*** acarbose 1glu ***
Output from eigenvector calculation:
STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8)
Build Tirion matrix:
Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model.
Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004.
Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file.
Pdbmat> Coordinate filename = 2610260201344067968.atom
Pdbmat> Distance cutoff = 8.00
Force constant = 10.00
Origin of mass values = CONS
Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09
PRINTing level = 2
Pdbmat> Coordinate file 2610260201344067968.atom to be opened.
Openam> File opened: 2610260201344067968.atom
Pdbmat> Coordinate file in PDB format.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 844
First residue number = 81
Last residue number = 952
Number of atoms found = 13059
Mean number per residue = 15.5
Pdbmat> Coordinate statistics:
= 1.650649 +/- 16.257585 From: -41.179000 To: 41.982000
= -26.483600 +/- 14.420982 From: -68.299000 To: 8.975000
= 86.468236 +/- 17.569014 From: 42.022000 To: 124.836000
Pdbmat> Masses are all set to one.
Openam> File opened: pdbmat.xyzm
Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved.
Openam> File opened: pdbmat.sdijb
Pdbmat> Matrix statistics:
Pdbmat> The matrix is 1.3506 % Filled.
Pdbmat> 10364822 non-zero elements.
Pdbmat> 1143127 atom-atom interactions.
Pdbmat> Number per atom= 175.07 +/- 47.81
Maximum number = 256
Minimum number = 19
Pdbmat> Matrix trace = 2.286254E+07
Pdbmat> Larger element = 912.152
Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10
Pdbmat> Normal end.
automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1)
844 non-zero elements, NRBL set to 5
Diagonalize Tirion matrix using diagrtb
Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation.
Diagrtb> Version 2.52, November 2004.
Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file.
Diagrtb> Options taken into account:
MATRix filename = pdbmat.sdijb
COORdinates filename = 2610260201344067968.atom
Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb
Nb of VECTors required = 106
EigeNVALues chosen = LOWE
Type of SUBStructuring = NONE
Nb of residues per BLOck = 5
Origin of MASS values = CONS
MATRix FORMat = BINA
Temporary files cleaning = ALL
Output PRINting level = 2
Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb.
Blocpdb> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.xyzm
Blocpdb> Coordinate file 2610260201344067968.atom to be opened.
Openam> file on opening on unit 11:
2610260201344067968.atom
Blocpdb> Coordinate file in PDB format.
Blocpdb> 13059 atoms picked in pdb file.
Blocpdb> All masses set to unity.
Blocpdb> Coordinate file is rewritten.
Blocpdb> Substructuring:
Blocpdb> 5 residue(s) per block.
Blocpdb> 844 residues.
Blocpdb> 71 atoms in block 1
Block first atom: 1
Blocpdb> 83 atoms in block 2
Block first atom: 72
Blocpdb> 58 atoms in block 3
Block first atom: 155
Blocpdb> 82 atoms in block 4
Block first atom: 213
Blocpdb> 67 atoms in block 5
Block first atom: 295
Blocpdb> 72 atoms in block 6
Block first atom: 362
Blocpdb> 82 atoms in block 7
Block first atom: 434
Blocpdb> 72 atoms in block 8
Block first atom: 516
Blocpdb> 79 atoms in block 9
Block first atom: 588
Blocpdb> 89 atoms in block 10
Block first atom: 667
Blocpdb> 78 atoms in block 11
Block first atom: 756
Blocpdb> 61 atoms in block 12
