***  MDH2  ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 260915171707797285.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 260915171707797285.atom to be opened.
Openam> File opened: 260915171707797285.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1256
First residue number = 6
Last residue number = 319
Number of atoms found = 9247
Mean number per residue = 7.4
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 30.430254 +/- 16.623223 From: -14.371000 To: 71.245000
= 158.608986 +/- 19.109699 From: 117.187000 To: 205.739000
= 49.904835 +/- 20.215896 From: 4.756000 To: 93.456000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 0.9435 % Filled.
Pdbmat> 3630571 non-zero elements.
Pdbmat> 397301 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 85.93 +/- 21.28
Maximum number = 131
Minimum number = 14
Pdbmat> Matrix trace = 7.946020E+06
Pdbmat> Larger element = 507.220
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
1256 non-zero elements, NRBL set to 7
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 260915171707797285.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 7
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 260915171707797285.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
260915171707797285.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 9247 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 7 residue(s) per block.
Blocpdb> 1256 residues.
Blocpdb> 49 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 35 atoms in block 2
Block first atom: 50
Blocpdb> 54 atoms in block 3
Block first atom: 85
Blocpdb> 51 atoms in block 4
Block first atom: 139
Blocpdb> 62 atoms in block 5
Block first atom: 190
Blocpdb> 45 atoms in block 6
Block first atom: 252
Blocpdb> 54 atoms in block 7
Block first atom: 297
Blocpdb> 43 atoms in block 8
Block first atom: 351
Blocpdb> 57 atoms in block 9
Block first atom: 394
Blocpdb> 48 atoms in block 10
Block first atom: 451
Blocpdb> 49 atoms in block 11
Block first atom: 499
Blocpdb> 49 atoms in block 12
Block first atom: 548
Blocpdb> 61 atoms in block 13
Block first atom: 597
Blocpdb> 57 atoms in block 14
Block first atom: 658
Blocpdb> 43 atoms in block 15
Block first atom: 715
Blocpdb> 51 atoms in block 16
Block first atom: 758
Blocpdb> 55 atoms in block 17
Block first atom: 809
Blocpdb> 50 atoms in block 18
Block first atom: 864
Blocpdb> 56 atoms in block 19
Block first atom: 914
Blocpdb> 57 atoms in block 20
Block first atom: 970
Blocpdb> 54 atoms in block 21
Block first atom: 1027
Blocpdb> 54 atoms in block 22
Block first atom: 1081
Blocpdb> 55 atoms in block 23
Block first atom: 1135
Blocpdb> 52 atoms in block 24
Block first atom: 1190
Blocpdb> 48 atoms in block 25
Block first atom: 1242
Blocpdb> 47 atoms in block 26
Block first atom: 1290
Blocpdb> 52 atoms in block 27
Block first atom: 1337
Blocpdb> 53 atoms in block 28
Block first atom: 1389
Blocpdb> 54 atoms in block 29
Block first atom: 1442
Blocpdb> 53 atoms in block 30
Block first atom: 1496
Blocpdb> 48 atoms in block 31
Block first atom: 1549
Blocpdb> 38 atoms in block 32
Block first atom: 1597
Blocpdb> 56 atoms in block 33
Block first atom: 1635
Blocpdb> 55 atoms in block 34
Block first atom: 1691
Blocpdb> 48 atoms in block 35
Block first atom: 1746
Blocpdb> 51 atoms in block 36
Block first atom: 1794
Blocpdb> 57 atoms in block 37
Block first atom: 1845
Blocpdb> 61 atoms in block 38
Block first atom: 1902
Blocpdb> 51 atoms in block 39
Block first atom: 1963
Blocpdb> 55 atoms in block 40
Block first atom: 2014
Blocpdb> 42 atoms in block 41
Block first atom: 2069
Blocpdb> 59 atoms in block 42
Block first atom: 2111
Blocpdb> 53 atoms in block 43
Block first atom: 2170
Blocpdb> 50 atoms in block 44
Block first atom: 2223
Blocpdb> 48 atoms in block 45
Block first atom: 2273
Blocpdb> 49 atoms in block 46
Block first atom: 2321
Blocpdb> 35 atoms in block 47
Block first atom: 2370
Blocpdb> 54 atoms in block 48
Block first atom: 2405
Blocpdb> 51 atoms in block 49
Block first atom: 2459
Blocpdb> 62 atoms in block 50
Block first atom: 2510
Blocpdb> 45 atoms in block 51
Block first atom: 2572
Blocpdb> 54 atoms in block 52
Block first atom: 2617
Blocpdb> 39 atoms in block 53
Block first atom: 2671
Blocpdb> 62 atoms in block 54
Block first atom: 2710
Blocpdb> 48 atoms in block 55
Block first atom: 2772
Blocpdb> 49 atoms in block 56
Block first atom: 2820
Blocpdb> 49 atoms in block 57
Block first atom: 2869
Blocpdb> 61 atoms in block 58
Block first atom: 2918
Blocpdb> 50 atoms in block 59
Block first atom: 2979
Blocpdb> 43 atoms in block 60
Block first atom: 3029
Blocpdb> 51 atoms in block 61
Block first atom: 3072
Blocpdb> 50 atoms in block 62
Block first atom: 3123
Blocpdb> 50 atoms in block 63
Block first atom: 3173
Blocpdb> 56 atoms in block 64
Block first atom: 3223
Blocpdb> 57 atoms in block 65
Block first atom: 3279
Blocpdb> 54 atoms in block 66
Block first atom: 3336
Blocpdb> 54 atoms in block 67
