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***  01-AUG-25  ***

LOGs for ID: 2609181322541682843

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2609181322541682843.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2609181322541682843.atom to be opened. Openam> File opened: 2609181322541682843.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 337 First residue number = 1 Last residue number = 337 Number of atoms found = 2694 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -4.234568 +/- 10.850621 From: -34.123000 To: 17.784000 = 5.004923 +/- 14.282898 From: -22.436000 To: 59.392000 = -4.120314 +/- 12.484791 From: -35.531000 To: 24.096000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.0182 % Filled. Pdbmat> 985841 non-zero elements. Pdbmat> 107758 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 80.00 +/- 23.41 Maximum number = 131 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 2.155160E+06 Pdbmat> Larger element = 481.548 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 337 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2609181322541682843.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2609181322541682843.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2609181322541682843.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2694 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 337 residues. Blocpdb> 16 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 16 atoms in block 2 Block first atom: 17 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 33 Blocpdb> 16 atoms in block 4 Block first atom: 47 Blocpdb> 18 atoms in block 5 Block first atom: 63 Blocpdb> 13 atoms in block 6 Block first atom: 81 Blocpdb> 8 atoms in block 7 Block first atom: 94 Blocpdb> 15 atoms in block 8 Block first atom: 102 Blocpdb> 13 atoms in block 9 Block first atom: 117 Blocpdb> 15 atoms in block 10 Block first atom: 130 Blocpdb> 13 atoms in block 11 Block first atom: 145 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 158 Blocpdb> 11 atoms in block 13 Block first atom: 176 Blocpdb> 19 atoms in block 14 Block first atom: 187 Blocpdb> 22 atoms in block 15 Block first atom: 206 Blocpdb> 13 atoms in block 16 Block first atom: 228 Blocpdb> 13 atoms in block 17 Block first atom: 241 Blocpdb> 19 atoms in block 18 Block first atom: 254 Blocpdb> 20 atoms in block 19 Block first atom: 273 Blocpdb> 26 atoms in block 20 Block first atom: 293 Blocpdb> 26 atoms in block 21 Block first atom: 319 Blocpdb> 22 atoms in block 22 Block first atom: 345 Blocpdb> 15 atoms in block 23 Block first atom: 367 Blocpdb> 12 atoms in block 24 Block first atom: 382 Blocpdb> 16 atoms in block 25 Block first atom: 394 Blocpdb> 23 atoms in block 26 Block first atom: 410 Blocpdb> 17 atoms in block 27 Block first atom: 433 Blocpdb> 19 atoms in block 28 Block first atom: 450 Blocpdb> 20 atoms in block 29 Block first atom: 469 Blocpdb> 20 atoms in block 30 Block first atom: 489 Blocpdb> 18 atoms in block 31 Block first atom: 509 Blocpdb> 17 atoms in block 32 Block first atom: 527 Blocpdb> 15 atoms in block 33 Block first atom: 544 Blocpdb> 18 atoms in block 34 Block first atom: 559 Blocpdb> 14 atoms in block 35 Block first atom: 577 Blocpdb> 16 atoms in block 36 Block first atom: 591 Blocpdb> 14 atoms in block 37 Block first atom: 607 Blocpdb> 16 atoms in block 38 Block first atom: 621 Blocpdb> 18 atoms in block 39 Block first atom: 637 Blocpdb> 15 atoms in block 40 Block first atom: 655 Blocpdb> 11 atoms in block 41 Block first atom: 670 Blocpdb> 19 atoms in block 42 Block first atom: 681 Blocpdb> 16 atoms in block 43 Block first atom: 700 Blocpdb> 22 atoms in block 44 Block first atom: 716 Blocpdb> 13 atoms in block 45 Block first atom: 738 Blocpdb> 16 atoms in block 46 Block first atom: 751 Blocpdb> 19 atoms in block 47 Block first atom: 767 Blocpdb> 16 atoms in block 48 Block first atom: 786 Blocpdb> 16 atoms in block 49 Block first atom: 802 Blocpdb> 18 atoms in block 50 Block first atom: 818 Blocpdb> 13 atoms in block 51 Block first atom: 836 Blocpdb> 15 atoms in block 52 Block first atom: 849 Blocpdb> 15 atoms in block 53 Block first atom: 864 Blocpdb> 14 atoms in block 54 Block first atom: 879 Blocpdb> 13 atoms in block 55 Block first atom: 893 Blocpdb> 14 atoms in block 56 Block first atom: 906 Blocpdb> 17 atoms in block 57 Block first atom: 920 Blocpdb> 14 atoms in block 58 Block first atom: 937 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 951 Blocpdb> 14 atoms in block 60 Block first atom: 967 Blocpdb> 16 atoms in block 61 Block first atom: 981 Blocpdb> 13 atoms in block 62 Block first atom: 997 Blocpdb> 16 atoms in block 63 Block first atom: 1010 Blocpdb> 19 atoms in block 64 Block first atom: 1026 Blocpdb> 19 atoms in block 65 Block first atom: 1045 Blocpdb> 18 atoms in block 66 