CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***  BMan WT  ***

LOGs for ID: 261030074727917150

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 261030074727917150.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 261030074727917150.atom to be opened. Openam> File opened: 261030074727917150.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 338 First residue number = 1 Last residue number = 338 Number of atoms found = 2710 Mean number per residue = 8.0 Pdbmat> Coordinate statistics: = -0.316801 +/- 12.714137 From: -27.707000 To: 30.584000 = -0.907454 +/- 10.282857 From: -25.761000 To: 22.166000 = -0.053982 +/- 9.391993 From: -24.083000 To: 22.064000 Pdbmat> Masses are all set to one. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 3.3206 % Filled. Pdbmat> 1097553 non-zero elements. Pdbmat> 120162 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 88.68 +/- 23.22 Maximum number = 134 Minimum number = 13 Pdbmat> Matrix trace = 2.403240E+06 Pdbmat> Larger element = 480.948 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 338 non-zero elements, NRBL set to 2 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 261030074727917150.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 2 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 261030074727917150.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 261030074727917150.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 2710 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 2 residue(s) per block. Blocpdb> 338 residues. Blocpdb> 17 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 13 atoms in block 2 Block first atom: 18 Blocpdb> 14 atoms in block 3 Block first atom: 31 Blocpdb> 15 atoms in block 4 Block first atom: 45 Blocpdb> 13 atoms in block 5 Block first atom: 60 Blocpdb> 18 atoms in block 6 Block first atom: 73 Blocpdb> 14 atoms in block 7 Block first atom: 91 Blocpdb> 16 atoms in block 8 Block first atom: 105 Blocpdb> 15 atoms in block 9 Block first atom: 121 Blocpdb> 22 atoms in block 10 Block first atom: 136 Blocpdb> 13 atoms in block 11 Block first atom: 158 Blocpdb> 18 atoms in block 12 Block first atom: 171 Blocpdb> 15 atoms in block 13 Block first atom: 189 Blocpdb> 18 atoms in block 14 Block first atom: 204 Blocpdb> 17 atoms in block 15 Block first atom: 222 Blocpdb> 18 atoms in block 16 Block first atom: 239 Blocpdb> 14 atoms in block 17 Block first atom: 257 Blocpdb> 9 atoms in block 18 Block first atom: 271 Blocpdb> 15 atoms in block 19 Block first atom: 280 Blocpdb> 16 atoms in block 20 Block first atom: 295 Blocpdb> 16 atoms in block 21 Block first atom: 311 Blocpdb> 15 atoms in block 22 Block first atom: 327 Blocpdb> 17 atoms in block 23 Block first atom: 342 Blocpdb> 13 atoms in block 24 Block first atom: 359 Blocpdb> 14 atoms in block 25 Block first atom: 372 Blocpdb> 19 atoms in block 26 Block first atom: 386 Blocpdb> 19 atoms in block 27 Block first atom: 405 Blocpdb> 11 atoms in block 28 Block first atom: 424 Blocpdb> 11 atoms in block 29 Block first atom: 435 Blocpdb> 15 atoms in block 30 Block first atom: 446 Blocpdb> 12 atoms in block 31 Block first atom: 461 Blocpdb> 20 atoms in block 32 Block first atom: 473 Blocpdb> 10 atoms in block 33 Block first atom: 493 Blocpdb> 20 atoms in block 34 Block first atom: 503 Blocpdb> 16 atoms in block 35 Block first atom: 523 Blocpdb> 18 atoms in block 36 Block first atom: 539 Blocpdb> 17 atoms in block 37 Block first atom: 557 Blocpdb> 12 atoms in block 38 Block first atom: 574 Blocpdb> 16 atoms in block 39 Block first atom: 586 Blocpdb> 17 atoms in block 40 Block first atom: 602 Blocpdb> 14 atoms in block 41 Block first atom: 619 Blocpdb> 15 atoms in block 42 Block first atom: 633 Blocpdb> 12 atoms in block 43 Block first atom: 648 Blocpdb> 12 atoms in block 44 Block first atom: 660 Blocpdb> 16 atoms in block 45 Block first atom: 672 Blocpdb> 14 atoms in block 46 Block first atom: 688 Blocpdb> 26 atoms in block 47 Block first atom: 702 Blocpdb> 17 atoms in block 48 Block first atom: 728 Blocpdb> 8 atoms in block 49 Block first atom: 745 Blocpdb> 15 atoms in block 50 Block first atom: 753 Blocpdb> 17 atoms in block 51 Block first atom: 768 Blocpdb> 14 atoms in block 52 Block first atom: 785 Blocpdb> 18 atoms in block 53 Block first atom: 799 Blocpdb> 13 atoms in block 54 Block first atom: 817 Blocpdb> 12 atoms in block 55 Block first atom: 830 Blocpdb> 20 atoms in block 56 Block first atom: 842 Blocpdb> 10 atoms in block 57 Block first atom: 862 Blocpdb> 21 atoms in block 58 Block first atom: 872 Blocpdb> 16 atoms in block 59 Block first atom: 893 Blocpdb> 15 atoms in block 60 Block first atom: 909 Blocpdb> 15 atoms in block 61 Block first atom: 924 Blocpdb> 17 atoms in block 62 Block first atom: 939 Blocpdb> 21 atoms in block 63 Block first atom: 956 Blocpdb> 17 atoms in block 64 Block first atom: 977 Blocpdb> 16 atoms in block 65 Block first atom: 994 Blocpdb> 12 atoms in block 66 Block first atom: 1010 Blocpdb> 14 atoms in block 67 Block first atom: 1022 Blocpdb> 13 atoms in block 68 Block first atom: 1036 Blocpdb> 20 atoms in block 69 Block first atom: 1049 Blocpdb> 16 atoms in block 70 Block first atom: 1069 Blocpdb> 13 atoms in block 71 Block first atom: 1085 Blocpdb> 14 atoms in block 72 Block first