*** seq6.2->acc7.7(withmyr) ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610231734473577258.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610231734473577258.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610231734473577258.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 117
First residue number = 2
Last residue number = 118
Number of atoms found = 1875
Mean number per residue = 16.0
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 39.999957 +/- 8.648077 From: 20.210000 To: 63.130000
= 40.001424 +/- 7.734460 From: 21.350000 To: 61.200000
= 39.995627 +/- 6.754414 From: 23.710000 To: 56.010000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 7.8440 % Filled.
Pdbmat> 1241172 non-zero elements.
Pdbmat> 136898 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 146.02 +/- 51.28
Maximum number = 238
Minimum number = 30
Pdbmat> Matrix trace = 2.737960E+06
Pdbmat> Larger element = 833.337
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
117 non-zero elements, NRBL set to 1
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610231734473577258.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 1
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610231734473577258.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610231734473577258.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 1875 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 1 residue(s) per block.
Blocpdb> 117 residues.
Blocpdb> 49 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 14 atoms in block 2
Block first atom: 50
Blocpdb> 24 atoms in block 3
Block first atom: 64
Blocpdb> 10 atoms in block 4
Block first atom: 88
Blocpdb> 20 atoms in block 5
Block first atom: 98
Blocpdb> 22 atoms in block 6
Block first atom: 118
Blocpdb> 11 atoms in block 7
Block first atom: 140
Blocpdb> 18 atoms in block 8
Block first atom: 151
Blocpdb> 18 atoms in block 9
Block first atom: 169
Blocpdb> 7 atoms in block 10
Block first atom: 187
Blocpdb> 18 atoms in block 11
Block first atom: 194
Blocpdb> 20 atoms in block 12
Block first atom: 212
Blocpdb> 19 atoms in block 13
Block first atom: 232
Blocpdb> 11 atoms in block 14
Block first atom: 251
Blocpdb> 10 atoms in block 15
Block first atom: 262
Blocpdb> 15 atoms in block 16
Block first atom: 272
Blocpdb> 7 atoms in block 17
Block first atom: 287
Blocpdb> 15 atoms in block 18
Block first atom: 294
Blocpdb> 10 atoms in block 19
Block first atom: 309
Blocpdb> 16 atoms in block 20
Block first atom: 319
Blocpdb> 22 atoms in block 21
Block first atom: 335
Blocpdb> 14 atoms in block 22
Block first atom: 357
Blocpdb> 18 atoms in block 23
Block first atom: 371
Blocpdb> 18 atoms in block 24
Block first atom: 389
Blocpdb> 7 atoms in block 25
Block first atom: 407
Blocpdb> 18 atoms in block 26
Block first atom: 414
Blocpdb> 18 atoms in block 27
Block first atom: 432
Blocpdb> 12 atoms in block 28
Block first atom: 450
Blocpdb> 18 atoms in block 29
Block first atom: 462
Blocpdb> 18 atoms in block 30
Block first atom: 480
Blocpdb> 14 atoms in block 31
Block first atom: 498
Blocpdb> 18 atoms in block 32
Block first atom: 512
Blocpdb> 20 atoms in block 33
Block first atom: 530
Blocpdb> 18 atoms in block 34
Block first atom: 550
Blocpdb> 16 atoms in block 35
Block first atom: 568
Blocpdb> 15 atoms in block 36
Block first atom: 584
Blocpdb> 14 atoms in block 37
Block first atom: 599
Blocpdb> 18 atoms in block 38
Block first atom: 613
Blocpdb> 7 atoms in block 39
Block first atom: 631
Blocpdb> 7 atoms in block 40
Block first atom: 638
Blocpdb> 22 atoms in block 41
Block first atom: 645
Blocpdb> 16 atoms in block 42
Block first atom: 667
Blocpdb> 10 atoms in block 43
Block first atom: 683
Blocpdb> 19 atoms in block 44
Block first atom: 693
Blocpdb> 22 atoms in block 45
Block first atom: 712
Blocpdb> 14 atoms in block 46
Block first atom: 734
Blocpdb> 18 atoms in block 47
Block first atom: 748
Blocpdb> 11 atoms in block 48
Block first atom: 766
Blocpdb> 7 atoms in block 49
