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LOGs for ID: 261027160417165189

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 261027160417165189.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 261027160417165189.atom to be opened. Openam> File opened: 261027160417165189.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1924 First residue number = 23 Last residue number = 557 Number of atoms found = 15749 Mean number per residue = 8.2 Pdbmat> Coordinate statistics: = 158.546211 +/- 16.992912 From: 115.669000 To: 199.399000 = 158.263399 +/- 17.546926 From: 118.740000 To: 199.630000 = 163.167969 +/- 32.759274 From: 90.841000 To: 221.378000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is -0.5978 % Filled. Pdbmat> 6164917 non-zero elements. Pdbmat> 674602 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 85.67 +/- 20.36 Maximum number = 129 Minimum number = 9 Pdbmat> Matrix trace = 1.349204E+07 Pdbmat> Larger element = 528.337 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 1924 non-zero elements, NRBL set to 10 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 261027160417165189.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 10 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 261027160417165189.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 261027160417165189.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 15749 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 10 residue(s) per block. Blocpdb> 1924 residues. Blocpdb> 82 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 84 atoms in block 2 Block first atom: 83 Blocpdb> 83 atoms in block 3 Block first atom: 167 Blocpdb> 83 atoms in block 4 Block first atom: 250 Blocpdb> 87 atoms in block 5 Block first atom: 333 Blocpdb> 93 atoms in block 6 Block first atom: 420 Blocpdb> 96 atoms in block 7 Block first atom: 513 Blocpdb> 88 atoms in block 8 Block first atom: 609 Blocpdb> 85 atoms in block 9 Block first atom: 697 Blocpdb> 81 atoms in block 10 Block first atom: 782 Blocpdb> 84 atoms in block 11 Block first atom: 863 Blocpdb> 79 atoms in block 12 Block first atom: 947 Blocpdb> 87 atoms in block 13 Block first atom: 1026 Blocpdb> 86 atoms in block 14 Block first atom: 1113 Blocpdb> 81 atoms in block 15 Block first atom: 1199 Blocpdb> 89 atoms in block 16 Block first atom: 1280 Blocpdb> 85 atoms in block 17 Block first atom: 1369 Blocpdb> 79 atoms in block 18 Block first atom: 1454 Blocpdb> 88 atoms in block 19 Block first atom: 1533 Blocpdb> 81 atoms in block 20 Block first atom: 1621 Blocpdb> 83 atoms in block 21 Block first atom: 1702 Blocpdb> 97 atoms in block 22 Block first atom: 1785 Blocpdb> 75 atoms in block 23 Block first atom: 1882 Blocpdb> 76 atoms in block 24 Block first atom: 1957 Blocpdb> 71 atoms in block 25 Block first atom: 2033 Blocpdb> 72 atoms in block 26 Block first atom: 2104 Blocpdb> 73 atoms in block 27 Block first atom: 2176 Blocpdb> 78 atoms in block 28 Block first atom: 2249 Blocpdb> 81 atoms in block 29 Block first atom: 2327 Blocpdb> 70 atoms in block 30 Block first atom: 2408 Blocpdb> 77 atoms in block 31 Block first atom: 2478 Blocpdb> 75 atoms in block 32 Block first atom: 2555 Blocpdb> 81 atoms in block 33 Block first atom: 2630 Blocpdb> 59 atoms in block 34 Block first atom: 2711 Blocpdb> 76 atoms in block 35 Block first atom: 2770 Blocpdb> 91 atoms in block 36 Block first atom: 2846 Blocpdb> 80 atoms in block 37 Block first atom: 2937 Blocpdb> 81 atoms in block 38 Block first atom: 3017 Blocpdb> 82 atoms in block 39 Block first atom: 3098 Blocpdb> 30 atoms in block 40 Block first atom: 3180 Blocpdb> 77 atoms in block 41 Block first atom: 3210 Blocpdb> 78 atoms in block 42 Block first atom: 3287 Blocpdb> 89 atoms in block 43 Block first atom: 3365 Blocpdb> 85 atoms in block 44 Block first atom: 3454 Blocpdb> 80 atoms in block 45 Block first atom: 3539 Blocpdb> 84 atoms in block 46 Block first atom: 3619 Blocpdb> 84 atoms in block 47 Block first atom: 3703 Blocpdb> 96 atoms in block 48 Block first atom: 3787 Blocpdb> 86 atoms in block 49 Block first atom: 3883 Blocpdb> 83 atoms in block 50 Block first atom: 3969 Blocpdb> 90 atoms in block 51 Block first atom: 4052 Blocpdb> 85 atoms in block 52 Block first atom: 4142 Blocpdb> 83 atoms in block 53 Block first atom: 4227 Blocpdb> 77 atoms in block 54 Block first atom: 4310 Blocpdb> 85 atoms in block 55 Block first atom: 4387 Blocpdb> 93 atoms in block 56 Block first atom: 4472 Blocpdb> 78 atoms in block 57 Block first atom: 4565 Blocpdb> 77 atoms in block 58 Block first atom: 4643 Blocpdb> 83 atoms in block 59 Block first atom: 4720 Blocpdb> 88 atoms in block 60 Block first atom: 4803 Blocpdb> 95 atoms in block 61 Block first atom: 4891 Blocpdb> 80 atoms in block 62 Block first atom: 4986 Blocpdb> 79 atoms in block 63 Block first atom: 5066 Blocpdb> 87 atoms in block 64 Block first atom: 5145 Blocpdb> 71 atoms in block 65 Block first atom: 5232 Blocpdb> 73 atoms in block 66 Block first atom: 5303 Blocpdb> 84 atoms in block 67 Block first atom: 5376 Blocpdb> 69 atoms in block 68 Block first atom: 5460 Blocpdb> 77 atoms in block 69 Block first atom: 5529 Blocpdb> 75 atoms in block 70 Block first atom: 5606 Blocpdb> 91 atoms in block 71 Block first atom: 5681 Blocpdb> 71 atoms in block 72 Block first atom: 5772 Blocpdb> 45 atoms in block 73 Block first atom: 5843 Blocpdb> 