Block first atom: 1064 Blocpdb> 15 atoms in block 67 Block first atom: 1082 Blocpdb> 17 atoms in block 68 Block first atom: 1097 Blocpdb> 16 atoms in block 69 Block first atom: 1114 Blocpdb> 18 atoms in block 70 Block first atom: 1130 Blocpdb> 18 atoms in block 71 Block first atom: 1148 Blocpdb> 18 atoms in block 72 Block first atom: 1166 Blocpdb> 11 atoms in block 73 Block first atom: 1184 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1195 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1208 Blocpdb> 13 atoms in block 76 Block first atom: 1220 Blocpdb> 12 atoms in block 77 Block first atom: 1233 Blocpdb> 11 atoms in block 78 Block first atom: 1245 Blocpdb> 17 atoms in block 79 Block first atom: 1256 Blocpdb> 17 atoms in block 80 Block first atom: 1273 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1290 Blocpdb> 14 atoms in block 82 Block first atom: 1309 Blocpdb> 13 atoms in block 83 Block first atom: 1323 Blocpdb> 14 atoms in block 84 Block first atom: 1336 Blocpdb> 14 atoms in block 85 Block first atom: 1350 Blocpdb> 13 atoms in block 86 Block first atom: 1364 Blocpdb> 12 atoms in block 87 Block first atom: 1377 Blocpdb> 12 atoms in block 88 Block first atom: 1389 Blocpdb> 21 atoms in block 89 Block first atom: 1401 Blocpdb> 13 atoms in block 90 Block first atom: 1422 Blocpdb> 16 atoms in block 91 Block first atom: 1435 Blocpdb> 20 atoms in block 92 Block first atom: 1451 Blocpdb> 16 atoms in block 93 Block first atom: 1471 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1487 Blocpdb> 18 atoms in block 95 Block first atom: 1506 Blocpdb> 17 atoms in block 96 Block first atom: 1524 Blocpdb> 10 atoms in block 97 Block first atom: 1541 Blocpdb> 10 atoms in block 98 Block first atom: 1551 Blocpdb> 16 atoms in block 99 Block first atom: 1561 Blocpdb> 17 atoms in block 100 Block first atom: 1577 Blocpdb> 15 atoms in block 101 Block first atom: 1594 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1609 Blocpdb> 13 atoms in block 103 Block first atom: 1624 Blocpdb> 16 atoms in block 104 Block first atom: 1637 Blocpdb> 17 atoms in block 105 Block first atom: 1653 Blocpdb> 15 atoms in block 106 Block first atom: 1670 Blocpdb> 16 atoms in block 107 Block first atom: 1685 Blocpdb> 17 atoms in block 108 Block first atom: 1701 Blocpdb> 12 atoms in block 109 Block first atom: 1718 Blocpdb> 19 atoms in block 110 Block first atom: 1730 Blocpdb> 22 atoms in block 111 Block first atom: 1749 Blocpdb> 16 atoms in block 112 Block first atom: 1771 Blocpdb> 16 atoms in block 113 Block first atom: 1787 Blocpdb> 17 atoms in block 114 Block first atom: 1803 Blocpdb> 17 atoms in block 115 Block first atom: 1820 Blocpdb> 12 atoms in block 116 Block first atom: 1837 Blocpdb> 15 atoms in block 117 Block first atom: 1849 Blocpdb> 18 atoms in block 118 Block first atom: 1864 Blocpdb> 15 atoms in block 119 Block first atom: 1882 Blocpdb> 18 atoms in block 120 Block first atom: 1897 Blocpdb> 19 atoms in block 121 Block first atom: 1915 Blocpdb> 23 atoms in block 122 Block first atom: 1934 Blocpdb> 17 atoms in block 123 Block first atom: 1957 Blocpdb> 19 atoms in block 124 Block first atom: 1974 Blocpdb> 17 atoms in block 125 Block first atom: 1993 Blocpdb> 13 atoms in block 126 Block first atom: 2010 Blocpdb> 18 atoms in block 127 Block first atom: 2023 Blocpdb> 17 atoms in block 128 Block first atom: 2041 Blocpdb> 18 atoms in block 129 Block first atom: 2058 Blocpdb> 18 atoms in block 130 Block first atom: 2076 Blocpdb> 17 atoms in block 131 Block first atom: 2094 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2111 Blocpdb> 17 atoms in block 133 Block first atom: 2127 Blocpdb> 16 atoms in block 134 Block first atom: 2144 Blocpdb> 14 atoms in block 135 Block first atom: 2160 Blocpdb> 17 atoms in block 136 Block first atom: 2174 Blocpdb> 22 atoms in block 137 Block first atom: 2191 Blocpdb> 13 atoms in block 138 Block first atom: 2213 Blocpdb> 17 atoms in block 139 Block first atom: 2226 Blocpdb> 16 atoms in block 140 Block first atom: 2243 Blocpdb> 16 atoms in block 141 Block first atom: 2259 Blocpdb> 13 atoms in block 142 Block first atom: 2275 Blocpdb> 9 atoms in block 143 Block first atom: 2288 Blocpdb> 16 atoms in block 144 Block first atom: 2297 Blocpdb> 13 atoms in block 145 Block first atom: 2313 Blocpdb> 15 atoms in block 146 Block first atom: 2326 Blocpdb> 13 atoms in block 147 Block first atom: 2341 Blocpdb> 14 atoms in block 148 Block first atom: 2354 Blocpdb> 16 atoms in block 149 Block first atom: 2368 Blocpdb> 17 atoms in block 150 Block first atom: 2384 Blocpdb> 17 atoms in block 151 Block first atom: 2401 Blocpdb> 14 atoms in block 152 Block first atom: 2418 Blocpdb> 14 atoms in block 153 Block first atom: 2432 Blocpdb> 13 atoms in block 154 Block first atom: 2446 Blocpdb> 15 atoms in block 155 Block