CNRS Nantes University US2B US2B
home |  start a new run |  job status |  references&downloads |  examples |  help  

Should you encounter any unexpected behaviour,
please let us know.
elNémo has been relocated.
**Some cleaning from time to time**
Sorry for the inconvenience.


***    ***

LOGs for ID: 2611051310012194214

Output from eigenvector calculation:


STDOUT:
CUTOFF set to default value (CUTOFF=8) Build Tirion matrix: Pdbmat> Computes the Hessian matrix, using an Elastic Network Model. Pdbmat> Version 3.50, Fevrier 2004. Pdbmat> Options to be read in pdbmat.dat file. Pdbmat> Coordinate filename = 2611051310012194214.atom Pdbmat> Distance cutoff = 8.00 Force constant = 10.00 Origin of mass values = CONS Pdbmat> Levelshift = 1.0E-09 PRINTing level = 2 Pdbmat> Coordinate file 2611051310012194214.atom to be opened. Openam> File opened: 2611051310012194214.atom Pdbmat> Coordinate file in PDB format. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 788 First residue number = 1 Last residue number = 440 Number of atoms found = 11684 Mean number per residue = 14.8 Pdbmat> Coordinate statistics: = 64.362974 +/- 13.687125 From: 25.712000 To: 98.550000 = 68.847226 +/- 25.614653 From: 18.435000 To: 123.020000 = 83.396746 +/- 13.158888 From: 48.619000 To: 115.471000 Pdbmat> Masses are all set to one. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'GLH ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> residue:'HIE ' is not a well known amino-acid. %Pdbmat-W> ........ %Pdbmat-W> 20 residue(s) not known. Openam> File opened: pdbmat.xyzm Pdbmat> Coordinates and masses considered are saved. Openam> File opened: pdbmat.sdijb Pdbmat> Matrix statistics: Pdbmat> The matrix is 1.4072 % Filled. Pdbmat> 8645120 non-zero elements. Pdbmat> 952934 atom-atom interactions. Pdbmat> Number per atom= 163.12 +/- 46.97 Maximum number = 246 Minimum number = 25 Pdbmat> Matrix trace = 1.905868E+07 Pdbmat> Larger element = 868.915 Pdbmat> 0 elements larger than +/- 1.0E+10 Pdbmat> Normal end. automatic determination of NRBL (NRBL = nresidues/200 + 1) 788 non-zero elements, NRBL set to 4 Diagonalize Tirion matrix using diagrtb Diagrtb> Diagonalizes a matrix, using the RTB/BNM approximation. Diagrtb> Version 2.52, November 2004. Diagrtb> Options to be read in diagrtb.dat file. Diagrtb> Options taken into account: MATRix filename = pdbmat.sdijb COORdinates filename = 2611051310012194214.atom Eigenvector OUTPut file = matrix.eigenrtb Nb of VECTors required = 106 EigeNVALues chosen = LOWE Type of SUBStructuring = NONE Nb of residues per BLOck = 4 Origin of MASS values = CONS MATRix FORMat = BINA Temporary files cleaning = ALL Output PRINting level = 2 Diagrtb> Memory allocation for Blocpdb. Blocpdb> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.xyzm Blocpdb> Coordinate file 2611051310012194214.atom to be opened. Openam> file on opening on unit 11: 2611051310012194214.atom Blocpdb> Coordinate file in PDB format. Blocpdb> 11684 atoms picked in pdb file. Blocpdb> All masses set to unity. Blocpdb> Coordinate file is rewritten. Blocpdb> Substructuring: Blocpdb> 4 residue(s) per block. Blocpdb> 788 residues. Blocpdb> 72 atoms in block 1 Block first atom: 1 Blocpdb> 66 atoms in block 2 Block first atom: 73 Blocpdb> 60 atoms in block 3 Block first atom: 139 Blocpdb> 49 atoms in block 4 Block first atom: 199 Blocpdb> 43 atoms in block 5 Block first atom: 248 Blocpdb> 58 