Block first atom: 3390
Blocpdb> 55 atoms in block 68
Block first atom: 3444
Blocpdb> 48 atoms in block 69
Block first atom: 3499
Blocpdb> 48 atoms in block 70
Block first atom: 3547
Blocpdb> 47 atoms in block 71
Block first atom: 3595
Blocpdb> 52 atoms in block 72
Block first atom: 3642
Blocpdb> 56 atoms in block 73
Block first atom: 3694
Blocpdb> 54 atoms in block 74
Block first atom: 3750
Blocpdb> 53 atoms in block 75
Block first atom: 3804
Blocpdb> 49 atoms in block 76
Block first atom: 3857
Blocpdb> 38 atoms in block 77
Block first atom: 3906
Blocpdb> 56 atoms in block 78
Block first atom: 3944
Blocpdb> 55 atoms in block 79
Block first atom: 4000
Blocpdb> 48 atoms in block 80
Block first atom: 4055
Blocpdb> 51 atoms in block 81
Block first atom: 4103
Blocpdb> 57 atoms in block 82
Block first atom: 4154
Blocpdb> 61 atoms in block 83
Block first atom: 4211
Blocpdb> 49 atoms in block 84
Block first atom: 4272
Blocpdb> 52 atoms in block 85
Block first atom: 4321
Blocpdb> 40 atoms in block 86
Block first atom: 4373
Blocpdb> 54 atoms in block 87
Block first atom: 4413
Blocpdb> 54 atoms in block 88
Block first atom: 4467
Blocpdb> 47 atoms in block 89
Block first atom: 4521
Blocpdb> 47 atoms in block 90
Block first atom: 4568
Blocpdb> 49 atoms in block 91
Block first atom: 4615
Blocpdb> 35 atoms in block 92
Block first atom: 4664
Blocpdb> 54 atoms in block 93
Block first atom: 4699
Blocpdb> 51 atoms in block 94
Block first atom: 4753
Blocpdb> 62 atoms in block 95
Block first atom: 4804
Blocpdb> 45 atoms in block 96
Block first atom: 4866
Blocpdb> 54 atoms in block 97
Block first atom: 4911
Blocpdb> 40 atoms in block 98
Block first atom: 4965
Blocpdb> 57 atoms in block 99
Block first atom: 5005
Blocpdb> 45 atoms in block 100
Block first atom: 5062
Blocpdb> 49 atoms in block 101
Block first atom: 5107
Blocpdb> 49 atoms in block 102
Block first atom: 5156
Blocpdb> 61 atoms in block 103
Block first atom: 5205
Blocpdb> 53 atoms in block 104
Block first atom: 5266
Blocpdb> 46 atoms in block 105
Block first atom: 5319
Blocpdb> 55 atoms in block 106
Block first atom: 5365
Blocpdb> 50 atoms in block 107
Block first atom: 5420
Blocpdb> 50 atoms in block 108
Block first atom: 5470
Blocpdb> 56 atoms in block 109
Block first atom: 5520
Blocpdb> 54 atoms in block 110
Block first atom: 5576
Blocpdb> 54 atoms in block 111
Block first atom: 5630
Blocpdb> 54 atoms in block 112
Block first atom: 5684
Blocpdb> 55 atoms in block 113
Block first atom: 5738
Blocpdb> 52 atoms in block 114
Block first atom: 5793
Blocpdb> 52 atoms in block 115
Block first atom: 5845
Blocpdb> 47 atoms in block 116
Block first atom: 5897
Blocpdb> 52 atoms in block 117
Block first atom: 5944
Blocpdb> 56 atoms in block 118
Block first atom: 5996
Blocpdb> 54 atoms in block 119
Block first atom: 6052
Blocpdb> 53 atoms in block 120
Block first atom: 6106
Blocpdb> 48 atoms in block 121
Block first atom: 6159
Blocpdb> 38 atoms in block 122
Block first atom: 6207
Blocpdb> 51 atoms in block 123
Block first atom: 6245
Blocpdb> 55 atoms in block 124
Block first atom: 6296
Blocpdb> 48 atoms in block 125
Block first atom: 6351
Blocpdb> 51 atoms in block 126
Block first atom: 6399
Blocpdb> 57 atoms in block 127
Block first atom: 6450
Blocpdb> 61 atoms in block 128
Block first atom: 6507
Blocpdb> 49 atoms in block 129
Block first atom: 6568
Blocpdb> 55 atoms in block 130
Block first atom: 6617
Blocpdb> 41 atoms in block 131
Block first atom: 6672
Blocpdb> 65 atoms in block 132
Block first atom: 6713
Blocpdb> 60 atoms in block 133
Block first atom: 6778
Blocpdb> 50 atoms in block 134
Block first atom: 6838
Blocpdb> 47 atoms in block 135
Block first atom: 6888
Blocpdb> 49 atoms in block 136
Block first atom: 6935
Blocpdb> 35 atoms in block 137
Block first atom: 6984
Blocpdb> 54 atoms in block 138
Block first atom: 7019
Blocpdb> 51 atoms in block 139
Block first atom: 7073
Blocpdb> 62 atoms in block 140
Block first atom: 7124
Blocpdb> 45 atoms in block 141
Block first atom: 7186
Blocpdb> 54 atoms in block 142
Block first atom: 7231
Blocpdb> 43 atoms in block 143
Block first atom: 7285
Blocpdb> 57 atoms in block 144
Block first atom: 7328
Blocpdb> 48 atoms in block 145
Block first atom: 7385
Blocpdb> 49 atoms in block 146
Block first atom: 7433
Blocpdb> 49 atoms in block 147
Block first atom: 7482
Blocpdb> 61 atoms in block 148
Block first atom: 7531
Blocpdb> 50 atoms in block 149
Block first atom: 7592
Blocpdb> 43 atoms in block 150
Block first atom: 7642
Blocpdb> 51 atoms in block 151
Block first atom: 7685
Blocpdb> 50 atoms in block 152
Block first atom: 7736
Blocpdb> 50 atoms in block 153
Block first atom: 7786
Blocpdb> 56 atoms in block 154
Block first atom: 7836
Blocpdb> 54 atoms in block 155
Block first atom: 7892
Blocpdb> 54 atoms in block 156
Block first atom: 7946
Blocpdb> 54 atoms in block 157
Block first atom: 8000
Blocpdb> 55 atoms in block 158
Block first atom: 8054
Blocpdb> 52 atoms in block 159
