom: 5071 Blocpdb> 42 atoms in block 130 Block first atom: 5110 Blocpdb> 44 atoms in block 131 Block first atom: 5152 Blocpdb> 38 atoms in block 132 Block first atom: 5196 Blocpdb> 39 atoms in block 133 Block first atom: 5234 Blocpdb> 36 atoms in block 134 Block first atom: 5273 Blocpdb> 38 atoms in block 135 Block first atom: 5309 Blocpdb> 35 atoms in block 136 Block first atom: 5347 Blocpdb> 59 atoms in block 137 Block first atom: 5382 Blocpdb> 35 atoms in block 138 Block first atom: 5441 Blocpdb> 37 atoms in block 139 Block first atom: 5476 Blocpdb> 36 atoms in block 140 Block first atom: 5513 Blocpdb> 37 atoms in block 141 Block first atom: 5549 Blocpdb> 35 atoms in block 142 Block first atom: 5586 Blocpdb> 32 atoms in block 143 Block first atom: 5621 Blocpdb> 44 atoms in block 144 Block first atom: 5653 Blocpdb> 39 atoms in block 145 Block first atom: 5697 Blocpdb> 44 atoms in block 146 Block first atom: 5736 Blocpdb> 42 atoms in block 147 Block first atom: 5780 Blocpdb> 44 atoms in block 148 Block first atom: 5822 Blocpdb> 39 atoms in block 149 Block first atom: 5866 Blocpdb> 42 atoms in block 150 Block first atom: 5905 Blocpdb> 43 atoms in block 151 Block first atom: 5947 Blocpdb> 38 atoms in block 152 Block first atom: 5990 Blocpdb> 37 atoms in block 153 Block first atom: 6028 Blocpdb> 39 atoms in block 154 Block first atom: 6065 Blocpdb> 41 atoms in block 155 Block first atom: 6104 Blocpdb> 42 atoms in block 156 Block first atom: 6145 Blocpdb> 43 atoms in block 157 Block first atom: 6187 Blocpdb> 32 atoms in block 158 Block first atom: 6230 Blocpdb> 38 atoms in block 159 Block first atom: 6262 Blocpdb> 49 atoms in block 160 Block first atom: 6300 Blocpdb> 52 atoms in block 161 Block first atom: 6349 Blocpdb> 39 atoms in block 162 Block first atom: 6401 Blocpdb> 39 atoms in block 163 Block first atom: 6440 Blocpdb> 34 atoms in block 164 Block first atom: 6479 Blocpdb> 39 atoms in block 165 Block first atom: 6513 Blocpdb> 39 atoms in block 166 Block first atom: 6552 Blocpdb> 38 atoms in block 167 Block first atom: 6591 Blocpdb> 36 atoms in block 168 Block first atom: 6629 Blocpdb> 40 atoms in block 169 Block first atom: 6665 Blocpdb> 38 atoms in block 170 Block first atom: 6705 Blocpdb> 44 atoms in block 171 Block first atom: 6743 Blocpdb> 46 atoms in block 172 Block first atom: 6787 Blocpdb> 43 atoms in block 173 Block first atom: 6833 Blocpdb> 33 atoms in block 174 Block first atom: 6876 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 6909 Blocpdb> 45 atoms in block 176 Block first atom: 6945 Blocpdb> 49 atoms in block 177 Block first atom: 6990 Blocpdb> 45 atoms in block 178 Block first atom: 7039 Blocpdb> 32 atoms in block 179 Block first atom: 7084 Blocpdb> 44 atoms in block 180 Block first atom: 7116 Blocpdb> 34 atoms in block 181 Block first atom: 7160 Blocpdb> 43 atoms in block 182 Block first atom: 7194 Blocpdb> 42 atoms in block 183 Block first atom: 7237 Blocpdb> 50 atoms in block 184 Block first atom: 7279 Blocpdb> 32 atoms in block 185 Block first atom: 7329 Blocpdb> 42 atoms in block 186 Block first atom: 7361 Blocpdb> 37 atoms in block 187 Block first atom: 7403 Blocpdb> 30 atoms in block 188 Block first atom: 7440 Blocpdb> 41 atoms in block 189 Block first atom: 7470 Blocpdb> 40 atoms in block 190 Block first atom: 7511 Blocpdb> 36 atoms in block 191 Block first atom: 7551 Blocpdb> 48 atoms in block 192 Block first atom: 7587 Blocpdb> 40 atoms in block 193 Block first atom: 7635 Blocpdb> 35 atoms in block 194 Block first atom: 7675 Blocpdb> 36 atoms in block 195 Block first atom: 7710 Blocpdb> 42 atoms in block 196 Block first atom: 7746 Blocpdb> 42 atoms in block 197 Block first atom: 7788 Blocpdb> 34 atoms in block 198 Block first atom: 7830 Blocpdb> 27 atoms in block 199 Block first atom: 7863 Blocpdb> 199 blocks. Blocpdb> At most, 59 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 14 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 3078069 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 23670 Prepmat> Matrix trace = 6735700.0000 Prepmat> Last element read: 23670 23670 182.1088 Prepmat> 19901 lines saved. Prepmat> 17971 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 7890 RTB> Total mass = 7890.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 7890 RTB> Number of blocks = 199 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 241059.9820 RTB> 66459 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1194 Diagstd> Nb of non-zero elements: 66459 Diagstd> Projected matrix trace = 241059.9820 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1194 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 241059.9820 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.8664623 1.1175567 1.3128034 1.5022136 2.1530872 3.3629711 3.7038734 3.9482152 4.6218676 4.8339159 5.4619178 6.1052484 6.4184030 7.1170966 7.3830245 8.1140512 8.5874622 8.7915712 9.5283101 9.6547727 10.6095968 10.9409822 11.5871106 12.0392968 12.8412342 12.9601959 13.3154295 13.7288435 13.9555602 14.4679115 14.8069268 15.0571592 16.0923525 16.5180178 17.2960746 17.6091479 17.8678384 18.1785445 18.6248757 19.4097591 19.7504820 20.3429035 20.6382176 21.0631986 21.4349079 21.7967243 23.0705946 23.1125144 23.5751930 23.8389267 24.0024388 24.4249848 24.5136076 25.5253219 26.2181245 26.6160291 27.2409475 27.5581164 27.6917623 28.6644015 28.8080438 28.9474993 29.6158256 30.1283953 30.3542728 30.8181480 31.2675541 31.6616958 32.2712046 32.5034059 32.8046468 33.9375083 34.0584771 34.2199757 34.5604897 34.9901777 35.2214080 35.6508741 36.9554002 37.3384102 37.5945415 38.2790835 38.3230713 38.7167043 39.0920549 40.0055214 40.2158037 40.5892791 40.6926323 41.1466261 41.4603876 41.8859766 42.8489879 43.0808724 43.5721580 43.7669688 43.8282852 44.1740629 44.9868719 45.2739373 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034324 0.0034328 0.0034337 0.0034341 0.0034344 0.0034355 101.0811359 114.7968735 124.4214117 133.0948130 159.3404689 199.1392417 208.9889618 215.7722992 233.4554560 238.7507935 253.7861176 268.3162334 275.1115161 289.6988095 295.0614243 309.3243817 318.2201676 321.9797278 335.1993909 337.4164934 353.7078670 359.1893376 369.6433158 376.7869396 389.1335386 390.9318579 396.2532801 402.3576451 405.6662881 413.0457926 417.8570606 421.3730950 435.6172295 441.3409704 451.6157244 455.6847037 459.0196613 462.9934361 468.6428240 478.4156230 482.5964571 489.7807923 493.3230107 498.3763690 502.7546439 506.9800797 521.5844963 522.0581468 527.2576728 530.1986639 532.0138837 536.6763182 537.6490656 548.6316955 556.0272691 560.2307099 566.7693874 570.0593134 571.4399215 581.3888778 582.8437782 584.2528057 590.9587974 596.0508071 598.2809809 602.8351241 