92 atoms in block 74 Block first atom: 5888 Blocpdb> 81 atoms in block 75 Block first atom: 5980 Blocpdb> 71 atoms in block 76 Block first atom: 6061 Blocpdb> 70 atoms in block 77 Block first atom: 6132 Blocpdb> 69 atoms in block 78 Block first atom: 6202 Blocpdb> 82 atoms in block 79 Block first atom: 6271 Blocpdb> 84 atoms in block 80 Block first atom: 6353 Blocpdb> 83 atoms in block 81 Block first atom: 6437 Blocpdb> 83 atoms in block 82 Block first atom: 6520 Blocpdb> 87 atoms in block 83 Block first atom: 6603 Blocpdb> 93 atoms in block 84 Block first atom: 6690 Blocpdb> 96 atoms in block 85 Block first atom: 6783 Blocpdb> 88 atoms in block 86 Block first atom: 6879 Blocpdb> 85 atoms in block 87 Block first atom: 6967 Blocpdb> 81 atoms in block 88 Block first atom: 7052 Blocpdb> 84 atoms in block 89 Block first atom: 7133 Blocpdb> 79 atoms in block 90 Block first atom: 7217 Blocpdb> 87 atoms in block 91 Block first atom: 7296 Blocpdb> 86 atoms in block 92 Block first atom: 7383 Blocpdb> 81 atoms in block 93 Block first atom: 7469 Blocpdb> 89 atoms in block 94 Block first atom: 7550 Blocpdb> 85 atoms in block 95 Block first atom: 7639 Blocpdb> 79 atoms in block 96 Block first atom: 7724 Blocpdb> 88 atoms in block 97 Block first atom: 7803 Blocpdb> 81 atoms in block 98 Block first atom: 7891 Blocpdb> 83 atoms in block 99 Block first atom: 7972 Blocpdb> 97 atoms in block 100 Block first atom: 8055 Blocpdb> 75 atoms in block 101 Block first atom: 8152 Blocpdb> 76 atoms in block 102 Block first atom: 8227 Blocpdb> 71 atoms in block 103 Block first atom: 8303 Blocpdb> 72 atoms in block 104 Block first atom: 8374 Blocpdb> 73 atoms in block 105 Block first atom: 8446 Blocpdb> 78 atoms in block 106 Block first atom: 8519 Blocpdb> 81 atoms in block 107 Block first atom: 8597 Blocpdb> 70 atoms in block 108 Block first atom: 8678 Blocpdb> 77 atoms in block 109 Block first atom: 8748 Blocpdb> 75 atoms in block 110 Block first atom: 8825 Blocpdb> 81 atoms in block 111 Block first atom: 8900 Blocpdb> 59 atoms in block 112 Block first atom: 8981 Blocpdb> 76 atoms in block 113 Block first atom: 9040 Blocpdb> 91 atoms in block 114 Block first atom: 9116 Blocpdb> 80 atoms in block 115 Block first atom: 9207 Blocpdb> 81 atoms in block 116 Block first atom: 9287 Blocpdb> 82 atoms in block 117 Block first atom: 9368 Blocpdb> 30 atoms in block 118 Block first atom: 9450 Blocpdb> 82 atoms in block 119 Block first atom: 9480 Blocpdb> 84 atoms in block 120 Block first atom: 9562 Blocpdb> 83 atoms in block 121 Block first atom: 9646 Blocpdb> 83 atoms in block 122 Block first atom: 9729 Blocpdb> 87 atoms in block 123 Block first atom: 9812 Blocpdb> 93 atoms in block 124 Block first atom: 9899 Blocpdb> 96 atoms in block 125 Block first atom: 9992 Blocpdb> 88 atoms in block 126 Block first atom: 10088 Blocpdb> 85 atoms in block 127 Block first atom: 10176 Blocpdb> 81 atoms in block 128 Block first atom: 10261 Blocpdb> 84 atoms in block 129 Block first atom: 10342 Blocpdb> 79 atoms in block 130 Block first atom: 10426 Blocpdb> 87 atoms in block 131 Block first atom: 10505 Blocpdb> 86 atoms in block 132 Block first atom: 10592 Blocpdb> 81 atoms in block 133 Block first atom: 10678 Blocpdb> 89 atoms in block 134 Block first atom: 10759 Blocpdb> 85 atoms in block 135 Block first atom: 10848 Blocpdb> 79 atoms in block 136 Block first atom: 10933 Blocpdb> 88 atoms in block 137 Block first atom: 11012 Blocpdb> 81 atoms in block 138 Block first atom: 11100 Blocpdb> 83 atoms in block 139 Block first atom: 11181 Blocpdb> 97 atoms in block 140 Block first atom: 11264 Blocpdb> 75 atoms in block 141 Block first atom: 11361 Blocpdb> 76 atoms in block 142 Block first atom: 11436 Blocpdb> 71 atoms in block 143 Block first atom: 11512 Blocpdb> 72 atoms in block 144 Block first atom: 11583 Blocpdb> 73 atoms in block 145 Block first atom: 11655 Blocpdb> 78 atoms in block 146 Block first atom: 11728 Blocpdb> 81 atoms in block 147 Block first atom: 11806 Blocpdb> 70 atoms in block 148 Block first atom: 11887 Blocpdb> 77 atoms in block 149 Block first atom: 11957 Blocpdb> 75 atoms in block 150 Block first atom: 12034 Blocpdb> 81 atoms in block 151 Block first atom: 12109 Blocpdb> 59 atoms in block 152 Block first atom: 12190 Blocpdb> 76 atoms in block 153 Block first atom: 12249 Blocpdb> 91 atoms in block 154 Block first atom: 12325 Blocpdb> 80 atoms in block 155 Block first atom: 12416 Blocpdb> 81 atoms in block 156 Block first atom: 12496 Blocpdb> 82 atoms in block 157 Block first atom: 12577 Blocpdb> 30 atoms in block 158 Block first atom: 12659 Blocpdb> 77 atoms in block 159 Block first atom: 12689 Blocpdb> 78 atoms in block 160 Block first atom: 12766 Blocpdb> 89 atoms in block 161 Block first atom: 12844 Blocpdb> 85 atoms in block 162 Block first atom: 12933 Blocpdb> 80 atoms in block 163 Block first atom: 13018 Blocpdb> 84 atoms in block 164 Block first atom: 13098 Blocpdb> 84 atoms in block 165 Block first atom: 13182 Blocpdb> 96 atoms in block 166 Block first atom: 13266 Blocpdb> 86 atoms in block 167 Block first atom: 13362 Blocpdb> 83 atoms in block 168 Block first atom: 13448 Blocpdb> 90 atoms in block 169 Block first atom: 13531 Blocpdb> 85 atoms in block 170 Block first atom: 13621 Blocpdb> 83 atoms in block 171 Block first atom: 13706 Blocpdb> 77 atoms in block 172 Block first atom: 13789 