Block first atom: 777
Blocpdb> 22 atoms in block 50
Block first atom: 784
Blocpdb> 21 atoms in block 51
Block first atom: 806
Blocpdb> 19 atoms in block 52
Block first atom: 827
Blocpdb> 11 atoms in block 53
Block first atom: 846
Blocpdb> 19 atoms in block 54
Block first atom: 857
Blocpdb> 7 atoms in block 55
Block first atom: 876
Blocpdb> 12 atoms in block 56
Block first atom: 883
Blocpdb> 18 atoms in block 57
Block first atom: 895
Blocpdb> 22 atoms in block 58
Block first atom: 913
Blocpdb> 17 atoms in block 59
Block first atom: 935
Blocpdb> 16 atoms in block 60
Block first atom: 952
Blocpdb> 21 atoms in block 61
Block first atom: 968
Blocpdb> 19 atoms in block 62
Block first atom: 989
Blocpdb> 11 atoms in block 63
Block first atom: 1008
Blocpdb> 18 atoms in block 64
Block first atom: 1019
Blocpdb> 18 atoms in block 65
Block first atom: 1037
Blocpdb> 19 atoms in block 66
Block first atom: 1055
Blocpdb> 18 atoms in block 67
Block first atom: 1074
Blocpdb> 7 atoms in block 68
Block first atom: 1092
Blocpdb> 12 atoms in block 69
Block first atom: 1099
Blocpdb> 18 atoms in block 70
Block first atom: 1111
Blocpdb> 11 atoms in block 71
Block first atom: 1129
Blocpdb> 19 atoms in block 72
Block first atom: 1140
Blocpdb> 20 atoms in block 73
Block first atom: 1159
Blocpdb> 18 atoms in block 74
Block first atom: 1179
Blocpdb> 19 atoms in block 75
Block first atom: 1197
Blocpdb> 15 atoms in block 76
Block first atom: 1216
Blocpdb> 18 atoms in block 77
Block first atom: 1231
Blocpdb> 18 atoms in block 78
Block first atom: 1249
Blocpdb> 7 atoms in block 79
Block first atom: 1267
Blocpdb> 7 atoms in block 80
Block first atom: 1274
Blocpdb> 22 atoms in block 81
Block first atom: 1281
Blocpdb> 16 atoms in block 82
Block first atom: 1303
Blocpdb> 11 atoms in block 83
Block first atom: 1319
Blocpdb> 19 atoms in block 84
Block first atom: 1330
Blocpdb> 22 atoms in block 85
Block first atom: 1349
Blocpdb> 7 atoms in block 86
Block first atom: 1371
Blocpdb> 18 atoms in block 87
Block first atom: 1378
Blocpdb> 18 atoms in block 88
Block first atom: 1396
Blocpdb> 18 atoms in block 89
Block first atom: 1414
Blocpdb> 18 atoms in block 90
Block first atom: 1432
Blocpdb> 21 atoms in block 91
Block first atom: 1450
Blocpdb> 19 atoms in block 92
Block first atom: 1471
Blocpdb> 11 atoms in block 93
Block first atom: 1490
Blocpdb> 10 atoms in block 94
Block first atom: 1501
Blocpdb> 12 atoms in block 95
Block first atom: 1511
Blocpdb> 18 atoms in block 96
Block first atom: 1523
Blocpdb> 18 atoms in block 97
Block first atom: 1541
Blocpdb> 7 atoms in block 98
Block first atom: 1559
Blocpdb> 18 atoms in block 99
Block first atom: 1566
Blocpdb> 16 atoms in block 100
Block first atom: 1584
Blocpdb> 11 atoms in block 101
Block first atom: 1600
Blocpdb> 14 atoms in block 102
Block first atom: 1611
Blocpdb> 22 atoms in block 103
Block first atom: 1625
Blocpdb> 15 atoms in block 104
Block first atom: 1647
Blocpdb> 18 atoms in block 105
Block first atom: 1662
Blocpdb> 18 atoms in block 106
Block first atom: 1680
Blocpdb> 12 atoms in block 107
Block first atom: 1698
Blocpdb> 18 atoms in block 108
Block first atom: 1710
Blocpdb> 12 atoms in block 109
Block first atom: 1728
Blocpdb> 14 atoms in block 110
Block first atom: 1740
Blocpdb> 14 atoms in block 111
Block first atom: 1754
Blocpdb> 20 atoms in block 112
Block first atom: 1768
Blocpdb> 15 atoms in block 113
Block first atom: 1788
Blocpdb> 15 atoms in block 114
Block first atom: 1803
Blocpdb> 19 atoms in block 115
Block first atom: 1818
Blocpdb> 19 atoms in block 116
Block first atom: 1837
Blocpdb> 20 atoms in block 117
Block first atom: 1855
Blocpdb> 117 blocks.
Blocpdb> At most, 49 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 7 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 1241289 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 5625
Prepmat> Matrix trace = 2737960.0000
Prepmat> Last element read: 5625 5625 150.6252
Prepmat> 6904 lines saved.