first atom: 2459 Blocpdb> 20 atoms in block 156 Block first atom: 2474 Blocpdb> 18 atoms in block 157 Block first atom: 2494 Blocpdb> 16 atoms in block 158 Block first atom: 2512 Blocpdb> 14 atoms in block 159 Block first atom: 2528 Blocpdb> 16 atoms in block 160 Block first atom: 2542 Blocpdb> 16 atoms in block 161 Block first atom: 2558 Blocpdb> 19 atoms in block 162 Block first atom: 2574 Blocpdb> 11 atoms in block 163 Block first atom: 2593 Blocpdb> 17 atoms in block 164 Block first atom: 2604 Blocpdb> 15 atoms in block 165 Block first atom: 2621 Blocpdb> 16 atoms in block 166 Block first atom: 2636 Blocpdb> 17 atoms in block 167 Block first atom: 2652 Blocpdb> 17 atoms in block 168 Block first atom: 2669 Blocpdb> 9 atoms in block 169 Block first atom: 2685 Blocpdb> 169 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 986010 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8082 Prepmat> Matrix trace = 2155160.0000 Prepmat> Last element read: 8082 8082 124.4216 Prepmat> 14366 lines saved. Prepmat> 12543 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2694 RTB> Total mass = 2694.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2694 RTB> Number of blocks = 169 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 229315.9201 RTB> 63057 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1014 Diagstd> Nb of non-zero elements: 63057 Diagstd> Projected matrix trace = 229315.9201 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1014 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 229315.9201 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0544419 0.0627162 0.4993401 0.9437851 1.0478917 1.4882991 2.0541549 3.1844726 3.9076047 5.6186251 5.9400194 6.3358666 7.4873666 8.1638026 8.7944511 8.9846107 9.6673592 11.3592202 11.6457637 12.3155517 12.8414157 13.3214974 13.8153450 14.3295861 15.7467753 16.0608439 16.7507535 17.2628869 17.5129806 17.6388053 17.8493619 18.3797761 18.6651892 19.1970649 19.4030226 20.5738181 21.2558631 21.6463813 22.3053337 22.8768395 23.6191762 24.0870159 24.1431478 24.9774305 26.0928490 26.7990996 26.8642210 27.7750830 27.9262086 28.6052657 30.1671217 30.7686213 31.4672896 32.1030830 32.8775235 33.2457079 34.0551022 34.3033783 34.6486276 35.1294347 35.4126729 36.6706904 36.8577932 37.3553228 38.2517358 38.4467960 38.7762977 39.1956539 39.8441145 40.5189628 41.0515723 41.5351811 41.6903671 42.2769339 42.8841679 43.6231327 44.1674164 45.3252690 45.8369429 46.0031194 46.8631195 47.3816594 47.9899765 48.2041531 48.8826919 49.2900882 50.3384508 50.8472999 51.7775516 52.1736485 52.6373165 53.4133052 53.7320830 54.3212752 54.5980081 55.3558717 56.4230113 56.4526704 57.2805849 57.8078132 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034318 0.0034335 0.0034335 0.0034336 0.0034340 0.0034352 25.3373916 27.1947620 76.7349989 105.4949899 111.1612645 132.4769702 155.6366503 193.7822703 214.6597375 257.4010471 264.6605509 273.3369182 297.1391178 310.2712448 322.0324598 325.4954428 337.6363581 365.9902697 370.5776871 381.0853178 389.1362896 396.3435563 403.6232243 411.0665173 430.9144870 435.1905545 444.4392994 451.1822371 454.4387045 456.0682754 458.7822714 465.5489902 469.1497388 475.7871370 478.3325935 492.5527276 500.6504984 505.2286065 512.8609622 519.3896517 527.7492851 532.9503846 533.5710117 542.7116694 554.6972731 562.1540986 562.8366975 572.2989680 573.8538098 580.7888543 596.4337604 602.3505325 609.1509822 615.2741244 622.6511993 626.1279238 633.7038920 636.0096813 639.2022555 643.6219707 646.2114278 657.5894295 659.2648855 663.6995557 671.6157220 673.3259568 676.2051135 679.8517778 685.4525081 691.2329628 695.7611553 699.8473694 701.1535545 706.0688010 711.1214424 717.2221701 721.6826722 731.0809632 735.1959445 736.5274221 743.3800085 747.4814401 752.2644678 753.9412565 759.2290853 762.3862903 770.4513190 774.3356032 781.3867366 784.3698369 787.8474801 793.6335279 795.9982603 800.3505702 802.3866230 807.9363117 815.6867554 815.9011129 821.8621924 825.6358660 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2694 Rtb_to_modes> Number of blocs = 169 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.4442E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.2716E-02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.4993 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.9438 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.048 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.488 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.054 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.184 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.908 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.619 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.940 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.336 