Blocpdb> 85 atoms in block 173 Block first atom: 13866 Blocpdb> 93 atoms in block 174 Block first atom: 13951 Blocpdb> 78 atoms in block 175 Block first atom: 14044 Blocpdb> 77 atoms in block 176 Block first atom: 14122 Blocpdb> 83 atoms in block 177 Block first atom: 14199 Blocpdb> 88 atoms in block 178 Block first atom: 14282 Blocpdb> 95 atoms in block 179 Block first atom: 14370 Blocpdb> 80 atoms in block 180 Block first atom: 14465 Blocpdb> 79 atoms in block 181 Block first atom: 14545 Blocpdb> 87 atoms in block 182 Block first atom: 14624 Blocpdb> 71 atoms in block 183 Block first atom: 14711 Blocpdb> 73 atoms in block 184 Block first atom: 14782 Blocpdb> 84 atoms in block 185 Block first atom: 14855 Blocpdb> 69 atoms in block 186 Block first atom: 14939 Blocpdb> 77 atoms in block 187 Block first atom: 15008 Blocpdb> 75 atoms in block 188 Block first atom: 15085 Blocpdb> 91 atoms in block 189 Block first atom: 15160 Blocpdb> 71 atoms in block 190 Block first atom: 15251 Blocpdb> 45 atoms in block 191 Block first atom: 15322 Blocpdb> 92 atoms in block 192 Block first atom: 15367 Blocpdb> 81 atoms in block 193 Block first atom: 15459 Blocpdb> 71 atoms in block 194 Block first atom: 15540 Blocpdb> 70 atoms in block 195 Block first atom: 15611 Blocpdb> 69 atoms in block 196 Block first atom: 15680 Blocpdb> 196 blocks. Blocpdb> At most, 97 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 30 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 6165113 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 47247 Prepmat> Matrix trace = 13492040.0000 Prepmat> Last element read: 47247 47247 154.1374 Prepmat> 19307 lines saved. Prepmat> 17629 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 15749 RTB> Total mass = 15749.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 15749 RTB> Number of blocks = 196 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 199689.5220 RTB> 57432 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1176 Diagstd> Nb of non-zero elements: 57432 Diagstd> Projected matrix trace = 199689.5220 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1176 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 199689.5220 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.7891711 1.1937551 1.3930774 1.6422977 1.9154046 2.2148671 2.6874752 2.7988334 3.0983660 3.2474130 3.3186013 3.4640597 3.5329637 3.9726079 4.1203511 4.6056353 4.8055973 5.5600203 5.9392200 6.0883628 6.3901536 6.5398996 6.6348376 7.0246140 7.6094415 7.8616795 8.1272284 8.1824370 8.4244236 8.6464835 8.8207261 9.1087598 9.3864891 9.4921052 9.6842109 10.0433907 10.3539028 10.8928769 10.9853338 11.3158595 11.4911559 11.6961886 12.3677661 12.6572883 12.9646554 13.4848364 13.6673834 13.9952029 14.4113784 14.6363750 14.9012905 15.1847423 15.6479540 15.9536233 16.1390071 16.2937855 16.9646551 17.2276830 17.2823220 17.6402407 17.7817329 17.8636024 18.4757360 18.6622246 18.9537653 19.8636637 20.1251920 20.4988794 20.7213805 21.1359996 21.3001912 21.5144090 21.9029822 21.9203013 22.3610855 22.5704935 22.7629242 23.0124595 23.2584431 23.5221303 23.8403332 24.3368899 24.5801821 24.8812546 25.0748595 25.2829035 25.8145131 26.2187862 26.7574008 27.0279510 27.2829253 27.5677374 28.1304409 28.3028842 28.7819743 29.3326288 29.9889004 30.3975977 30.7395159 31.1322246 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034326 0.0034337 0.0034340 0.0034343 0.0034350 0.0034360 96.4674641 118.6459451 128.1689721 139.1621788 150.2884276 161.6103303 178.0194752 181.6702460 191.1444262 195.6879308 197.8211952 202.1100754 204.1102747 216.4378110 220.4257822 233.0451424 238.0504276 256.0551221 264.6427410 267.9449294 274.5054223 277.7031601 279.7115690 287.8104197 299.5516194 304.4759174 309.5754490 310.6251498 315.1848821 319.3118530 322.5131660 327.7365716 332.6954570 334.5619542 337.9305064 344.1402408 349.4196479 358.3988262 359.9166263 365.2910686 368.1095955 371.3791016 381.8923081 386.3363896 390.9991105 398.7660000 401.4560145 406.2420544 412.2380170 415.4435731 419.1864350 423.1545281 429.5602251 433.7354773 436.2482391 438.3351289 447.2679694 450.7219576 451.4361427 456.0868315 457.9123125 458.9652468 466.7627118 469.1124791 472.7625094 483.9772606 487.1529047 491.6548647 494.3159495 499.2368983 501.1722678 503.6861281 508.2143284 508.4152164 513.5015056 515.9003330 518.0948870 520.9269175 523.7036496 526.6639672 530.2143050 535.7076138 538.3786494 541.6658028 543.7691121 546.0202553 551.7308262 556.0342855 561.7165790 564.5492593 567.2059096 570.1588129 575.9483649 577.7109877 582.5800000 588.1265338 594.6693452 598.7077939 602.0655699 605.8991699 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 15749 Rtb_to_modes> Number of blocs = 196 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.7892 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.194 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.393 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.642 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.915 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.215 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.687 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.799 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.098 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.247 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.319 