CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  thiolase  ***

LOGs for ID: 2610231621323558254

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2610231621323558254.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2610231621323558254.atom to be opened. Openam> File opened: 2610231621323558254.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 784 First residue number = 1 Last residue number = 392 Number of atoms found = 5784 Mean number per residue = 7.4 Pdbmat> Coordinate statistics: = 26.299170 +/- 12.640422 From: -10.946000 To: 56.681000 = -5.518622 +/- 13.706933 From: -39.626000 To: 29.952000 = -14.924535 +/- 17.654481 From: -53.583000 To: 23.375000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.5303 % Filled. Pdbmat> 2303884 non-zero elements. Pdbmat> 252170 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 87.20 +/- 24.03 Maximum number = 131 Minimum number = 11 Pdbmat> Matrix trace = 5.043400E+06 Pdbmat> Larger element = 513.265 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 784 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2610231621323558254.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2610231621323558254.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2610231621323558254.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 5784 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 784 residues. Blocpdb> 33 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 26 atoms in block 2 Block first atom: 34 Blocpdb> 30 atoms in block 3 Block first atom: 60 Blocpdb> 23 atoms in block 4 Block first atom: 90 Blocpdb> 31 atoms in block 5 Block first atom: 113 Blocpdb> 32 atoms in block 6 Block first atom: 144 Blocpdb> 27 atoms in block 7 Block first atom: 176 Blocpdb> 24 atoms in block 8 Block first atom: 203 Blocpdb> 31 atoms in block 9 Block first atom: 227 Blocpdb> 30 atoms in block 10 Block first atom: 258 Blocpdb> 26 atoms in block 11 Block first atom: 288 Blocpdb> 31 atoms in block 12 Block first atom: 314 Blocpdb> 32 atoms in block 13 Block first atom: 345 Blocpdb> 27 atoms in block 14 Block first atom: 377 Blocpdb> 26 atoms in block 15 Block first atom: 404 Blocpdb> 29 atoms in block 16 Block first atom: 430 Blocpdb> 32 atoms in block 17 Block first atom: 459 Blocpdb> 31 atoms in block 18 Block first atom: 491 Blocpdb> 24 atoms in block 19 Block first atom: 522 Blocpdb> 31 atoms in block 20 Block first atom: 546 Blocpdb> 28 atoms in block 21 Block first atom: 577 Blocpdb> 30 atoms in block 22 Block first atom: 605 Blocpdb> 22 atoms in block 23 Block first atom: 635 Blocpdb> 31 atoms in block 24 Block first atom: 657 Blocpdb> 27 atoms in block 25 Block first atom: 688 Blocpdb> 30 atoms in block 26 Block first atom: 715 Blocpdb> 25 atoms in block 27 Block first atom: 745 Blocpdb> 28 atoms in block 28 Block first atom: 770 Blocpdb> 25 atoms in block 29 Block first atom: 798 Blocpdb> 33 atoms in block 30 Block first atom: 823 Blocpdb> 32 atoms in block 31 Block first atom: 856 Blocpdb> 26 atoms in block 32 Block first atom: 888 Blocpdb> 41 atoms in block 33 Block first atom: 914 Blocpdb> 31 atoms in block 34 Block first atom: 955 Blocpdb> 32 atoms in block 35 Block first atom: 986 Blocpdb> 33 atoms in block 36 Block first atom: 1018 Blocpdb> 27 atoms in block 37 Block first atom: 1051 Blocpdb> 38 atoms in block 38 Block first atom: 1078 Blocpdb> 38 atoms in block 39 Block first atom: 1116 Blocpdb> 27 atoms in block 40 Block first atom: 1154 Blocpdb> 30 atoms in block 41 Block first atom: 1181 Blocpdb> 39 atoms in block 42 Block first atom: 1211 Blocpdb> 33 atoms in block 43 Block first atom: 1250 Blocpdb> 35 atoms in block 44 Block first atom: 1283 Blocpdb> 33 atoms in block 45 Block first atom: 1318 Blocpdb> 29 atoms in block 46 Block first atom: 1351 Blocpdb> 32 atoms in block 47 Block first atom: 1380 Blocpdb> 28 atoms in block 48 Block first atom: 1412 Blocpdb> 33 atoms in block 49 Block first atom: 1440 Blocpdb> 32 atoms in block 50 Block first atom: 1473 Blocpdb> 29 atoms in block 51 Block first atom: 1505 Blocpdb> 33 atoms in block 52 Block first atom: 1534 Blocpdb> 27 atoms in block 53 Block first atom: 1567 Blocpdb> 30 atoms in block 54 Block first atom: 1594 Blocpdb> 37 atoms in block 55 Block first atom: 1624 Blocpdb> 28 atoms in block 56 Block first atom: 1661 Blocpdb> 29 atoms in block 57 Block first atom: 1689 Blocpdb> 31 atoms in block 58 Block first atom: 1718 Blocpdb> 32 atoms in block 59 Block first atom: 1749 Blocpdb> 28 atoms in block 60 Block first atom: 1781 Blocpdb> 