Prepmat> 5263 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 1875
RTB> Total mass = 1875.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 1875
RTB> Number of blocks = 117
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 309289.9809
RTB> 57285 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 702
Diagstd> Nb of non-zero elements: 57285
Diagstd> Projected matrix trace = 309289.9809
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 702 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 309289.9809
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 13.9773150 17.7310017 20.6266251 25.8102950
31.7272269 32.8308372 33.2138325 39.0730110 41.2197732
45.4576999 46.8775471 47.0157208 50.1826833 51.0163655
53.1812932 55.2124442 59.3270676 60.2397964 64.0226121
65.1586781 65.6414005 66.6475119 68.4442705 70.0117084
72.1091978 74.7655928 76.7271714 78.4595187 80.9601142
82.8197495 85.3811951 86.7068369 88.6287729 90.0422468
91.8675473 93.1943550 97.2129281 98.6903238 99.7800826
100.9346127 102.1860709 103.4822504 106.2625098 107.4519536
110.2102878 114.0384684 116.0106809 118.8822424 120.7081156
120.9909376 123.9618723 125.5744007 127.8680800 128.4307065
130.1835022 132.4791637 132.9828991 134.7326262 136.2963758
137.5346721 139.7341609 142.3929791 144.1371471 145.6287513
147.4003838 147.9214015 151.5763471 152.6712717 153.9948771
154.8021650 155.3067570 155.6799639 159.2787273 160.8052861
162.3810064 164.7628977 165.9202122 169.5870324 169.9601323
172.1128596 172.7334640 174.3792776 176.6679731 176.9135432
178.9571730 179.9338898 180.5600871 182.2100006 184.1309300
184.5528404 185.5062326 187.4122877 188.3591467 189.3522539
192.0490008 192.2198310 193.4651436 195.5813514 197.9932569
200.0909630
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034307 0.0034314 0.0034317 0.0034336 0.0034349
0.0034351 405.9823530 457.2586351 493.1844417 551.6857481
611.6617707 622.2089574 625.8276914 678.7873186 697.1850719
732.1482163 743.4944305 744.5893662 769.2583519 775.6218550
791.9079946 806.8889482 836.4148248 842.8242603 868.8843497
876.5595238 879.8004901 886.5173730 898.3877672 908.6164975
922.1267324 938.9580095 951.1956911 961.8738108 977.0816031
988.2395634 1003.4053097 1011.1648211 1022.3100931 1030.4298757
1040.8217066 1048.3108574 1070.6740887 1078.7792076 1084.7189062
1090.9763617 1097.7188717 1104.6589423 1119.4000318 1125.6475701
1140.0039300 1159.6340746 1169.6186057 1184.0056490 1193.0633790
1194.4602495 1209.0363099 1216.8746313 1227.9377538 1230.6362854
1239.0055609 1249.8821597 1252.2561652 1260.4675449 1267.7611362
1273.5071234 1283.6498547 1295.8047526 1303.7167377 1310.4451358
1318.3920863 1320.7200981 1336.9371720 1341.7572227 1347.5609490
1351.0884936 1353.2887011 1354.9137228 1370.4846282 1377.0364646
1383.7667620 1393.8787300 1398.7655496 1414.1373746 1415.6921065
1424.6295240 1427.1956769 1433.9787557 1443.3584315 1444.3612236
1452.6795924 1456.6384331 1459.1708934 1465.8225046 1473.5288852
1475.2161125 1479.0216561 1486.6006256 1490.3512544 1494.2749630
1504.8780452 1505.5472012 1510.4162359 1518.6545706 1527.9898878
1536.0629620
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 1875
Rtb_to_modes> Number of blocs = 117
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9812E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9866E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.98
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.83
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 39.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.88
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.18
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.33
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.02
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.16
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.64
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.65
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.44
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.11
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.82
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.71
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.87
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.19
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 116.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 121.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 124.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 127.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 130.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 132.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 133.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 134.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 136.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 137.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 139.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 142.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 144.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 145.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 147.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 151.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 152.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 154.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 155.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 159.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 160.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 162.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 164.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 165.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 169.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 170.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 172.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 174.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 176.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 176.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 179.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 179.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 180.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 182.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 184.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 184.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 185.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 187.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 188.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 189.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 192.2
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 193.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 195.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 198.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 200.1
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 702 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998
0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 0.99998
0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99997
1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002
1.00002 0.99996 1.00002 0.99999 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00004
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 33750 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
1.00001 1.00002 0.99998 0.99998 1.00000
1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00001
1.00001 0.99999 1.00002 1.00001 0.99998
0.99999 1.00003 1.00000 1.00003 0.99998
0.99997 0.99999 0.99998 1.00002 1.00002
1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00001
1.00001 0.99998 1.00000 1.00001 1.00000
1.00000 1.00002 1.00000 0.99997 0.99997
1.00000 1.00003 1.00001 1.00002 0.99999
1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00001
1.00003 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 0.99996 1.00002
1.00002 0.99996 1.00002 0.99999 0.99998
1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000
0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999
0.99999 0.99998 0.99999 1.00000 1.00000
1.00001 1.00002 1.00000 0.99999 0.99998
0.99996 1.00000 1.00002 0.99999 1.00001
0.99999 0.99999 0.99999 0.99997 1.00004
1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 1.00001
1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3:-0.000-0.000
Vector 4:-0.000 0.000-0.000
Vector 5:-0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000
Vector 7: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000
Vector 9:-0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000
Vector 10:-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610231734473577258.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610231734473577258.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610231734473577258.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610231734473577258.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 117
First residue number = 2
Last residue number = 118
Number of atoms found = 1875
Mean number per residue = 16.0
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9812E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9853E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9866E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9981E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0007E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.98
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.83
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 39.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.88
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.18
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.33
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.02
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.16
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.64
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.65
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.44
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.11
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.82
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.71
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.87
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.19
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 116.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 121.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 124.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 127.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 130.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 132.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 133.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 134.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 136.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 137.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 139.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 142.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 144.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 145.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 147.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 151.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 152.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 154.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 155.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 159.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 160.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 162.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 164.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 165.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 169.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 170.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 172.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 174.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 176.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 179.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 180.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 182.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 184.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 185.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 187.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 188.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 189.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 192.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 193.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 195.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 198.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 200.1
Bfactors> 106 vectors, 5625 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 13.980000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
%Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant !
Bfactors> = 0.008 +/- 0.01
Bfactors> = 0.000 +/- 0.00
Bfactors> Shiftng-fct= -0.008
Bfactors> Scaling-fct= 0.000
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610231734473577258.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610231734473577258.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1159.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1170.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1217.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1228.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1239.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1250.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1268.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1273.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1296.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1337.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1342.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1348.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1351.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1353.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1371.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1377.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1384.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1394.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1399.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1414.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1416.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1425.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1443.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1444.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1453.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1456.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1459.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1466.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1473.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1479.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1486.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1490.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1494.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1505.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1505.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1510.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1519.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1528.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1536.
Chkmod> 106 vectors, 5625 coordinates in file.
Chkmod> That is: 1875 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
%Chkmod-Wn> Norm of vector 62 is: 0.9999 (instead of 1.0000).
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.8778
0.0034 0.7464
0.0034 0.8567
0.0034 0.7419
0.0034 0.8440
0.0034 0.8840
406.0039 0.0993
457.2261 0.2380
493.2036 0.1357
551.6589 0.3351
611.6622 0.4851
622.1743 0.3709
625.7647 0.3877
678.7320 0.1995
697.1571 0.2471
732.1353 0.3184
743.4820 0.2232
744.5913 0.1860
769.2048 0.2802
775.6162 0.2999
791.8644 0.3501
806.8365 0.3264
836.3996 0.2122
842.7895 0.2804
868.8293 0.3417
876.5308 0.5284
879.7533 0.4050
886.4959 0.4331
898.3212 0.3919
908.5664 0.2560
922.0923 0.5639
938.9454 0.4957
951.1724 0.3954
961.8355 0.4446
977.0390 0.2602
988.1986 0.2139
1003.3552 0.3692
1011.1399 0.4008
1022.2733 0.3734
1030.3728 0.3249
1040.7909 0.4115
1048.2414 0.2988
1070.6120 0.1161
1078.7311 0.4202
1084.6719 0.2007
1090.7425 0.2755
1097.7466 0.3246
1104.7063 0.3078
1119.5494 0.2773
1125.8509 0.2648
1139.9018 0.2959
1159.3887 0.3738
1169.5146 0.2100
1184.0432 0.2802
1192.9721 0.3484
1194.4537 0.3057
1209.1703 0.2448
1216.9464 0.5029
1228.0383 0.3609
1230.4363 0.3448
1239.0309 0.3724
1249.9268 0.1370
1252.2829 0.5002
1260.2608 0.2007
1267.7236 0.2106
1273.2919 0.4347
1283.4378 0.4149
1295.7811 0.3122
1303.4928 0.3386
1310.2595 0.1613
1318.3338 0.0936
1320.5679 0.2271
1336.9841 0.3383
1341.8259 0.2437
1347.5255 0.4151
1351.0210 0.2327
1353.2012 0.3914
1354.9427 0.2228
1370.5173 0.4004
1376.9547 0.3502
1383.7883 0.3482
1393.9758 0.3802
1398.6203 0.3981
1414.1307 0.2692
1415.7974 0.2896
1424.5151 0.3739
1426.9962 0.4044
1434.0024 0.2774
1443.4273 0.3189
1444.2439 0.2564
1452.7910 0.3802
1456.4387 0.3811
1459.2695 0.3175
1465.7194 0.3718
1473.3419 0.0498
1475.3412 0.2579
1478.9333 0.3393
1486.4881 0.2969
1490.4489 0.4270
1494.3992 0.3550
1504.6215 0.3703
1505.4049 0.3297
1510.4875 0.3454
1518.6618 0.3446
1527.9503 0.3801
1536.0317 0.4281
Project conformational change on normal modes:
Projmod> Version 1.36, April 2003.