Block first atom: 834
Blocpdb> 78 atoms in block 13
Block first atom: 895
Blocpdb> 80 atoms in block 14
Block first atom: 973
Blocpdb> 90 atoms in block 15
Block first atom: 1053
Blocpdb> 83 atoms in block 16
Block first atom: 1143
Blocpdb> 88 atoms in block 17
Block first atom: 1226
Blocpdb> 75 atoms in block 18
Block first atom: 1314
Blocpdb> 94 atoms in block 19
Block first atom: 1389
Blocpdb> 77 atoms in block 20
Block first atom: 1483
Blocpdb> 98 atoms in block 21
Block first atom: 1560
Blocpdb> 64 atoms in block 22
Block first atom: 1658
Blocpdb> 68 atoms in block 23
Block first atom: 1722
Blocpdb> 83 atoms in block 24
Block first atom: 1790
Blocpdb> 75 atoms in block 25
Block first atom: 1873
Blocpdb> 75 atoms in block 26
Block first atom: 1948
Blocpdb> 79 atoms in block 27
Block first atom: 2023
Blocpdb> 92 atoms in block 28
Block first atom: 2102
Blocpdb> 68 atoms in block 29
Block first atom: 2194
Blocpdb> 81 atoms in block 30
Block first atom: 2262
Blocpdb> 92 atoms in block 31
Block first atom: 2343
Blocpdb> 69 atoms in block 32
Block first atom: 2435
Blocpdb> 82 atoms in block 33
Block first atom: 2504
Blocpdb> 68 atoms in block 34
Block first atom: 2586
Blocpdb> 80 atoms in block 35
Block first atom: 2654
Blocpdb> 79 atoms in block 36
Block first atom: 2734
Blocpdb> 90 atoms in block 37
Block first atom: 2813
Blocpdb> 93 atoms in block 38
Block first atom: 2903
Blocpdb> 59 atoms in block 39
Block first atom: 2996
Blocpdb> 71 atoms in block 40
Block first atom: 3055
Blocpdb> 83 atoms in block 41
Block first atom: 3126
Blocpdb> 75 atoms in block 42
Block first atom: 3209
Blocpdb> 52 atoms in block 43
Block first atom: 3284
Blocpdb> 81 atoms in block 44
Block first atom: 3336
Blocpdb> 66 atoms in block 45
Block first atom: 3417
Blocpdb> 80 atoms in block 46
Block first atom: 3483
Blocpdb> 68 atoms in block 47
Block first atom: 3563
Blocpdb> 84 atoms in block 48
Block first atom: 3631
Blocpdb> 64 atoms in block 49
Block first atom: 3715
Blocpdb> 95 atoms in block 50
Block first atom: 3779
Blocpdb> 72 atoms in block 51
Block first atom: 3874
Blocpdb> 77 atoms in block 52
Block first atom: 3946
Blocpdb> 84 atoms in block 53
Block first atom: 4023
Blocpdb> 79 atoms in block 54
Block first atom: 4107
Blocpdb> 80 atoms in block 55
Block first atom: 4186
Blocpdb> 82 atoms in block 56
Block first atom: 4266
Blocpdb> 87 atoms in block 57
Block first atom: 4348
Blocpdb> 65 atoms in block 58
Block first atom: 4435
Blocpdb> 87 atoms in block 59
Block first atom: 4500
Blocpdb> 84 atoms in block 60
Block first atom: 4587
Blocpdb> 80 atoms in block 61
Block first atom: 4671
Blocpdb> 83 atoms in block 62
Block first atom: 4751
Blocpdb> 81 atoms in block 63
Block first atom: 4834
Blocpdb> 83 atoms in block 64
Block first atom: 4915
Blocpdb> 90 atoms in block 65
Block first atom: 4998
Blocpdb> 75 atoms in block 66
Block first atom: 5088
Blocpdb> 77 atoms in block 67
Block first atom: 5163
Blocpdb> 85 atoms in block 68
Block first atom: 5240
Blocpdb> 83 atoms in block 69
Block first atom: 5325
Blocpdb> 81 atoms in block 70
Block first atom: 5408
Blocpdb> 65 atoms in block 71
Block first atom: 5489
Blocpdb> 49 atoms in block 72
Block first atom: 5554
Blocpdb> 91 atoms in block 73
Block first atom: 5603
Blocpdb> 77 atoms in block 74
Block first atom: 5694