atom: 1098 Blocpdb> 17 atoms in block 73 Block first atom: 1112 Blocpdb> 13 atoms in block 74 Block first atom: 1129 Blocpdb> 12 atoms in block 75 Block first atom: 1142 Blocpdb> 18 atoms in block 76 Block first atom: 1154 Blocpdb> 17 atoms in block 77 Block first atom: 1172 Blocpdb> 17 atoms in block 78 Block first atom: 1189 Blocpdb> 11 atoms in block 79 Block first atom: 1206 Blocpdb> 14 atoms in block 80 Block first atom: 1217 Blocpdb> 19 atoms in block 81 Block first atom: 1231 Blocpdb> 18 atoms in block 82 Block first atom: 1250 Blocpdb> 18 atoms in block 83 Block first atom: 1268 Blocpdb> 17 atoms in block 84 Block first atom: 1286 Blocpdb> 12 atoms in block 85 Block first atom: 1303 Blocpdb> 23 atoms in block 86 Block first atom: 1315 Blocpdb> 25 atoms in block 87 Block first atom: 1338 Blocpdb> 18 atoms in block 88 Block first atom: 1363 Blocpdb> 15 atoms in block 89 Block first atom: 1381 Blocpdb> 18 atoms in block 90 Block first atom: 1396 Blocpdb> 17 atoms in block 91 Block first atom: 1414 Blocpdb> 17 atoms in block 92 Block first atom: 1431 Blocpdb> 17 atoms in block 93 Block first atom: 1448 Blocpdb> 19 atoms in block 94 Block first atom: 1465 Blocpdb> 14 atoms in block 95 Block first atom: 1484 Blocpdb> 21 atoms in block 96 Block first atom: 1498 Blocpdb> 17 atoms in block 97 Block first atom: 1519 Blocpdb> 21 atoms in block 98 Block first atom: 1536 Blocpdb> 17 atoms in block 99 Block first atom: 1557 Blocpdb> 22 atoms in block 100 Block first atom: 1574 Blocpdb> 20 atoms in block 101 Block first atom: 1596 Blocpdb> 15 atoms in block 102 Block first atom: 1616 Blocpdb> 18 atoms in block 103 Block first atom: 1631 Blocpdb> 12 atoms in block 104 Block first atom: 1649 Blocpdb> 18 atoms in block 105 Block first atom: 1661 Blocpdb> 16 atoms in block 106 Block first atom: 1679 Blocpdb> 21 atoms in block 107 Block first atom: 1695 Blocpdb> 18 atoms in block 108 Block first atom: 1716 Blocpdb> 15 atoms in block 109 Block first atom: 1734 Blocpdb> 13 atoms in block 110 Block first atom: 1749 Blocpdb> 19 atoms in block 111 Block first atom: 1762 Blocpdb> 20 atoms in block 112 Block first atom: 1781 Blocpdb> 15 atoms in block 113 Block first atom: 1801 Blocpdb> 23 atoms in block 114 Block first atom: 1816 Blocpdb> 11 atoms in block 115 Block first atom: 1839 Blocpdb> 11 atoms in block 116 Block first atom: 1850 Blocpdb> 19 atoms in block 117 Block first atom: 1861 Blocpdb> 16 atoms in block 118 Block first atom: 1880 Blocpdb> 11 atoms in block 119 Block first atom: 1896 Blocpdb> 16 atoms in block 120 Block first atom: 1907 Blocpdb> 17 atoms in block 121 Block first atom: 1923 Blocpdb> 20 atoms in block 122 Block first atom: 1940 Blocpdb> 13 atoms in block 123 Block first atom: 1960 Blocpdb> 18 atoms in block 124 Block first atom: 1973 Blocpdb> 16 atoms in block 125 Block first atom: 1991 Blocpdb> 16 atoms in block 126 Block first atom: 2007 Blocpdb> 17 atoms in block 127 Block first atom: 2023 Blocpdb> 15 atoms in block 128 Block first atom: 2040 Blocpdb> 13 atoms in block 129 Block first atom: 2055 Blocpdb> 17 atoms in block 130 Block first atom: 2068 Blocpdb> 18 atoms in block 131 Block first atom: 2085 Blocpdb> 16 atoms in block 132 Block first atom: 2103 Blocpdb> 16 atoms in block 133 Block first atom: 2119 Blocpdb> 11 atoms in block 134 Block first atom: 2135 Blocpdb> 16 atoms in block 135 Block first atom: 2146 Blocpdb> 12 atoms in block 136 Block first atom: 2162 Blocpdb> 12 atoms in block 137 Block first atom: 2174 Blocpdb> 17 atoms in block 138 Block first atom: 2186 Blocpdb> 20 atoms in block 139 Block first atom: 2203 Blocpdb> 14 atoms in block 140 Block first atom: 2223 Blocpdb> 19 atoms in block 141 Block first atom: 2237 Blocpdb> 13 atoms in block 142 Block first atom: 2256 Blocpdb> 17 atoms in block 143 Block first atom: 2269 Blocpdb> 18 atoms in block 144 Block first atom: 2286 Blocpdb> 19 atoms in block 145 Block first atom: 2304 Blocpdb> 16 atoms in block 146 Block first atom: 2323 Blocpdb> 20 atoms in block 147 Block first atom: 2339 Blocpdb> 19 atoms in block 148 Block first atom: 2359 Blocpdb> 19 atoms in block 149 Block first atom: 2378 Blocpdb> 16 atoms in block 150 Block first atom: 2397 Blocpdb> 23 atoms in block 151 Block first atom: 2413 Blocpdb> 11 atoms in block 152 Block first atom: 2436 Blocpdb> 12 atoms in block 153 Block first atom: 2447 Blocpdb> 17 atoms in block 154 Block first atom: 2459 Blocpdb> 9 atoms in block 155 Block first atom: 2476 Blocpdb> 11 atoms in block 156 Block first atom: 2485 Blocpdb> 20 atoms in block 157 Block first atom: 2496 Blocpdb> 18 atoms in block 158 Block first atom: 2516 Blocpdb> 20 atoms in block 159 Block first atom: 2534 Blocpdb> 15 atoms in block 160 Block first atom: 2554 Blocpdb> 17 atoms in block 161 Block first atom: 2569 Blocpdb> 13 atoms in block 162 Block first atom: 2586 Blocpdb> 22 atoms in block 163 Block first atom: 2599 Blocpdb> 12 atoms in block 164 Block first atom: 2621 Blocpdb> 14 atoms in block 165 Block first atom: 2633 Blocpdb> 15 atoms in block 166 Block first atom: 2647 Blocpdb> 15 atoms in block 167 Block first atom: 2662 Blocpdb> 16 atoms in block 168 Block first atom: 2677 Blocpdb> 18 atoms in block 169 Block first atom: 2692 Blocpdb> 169 blocks. Blocpdb> At most, 26 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 8 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 1097722 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 8130 Prepmat> Matrix trace = 2403240.0000 Prepmat> Last element read: 8130 8130 117.9471 Prepmat> 14366 lines saved. Prepmat> 12331 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 2710 RTB> Total mass = 2710.