Projmod> Projection of a difference vector on a set of eigenvectors.
Getnam> CERFACS file with the eigenvectors ?
Getnam> 2610231734473577258.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610231734473577258.eigenfacs
Getnam> Pdb file with the reference structure ?
Getnam> 2610231734473577258.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610231734473577258.atom
Getnam> Pdb file with the other conformer ?
Getnam> 2610231734473577258.atom2
Openam> file on opening on unit 12:
2610231734473577258.atom2
Getrep> Are the masses given in the pdb file ? (y/n)
Getrep> F
Projmod> All masses will all be assumed to be of 1.
Getrep> Displacement along one mode ? (y/n)
Getrep> F
Openam> file on opening on unit 13:
projmod.res
Openam> file on opening on unit 14:
dr.res
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4306E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4313E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4315E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4350E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 406.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 493.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 551.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 611.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 625.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 678.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 697.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 732.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 743.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 769.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 775.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 791.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 836.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 842.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 868.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 876.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 898.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 922.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 938.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 951.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 961.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1003.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1011.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1030.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1041.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1048.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1079.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1085.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1091.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1098.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1105.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1120.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1126.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1159.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1170.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1184.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1193.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1194.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1217.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1228.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1239.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1250.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1252.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1260.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1268.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1273.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1283.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1296.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1303.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1310.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1318.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1321.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1337.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1342.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1348.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1351.