Blocpdb> 86 atoms in block 75
Block first atom: 5771
Blocpdb> 64 atoms in block 76
Block first atom: 5857
Blocpdb> 76 atoms in block 77
Block first atom: 5921
Blocpdb> 83 atoms in block 78
Block first atom: 5997
Blocpdb> 69 atoms in block 79
Block first atom: 6080
Blocpdb> 74 atoms in block 80
Block first atom: 6149
Blocpdb> 77 atoms in block 81
Block first atom: 6223
Blocpdb> 84 atoms in block 82
Block first atom: 6300
Blocpdb> 74 atoms in block 83
Block first atom: 6384
Blocpdb> 79 atoms in block 84
Block first atom: 6458
Blocpdb> 79 atoms in block 85
Block first atom: 6537
Blocpdb> 71 atoms in block 86
Block first atom: 6616
Blocpdb> 84 atoms in block 87
Block first atom: 6687
Blocpdb> 55 atoms in block 88
Block first atom: 6771
Blocpdb> 76 atoms in block 89
Block first atom: 6826
Blocpdb> 78 atoms in block 90
Block first atom: 6902
Blocpdb> 69 atoms in block 91
Block first atom: 6980
Blocpdb> 64 atoms in block 92
Block first atom: 7049
Blocpdb> 63 atoms in block 93
Block first atom: 7113
Blocpdb> 66 atoms in block 94
Block first atom: 7176
Blocpdb> 81 atoms in block 95
Block first atom: 7242
Blocpdb> 85 atoms in block 96
Block first atom: 7323
Blocpdb> 80 atoms in block 97
Block first atom: 7408
Blocpdb> 65 atoms in block 98
Block first atom: 7488
Blocpdb> 86 atoms in block 99
Block first atom: 7553
Blocpdb> 77 atoms in block 100
Block first atom: 7639
Blocpdb> 93 atoms in block 101
Block first atom: 7716
Blocpdb> 80 atoms in block 102
Block first atom: 7809
Blocpdb> 65 atoms in block 103
Block first atom: 7889
Blocpdb> 79 atoms in block 104
Block first atom: 7954
Blocpdb> 73 atoms in block 105
Block first atom: 8033
Blocpdb> 78 atoms in block 106
Block first atom: 8106
Blocpdb> 67 atoms in block 107
Block first atom: 8184
Blocpdb> 84 atoms in block 108
Block first atom: 8251
Blocpdb> 79 atoms in block 109
Block first atom: 8335
Blocpdb> 72 atoms in block 110
Block first atom: 8414
Blocpdb> 55 atoms in block 111
Block first atom: 8486
Blocpdb> 74 atoms in block 112
Block first atom: 8541
Blocpdb> 70 atoms in block 113
Block first atom: 8615
Blocpdb> 95 atoms in block 114
Block first atom: 8685
Blocpdb> 77 atoms in block 115
Block first atom: 8780
Blocpdb> 89 atoms in block 116
Block first atom: 8857
Blocpdb> 80 atoms in block 117
Block first atom: 8946
Blocpdb> 76 atoms in block 118
Block first atom: 9026
Blocpdb> 77 atoms in block 119
Block first atom: 9102
Blocpdb> 73 atoms in block 120
Block first atom: 9179
Blocpdb> 83 atoms in block 121
Block first atom: 9252
Blocpdb> 97 atoms in block 122
Block first atom: 9335
Blocpdb> 79 atoms in block 123
Block first atom: 9432
Blocpdb> 93 atoms in block 124
Block first atom: 9511
Blocpdb> 77 atoms in block 125
Block first atom: 9604
Blocpdb> 62 atoms in block 126
Block first atom: 9681
Blocpdb> 87 atoms in block 127
Block first atom: 9743
Blocpdb> 90 atoms in block 128
Block first atom: 9830
Blocpdb> 72 atoms in block 129
Block first atom: 9920
Blocpdb> 76 atoms in block 130
Block first atom: 9992
Blocpdb> 84 atoms in block 131
Block first atom: 10068
Blocpdb> 81 atoms in block 132
Block first atom: 10152
Blocpdb> 76 atoms in block 133
Block first atom: 10233
Blocpdb> 70 atoms in block 134
Block first atom: 10309
Blocpdb> 76 atoms in block 135
Block first atom: 10379
Blocpdb> 85 atoms in block 136
Block first atom: 10455