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.487 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.164 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.794 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.985 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.667 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.98 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.85 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.73 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.81 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1014 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00005 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00005 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 1.00002 1.00003 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 48492 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00000 1.00002 1.00000 1.00002 1.00001 0.99999 0.99999 0.99997 1.00001 1.00005 1.00003 1.00002 0.99998 0.99999 0.99999 1.00005 1.00001 1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00003 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 1.00003 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99997 0.99999 1.00000 0.99999 1.00004 0.99999 0.99997 0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00003 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 1.00001 1.00003 1.00002 1.00003 0.99999 0.99996 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99999 1.00000 0.99997 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99998 0.99998 0.99999 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99999 0.99997 0.99999 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000-0.000-0.000 Vector 5:-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609181322541682843.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609181322541682843.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2609181322541682843.atom Openam> file on opening on unit 11: 2609181322541682843.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 337 First residue number = 1 Last residue number = 337 Number of atoms found = 2694 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9874E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9974E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.4442E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.2716E-02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.4993 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.9438 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.048 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.488 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.054 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.184 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.908 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.619 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.940 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.336 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.487 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.164 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.794 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.985 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.667 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.98 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.85 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.81 Bfactors> 106 vectors, 8082 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.054442 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.473 for 337 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.241 +/- 0.89 Bfactors> = 90.800 +/- 10.30 Bfactors> Shiftng-fct= 90.559 Bfactors> Scaling-fct= 11.619 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2609181322541682843.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2609181322541682843.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 25.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 27.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 76.73 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 105.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 111.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 132.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 193.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 214.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 257.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 273.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 297.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 337.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 370.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 381.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 389.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 403.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 411.