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 2710 RTB> Number of blocks = 169 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 257368.0179 RTB> 70689 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1014 Diagstd> Nb of non-zero elements: 70689 Diagstd> Projected matrix trace = 257368.0179 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1014 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 257368.0179 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 4.1727121 5.2795274 5.8202030 7.1220247 8.3561097 10.2236641 12.0032384 13.3126928 14.6949232 16.2070088 16.7732796 17.3515346 18.3682462 19.1687582 20.4694947 20.5499863 22.3043111 23.8879492 24.3497482 26.1327344 28.1702398 29.2748931 29.9022963 30.3085957 30.7543051 31.7655876 32.4468765 32.8658498 33.6154945 33.7533304 34.8205005 36.3015752 36.5954143 36.9091062 38.6232704 40.6002036 42.1971681 42.6605912 44.0611977 45.0258831 45.3673730 46.0262914 46.3842623 47.8299221 48.2087103 48.7748180 49.5211460 51.4039214 51.5504700 52.1031162 53.2474648 53.6223411 55.2149326 55.8404392 56.1904339 56.6273809 57.2707205 57.9237387 58.7931057 59.1298313 60.4164808 60.7105746 61.7630455 62.8612550 63.1986632 64.6133365 65.0560582 65.5291292 66.5662587 67.9172825 70.1467694 70.4654474 70.8722904 71.2824885 72.6162426 73.6832251 74.1378641 75.0507028 75.5818366 75.9447867 76.9472104 77.1545873 77.8997712 78.8076644 79.9491296 80.2987586 81.0473095 81.5506617 82.0548333 82.3241542 83.3556425 83.9963320 84.5731488 85.7738242 86.0677984 87.5907980 87.8046193 88.5858851 89.1742853 90.2333157 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034313 0.0034336 0.0034340 0.0034342 0.0034348 0.0034359 221.8219355 249.5127856 261.9777124 289.7990909 313.9043583 347.2150696 376.2222669 396.2125575 416.2736690 437.1663379 444.7380359 452.3391999 465.4029436 475.4362254 491.3023499 492.2673690 512.8492052 530.7435359 535.8491149 555.1210645 576.3556469 587.5474410 593.8100591 597.8306644 602.2103840 612.0314322 618.5598520 622.5406482 629.6004543 630.8899301 640.7856610 654.2715185 656.9141469 659.7236372 674.8695021 691.9255795 705.4024008 709.2653031 720.8143589 728.6624672 731.4204456 736.7128952 739.5722499 751.0089573 753.9768943 758.3908929 764.1711250 778.5623637 779.6713843 783.8394716 792.4005123 795.1849755 806.9071307 811.4648139 814.0038767 817.1626681 821.7914222 826.4632999 832.6423212 835.0233123 844.0593643 846.1112158 853.4137417 860.9675909 863.2751232 872.8836608 875.8689953 879.0477743 885.9768097 894.9225068 909.4924905 911.5560697 914.1837863 916.8255476 925.3630779 932.1366703 935.0079752 940.7466102 944.0695728 946.3336076 952.5586390 953.8413742 958.4365589 964.0054931 970.9618141 973.0825752 977.6076277 980.6386924 983.6653285 985.2783023 991.4316565 995.2345422 998.6459162 1005.7097649 1007.4317344 1016.3060752 1017.5457916 1022.0627129 1025.4514391 1031.5225783 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 2710 Rtb_to_modes> Number of blocs = 169 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9843E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.173 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.280 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 5.820 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 7.122 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.356 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 10.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 12.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 13.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.69 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 18.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 19.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 23.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.35 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 28.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.31 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 30.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.45 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.75 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 36.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 38.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 40.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 44.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.03 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.83 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 48.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.40 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.25 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.19 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 56.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.27 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.71 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 61.