Blocpdb> 78 atoms in block 137
Block first atom: 10540
Blocpdb> 48 atoms in block 138
Block first atom: 10618
Blocpdb> 75 atoms in block 139
Block first atom: 10666
Blocpdb> 74 atoms in block 140
Block first atom: 10741
Blocpdb> 73 atoms in block 141
Block first atom: 10815
Blocpdb> 78 atoms in block 142
Block first atom: 10888
Blocpdb> 90 atoms in block 143
Block first atom: 10966
Blocpdb> 76 atoms in block 144
Block first atom: 11056
Blocpdb> 71 atoms in block 145
Block first atom: 11132
Blocpdb> 68 atoms in block 146
Block first atom: 11203
Blocpdb> 84 atoms in block 147
Block first atom: 11271
Blocpdb> 70 atoms in block 148
Block first atom: 11355
Blocpdb> 81 atoms in block 149
Block first atom: 11425
Blocpdb> 63 atoms in block 150
Block first atom: 11506
Blocpdb> 85 atoms in block 151
Block first atom: 11569
Blocpdb> 57 atoms in block 152
Block first atom: 11654
Blocpdb> 84 atoms in block 153
Block first atom: 11711
Blocpdb> 76 atoms in block 154
Block first atom: 11795
Blocpdb> 91 atoms in block 155
Block first atom: 11871
Blocpdb> 76 atoms in block 156
Block first atom: 11962
Blocpdb> 83 atoms in block 157
Block first atom: 12038
Blocpdb> 81 atoms in block 158
Block first atom: 12121
Blocpdb> 58 atoms in block 159
Block first atom: 12202
Blocpdb> 91 atoms in block 160
Block first atom: 12260
Blocpdb> 72 atoms in block 161
Block first atom: 12351
Blocpdb> 65 atoms in block 162
Block first atom: 12423
Blocpdb> 77 atoms in block 163
Block first atom: 12488
Blocpdb> 64 atoms in block 164
Block first atom: 12565
Blocpdb> 80 atoms in block 165
Block first atom: 12629
Blocpdb> 78 atoms in block 166
Block first atom: 12709
Blocpdb> 50 atoms in block 167
Block first atom: 12787
Blocpdb> 82 atoms in block 168
Block first atom: 12837
Blocpdb> 78 atoms in block 169
Block first atom: 12919
Blocpdb> 63 atoms in block 170
Block first atom: 12996
Blocpdb> 170 blocks.
Blocpdb> At most, 98 atoms in each of them.
Blocpdb> At least, 48 atoms in each of them.
Blocpdb> Normal end of Blocpdb.
Diagrtb> Memory allocation for Prepmat.
Diagrtb> Memory allocation for RTB.
Diagrtb> Memory allocation for Diagstd.
Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes.
Prepmat> Entering in.
Prepmat> Rewriting of the matrix begins.
Prepmat> 10364992 matrix lines read.
Prepmat> Matrix order = 39177
Prepmat> Matrix trace = 22862540.0000
Prepmat> Last element read: 39177 39177 252.5197
Prepmat> 14536 lines saved.
Prepmat> 12581 empty lines.
Prepmat> Number of lines on output is as expected.
Prepmat> Normal end of Prepmat.
RTB> Entering in.
RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 13059
RTB> Total mass = 13059.0000
RTB> Number of atoms found in matrix: 13059
RTB> Number of blocks = 170
RTB> Projection begins.
RTB> Projected matrix is being saved.
RTB> Projected matrix trace = 440212.9226
RTB> 67794 non-zero elements.
RTB> Normal end of RTB.
Diagstd> Entering in.
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.sdijb
Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb
Diagstd> CERFACS matrix format.
Diagstd> Projected matrix order = 1020
Diagstd> Nb of non-zero elements: 67794
Diagstd> Projected matrix trace = 440212.9226
Openam> file on opening on unit 11:
diagrtb_work.eigenfacs
Diagstd> Diagonalization.
Diagstd> 1020 eigenvectors are computed.
Diagstd> 106 of them to be saved.