23 atoms in block 61 Block first atom: 1809 Blocpdb> 23 atoms in block 62 Block first atom: 1832 Blocpdb> 30 atoms in block 63 Block first atom: 1855 Blocpdb> 25 atoms in block 64 Block first atom: 1885 Blocpdb> 29 atoms in block 65 Block first atom: 1910 Blocpdb> 28 atoms in block 66 Block first atom: 1939 Blocpdb> 30 atoms in block 67 Block first atom: 1967 Blocpdb> 31 atoms in block 68 Block first atom: 1997 Blocpdb> 29 atoms in block 69 Block first atom: 2028 Blocpdb> 28 atoms in block 70 Block first atom: 2057 Blocpdb> 24 atoms in block 71 Block first atom: 2085 Blocpdb> 28 atoms in block 72 Block first atom: 2109 Blocpdb> 27 atoms in block 73 Block first atom: 2137 Blocpdb> 35 atoms in block 74 Block first atom: 2164 Blocpdb> 27 atoms in block 75 Block first atom: 2199 Blocpdb> 27 atoms in block 76 Block first atom: 2226 Blocpdb> 36 atoms in block 77 Block first atom: 2253 Blocpdb> 33 atoms in block 78 Block first atom: 2289 Blocpdb> 31 atoms in block 79 Block first atom: 2322 Blocpdb> 30 atoms in block 80 Block first atom: 2353 Blocpdb> 28 atoms in block 81 Block first atom: 2383 Blocpdb> 26 atoms in block 82 Block first atom: 2411 Blocpdb> 36 atoms in block 83 Block first atom: 2437 Blocpdb> 33 atoms in block 84 Block first atom: 2473 Blocpdb> 30 atoms in block 85 Block first atom: 2506 Blocpdb> 21 atoms in block 86 Block first atom: 2536 Blocpdb> 27 atoms in block 87 Block first atom: 2557 Blocpdb> 24 atoms in block 88 Block first atom: 2584 Blocpdb> 26 atoms in block 89 Block first atom: 2608 Blocpdb> 30 atoms in block 90 Block first atom: 2634 Blocpdb> 30 atoms in block 91 Block first atom: 2664 Blocpdb> 37 atoms in block 92 Block first atom: 2694 Blocpdb> 31 atoms in block 93 Block first atom: 2731 Blocpdb> 24 atoms in block 94 Block first atom: 2762 Blocpdb> 26 atoms in block 95 Block first atom: 2786 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 2812 Blocpdb> 28 atoms in block 97 Block first atom: 2833 Blocpdb> 32 atoms in block 98 Block first atom: 2861 Blocpdb> 33 atoms in block 99 Block first atom: 2893 Blocpdb> 26 atoms in block 100 Block first atom: 2926 Blocpdb> 30 atoms in block 101 Block first atom: 2952 Blocpdb> 23 atoms in block 102 Block first atom: 2982 Blocpdb> 31 atoms in block 103 Block first atom: 3005 Blocpdb> 32 atoms in block 104 Block first atom: 3036 Blocpdb> 27 atoms in block 105 Block first atom: 3068 Blocpdb> 24 atoms in block 106 Block first atom: 3095 Blocpdb> 31 atoms in block 107 Block first atom: 3119 Blocpdb> 30 atoms in block 108 Block first atom: 3150 Blocpdb> 26 atoms in block 109 Block first atom: 3180 Blocpdb> 31 atoms in block 110 Block first atom: 3206 Blocpdb> 32 atoms in block 111 Block first atom: 3237 Blocpdb> 27 atoms in block 112 Block first atom: 3269 Blocpdb> 26 atoms in block 113 Block first atom: 3296 Blocpdb> 29 atoms in block 114 Block first atom: 3322 Blocpdb> 32 atoms in block 115 Block first atom: 3351 Blocpdb> 31 atoms in block 116 Block first atom: 3383 Blocpdb> 24 atoms in block 117 Block first atom: 3414 Blocpdb> 31 atoms in block 118 Block first atom: 3438 Blocpdb> 28 atoms in block 119 Block first atom: 3469 Blocpdb> 30 atoms in block 120 Block first atom: 3497 Blocpdb> 22 atoms in block 121 Block first atom: 3527 Blocpdb> 31 atoms in block 122 Block first atom: 3549 Blocpdb> 27 atoms in block 123 Block first atom: 3580 Blocpdb> 30 atoms in block 124 Block first atom: 3607 Blocpdb> 25 atoms in block 125 Block first atom: 3637 Blocpdb> 28 atoms in block 126 Block first atom: 3662 Blocpdb> 25 atoms in block 127 Block first atom: 3690 Blocpdb> 33 atoms in block 128 Block first atom: 3715 Blocpdb> 32 atoms in block 129 Block first atom: 3748 Blocpdb> 26 atoms in block 130 Block first atom: 3780 Blocpdb> 41 atoms in block 131 Block first atom: 3806 Blocpdb> 31 atoms in block 132 Block first atom: 3847 Blocpdb> 32 atoms in block 133 Block first atom: 3878 Blocpdb> 33 atoms in block 134 Block first atom: 3910 Blocpdb> 27 atoms in block 135 Block first atom: 3943 Blocpdb> 38 atoms in block 136 Block first atom: 3970 Blocpdb> 38 atoms in block 137 Block first atom: 4008 Blocpdb> 27 atoms in block 138 Block first atom: 4046 Blocpdb> 30 atoms in block 139 Block first atom: 4073 Blocpdb> 39 atoms in block 140 Block first atom: 4103 Blocpdb> 33 atoms in block 141 Block first atom: 4142 Blocpdb> 35 atoms in block 142 Block first atom: 4175 Blocpdb> 33 atoms in block 143 Block first atom: 4210 Blocpdb> 29 atoms in block 144 Block first atom: 4243 Blocpdb> 32 atoms in block 145 