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1353.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1355.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1371.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1377.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1384.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1394.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1399.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1414.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1416.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1425.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1427.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1434.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1443.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1444.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1453.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1456.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1459.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1466.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1473.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1475.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1479.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1486.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1490.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1494.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1505.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1505.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1510.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1519.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1528.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1536.
Projmod> 106 vectors, 5625 coordinates in file.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 117
First residue number = 2
Last residue number = 118
Number of atoms found = 1875
Mean number per residue = 16.0
Projmod> Cartesian (eigen)vectors will be studied.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 117
First residue number = 2
Last residue number = 118
Number of atoms found = 1875
Mean number per residue = 16.0
Projmod> File dr.res: displacement=f(atom number).
Projmod> 1875 atoms are considered.
Projmod> Atomic r.m.s. displacements= 3.52
Projmod> Atomic average masses = 1.00 +/- 0.00
Projmod> File projmod.res: dr.vector=f(fqcy), and cumulative square sum.
Vector: 1 F= 0.00 Cos= 0.033 Sum= 0.001 q= 4.9604
Vector: 2 F= 0.00 Cos= -0.011 Sum= 0.001 q= -1.6257
Vector: 3 F= 0.00 Cos= 0.014 Sum= 0.001 q= 2.1969
Vector: 4 F= 0.00 Cos= 0.053 Sum= 0.004 q= 7.9989
Vector: 5 F= 0.00 Cos= 0.021 Sum= 0.005 q= 3.2313
Vector: 6 F= 0.00 Cos= 0.030 Sum= 0.006 q= 4.6399
Vector: 7 F= 406.00 Cos= 0.110 Sum= 0.018 q= 16.7508
Vector: 8 F= 457.23 Cos= -0.042 Sum= 0.019 q= -6.4244
Vector: 9 F= 493.20 Cos= 0.151 Sum= 0.042 q= 22.9549
Vector: 10 F= 551.66 Cos= 0.166 Sum= 0.070 q= 25.2047
Vector: 11 F= 611.66 Cos= -0.152 Sum= 0.093 q= -23.1922
Vector: 12 F= 622.17 Cos= -0.065 Sum= 0.097 q= -9.8299
Vector: 13 F= 625.76 Cos= 0.099 Sum= 0.107 q= 15.1337
Vector: 14 F= 678.73 Cos= 0.030 Sum= 0.108 q= 4.6126
Vector: 15 F= 697.16 Cos= -0.059 Sum= 0.111 q= -8.9802
Vector: 16 F= 732.14 Cos= -0.157 Sum= 0.136 q= -23.9332
Vector: 17 F= 743.48 Cos= -0.021 Sum= 0.136 q= -3.1490
Vector: 18 F= 744.59 Cos= -0.056 Sum= 0.139 q= -8.5595
Vector: 19 F= 769.20 Cos= -0.000 Sum= 0.139 q= -0.0024
Vector: 20 F= 775.62 Cos= -0.018 Sum= 0.140 q= -2.8031
Vector: 21 F= 791.86 Cos= -0.123 Sum= 0.155 q= -18.7421
Vector: 22 F= 806.84 Cos= 0.019 Sum= 0.155 q= 2.8211
Vector: 23 F= 836.40 Cos= -0.078 Sum= 0.161 q= -11.8362
Vector: 24 F= 842.79 Cos= -0.018 Sum= 0.162 q= -2.7920
Vector: 25 F= 868.83 Cos= -0.013 Sum= 0.162 q= -1.9989
Vector: 26 F= 876.53 Cos= 0.041 Sum= 0.164 q= 6.3041
Vector: 27 F= 879.75 Cos= 0.032 Sum= 0.165 q= 4.8859
Vector: 28 F= 886.50 Cos= -0.126 Sum= 0.181 q= -19.2429
Vector: 29 F= 898.32 Cos= 0.011 Sum= 0.181 q= 1.6859
Vector: 30 F= 908.57 Cos= -0.113 Sum= 0.193 q= -17.1990
Vector: 31 F= 922.09 Cos= -0.029 Sum= 0.194 q= -4.3607
Vector: 32 F= 938.95 Cos= 0.016 Sum= 0.194 q= 2.4894
Vector: 33 F= 951.17 Cos= -0.055 Sum= 0.198 q= -8.4378
Vector: 34 F= 961.84 Cos= -0.052 Sum= 0.200 q= -7.8535
Vector: 35 F= 977.04 Cos= 0.110 Sum= 0.212 q= 16.7195