Diagstd> Sum of eigenvalues = 440212.9226
Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000
Diagstd> Selected eigenvalues:
0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000
0.0000000 3.3900880 4.1033205 5.3930107 8.9712490
10.2669336 11.0857873 13.0777780 14.4726613 17.2339965
18.2168439 19.7259293 19.7829146 23.4627150 25.0694694
27.5131850 28.9199855 29.2389464 30.4938387 32.2678547
34.1000109 36.0359621 36.3094022 37.3057357 38.3822934
38.8612278 40.5719970 44.2145375 45.1248218 46.5263139
48.2318388 49.7553015 51.4001710 53.5489711 54.3806665
56.6251038 58.2070629 58.3518356 59.2140774 60.4027975
61.6766137 62.6143633 64.9453903 65.7458065 66.4290505
68.6280219 69.6227069 69.9482949 71.3157215 73.9069044
75.1435545 75.9963909 77.5593179 78.7822857 80.0296200
81.2243922 82.9550121 83.5839524 84.2196941 85.0070257
86.1222024 86.9890779 87.4119819 89.7716785 91.1723504
91.6664188 93.0540266 93.7977344 94.4667862 94.9227583
95.5534795 97.2583669 99.4292343 99.6880778 100.5468739
101.6367559 102.8294471 103.6578775 105.0113422 105.8995979
106.9042754 107.6715588 109.6910190 110.2816415 112.0342045
112.4816338 114.1122268 114.9298478 115.8784876 117.5304037
118.6546792 119.4328996 120.4098643 122.2643648 123.9306334
125.1110766 125.3598345 126.4126575 128.2712323 129.1314444
129.6646963
Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units):
0.0034294 0.0034317 0.0034330 0.0034335 0.0034336
0.0034373 199.9404962 219.9697693 252.1801633 325.2533176
347.9490521 361.5584800 392.7012287 413.1135881 450.8045395
463.4809082 482.2963957 482.9925347 525.9983878 543.7106649
569.5944052 583.9750812 587.1866046 599.6548212 616.8510761
634.1215890 651.8735218 654.3420487 663.2588976 672.7608968
676.9452409 691.6851830 722.0675427 729.4625997 740.7038522
754.1577353 765.9756455 778.5339611 794.6407742 800.7879760
817.1462386 828.4820876 829.5117487 835.6179561 843.9637764
852.8163946 859.2751747 875.1237006 880.4998960 885.0632392
899.5929035 906.0887379 908.2049121 917.0392419 933.5504364
941.3283697 946.6550678 956.3398896 963.8502594 971.4504589
978.6750469 989.0462389 992.7884867 996.5569221 1001.2042645
1007.7500860 1012.8092145 1015.2681542 1028.8805396 1036.8760801
1039.6817305 1047.5213073 1051.6989844 1055.4431624 1057.9873015
1061.4964191 1070.9242842 1082.8101739 1084.2186947 1088.8788606
1094.7644280 1101.1691367 1105.5959425 1112.7904377 1117.4868873
1122.7752154 1126.7972554 1137.3151275 1140.3729080 1149.3984248
1151.6913057 1160.0090310 1164.1573810 1168.9520296 1177.2545948
1182.8719001 1186.7446112 1191.5885287 1200.7296315 1208.8839593
1214.6276434 1215.8345635 1220.9294260 1229.8719988 1233.9889898
1236.5342607
Diagstd> Normal end.
Rtb_to_modes> Entering in.
Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 13059
Rtb_to_modes> Number of blocs = 170
Openam> file on opening on unit 10:
diagrtb_work.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 11:
matrix.eigenrtb
Rdmodfacs> Entering in.
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Eigenvector number: 1
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9732E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 2
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9870E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 3
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 4
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 5
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 6
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0020E-09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 7
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.390
Rdmodfacs> Eigenvector number: 8
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.103
Rdmodfacs> Eigenvector number: 9
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.393
Rdmodfacs> Eigenvector number: 10
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.971
Rdmodfacs> Eigenvector number: 11
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 12
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.09
Rdmodfacs> Eigenvector number: 13
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.08
Rdmodfacs> Eigenvector number: 14
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 15
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 16
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 17
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.73
Rdmodfacs> Eigenvector number: 18
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 19
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.46
Rdmodfacs> Eigenvector number: 20
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07
Rdmodfacs> Eigenvector number: 21
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.51
Rdmodfacs> Eigenvector number: 22
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 23
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.24
Rdmodfacs> Eigenvector number: 24
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.49
Rdmodfacs> Eigenvector number: 25
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.27
Rdmodfacs> Eigenvector number: 26
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.10
Rdmodfacs> Eigenvector number: 27
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.04
Rdmodfacs> Eigenvector number: 28
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 29
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.31
Rdmodfacs> Eigenvector number: 30
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 31
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.86
Rdmodfacs> Eigenvector number: 32
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.57
Rdmodfacs> Eigenvector number: 33
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 34
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 35
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.53
Rdmodfacs> Eigenvector number: 36
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.23
Rdmodfacs> Eigenvector number: 37
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76
Rdmodfacs> Eigenvector number: 38
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 39
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 40
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 54.38
Rdmodfacs> Eigenvector number: 41
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 42
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 43
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.35
Rdmodfacs> Eigenvector number: 44
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.21
Rdmodfacs> Eigenvector number: 45
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.40
Rdmodfacs> Eigenvector number: 46
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.68
Rdmodfacs> Eigenvector number: 47
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.61
Rdmodfacs> Eigenvector number: 48
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 49
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.75
Rdmodfacs> Eigenvector number: 50
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 51