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 430.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 435.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 451.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 456.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 458.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 478.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 500.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 505.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 519.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 527.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 533.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 554.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 562.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 572.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 573.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 580.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 596.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 615.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 626.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 633.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 636.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 643.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 646.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.6 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vecteur en lecture: 699.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 701.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 706.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 711.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 717.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 721.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 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CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 802.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 815.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 825.6 Chkmod> 106 vectors, 8082 coordinates in file. Chkmod> That is: 2694 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 13 is: 1.0001 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 17 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.6553 0.0034 0.7918 0.0034 0.7490 0.0034 0.9972 0.0034 0.6758 0.0034 0.8816 25.3363 0.1381 27.1935 0.1593 76.7286 0.0398 105.4913 0.0786 111.1622 0.1102 132.4580 0.0431 155.6241 0.0660 193.7596 0.2357 214.6614 0.2651 257.3986 0.2192 264.6488 0.2037 273.3281 0.0747 297.1191 0.2434 310.2617 0.2295 322.0104 0.3401 325.4885 0.4200 337.6156 0.1625 365.9871 0.3364 370.6292 0.5171 381.1378 0.2212 389.0981 0.3862 396.3043 0.1083 403.6739 0.2928 411.0548 0.3088 430.9401 0.3235 435.1604 0.4277 444.4102 0.3732 451.1251 0.5094 454.3805 0.3116 456.0641 0.3316 458.7708 0.1138 465.5318 0.5815 469.1901 0.1535 475.8031 0.1926 478.2748 0.2823 492.4859 0.3861 500.6777 0.3712 505.2491 0.4085 512.8926 0.5276 519.4032 0.4475 527.7358 0.3967 532.9605 0.3489 533.5133 0.4123 542.7163 0.1889 554.6432 0.3209 562.1394 0.4104 562.7683 0.3448 572.3251 0.3813 573.8681 0.3545 580.8120 0.4018 596.4366 0.2211 602.3382 0.5072 609.1511 0.6718 615.2182 0.3346 622.6479 0.3162 626.1415 0.2188 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DQ=-80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom making animated gifs 11 models are in 2609181322541682843.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2609181322541682843 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom making animated gifs 11 models are in 2609181322541682843.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2609181322541682843 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom making animated gifs 11 models are in 2609181322541682843.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2609181322541682843 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=20 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100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2609181322541682843 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2609181322541682843.eigenfacs 2609181322541682843.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2609181322541682843.eigenfacs 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MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2609181322541682843.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2609181322541682843.10.pdb 2609181322541682843.11.pdb 2609181322541682843.7.pdb 2609181322541682843.8.pdb 2609181322541682843.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m17.736s user 0m17.560s sys 0m0.165s rm: cannot remove '2609181322541682843.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: 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