Block first atom: 4272 Blocpdb> 28 atoms in block 146 Block first atom: 4304 Blocpdb> 33 atoms in block 147 Block first atom: 4332 Blocpdb> 32 atoms in block 148 Block first atom: 4365 Blocpdb> 29 atoms in block 149 Block first atom: 4397 Blocpdb> 33 atoms in block 150 Block first atom: 4426 Blocpdb> 27 atoms in block 151 Block first atom: 4459 Blocpdb> 30 atoms in block 152 Block first atom: 4486 Blocpdb> 37 atoms in block 153 Block first atom: 4516 Blocpdb> 28 atoms in block 154 Block first atom: 4553 Blocpdb> 29 atoms in block 155 Block first atom: 4581 Blocpdb> 31 atoms in block 156 Block first atom: 4610 Blocpdb> 32 atoms in block 157 Block first atom: 4641 Blocpdb> 28 atoms in block 158 Block first atom: 4673 Blocpdb> 23 atoms in block 159 Block first atom: 4701 Blocpdb> 23 atoms in block 160 Block first atom: 4724 Blocpdb> 30 atoms in block 161 Block first atom: 4747 Blocpdb> 25 atoms in block 162 Block first atom: 4777 Blocpdb> 29 atoms in block 163 Block first atom: 4802 Blocpdb> 28 atoms in block 164 Block first atom: 4831 Blocpdb> 30 atoms in block 165 Block first atom: 4859 Blocpdb> 31 atoms in block 166 Block first atom: 4889 Blocpdb> 29 atoms in block 167 Block first atom: 4920 Blocpdb> 28 atoms in block 168 Block first atom: 4949 Blocpdb> 24 atoms in block 169 Block first atom: 4977 Blocpdb> 28 atoms in block 170 Block first atom: 5001 Blocpdb> 27 atoms in block 171 Block first atom: 5029 Blocpdb> 35 atoms in block 172 Block first atom: 5056 Blocpdb> 27 atoms in block 173 Block first atom: 5091 Blocpdb> 27 atoms in block 174 Block first atom: 5118 Blocpdb> 36 atoms in block 175 Block first atom: 5145 Blocpdb> 33 atoms in block 176 Block first atom: 5181 Blocpdb> 31 atoms in block 177 Block first atom: 5214 Blocpdb> 30 atoms in block 178 Block first atom: 5245 Blocpdb> 28 atoms in block 179 Block first atom: 5275 Blocpdb> 26 atoms in block 180 Block first atom: 5303 Blocpdb> 36 atoms in block 181 Block first atom: 5329 Blocpdb> 33 atoms in block 182 Block first atom: 5365 Blocpdb> 30 atoms in block 183 Block first atom: 5398 Blocpdb> 21 atoms in block 184 Block first atom: 5428 Blocpdb> 27 atoms in block 185 Block first atom: 5449 Blocpdb> 24 atoms in block 186 Block first atom: 5476 Blocpdb> 26 atoms in block 187 Block first atom: 5500 Blocpdb> 30 atoms in block 188 Block first atom: 5526 Blocpdb> 30 atoms in block 189 Block first atom: 5556 Blocpdb> 37 atoms in block 190 Block first atom: 5586 Blocpdb> 31 atoms in block 191 Block first atom: 5623 Blocpdb> 24 atoms in block 192 Block first atom: 5654 Blocpdb> 26 atoms in block 193 Block first atom: 5678 Blocpdb> 21 atoms in block 194 Block first atom: 5704 Blocpdb> 28 atoms in block 195 Block first atom: 5725 Blocpdb> 32 atoms in block 196 Block first atom: 5752 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 41 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 21 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 2304080 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 17352 Prepmat> Matrix trace = 5043400.0000 Prepmat> Last element read: 17352 17352 237.5164 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17207 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 5784 RTB> Total mass = 5784.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 5784 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 268153.5168 RTB> 72624 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 72624 Diagstd> Projected matrix trace = 268153.5168 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 268153.5168 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.2458578 1.6202879 1.8814549 1.9916709 2.2290528 2.3784234 2.6718797 3.4259347 3.5217479 6.1125239 6.1882107 6.7567609 6.8534625 7.0546917 7.2598891 7.9098643 8.6650316 9.0997314 9.3091486 9.8714548 10.4712952 10.6321247 11.0907568 11.5409129 12.7466440 12.8286927 13.0684869 15.7606598 16.3819539 16.8137292 17.2360302 17.4815942 18.0324348 18.2670919 18.6617654 19.4830853 19.7482861 20.2429046 20.7069985 21.0783951 21.3524823 22.0863280 22.5808300 22.9878803 24.5143982 24.7004130 25.0028065 25.6142649 26.4231704 26.9336324 27.2232929 27.3228335 28.2274695 28.9580139 29.2767238 29.8739362 30.3398411 30.6415155 31.7590805 31.9191417 32.6791256 33.4739713 33.7406793 34.2583417 34.7042870 36.1109895 36.7144441 36.8202170 37.8898350 38.4158038 38.6870028 39.1940224 39.4991817 40.2212507 40.5142652 41.1780593 41.4318868 42.5311511 42.7795494 43.0796245 43.8848491 44.3790147 44.7168717 45.1102724 45.8625400 46.0973082 46.8187140 