Vector: 36 F= 988.20 Cos= -0.010 Sum= 0.212 q= -1.4804
Vector: 37 F= 1003.36 Cos= -0.016 Sum= 0.213 q= -2.4093
Vector: 38 F= 1011.14 Cos= 0.042 Sum= 0.214 q= 6.4187
Vector: 39 F= 1022.27 Cos= -0.023 Sum= 0.215 q= -3.4603
Vector: 40 F= 1030.37 Cos= 0.018 Sum= 0.215 q= 2.8012
Vector: 41 F= 1040.79 Cos= -0.010 Sum= 0.215 q= -1.5390
Vector: 42 F= 1048.24 Cos= -0.040 Sum= 0.217 q= -6.1644
Vector: 43 F= 1070.61 Cos= -0.033 Sum= 0.218 q= -4.9800
Vector: 44 F= 1078.73 Cos= -0.101 Sum= 0.228 q= -15.4476
Vector: 45 F= 1084.67 Cos= 0.040 Sum= 0.230 q= 6.0404
Vector: 46 F= 1090.74 Cos= 0.032 Sum= 0.231 q= 4.8106
Vector: 47 F= 1097.75 Cos= -0.051 Sum= 0.233 q= -7.7216
Vector: 48 F= 1104.71 Cos= 0.029 Sum= 0.234 q= 4.3456
Vector: 49 F= 1119.55 Cos= 0.057 Sum= 0.237 q= 8.6313
Vector: 50 F= 1125.85 Cos= -0.021 Sum= 0.238 q= -3.2151
Vector: 51 F= 1139.90 Cos= -0.037 Sum= 0.239 q= -5.6370
Vector: 52 F= 1159.39 Cos= -0.019 Sum= 0.240 q= -2.9381
Vector: 53 F= 1169.51 Cos= 0.068 Sum= 0.244 q= 10.3590
Vector: 54 F= 1184.04 Cos= -0.013 Sum= 0.244 q= -2.0322
Vector: 55 F= 1192.97 Cos= 0.090 Sum= 0.253 q= 13.6550
Vector: 56 F= 1194.45 Cos= 0.017 Sum= 0.253 q= 2.5180
Vector: 57 F= 1209.17 Cos= -0.008 Sum= 0.253 q= -1.1502
Vector: 58 F= 1216.95 Cos= 0.077 Sum= 0.259 q= 11.6573
Vector: 59 F= 1228.04 Cos= 0.012 Sum= 0.259 q= 1.8271
Vector: 60 F= 1230.44 Cos= -0.015 Sum= 0.259 q= -2.2631
Vector: 61 F= 1239.03 Cos= 0.017 Sum= 0.259 q= 2.6612
%Projmod-Wn> Eigenvector 62 Norm= 0.9999
Vector: 62 F= 1249.93 Cos= 0.021 Sum= 0.260 q= 3.2184
Vector: 63 F= 1252.28 Cos= 0.031 Sum= 0.261 q= 4.7770
Vector: 64 F= 1260.26 Cos= 0.008 Sum= 0.261 q= 1.2554
Vector: 65 F= 1267.72 Cos= -0.006 Sum= 0.261 q= -0.8691
Vector: 66 F= 1273.29 Cos= -0.022 Sum= 0.261 q= -3.3001
Vector: 67 F= 1283.44 Cos= -0.008 Sum= 0.261 q= -1.2833
Vector: 68 F= 1295.78 Cos= 0.045 Sum= 0.263 q= 6.8197
Vector: 69 F= 1303.49 Cos= -0.015 Sum= 0.264 q= -2.3127
Vector: 70 F= 1310.26 Cos= -0.029 Sum= 0.265 q= -4.4470
Vector: 71 F= 1318.33 Cos= -0.003 Sum= 0.265 q= -0.4950
Vector: 72 F= 1320.57 Cos= -0.003 Sum= 0.265 q= -0.4586
Vector: 73 F= 1336.98 Cos= -0.021 Sum= 0.265 q= -3.1405
Vector: 74 F= 1341.83 Cos= 0.020 Sum= 0.265 q= 2.9981
Vector: 75 F= 1347.53 Cos= 0.004 Sum= 0.265 q= 0.6455
Vector: 76 F= 1351.02 Cos= -0.047 Sum= 0.268 q= -7.1610
Vector: 77 F= 1353.20 Cos= 0.031 Sum= 0.269 q= 4.7019
Vector: 78 F= 1354.94 Cos= 0.066 Sum= 0.273 q= 10.0548
Vector: 79 F= 1370.52 Cos= -0.018 Sum= 0.273 q= -2.7471
Vector: 80 F= 1376.95 Cos= -0.002 Sum= 0.273 q= -0.3742
Vector: 81 F= 1383.79 Cos= -0.017 Sum= 0.274 q= -2.5562
Vector: 82 F= 1393.98 Cos= 0.054 Sum= 0.276 q= 8.2763
Vector: 83 F= 1398.62 Cos= 0.051 Sum= 0.279 q= 7.7449
Vector: 84 F= 1414.13 Cos= -0.015 Sum= 0.279 q= -2.3316
Vector: 85 F= 1415.80 Cos= 0.011 Sum= 0.279 q= 1.7257
Vector: 86 F= 1424.52 Cos= 0.089 Sum= 0.287 q= 13.6198
Vector: 87 F= 1427.00 Cos= -0.037 Sum= 0.289 q= -5.6305
Vector: 88 F= 1434.00 Cos= -0.007 Sum= 0.289 q= -1.0080
Vector: 89 F= 1443.43 Cos= -0.026 Sum= 0.290 q= -3.9154
Vector: 90 F= 1444.24 Cos= -0.029 Sum= 0.290 q= -4.4269
Vector: 91 F= 1452.79 Cos= -0.003 Sum= 0.290 q= -0.4802
Vector: 92 F= 1456.44 Cos= 0.077 Sum= 0.296 q= 11.7118
Vector: 93 F= 1459.27 Cos= 0.013 Sum= 0.296 q= 1.9948
Vector: 94 F= 1465.72 Cos= 0.025 Sum= 0.297 q= 3.7657
Vector: 95 F= 1473.34 Cos= 0.037 Sum= 0.298 q= 5.6933
Vector: 96 F= 1475.34 Cos= -0.004 Sum= 0.298 q= -0.6138
Vector: 97 F= 1478.93 Cos= -0.030 Sum= 0.299 q= -4.6322
Vector: 98 F= 1486.49 Cos= 0.012 Sum= 0.300 q= 1.8905
Vector: 99 F= 1490.45 Cos= -0.053 Sum= 0.302 q= -8.1251
Vector: 100 F= 1494.40 Cos= 0.057 Sum= 0.306 q= 8.6636
Vector: 101 F= 1504.62 Cos= -0.025 Sum= 0.306 q= -3.8391
Vector: 102 F= 1505.40 Cos= -0.007 Sum= 0.306 q= -0.9925
Vector: 103 F= 1510.49 Cos= -0.061 Sum= 0.310 q= -9.3190
Vector: 104 F= 1518.66 Cos= -0.025 Sum= 0.311 q= -3.7996
Vector: 105 F= 1527.95 Cos= 0.049 Sum= 0.313 q= 7.4252
Vector: 106 F= 1536.03 Cos= 0.033 Sum= 0.314 q= 4.9950
Projmod> Best zero-frequency found : 0.003431
Projmod> 6 frequencies less than: 0.003435
Projmod> Lowest non-zero frequency : 406.003916
Projmod> Best overlap with diff.vect. = 0.17 for mode 10 with F= 551.66 cm-1.
Projmod> 1-3-6-9-12-all-best contrb. = 0.027 0.075 0.129 0.166 0.194 0.314
Projmod> Normal end.