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.464 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.533 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.120 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.606 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.806 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.560 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.939 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.088 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.390 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.540 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 6.635 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.025 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.609 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.862 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.127 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.182 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.424 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.646 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.821 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.109 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.386 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.492 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.684 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.49 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.18 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.65 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.29 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.96 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.72 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.51 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 21.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.01 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.26 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.78 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.33 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.99 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.13 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1176 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 283482 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 0.99998 1.00000 1.00000 1.00003 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 1.00000 0.99999 0.99997 1.00000 0.99999 0.99999 1.00000 1.00004 1.00001 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99998 1.00000 0.99999 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 1.00000 1.00001 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 0.99998 1.00001 1.00003 1.00001 1.00002 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00003 0.99999 1.00001 0.99998 1.00003 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3:-0.000 0.000 Vector 4:-0.000 0.000 0.000 Vector 5:-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 6: 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 7: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 9:-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 10:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261027160417165189.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261027160417165189.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 261027160417165189.atom Openam> file on opening on unit 11: 261027160417165189.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 1924 First residue number = 23 Last residue number = 557 Number of atoms found = 15749 Mean number per residue = 8.2 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9923E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9984E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0002E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0006E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0012E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.7892 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.194 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.393 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.642 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.915 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.215 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.687 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.799 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.098 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.247 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.319 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.464 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.533 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.120 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.606 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.806 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.560 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.939 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.088 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.390 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.540 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 6.635 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.025 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.609 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.862 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.127 