atoms in block 6 Block first atom: 291 Blocpdb> 51 atoms in block 7 Block first atom: 349 Blocpdb> 60 atoms in block 8 Block first atom: 400 Blocpdb> 61 atoms in block 9 Block first atom: 460 Blocpdb> 41 atoms in block 10 Block first atom: 521 Blocpdb> 76 atoms in block 11 Block first atom: 562 Blocpdb> 84 atoms in block 12 Block first atom: 638 Blocpdb> 51 atoms in block 13 Block first atom: 722 Blocpdb> 76 atoms in block 14 Block first atom: 773 Blocpdb> 51 atoms in block 15 Block first atom: 849 Blocpdb> 44 atoms in block 16 Block first atom: 900 Blocpdb> 59 atoms in block 17 Block first atom: 944 Blocpdb> 51 atoms in block 18 Block first atom: 1003 Blocpdb> 68 atoms in block 19 Block first atom: 1054 Blocpdb> 58 atoms in block 20 Block first atom: 1122 Blocpdb> 62 atoms in block 21 Block first atom: 1180 Blocpdb> 78 atoms in block 22 Block first atom: 1242 Blocpdb> 56 atoms in block 23 Block first atom: 1320 Blocpdb> 54 atoms in block 24 Block first atom: 1376 Blocpdb> 44 atoms in block 25 Block first atom: 1430 Blocpdb> 52 atoms in block 26 Block first atom: 1474 Blocpdb> 64 atoms in block 27 Block first atom: 1526 Blocpdb> 67 atoms in block 28 Block first atom: 1590 Blocpdb> 74 atoms in block 29 Block first atom: 1657 Blocpdb> 75 atoms in block 30 Block first atom: 1731 Blocpdb> 51 atoms in block 31 Block first atom: 1806 Blocpdb> 71 atoms in block 32 Block first atom: 1857 Blocpdb> 63 atoms in block 33 Block first atom: 1928 Blocpdb> 76 atoms in block 34 Block first atom: 1991 Blocpdb> 35 atoms in block 35 Block first atom: 2067 Blocpdb> 47 atoms in block 36 Block first atom: 2102 Blocpdb> 41 atoms in block 37 Block first atom: 2149 Blocpdb> 50 atoms in block 38 Block first atom: 2190 Blocpdb> 69 atoms in block 39 Block first atom: 2240 Blocpdb> 63 atoms in block 40 Block first atom: 2309 Blocpdb> 55 atoms in block 41 Block first atom: 2372 Blocpdb> 55 atoms in block 42 Block first atom: 2427 Blocpdb> 55 atoms in block 43 Block first atom: 2482 Blocpdb> 65 atoms in block 44 Block first atom: 2537 Blocpdb> 48 atoms in block 45 Block first atom: 2602 Blocpdb> 63 atoms in block 46 Block first atom: 2650 Blocpdb> 39 atoms in block 47 Block first atom: 2713 Blocpdb> 50 atoms in block 48 Block first atom: 2752 Blocpdb> 44 atoms in block 49 Block first atom: 2802 Blocpdb> 65 atoms in block 50 Block first atom: 2846 Blocpdb> 70 atoms in block 51 Block first atom: 2911 Blocpdb> 84 atoms in block 52 Block first atom: 2981 Blocpdb> 52 atoms in block 53 Block first atom: 3065 Blocpdb> 69 atoms in block 54 Block first atom: 3117 Blocpdb> 60 atoms in block 55 Block first atom: 3186 Blocpdb> 62 atoms in block 56 Block first atom: 3246 Blocpdb> 79 atoms in block 57 Block first atom: 3308 Blocpdb> 40 atoms in block 58 Block first atom: 3387 Blocpdb> 56 atoms in block 59 Block first atom: 3427 Blocpdb> 40 atoms in block 60 Block first atom: 3483 Blocpdb> 71 atoms in block 61 Block first atom: 3523 Blocpdb> 66 atoms in block 62 Block first atom: 3594 Blocpdb> 59 atoms in block 63 Block first atom: 3660 Blocpdb> 78 atoms in block 64 Block first atom: 3719 Blocpdb> 55 atoms in block 65 Block first atom: 3797 Blocpdb> 66 atoms in block 66 Block first atom: 3852 Blocpdb> 62 atoms in block 67 Block first atom: 3918 Blocpdb> 75 atoms in block 68 Block first atom: 3980 Blocpdb> 50 atoms in block 69 Block first atom: 4055 Blocpdb> 45 atoms in block 70 Block first atom: 