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610231734473577258 7 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
making animated gifs
11 models are in 2610231734473577258.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=7 DQ=-100 117 3.259 97 1.274
MODEL 2 MODE=7 DQ=-80 117 2.956 98 1.252
MODEL 3 MODE=7 DQ=-60 117 2.681 99 1.226
MODEL 4 MODE=7 DQ=-40 117 2.441 101 1.255
MODEL 5 MODE=7 DQ=-20 117 2.250 102 1.202
MODEL 6 MODE=7 DQ=0 117 2.120 104 1.232
MODEL 7 MODE=7 DQ=20 117 2.063 107 1.337
MODEL 8 MODE=7 DQ=40 117 2.084 105 1.318
MODEL 9 MODE=7 DQ=60 117 2.182 104 1.337
MODEL 10 MODE=7 DQ=80 117 2.347 103 1.311
MODEL 11 MODE=7 DQ=100 117 2.566 103 1.344
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610231734473577258 8 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
making animated gifs
11 models are in 2610231734473577258.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=8 DQ=-100 117 2.675 95 1.409
MODEL 2 MODE=8 DQ=-80 117 2.459 99 1.376
MODEL 3 MODE=8 DQ=-60 117 2.287 102 1.355
MODEL 4 MODE=8 DQ=-40 117 2.168 105 1.309
MODEL 5 MODE=8 DQ=-20 117 2.110 106 1.268
MODEL 6 MODE=8 DQ=0 117 2.120 104 1.232
MODEL 7 MODE=8 DQ=20 117 2.196 101 1.236
MODEL 8 MODE=8 DQ=40 117 2.332 100 1.325
MODEL 9 MODE=8 DQ=60 117 2.518 97 1.362
MODEL 10 MODE=8 DQ=80 117 2.744 93 1.437
MODEL 11 MODE=8 DQ=100 117 3.001 91 1.582
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610231734473577258 9 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
making animated gifs
11 models are in 2610231734473577258.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=9 DQ=-100 117 3.092 91 1.635
MODEL 2 MODE=9 DQ=-80 117 2.841 96 1.570
MODEL 3 MODE=9 DQ=-60 117 2.612 99 1.471
MODEL 4 MODE=9 DQ=-40 117 2.410 102 1.397
MODEL 5 MODE=9 DQ=-20 117 2.244 103 1.289
MODEL 6 MODE=9 DQ=0 117 2.120 104 1.232
MODEL 7 MODE=9 DQ=20 117 2.048 106 1.253
MODEL 8 MODE=9 DQ=40 117 2.033 104 1.238
MODEL 9 MODE=9 DQ=60 117 2.075 102 1.234
MODEL 10 MODE=9 DQ=80 117 2.172 103 1.356
MODEL 11 MODE=9 DQ=100 117 2.317 102 1.456
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610231734473577258 10 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
making animated gifs
11 models are in 2610231734473577258.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=10 DQ=-100 117 3.461 85 1.634
MODEL 2 MODE=10 DQ=-80 117 3.134 93 1.643
MODEL 3 MODE=10 DQ=-60 117 2.827 100 1.588
MODEL 4 MODE=10 DQ=-40 117 2.548 102 1.432
MODEL 5 MODE=10 DQ=-20 117 2.308 103 1.305
MODEL 6 MODE=10 DQ=0 117 2.120 104 1.232
MODEL 7 MODE=10 DQ=20 117 1.998 104 1.156
MODEL 8 MODE=10 DQ=40 117 1.955 106 1.236
MODEL 9 MODE=10 DQ=60 117 1.996 105 1.326
MODEL 10 MODE=10 DQ=80 117 2.116 106 1.493
MODEL 11 MODE=10 DQ=100 117 2.303 104 1.635
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610231734473577258 11 -100 100 20 on on
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610231734473577258.eigenfacs
2610231734473577258.atom
making animated gifs
11 models are in 2610231734473577258.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610231734473577258.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
compute RMSD to second conformer
MODEL 1 MODE=11 DQ=-100 117 2.745 91 1.618
MODEL 2 MODE=11 DQ=-80 117 2.495 94 1.505
MODEL 3 MODE=11 DQ=-60 117 2.294 98 1.371
MODEL 4 MODE=11 DQ=-40 117 2.158 99 1.283
MODEL 5 MODE=11 DQ=-20 117 2.098 102 1.233
MODEL 6 MODE=11 DQ=0 117 2.120 104 1.232
MODEL 7 MODE=11 DQ=20 117 2.223 105 1.271
MODEL 8 MODE=11 DQ=40 117 2.396 105 1.388
MODEL 9 MODE=11 DQ=60 117 2.626 101 1.506
MODEL 10 MODE=11 DQ=80 117 2.898 95 1.601
MODEL 11 MODE=11 DQ=100 117 3.202 88 1.662
2610231734473577258.10.pdb
2610231734473577258.11.pdb
2610231734473577258.7.pdb
2610231734473577258.8.pdb
2610231734473577258.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 0m8.000s
user 0m7.864s
sys 0m0.131s
rm: cannot remove '2610231734473577258.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