Block first atom: 8109
Blocpdb> 52 atoms in block 160
Block first atom: 8161
Blocpdb> 47 atoms in block 161
Block first atom: 8213
Blocpdb> 52 atoms in block 162
Block first atom: 8260
Blocpdb> 53 atoms in block 163
Block first atom: 8312
Blocpdb> 54 atoms in block 164
Block first atom: 8365
Blocpdb> 61 atoms in block 165
Block first atom: 8419
Blocpdb> 45 atoms in block 166
Block first atom: 8480
Blocpdb> 38 atoms in block 167
Block first atom: 8525
Blocpdb> 56 atoms in block 168
Block first atom: 8563
Blocpdb> 55 atoms in block 169
Block first atom: 8619
Blocpdb> 48 atoms in block 170
Block first atom: 8674
Blocpdb> 51 atoms in block 171
Block first atom: 8722
Blocpdb> 57 atoms in block 172
Block first atom: 8773
Blocpdb> 62 atoms in block 173
Block first atom: 8830
Blocpdb> 51 atoms in block 174
Block first atom: 8892
Blocpdb> 55 atoms in block 175
Block first atom: 8943
Blocpdb> 41 atoms in block 176
Block first atom: 8998
Blocpdb> 56 atoms in block 177
Block first atom: 9039
Blocpdb> 53 atoms in block 178
Block first atom: 9095
Blocpdb> 50 atoms in block 179
Block first atom: 9148
Blocpdb> 50 atoms in block 180
Block first atom: 9197
Blocpdb> 180 blocks.
Blocpdb> At most, 65 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 35 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 3630751 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 27741
Prepmat> Matrix trace = 7946020.0000
Prepmat> Last element read: 27741 27741 176.3556
Prepmat> 16291 lines saved.
Prepmat> 14756 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 9247
RTB> Total mass = 9247.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 9247
RTB> Number of blocks = 180
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 202669.2715
RTB> 52524 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1080
Diagstd> Nb of non-zero elements: 52524
Diagstd> Projected matrix trace = 202669.2715
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1080 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 202669.2715
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 0.4642195 0.5944634 1.4862802 1.5041743
1.9047518 2.1182746 2.6143591 2.7562552 2.9393720
3.1372985 3.5217217 3.6015741 5.6666713 6.0487700
6.8594174 7.1846968 7.4927506 7.8149227 8.1402787
9.2018330 10.4435507 10.8653385 12.1314129 12.6399089
12.8775143 13.0488489 14.0348858 14.0656495 14.7655199
14.8529654 17.7402642 18.3489017 18.3926276 18.5021922
19.1445214 19.8128759 20.3293455 20.7374578 21.0918504
21.2426000 22.5239336 22.8084256 23.0637964 24.1401340
24.4986958 24.5554049 26.0530636 26.1199472 26.3133606
26.7467979 26.9349199 27.1719110 27.5608231 27.6654842
28.3894836 28.7298722 28.8524822 29.6976122 29.7721157
30.0475328 30.6898514 31.2884925 31.3114013 31.6276289
32.0452652 32.2124319 32.5013634 32.7950034 33.0209453
33.3594008 34.4720318 34.7056708 35.0221544 35.3073895
35.5003594 35.9005720 36.4870468 36.5376638 36.9992576
37.3594822 37.6451322 38.2450709 39.2713265 40.2430018
40.3070196 40.8392813 42.3823512 42.6174059 43.1855211
43.4555723 43.8955277 44.7597529 45.0313408 45.3096177
45.5185770 45.7716830 46.0311985 46.3038585 47.0607294
47.1979047
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034310 0.0034334 0.0034334 0.0034337 0.0034344
0.0034358 73.9872653 83.7255209 132.3870869 133.1816406
149.8699209 158.0470544 175.5811552 180.2830892 186.1755116
192.3415909 203.7852732 206.0826633 258.4992515 267.0722820
284.4060926 291.0713782 297.2459305 303.5691427 309.8239015
329.4067195 350.9290906 357.9455033 378.2256456 386.0710641
389.6828563 392.2666450 406.8175892 407.2632059 417.2723921
418.5061704 457.3780539 465.1578097 465.7117213 467.0967815
475.1355620 483.3581432 489.6175531 494.5076767 498.7152191
500.4942772 515.3679415 518.6124447 521.5076436 533.5377076
537.4855128 538.1072339 554.2742206 554.9852331 557.0362249
561.6052754 563.5768233 566.0507526 570.0873073 571.1687235
578.5941349 582.0524580 583.2931433 591.7742260 592.5160637
595.2503907 601.5790078 607.4179188 607.6402480 610.7009525
614.7198193 616.3211012 619.0789967 621.8693044 624.0078183
627.1976186 637.5712442 639.7282098 642.6384544 645.2501056
647.0109860 650.6477981 655.9407880 656.3956099 660.5288408
663.7365055 666.2691332 671.5572090 680.5077345 688.8750636
689.4227710 693.9598203 706.9485424 708.9062177 713.6156448
715.8433865 719.4579529 726.5058578 728.7066278 730.9547272
732.6383006 734.6723939 736.7521666 738.9309744 744.9456820
746.0305973
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 9247
Rtb_to_modes> Number of blocs = 180
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9827E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4642
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.5945
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.486
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.504
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.905