4105 Blocpdb> 54 atoms in block 71 Block first atom: 4150 Blocpdb> 76 atoms in block 72 Block first atom: 4204 Blocpdb> 81 atoms in block 73 Block first atom: 4280 Blocpdb> 67 atoms in block 74 Block first atom: 4361 Blocpdb> 68 atoms in block 75 Block first atom: 4428 Blocpdb> 56 atoms in block 76 Block first atom: 4496 Blocpdb> 54 atoms in block 77 Block first atom: 4552 Blocpdb> 41 atoms in block 78 Block first atom: 4606 Blocpdb> 82 atoms in block 79 Block first atom: 4647 Blocpdb> 49 atoms in block 80 Block first atom: 4729 Blocpdb> 76 atoms in block 81 Block first atom: 4778 Blocpdb> 52 atoms in block 82 Block first atom: 4854 Blocpdb> 60 atoms in block 83 Block first atom: 4906 Blocpdb> 35 atoms in block 84 Block first atom: 4966 Blocpdb> 54 atoms in block 85 Block first atom: 5001 Blocpdb> 70 atoms in block 86 Block first atom: 5055 Blocpdb> 73 atoms in block 87 Block first atom: 5125 Blocpdb> 56 atoms in block 88 Block first atom: 5198 Blocpdb> 49 atoms in block 89 Block first atom: 5254 Blocpdb> 55 atoms in block 90 Block first atom: 5303 Blocpdb> 74 atoms in block 91 Block first atom: 5358 Blocpdb> 73 atoms in block 92 Block first atom: 5432 Blocpdb> 38 atoms in block 93 Block first atom: 5505 Blocpdb> 55 atoms in block 94 Block first atom: 5543 Blocpdb> 59 atoms in block 95 Block first atom: 5598 Blocpdb> 54 atoms in block 96 Block first atom: 5657 Blocpdb> 53 atoms in block 97 Block first atom: 5711 Blocpdb> 58 atoms in block 98 Block first atom: 5764 Blocpdb> 50 atoms in block 99 Block first atom: 5822 Blocpdb> 46 atoms in block 100 Block first atom: 5872 Blocpdb> 66 atoms in block 101 Block first atom: 5918 Blocpdb> 56 atoms in block 102 Block first atom: 5984 Blocpdb> 59 atoms in block 103 Block first atom: 6040 Blocpdb> 53 atoms in block 104 Block first atom: 6099 Blocpdb> 62 atoms in block 105 Block first atom: 6152 Blocpdb> 42 atoms in block 106 Block first atom: 6214 Blocpdb> 59 atoms in block 107 Block first atom: 6256 Blocpdb> 59 atoms in block 108 Block first atom: 6315 Blocpdb> 50 atoms in block 109 Block first atom: 6374 Blocpdb> 72 atoms in block 110 Block first atom: 6424 Blocpdb> 50 atoms in block 111 Block first atom: 6496 Blocpdb> 70 atoms in block 112 Block first atom: 6546 Blocpdb> 45 atoms in block 113 Block first atom: 6616 Blocpdb> 53 atoms in block 114 Block first atom: 6661 Blocpdb> 67 atoms in block 115 Block first atom: 6714 Blocpdb> 65 atoms in block 116 Block first atom: 6781 Blocpdb> 62 atoms in block 117 Block first atom: 6846 Blocpdb> 82 atoms in block 118 Block first atom: 6908 Blocpdb> 47 atoms in block 119 Block first atom: 6990 Blocpdb> 51 atoms in block 120 Block first atom: 7037 Blocpdb> 59 atoms in block 121 Block first atom: 7088 Blocpdb> 54 atoms in block 122 Block first atom: 7147 Blocpdb> 68 atoms in block 123 Block first atom: 7201 Blocpdb> 62 atoms in block 124 Block first atom: 7269 Blocpdb> 57 atoms in block 125 Block first atom: 7331 Blocpdb> 45 atoms in block 126 Block first atom: 7388 Blocpdb> 52 atoms in block 127 Block first atom: 7433 Blocpdb> 66 atoms in block 128 Block first atom: 7485 Blocpdb> 68 atoms in block 129 Block first atom: 7551 Blocpdb> 61 atoms in block 130 Block first atom: 7619 Blocpdb> 82 atoms in block 131 Block first atom: 7680 Blocpdb> 43 atoms in block 132 Block first atom: 7762 Blocpdb> 56 atoms in block 133 Block first atom: 7805 Blocpdb> 64 atoms in block 134 Block