607.2146415 611.0297642 616.8830942 619.0984488 621.9607285 632.6088407 633.7352917 635.2360383 638.3887489 642.3450096 644.4639618 648.3811366 660.1372427 663.5492944 665.8212884 671.8557614 672.2416770 675.6853010 678.9527169 686.8394751 688.6422372 691.8324833 692.7127356 696.5661973 699.2169682 702.7965216 710.8296985 712.7504908 716.8030015 718.4036250 718.9066810 721.7369716 728.3467358 730.6668644 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 7890 Rtb_to_modes> Number of blocs = 199 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.8665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.118 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.313 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.502 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.153 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.363 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.704 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.948 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.622 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.834 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.462 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.105 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.418 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.117 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.383 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.114 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.587 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.792 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.528 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.56 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.27 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1194 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 1.00002 0.99997 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99995 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 142020 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 0.99999 1.00002 1.00001 0.99996 1.00000 1.00002 0.99997 1.00003 0.99997 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99998 0.99999 1.00001 0.99997 1.00001 0.99997 0.99999 1.00002 1.00002 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99995 1.00001 1.00002 0.99999 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 1.00001 0.99997 0.99998 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000-0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915155804780221.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915155804780221.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 260915155804780221.atom Openam> file on opening on unit 11: 260915155804780221.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 990 First residue number = 4 Last residue number = 496 Number of atoms found = 7890 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9907E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9930E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0009E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.8665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.118 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.313 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.502 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.153 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.363 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.704 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.948 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.622 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.834 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.462 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.105 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.418 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.117 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.383 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.114 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.587 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.792 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.528 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.56 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.27 Bfactors> 106 vectors, 23670 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.866500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.418 for 990 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.018 +/- 0.07 Bfactors> = 45.960 +/- 11.74 Bfactors> Shiftng-fct= 45.942 Bfactors> Scaling-fct= 177.934 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 260915155804780221.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 260915155804780221.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4322E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4326E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4354E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 101.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 114.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 124.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 159.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 209.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 215.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 253.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 275.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 295.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 318.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 335.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 353.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 359.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 369.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 390.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 402.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 405.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 421.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 7890 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915155804780221.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 260915155804780221.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 260915155804780221 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=80 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 260915155804780221 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=0 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=20 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=40 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom calculating perturbed structure for DQ=60 260915155804780221.eigenfacs 260915155804780221.atom 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