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 64.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 65.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 66.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 70.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.68 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 75.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 76.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 77.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 78.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.30 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 81.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.32 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.00 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.57 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 86.07 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.59 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.17 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.23 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1014 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00005 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99996 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 48780 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 1.00000 0.99997 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 1.00005 0.99997 1.00003 1.00000 1.00001 1.00001 1.00001 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99999 1.00000 1.00000 0.99997 1.00001 0.99998 1.00001 0.99998 0.99998 1.00003 1.00000 1.00000 0.99996 0.99997 1.00001 1.00002 0.99999 1.00000 1.00000 1.00001 1.00001 0.99998 1.00000 1.00000 0.99999 1.00001 0.99997 1.00002 0.99999 1.00001 0.99999 1.00001 1.00002 1.00002 0.99999 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00001 0.99999 0.99998 1.00001 1.00001 1.00002 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99998 0.99997 0.99999 1.00002 0.99999 1.00000 0.99997 1.00003 0.99999 1.00000 1.00001 0.99999 1.00002 0.99999 1.00001 1.00000 1.00001 1.00000 1.00003 0.99999 1.00001 1.00001 1.00001 1.00002 1.00000 1.00000 1.00002 0.99999 0.99998 0.99999 1.00004 1.00000 1.00001 1.00000 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2: 0.000 Vector 3: 0.000 0.000 Vector 4:-0.000-0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000 0.000 0.000 Vector 6: 0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 7: 0.000-0.000-0.000 0.000 0.000-0.000 Vector 8:-0.000 0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9: 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 Vector 10: 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261030074727917150.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261030074727917150.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 261030074727917150.atom Openam> file on opening on unit 11: 261030074727917150.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 338 First residue number = 1 Last residue number = 338 Number of atoms found = 2710 Mean number per residue = 8.0 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9843E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9980E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0000E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0001E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0011E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.173 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.280 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 5.820 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 7.122 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.356 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 10.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 12.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 13.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.69 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 18.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 19.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 23.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.35 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 28.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.31 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 30.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.45 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.75 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 36.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 38.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 40.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 44.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.83 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 48.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.40 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.25 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.19 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 56.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.27 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.71 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 61.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 64.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 65.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 66.