first atom: 7861 Blocpdb> 46 atoms in block 135 Block first atom: 7925 Blocpdb> 71 atoms in block 136 Block first atom: 7971 Blocpdb> 62 atoms in block 137 Block first atom: 8042 Blocpdb> 61 atoms in block 138 Block first atom: 8104 Blocpdb> 45 atoms in block 139 Block first atom: 8165 Blocpdb> 74 atoms in block 140 Block first atom: 8210 Blocpdb> 64 atoms in block 141 Block first atom: 8284 Blocpdb> 65 atoms in block 142 Block first atom: 8348 Blocpdb> 43 atoms in block 143 Block first atom: 8413 Blocpdb> 67 atoms in block 144 Block first atom: 8456 Blocpdb> 44 atoms in block 145 Block first atom: 8523 Blocpdb> 79 atoms in block 146 Block first atom: 8567 Blocpdb> 57 atoms in block 147 Block first atom: 8646 Blocpdb> 49 atoms in block 148 Block first atom: 8703 Blocpdb> 75 atoms in block 149 Block first atom: 8752 Blocpdb> 64 atoms in block 150 Block first atom: 8827 Blocpdb> 64 atoms in block 151 Block first atom: 8891 Blocpdb> 43 atoms in block 152 Block first atom: 8955 Blocpdb> 63 atoms in block 153 Block first atom: 8998 Blocpdb> 69 atoms in block 154 Block first atom: 9061 Blocpdb> 66 atoms in block 155 Block first atom: 9130 Blocpdb> 55 atoms in block 156 Block first atom: 9196 Blocpdb> 67 atoms in block 157 Block first atom: 9251 Blocpdb> 44 atoms in block 158 Block first atom: 9318 Blocpdb> 79 atoms in block 159 Block first atom: 9362 Blocpdb> 60 atoms in block 160 Block first atom: 9441 Blocpdb> 52 atoms in block 161 Block first atom: 9501 Blocpdb> 71 atoms in block 162 Block first atom: 9553 Blocpdb> 67 atoms in block 163 Block first atom: 9624 Blocpdb> 60 atoms in block 164 Block first atom: 9691 Blocpdb> 44 atoms in block 165 Block first atom: 9751 Blocpdb> 62 atoms in block 166 Block first atom: 9795 Blocpdb> 52 atoms in block 167 Block first atom: 9857 Blocpdb> 77 atoms in block 168 Block first atom: 9909 Blocpdb> 55 atoms in block 169 Block first atom: 9986 Blocpdb> 71 atoms in block 170 Block first atom: 10041 Blocpdb> 45 atoms in block 171 Block first atom: 10112 Blocpdb> 79 atoms in block 172 Block first atom: 10157 Blocpdb> 59 atoms in block 173 Block first atom: 10236 Blocpdb> 67 atoms in block 174 Block first atom: 10295 Blocpdb> 70 atoms in block 175 Block first atom: 10362 Blocpdb> 52 atoms in block 176 Block first atom: 10432 Blocpdb> 57 atoms in block 177 Block first atom: 10484 Blocpdb> 48 atoms in block 178 Block first atom: 10541 Blocpdb> 63 atoms in block 179 Block first atom: 10589 Blocpdb> 70 atoms in block 180 Block first atom: 10652 Blocpdb> 63 atoms in block 181 Block first atom: 10722 Blocpdb> 58 atoms in block 182 Block first atom: 10785 Blocpdb> 35 atoms in block 183 Block first atom: 10843 Blocpdb> 68 atoms in block 184 Block first atom: 10878 Blocpdb> 55 atoms in block 185 Block first atom: 10946 Blocpdb> 48 atoms in block 186 Block first atom: 11001 Blocpdb> 64 atoms in block 187 Block first atom: 11049 Blocpdb> 51 atoms in block 188 Block first atom: 11113 Blocpdb> 59 atoms in block 189 Block first atom: 11164 Blocpdb> 58 atoms in block 190 Block first atom: 11223 Blocpdb> 55 atoms in block 191 Block first atom: 11281 Blocpdb> 44 atoms in block 192 Block first atom: 11336 Blocpdb> 54 atoms in block 193 Block first atom: 11380 Blocpdb> 45 atoms in block 194 Block first atom: 11434 Blocpdb> 58 atoms in block 195 Block first atom: 11479 Blocpdb> 64 atoms in block 196 Block first atom: 11537 Blocpdb> 84 atoms