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 68.63
Rdmodfacs> Eigenvector number: 52
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.62
Rdmodfacs> Eigenvector number: 53
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.95
Rdmodfacs> Eigenvector number: 54
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.32
Rdmodfacs> Eigenvector number: 55
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.91
Rdmodfacs> Eigenvector number: 56
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.14
Rdmodfacs> Eigenvector number: 57
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.00
Rdmodfacs> Eigenvector number: 58
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.56
Rdmodfacs> Eigenvector number: 59
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.78
Rdmodfacs> Eigenvector number: 60
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.03
Rdmodfacs> Eigenvector number: 61
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 62
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.96
Rdmodfacs> Eigenvector number: 63
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.58
Rdmodfacs> Eigenvector number: 64
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.22
Rdmodfacs> Eigenvector number: 65
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.01
Rdmodfacs> Eigenvector number: 66
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.12
Rdmodfacs> Eigenvector number: 67
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.99
Rdmodfacs> Eigenvector number: 68
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.41
Rdmodfacs> Eigenvector number: 69
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.77
Rdmodfacs> Eigenvector number: 70
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.17
Rdmodfacs> Eigenvector number: 71
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.67
Rdmodfacs> Eigenvector number: 72
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.05
Rdmodfacs> Eigenvector number: 73
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 93.80
Rdmodfacs> Eigenvector number: 74
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.47
Rdmodfacs> Eigenvector number: 75
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.92
Rdmodfacs> Eigenvector number: 76
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.55
Rdmodfacs> Eigenvector number: 77
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 97.26
Rdmodfacs> Eigenvector number: 78
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.43
Rdmodfacs> Eigenvector number: 79
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.69
Rdmodfacs> Eigenvector number: 80
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 100.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 81
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.6
Rdmodfacs> Eigenvector number: 82
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.8
Rdmodfacs> Eigenvector number: 83
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 84
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 85
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 105.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 86
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 87
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 88
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 89
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 90
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.0
Rdmodfacs> Eigenvector number: 91
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 92
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 93
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 114.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 94
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 115.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 95
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 117.5
Rdmodfacs> Eigenvector number: 96
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 118.7
Rdmodfacs> Eigenvector number: 97
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 119.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 98
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 120.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 99
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 122.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 100
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 123.9
Rdmodfacs> Eigenvector number: 101
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 102
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 125.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 103
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 126.4
Rdmodfacs> Eigenvector number: 104
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 128.3
Rdmodfacs> Eigenvector number: 105
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.1
Rdmodfacs> Eigenvector number: 106
Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 129.7
Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1020 coordinates in vector file.
Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 0.99996
0.99997 0.99996 0.99997 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004
1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
1.00003 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002
0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001
1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999
Rtb_to_modes> RTB block-file is being read.
Rtb_to_modes> 235062 lines found in RTB file.
Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected):
0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000
1.00002 1.00001 0.99999 1.00004 0.99996
0.99997 0.99996 0.99997 0.99999 0.99999
0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999
1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000
1.00000 1.00000 1.00000 0.99998 1.00004
1.00002 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000
1.00002 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
1.00002 0.99998 1.00002 0.99999 1.00001
1.00003 1.00001 1.00003 0.99998 1.00000
0.99999 0.99999 0.99999 1.00002 0.99999
0.99999 1.00003 1.00001 0.99999 0.99998
1.00000 1.00002 1.00002 0.99999 1.00002
0.99998 0.99999 1.00001 0.99998 1.00002
1.00001 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000
1.00000 1.00001 1.00000 1.00002 0.99999
1.00001 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002
0.99999 0.99999 1.00003 0.99997 1.00001
1.00000 0.99997 1.00001 1.00000 0.99999
0.99998 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001
1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001
0.99999
Orthogonality of first eigenvectors (zero expected):
Vector 2: 0.000
Vector 3: 0.000 0.000
Vector 4: 0.000-0.000 0.000
Vector 5:-0.000 0.000 0.000-0.000
Vector 6:-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 0.000
Vector 8:-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000
Vector 9: 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Vector 10: 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000
Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved.