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.182 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.424 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.646 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.821 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.109 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.386 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.492 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.684 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.49 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.18 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.65 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.29 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.96 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.72 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.51 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 21.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.01 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.26 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.78 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.33 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.99 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.13 Bfactors> 106 vectors, 47247 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.789200 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= 0.679 for 1924 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.013 +/- 0.02 Bfactors> = 54.969 +/- 26.07 Bfactors> Shiftng-fct= 54.956 Bfactors> Scaling-fct= 1317.334 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261027160417165189.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261027160417165189.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4325E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4342E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4348E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4359E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 96.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 118.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 128.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 139.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 150.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 161.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 178.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 181.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 191.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 195.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 197.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 202.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 204.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 216.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 220.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 233.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 238.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 256.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 264.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 267.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 274.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 277.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 279.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 287.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 299.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 304.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 309.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 310.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 315.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 319.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 322.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 327.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du 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Chkmod> That is: 15749 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.8787 0.0034 0.6691 0.0034 0.8132 0.0034 0.6271 0.0034 0.7616 0.0034 0.8306 96.4651 0.2633 118.6530 0.1772 128.1599 0.1254 139.1436 0.1489 150.2661 0.3210 161.6082 0.1474 177.9961 0.1204 181.6679 0.1881 191.1249 0.4246 195.6671 0.4789 197.8246 0.5358 202.0997 0.3069 204.1026 0.1931 216.4392 0.1292 220.4069 0.3547 233.0444 0.1606 238.0502 0.3170 256.0437 0.4203 264.6265 0.2731 267.9254 0.4347 274.4903 0.6380 277.6934 0.6405 279.7030 0.3098 287.8060 0.3988 299.5301 0.4594 304.4691 0.3105 309.5578 0.4621 310.6035 0.4453 315.1634 0.1841 319.2892 0.4347 322.5043 0.5613 327.7268 0.3819 332.6725 0.4378 334.5457 0.3933 337.9123 0.5258 344.0674 0.3814 349.3388 0.4171 358.3361 0.5335 359.9776 0.4950 365.3422 0.5051 368.0753 0.4660 371.4237 0.2798 381.9104 0.5940 386.3612 0.4400 390.9121 0.4527 398.6774 0.3961 401.4772 0.4883 406.2942 0.4840 412.2006 0.3872 415.4772 0.3551 419.1503 0.4934 423.0703 0.5528 429.5699 0.3813 433.6676 0.5964 436.2429 0.5432 438.2654 0.3940 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perturbed structure for DQ=-100 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=100 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../../bin/get_modes.sh 261027160417165189 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261027160417165189.eigenfacs 261027160417165189.atom 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