in block 197 Block first atom: 11600 Blocpdb> 197 blocks. Blocpdb> At most, 84 atoms in each of them. Blocpdb> At least, 35 atoms in each of them. Blocpdb> Normal end of Blocpdb. Diagrtb> Memory allocation for Prepmat. Diagrtb> Memory allocation for RTB. Diagrtb> Memory allocation for Diagstd. Diagrtb> Memory allocation for RTB_to_modes. Prepmat> Entering in. Prepmat> Rewriting of the matrix begins. Prepmat> 8645317 matrix lines read. Prepmat> Matrix order = 35052 Prepmat> Matrix trace = 19058680.0000 Prepmat> Last element read: 35052 35052 407.2521 Prepmat> 19504 lines saved. Prepmat> 17305 empty lines. Prepmat> Number of lines on output is as expected. Prepmat> Normal end of Prepmat. RTB> Entering in. RTB> Number of atoms found in temporary coordinate file: 11684 RTB> Total mass = 11684.0000 RTB> Number of atoms found in matrix: 11684 RTB> Number of blocks = 197 RTB> Projection begins. RTB> Projected matrix is being saved. RTB> Projected matrix trace = 496037.1636 RTB> 76173 non-zero elements. RTB> Normal end of RTB. Diagstd> Entering in. Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.sdijb Diagstd> Projected matrix to be read from file: diagrtb_work.sdijb Diagstd> CERFACS matrix format. Diagstd> Projected matrix order = 1182 Diagstd> Nb of non-zero elements: 76173 Diagstd> Projected matrix trace = 496037.1636 Openam> file on opening on unit 11: diagrtb_work.eigenfacs Diagstd> Diagonalization. Diagstd> 1182 eigenvectors are computed. Diagstd> 106 of them to be saved. Diagstd> Sum of eigenvalues = 496037.1636 Diagstd> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Diagstd> 6 zero-eigenvalues, that is, below or equal to: 0.0000000 Diagstd> Selected eigenvalues: 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.1654841 0.6406244 2.0550735 3.3526415 3.4029505 4.0033995 8.9730761 11.3803032 14.1998669 15.1225518 16.3709835 17.1234396 17.7363302 20.1401611 22.4969845 24.3563074 25.1250506 26.5752907 27.6184333 29.0459287 29.9042537 31.5206337 32.6271429 33.8755495 34.9381447 35.3811942 37.1326099 37.9137220 41.0229683 42.2110633 42.4616397 43.4138350 43.5351794 45.0161375 46.9352193 47.2798001 47.6443406 49.1095277 49.7647443 50.8092590 51.4161676 52.7690903 53.7682966 55.2380106 55.5159565 57.2331837 58.0190455 59.8376599 60.4190161 60.8705135 62.4846694 63.6330410 67.0507305 67.2235882 69.0861981 69.6585208 71.0352586 71.6020556 72.7566182 73.7965942 74.0791347 74.5258273 74.9508089 79.0166835 79.1995904 79.6658346 80.4132989 82.7926710 83.3440124 84.5468056 85.2172403 85.4708358 87.6147462 88.5418007 89.3405558 90.8163245 91.1546370 92.0905307 92.8777974 94.1313194 94.8892011 95.8571135 96.4273782 96.9229361 98.0630176 99.1124608 99.7011968 101.2308139 102.0212188 102.9984473 103.1792798 104.7922376 106.2069561 107.8586035 109.4631120 109.4759539 110.0529624 110.9352307 112.2739698 113.6184713 Diagstd> Frequencies (cm-1, if the input matrix is a hessian in CHARMM units): 0.0034305 0.0034335 0.0034344 0.0034345 0.0034346 0.0034348 44.1746833 86.9154553 155.6714477 198.8331705 200.3194388 217.2749947 325.2864372 366.3297555 409.2016890 422.2871054 439.3722922 449.3562464 457.3273373 487.3340426 515.0595388 535.9212819 544.3130578 559.8018016 570.6828219 585.2452717 593.8294945 609.6670870 620.2757504 632.0311084 641.8672241 645.9241526 661.7181060 668.6417504 695.5187157 705.5185331 707.6095099 715.4995352 716.4987704 728.5836058 743.9516410 