Rtb_to_modes> Normal end.
Diagrtb> Normal end.
B-factor analysis
Bfactors> Version 1.22, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610260201344067968.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610260201344067968.eigenfacs
Getnam> Corresponding pdb filename ?
Getnam> 2610260201344067968.atom
Openam> file on opening on unit 11:
2610260201344067968.atom
Getnum> Number of skipped eigenvectors ?
Getnum> 0
Getnum> Number of usefull eigenvectors ?
Getnum> 10000
%Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry.
Rdatompdb> Reading pdb file.
Rdatompdb> End of file reached.
Rdatompdb> Number of I/O errors: 0
Rdatompdb> Number of residues found = 844
First residue number = 81
Last residue number = 952
Number of atoms found = 13059
Mean number per residue = 15.5
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9732E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9870E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9946E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9972E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9979E-10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0020E-09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.390
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.103
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.393
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.971
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.09
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.08
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.73
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.46
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.51
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.24
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.49
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.27
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.10
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.04
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.31
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.86
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.57
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.53
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.23
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 54.38
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.35
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.21
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.40
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.68
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.61
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.75
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 68.63
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.62
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.95
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.32
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.91
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.14
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.00
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.56
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.78
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.96
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.58
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.22
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.01
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.12
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.99
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.41
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.77
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.17
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.67
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.05
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 93.80
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.47
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.92
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.55
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 97.26
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.43
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.69
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 100.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 105.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 114.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 115.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 117.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 118.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 119.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 120.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 122.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 123.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 125.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 126.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 128.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 129.7
Bfactors> 106 vectors, 39177 coordinates in file.
Openam> file on opening on unit 12:
bfactors.pred
Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000
Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000
Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 3.390000
Bfactors> 100 eigenvectors will be considered.
Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped.
Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed.
(CHARMM units assumed for eigenvalues)
Bfactors> Correlation= 0.729 for 844 C-alpha atoms.
Bfactors> = 0.003 +/- 0.00
Bfactors> = 27.560 +/- 8.24
Bfactors> Shiftng-fct= 27.557
Bfactors> Scaling-fct= 2302.172
Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved.
Bfactors> Normal end.
check_modes
Chkmod> Version 1.00, Bordeaux.
Getnam> Eigenvector filename ?
Getnam> 2610260201344067968.eigenfacs
Openam> file on opening on unit 10:
2610260201344067968.eigenfacs
Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4292E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4316E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4329E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4333E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4372E-03
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 199.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 252.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 348.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 361.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 392.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 413.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 450.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 463.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 482.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 525.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 543.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 569.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 584.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 599.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 616.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 634.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 651.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 663.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 672.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 676.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 722.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 729.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 740.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 794.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 800.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 828.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 829.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 843.9
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 852.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 859.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.1
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 880.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 885.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 899.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 908.2
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 917.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 933.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 941.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 956.3
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 963.8
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 971.4
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 978.6
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 989.0
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 992.7
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 996.5
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1001.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1008.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1013.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1015.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1029.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1040.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1047.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1052.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1055.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1061.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1071.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1083.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1089.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1095.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1101.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1106.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1113.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1117.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1123.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1127.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1137.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1140.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1149.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1152.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1160.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1164.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1169.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1177.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1183.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1187.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1191.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1201.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1209.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1215.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1216.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1221.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1230.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1234.
Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106
Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1237.
Chkmod> 106 vectors, 39177 coordinates in file.
Chkmod> That is: 13059 cartesian points.
Openam> file on opening on unit 11:
Chkmod.res
Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file.
Chkmod> Normal end.