47.2404576 47.4791748 47.8822389 49.0956674 49.8308479 50.2596992 50.5241230 50.6125154 51.5683339 52.0337387 52.3726626 53.0333251 53.3501957 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034323 0.0034331 0.0034341 0.0034341 0.0034347 0.0034350 121.2075086 138.2265198 148.9505748 153.2512667 162.1270419 167.4710982 177.5021952 200.9948002 203.7860327 268.4760607 270.1331147 282.2698908 284.2826153 288.4259278 292.5905349 305.4075693 319.6541554 327.5741079 331.3219895 341.1818034 351.3949229 354.0831908 361.6395094 368.9056961 387.6976860 388.9434676 392.5617071 431.1044225 439.5194816 445.2739663 450.8311374 454.0313039 461.1290313 464.1196835 469.1067082 479.3184495 482.5696282 488.5755099 494.1443756 498.5561183 501.7870688 510.3369798 516.0184509 520.6486470 537.6577357 539.6937484 542.9872858 549.5867185 558.1973153 563.5633528 566.5856988 567.6205995 576.9408021 584.3589043 587.5658124 593.5284000 598.1387392 601.1050837 611.9687427 613.5089218 620.7696765 628.2737287 630.7716872 635.5920383 639.7154555 652.5517739 657.9816149 658.9287424 668.4310832 673.0545159 675.4260747 679.8376284 682.4790582 688.6888722 691.1928926 696.8322108 698.9765986 708.1884649 710.2535007 712.7401675 719.3704347 723.4093340 726.1577669 729.3449917 735.4011966 737.2810362 743.0277271 746.3668267 748.2502344 751.4195755 760.8812190 766.5569381 769.8484203 771.8709073 772.5458094 779.8064629 783.3174406 785.8643847 790.8055511 793.1645375 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 5784 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.246 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.620 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.881 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.992 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.229 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.378 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.672 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.426 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.522 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.113 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.188 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.757 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.853 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.260 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.910 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.665 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.100 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.309 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.871 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.93 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.35 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 104112 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00005 1.00000 0.99999 1.00003 0.99999 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99998 0.99999 1.00001 1.00003 1.00001 0.99998 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99998 0.99999 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 1.00001 0.99996 1.00001 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00002 0.99997 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00001 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 0.99997 0.99999 1.00002 1.00001 1.00001 0.99999 0.99999 1.00003 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 9: 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 10:-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610231621323558254.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610231621323558254.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2610231621323558254.atom Openam> file on opening on unit 11: 2610231621323558254.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 784 First residue number = 1 Last residue number = 392 Number of atoms found = 5784 Mean number per residue = 7.4 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9901E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9947E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.246 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.620 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.881 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.992 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.229 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.378 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.672 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.426 