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.118
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.614
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.756
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.939
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.137
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.522
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.602
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.667
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.049
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.859
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.185
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.493
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.815
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.140
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.202
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.13
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.74
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.39
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.85
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.70
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.29
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.50
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.54
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.25
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.84
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.90
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.52
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.30
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.06
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.20
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1080 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00002 1.00003 0.99999 1.00003 1.00002
1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 166446 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00000
1.00001 0.99998 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00002 1.00003 0.99999 1.00003 1.00002
1.00001 1.00000 0.99998 0.99997 1.00001
0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000
1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00000
1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001
0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999
1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000
0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002
1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 1.00001 1.00001 0.99998
1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00000 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002
1.00000 1.00000 0.99999 0.99997 1.00003
0.99999 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000
1.00000
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4: 0.000 0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 6: 0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 7: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 8: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 10:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260915171707797285.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260915171707797285.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 260915171707797285.atom
Openam> file on opening on unit 11:
260915171707797285.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 1256
First residue number = 6
Last residue number = 319
Number of atoms found = 9247
Mean number per residue = 7.4
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9827E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9967E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9969E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9986E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4642
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.5945
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.486
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.504
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.905
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.118
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.614
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.756
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.939
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.137
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.522
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.602
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.667
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.049
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.859
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.185
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.493
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.815
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.140
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.202
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.13
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.74
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.39
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.85
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.70
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.29
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.50
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.54
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.25
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.84
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.90
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.52
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.30
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.06
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.20
Bfactors> 106 vectors, 27741 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.464200
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.353 for 1264 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.020 +/- 0.01
Bfactors> = 32.431 +/- 2.34
Bfactors> Shiftng-fct= 32.411
Bfactors> Scaling-fct= 194.429
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 260915171707797285.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
260915171707797285.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4308E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4332E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4336E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 73.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 83.72
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 133.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 149.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 158.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 175.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 180.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 186.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 192.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 206.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 258.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 291.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 303.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 329.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 350.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 358.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 378.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 386.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 407.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 417.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 418.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 467.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 483.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 489.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 518.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 521.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 538.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 557.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 561.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 571.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 578.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 582.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 583.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 591.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 592.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 595.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 607.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 610.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 614.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 619.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 621.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 624.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 627.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 637.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 642.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 647.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 650.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 655.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 660.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 666.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 671.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 680.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 689.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 693.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 713.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 730.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 734.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 738.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.0
Chkmod> 106 vectors, 27741 coordinates in file.