0.0034 0.7020
0.0034 0.7175
0.0034 0.7212
0.0034 0.9501
0.0034 0.9270
0.0034 0.7735
199.9293 0.5123
219.9517 0.4776
252.1691 0.4525
325.2348 0.4583
347.9861 0.3603
361.6116 0.4996
392.7177 0.1818
413.0579 0.5482
450.7329 0.7004
463.5012 0.4239
482.3255 0.4942
482.9362 0.4281
525.9454 0.2544
543.6931 0.4267
569.5370 0.2600
583.9502 0.5175
587.1720 0.5956
599.5913 0.3065
616.8451 0.5737
634.0943 0.4306
651.8821 0.2408
654.3193 0.2801
663.2683 0.2028
672.7119 0.2675
676.9055 0.4870
691.6385 0.1232
721.9995 0.4910
729.3923 0.4978
740.7014 0.1796
754.1110 0.5594
765.9789 0.6369
778.4992 0.4996
794.6143 0.4173
800.7487 0.2559
817.1465 0.6101
828.4674 0.3884
829.4631 0.4758
835.5533 0.4593
843.9080 0.4848
852.8032 0.2427
859.2083 0.4748
875.1172 0.4780
880.4902 0.5655
885.0316 0.3058
899.5673 0.3809
906.0322 0.4113
908.1770 0.2836
917.0274 0.5252
933.5299 0.4165
941.2657 0.5339
946.6369 0.4223
956.3030 0.2771
963.7949 0.2901
971.4111 0.3330
978.6066 0.5217
989.0335 0.4845
992.7224 0.4481
996.5160 0.4282
1001.1788 0.4112
1007.6939 0.2903
1012.7711 0.4915
1015.2131 0.3559
1028.8268 0.2993
1036.8182 0.3309
1039.6574 0.1690
1047.4537 0.3208
1051.6665 0.4870
1055.4158 0.4266
1057.9265 0.4703
1061.4315 0.3967
1070.8873 0.3332
1082.7679 0.4387
1084.1826 0.4728
1088.5783 0.3813
1094.5195 0.5016
1100.9642 0.3971
1105.7731 0.4876
1112.6826 0.3623
1117.4410 0.3725
1122.7046 0.4924
1126.8977 0.4173
1137.3129 0.4517
1140.4189 0.3652
1149.1736 0.4731
1151.7359 0.3864
1159.8971 0.3611
1163.9562 0.4903
1169.0103 0.2854
1177.0518 0.4347
1183.0470 0.5549
1186.5302 0.2911
1191.4886 0.3610
1200.8530 0.4905
1208.6827 0.4596
1214.5217 0.4237
1215.9771 0.4931
1220.8159 0.3840
1229.9571 0.4098
1233.7858 0.4694
1236.6495 0.3610
getting mode 7
running: ../../bin/get_modes.sh 2610260201344067968 7 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 7
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
making animated gifs
11 models are in 2610260201344067968.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.7.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 8
running: ../../bin/get_modes.sh 2610260201344067968 8 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 8
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
making animated gifs
11 models are in 2610260201344067968.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.8.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 9
running: ../../bin/get_modes.sh 2610260201344067968 9 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 9
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
making animated gifs
11 models are in 2610260201344067968.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.9.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 10
running: ../../bin/get_modes.sh 2610260201344067968 10 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 10
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
making animated gifs
11 models are in 2610260201344067968.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.10.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
getting mode 11
running: ../../bin/get_modes.sh 2610260201344067968 11 -100 100 20 on 0
normal mode computation
generate a series of perturbations for mode 11
calculating perturbed structure for DQ=-100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=-20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=0
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=20
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=40
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=60
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=80
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
calculating perturbed structure for DQ=100
2610260201344067968.eigenfacs
2610260201344067968.atom
making animated gifs
11 models are in 2610260201344067968.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
11 models are in 2610260201344067968.11.pdb, 1 models will be skipped
MODEL 1 will be plotted
MODEL 3 will be plotted
MODEL 5 will be plotted
MODEL 7 will be plotted
MODEL 9 will be plotted
MODEL 11 will be plotted
making thumbnail 100x100
making small animated gif 100x100
making animated gif 300x300
2610260201344067968.10.pdb
2610260201344067968.11.pdb
2610260201344067968.7.pdb
2610260201344067968.8.pdb
2610260201344067968.9.pdb
STDERR:
Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL
real 1m29.000s
user 1m28.197s
sys 0m0.783s
rm: cannot remove '2610260201344067968.sdijf': No such file or directory
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
pstopnm: Writing ppmraw format
If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:
elNémo
is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed
by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.
|