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.522 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.113 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.188 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.757 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.853 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.260 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.910 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.665 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.100 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.309 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.871 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.93 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.35 Bfactors> 106 vectors, 17352 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 1.246000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.458 for 784 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.019 +/- 0.05 Bfactors> = 18.323 +/- 8.72 Bfactors> Shiftng-fct= 18.304 Bfactors> Scaling-fct= 165.497 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2610231621323558254.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2610231621323558254.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4321E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 121.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 138.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 148.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 153.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 162.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 167.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 177.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 201.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 203.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 268.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 270.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 282.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 284.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 288.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 292.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 305.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 331.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 341.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 351.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 354.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 368.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 387.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 388.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 431.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 445.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 454.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 461.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 464.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 469.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 479.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 488.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 494.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 498.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 501.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 510.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 516.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 520.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 537.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 539.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 542.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 549.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 558.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 563.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 566.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 567.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 598.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 601.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 613.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 628.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 635.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 639.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 652.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 657.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 658.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 673.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 675.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 679.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 682.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 688.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 696.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 698.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 708.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 710.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 712.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 719.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 723.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 726.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 735.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 737.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 748.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 760.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 771.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 772.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 785.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 790.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 793.1 Chkmod> 106 vectors, 17352 coordinates in file. Chkmod> That is: 5784 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. %Chkmod-Wn> Norm of vector 9 is: 1.0002 (instead of 1.0000). %Chkmod-Wn> Norm of vector 12 is: 1.0001 (instead of 1.0000). Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7238 0.0034 0.6719 0.0034 0.9924 0.0034 0.9418 0.0034 0.9416 0.0034 0.7500 121.2092 0.0101 138.2083 0.0217 148.9262 0.0179 153.2573 0.0227 162.1182 0.0285 167.4490 0.0907 177.4986 0.1902 200.9881 0.5116 203.7846 0.4593 268.4750 0.2348 270.1169 0.1171 282.2628 0.5853 284.2608 0.3602 288.4198 0.0369 292.5802 0.0294 305.3971 0.0331 319.6399 0.1341 327.5649 0.2519 331.3051 0.4147 341.1593 0.2460 351.3581 0.4698 354.0326 0.2357 361.6116 0.3479 368.8753 0.3622 387.7321 0.3401 388.9466 0.5338 392.5676 0.4250 431.0769 0.5082 439.4744 0.5302 445.2055 0.5158 450.8637 0.4838 453.9911 0.2180 461.0781 0.2346 464.1367 0.4956 469.0644 0.3922 479.2599 0.3456 482.5699 0.3976 488.5195 0.1943 494.1590 0.1715 498.5537 0.4638 501.7364 0.4768 510.3575 0.4692 515.9868 0.4716 520.6503 0.4668 537.5864 0.4509 539.6661 0.6970 542.9335 0.2043 549.5174 0.4366 558.1399 0.4404 563.5012 0.3470 566.5271 0.4477 567.5668 0.4711 576.9419 0.4792 584.3539 0.4867 587.5735 0.2395 593.4638 0.4865 598.1146 0.4340 601.0644 0.5749 611.9513 0.5231 613.4908 0.4895 620.7513 0.5612 628.2095 0.4987 630.7383 0.5239 635.5801 0.3702 639.6485 0.4654 652.5148 0.4487 657.9135 0.5355 658.8985 0.5097 668.4038 0.5251 673.0624 0.5943 675.4232 0.4357 679.7736 0.4838 682.4568 0.4917 688.6486 0.4766 691.1268 0.4963 696.8187 0.4478 698.9307 0.5319 708.1485 0.5111 710.2268 0.4677 712.7127 0.4815 719.2998 0.4809 723.3863 0.3720 726.1520 0.5141 729.3115 0.3941 735.3493 0.4802 737.2709 0.5466 743.0060 0.4603 746.3312 0.5374 748.2246 0.4477 751.3698 0.4497 760.8821 0.3611 766.5175 0.4793 769.8177 0.3348 771.8063 0.4557 772.4934 0.3324 779.7856 0.5008 783.2557 0.4978 785.8107 0.5179 790.7468 0.4679 793.1290 0.4102 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2610231621323558254 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom making animated gifs 11 models are in 2610231621323558254.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2610231621323558254 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom making animated gifs 11 models are in 2610231621323558254.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2610231621323558254 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom making animated gifs 11 models are in 2610231621323558254.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2610231621323558254 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom making animated gifs 11 models are in 2610231621323558254.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2610231621323558254 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2610231621323558254.eigenfacs 2610231621323558254.atom making animated gifs 11 models are in 2610231621323558254.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 2610231621323558254.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2610231621323558254.10.pdb 2610231621323558254.11.pdb 2610231621323558254.7.pdb 2610231621323558254.8.pdb 2610231621323558254.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m43.022s user 0m42.712s sys 0m0.278s rm: cannot remove '2610231621323558254.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.