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 70.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.68 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 75.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 76.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 77.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 78.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.30 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 81.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.32 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.00 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.57 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 86.07 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.59 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.23 Bfactors> 106 vectors, 8130 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 4.173000 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) Bfactors> Correlation= -0.494 for 338 C-alpha atoms. Bfactors> = 0.016 +/- 0.02 Bfactors> = 97.760 +/- 2.71 Bfactors> Shiftng-fct= 97.744 Bfactors> Scaling-fct= 113.476 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 261030074727917150.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 261030074727917150.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4311E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4335E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4338E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4340E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4357E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 221.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 249.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 262.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 289.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 313.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 347.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 376.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 396.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 416.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 437.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 444.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 452.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 465.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 475.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 491.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 492.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 512.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 530.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 555.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 576.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 587.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 597.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 602.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 612.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 618.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 622.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 629.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 630.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 640.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 654.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 656.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 659.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 674.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 691.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 709.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 720.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 731.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 736.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 739.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 751.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 754.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 758.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 764.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 779.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 783.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 792.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 795.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 806.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 811.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 814.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 817.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 826.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 832.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 835.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 846.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 853.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 860.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 863.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 872.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 875.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 879.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 886.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 894.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 909.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 911.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 914.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 916.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 925.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 935.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 944.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 946.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 952.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 953.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 958.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 964.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 970.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 977.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 980.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 983.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 985.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 995.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1006. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1007. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1017. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1025. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1031. Chkmod> 106 vectors, 8130 coordinates in file. Chkmod> That is: 2710 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.9883 0.0034 0.9259 0.0034 0.7552 0.0034 0.6985 0.0034 0.7660 0.0034 0.7572 221.8201 0.0243 249.5132 0.1869 261.9619 0.2838 289.7861 0.1724 313.8888 0.4321 347.1379 0.0852 376.1554 0.1730 396.1555 0.3967 416.1861 0.2130 437.1879 0.3561 444.6755 0.6660 452.2998 0.5806 465.4052 0.6387 475.4312 0.5136 491.2873 0.6433 492.2464 0.6505 512.7776 0.7237 530.7435 0.6734 535.8289 0.5273 555.0682 0.3549 576.3285 0.4679 587.4731 0.3568 593.7618 0.3998 597.8189 0.5209 602.1424 0.2185 612.0477 0.3836 618.5631 0.2452 622.5532 0.4064 629.6156 0.4055 630.8317 0.4182 640.7535 0.5718 654.2292 0.5358 656.9271 0.6515 659.7033 0.4998 674.8120 0.6045 691.8941 0.5476 705.3958 0.4667 709.2299 0.4267 720.7736 0.2707 728.6645 0.5097 731.4102 0.4791 736.7109 0.4869 739.5065 0.4345 750.9773 0.4895 753.9546 0.5133 758.3209 0.4512 764.1295 0.5608 778.4992 0.4133 779.6344 0.5054 783.7824 0.4113 792.3854 0.4365 795.1335 0.3830 806.8365 0.4364 811.4268 0.4755 813.9658 0.4741 817.1465 0.3033 821.7510 0.5000 826.4012 0.4724 832.5846 0.5204 834.9887 0.3975 844.0477 0.4331 846.0709 0.3215 853.3561 0.3971 860.9220 0.3644 863.2472 0.5270 872.8237 0.2956 875.8579 0.3888 879.0159 0.3485 885.9637 0.5286 894.9020 0.4307 909.4744 0.4678 911.5464 0.3133 914.1298 0.4415 916.7702 0.4671 925.3473 0.3574 932.0763 0.3641 934.9813 0.5083 940.7018 0.4327 944.0176 0.5537 946.2632 0.4433 952.5350 0.5789 953.7721 0.4872 958.3968 0.4584 963.9784 0.4693 970.9254 0.4312 973.0483 0.4301 977.5819 0.4094 980.5926 0.4820 983.5941 0.3551 985.2111 0.3444 991.4150 0.5179 995.2135 0.5192 998.5845 0.4823 1005.6442 0.2935 1007.4014 0.4880 1016.2578 0.4022 1017.4753 0.3908 1022.0426 0.3537 1025.3828 0.3461 1031.4593 0.5270 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 261030074727917150 7 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom making animated gifs 11 models are in 261030074727917150.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.7.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 261030074727917150 8 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom making animated gifs 11 models are in 261030074727917150.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.8.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 261030074727917150 9 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom making animated gifs 11 models are in 261030074727917150.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.9.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 261030074727917150 10 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom making animated gifs 11 models are in 261030074727917150.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.10.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 261030074727917150 11 -100 100 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=0 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=20 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=40 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=60 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=80 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom calculating perturbed structure for DQ=100 261030074727917150.eigenfacs 261030074727917150.atom making animated gifs 11 models are in 261030074727917150.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 11 models are in 261030074727917150.11.pdb, 1 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 3 will be plotted MODEL 5 will be plotted MODEL 7 will be plotted MODEL 9 will be plotted MODEL 11 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 261030074727917150.10.pdb 261030074727917150.11.pdb 261030074727917150.7.pdb 261030074727917150.8.pdb 261030074727917150.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 0m20.564s user 0m20.423s sys 0m0.129s rm: cannot remove '261030074727917150.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.