Chkmod> That is: 9247 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7799
0.0034 0.9603
0.0034 0.8509
0.0034 0.7598
0.0034 0.7979
0.0034 0.9647
73.9825 0.7363
83.7245 0.7465
132.3689 0.6425
133.1682 0.8377
149.8733 0.6106
158.0300 0.5919
175.5616 0.7262
180.2670 0.7426
186.1557 0.7272
192.3242 0.7243
203.7846 0.6272
206.0860 0.6009
258.4957 0.8356
267.0659 0.5569
284.3852 0.3539
291.0650 0.3771
297.2381 0.7631
303.5576 0.4577
309.8053 0.4086
329.3956 0.7899
350.8544 0.5654
358.0069 0.5735
378.1874 0.5428
386.0559 0.6317
389.7037 0.6954
392.2671 0.5334
406.7293 0.3888
407.3087 0.4617
417.3178 0.5078
418.4464 0.4945
457.3550 0.4967
465.1518 0.5275
465.6585 0.5063
467.0491 0.6207
475.0591 0.5504
483.3023 0.4653
489.6044 0.5243
494.5168 0.4196
498.6719 0.5601
500.4422 0.5199
515.3008 0.5269
518.6081 0.5967
521.4423 0.5052
533.5133 0.3969
537.4767 0.3803
538.1345 0.5560
554.2178 0.5793
554.9620 0.4883
556.9767 0.5943
561.6148 0.5497
563.5012 0.3490
566.0065 0.5727
570.0543 0.7154
571.1908 0.4129
578.5746 0.6074
582.0288 0.6284
583.2430 0.5013
591.7726 0.6761
592.4696 0.6984
595.2493 0.5516
601.5546 0.4742
607.4065 0.5470
607.6006 0.5076
610.6976 0.4927
614.7388 0.5436
616.2714 0.3625
619.0394 0.5838
621.8900 0.5425
623.9721 0.5199
627.1763 0.5033
637.5251 0.4966
639.7406 0.4724
642.5911 0.5444
645.2463 0.3327
646.9799 0.3992
650.6147 0.4117
655.9392 0.4423
656.3884 0.5073
660.5071 0.4153
663.7126 0.5587
666.2836 0.6104
671.5717 0.5439
680.4670 0.4354
688.8198 0.5971
689.4187 0.6089
693.9361 0.4427
706.8986 0.4214
708.8974 0.2635
713.6220 0.4950
715.8491 0.4909
719.4637 0.5358
726.4767 0.3973
728.6645 0.4016
730.9264 0.4373
732.6183 0.4710
734.6273 0.4042
736.7109 0.5519
738.8685 0.5270
744.9079 0.5758
746.0151 0.4482
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 260915171707797285 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
making animated gifs
11 models are in 260915171707797285.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 260915171707797285 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
making animated gifs
11 models are in 260915171707797285.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 260915171707797285 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
making animated gifs
11 models are in 260915171707797285.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 260915171707797285 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
making animated gifs
11 models are in 260915171707797285.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 260915171707797285 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
260915171707797285.eigenfacs
260915171707797285.atom
making animated gifs
11 models are in 260915171707797285.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 260915171707797285.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
260915171707797285.10.pdb
260915171707797285.11.pdb
260915171707797285.7.pdb
260915171707797285.8.pdb
260915171707797285.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m54.340s
user 0m53.918s
sys 0m0.389s
rm: cannot remove '260915171707797285.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|