746.6775538 749.5505729 760.9886140 766.0483271 774.0458931 778.6550980 788.8330240 796.2664536 807.0757431 809.1037123 821.5220657 827.1429452 840.0063726 844.0770738 847.2250009 858.3847998 866.2367799 889.1950516 890.3404925 902.5908511 906.3217537 915.2342485 918.8783634 926.2570624 932.8534879 934.6375618 937.4512297 940.1203258 965.2830471 966.3996144 969.2400145 973.7763434 988.0779946 991.3624900 998.4903732 1002.4414431 1003.9319032 1016.4450002 1021.8083689 1026.4069999 1034.8496116 1036.7753504 1042.0840966 1046.5289195 1053.5674709 1057.8002747 1063.1816051 1066.3394083 1069.0759533 1075.3452151 1081.0839250 1084.2900341 1092.5759704 1096.8330645 1102.0736511 1103.0406722 1111.6289210 1119.1073841 1127.7755549 1136.1330034 1136.1996453 1139.1899608 1143.7471519 1150.6276859 1157.4966722 Diagstd> Normal end. Rtb_to_modes> Entering in. Rtb_to_modes> Number of atoms in temporary block-file = 11684 Rtb_to_modes> Number of blocs = 197 Openam> file on opening on unit 10: diagrtb_work.eigenfacs Openam> file on opening on unit 11: matrix.eigenrtb Rdmodfacs> Entering in. Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Eigenvector number: 1 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9798E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 2 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Eigenvector number: 3 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 4 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 5 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 6 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 7 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.1655 Rdmodfacs> Eigenvector number: 8 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 0.6406 Rdmodfacs> Eigenvector number: 9 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 2.055 Rdmodfacs> Eigenvector number: 10 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.353 Rdmodfacs> Eigenvector number: 11 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 3.403 Rdmodfacs> Eigenvector number: 12 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 4.003 Rdmodfacs> Eigenvector number: 13 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 8.973 Rdmodfacs> Eigenvector number: 14 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 11.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 15 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 14.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 16 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 15.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 17 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 16.37 Rdmodfacs> Eigenvector number: 18 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.12 Rdmodfacs> Eigenvector number: 19 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 17.74 Rdmodfacs> Eigenvector number: 20 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 20.14 Rdmodfacs> Eigenvector number: 21 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 22.50 Rdmodfacs> Eigenvector number: 22 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 24.36 Rdmodfacs> Eigenvector number: 23 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 25.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 24 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 26.58 Rdmodfacs> Eigenvector number: 25 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 27.62 Rdmodfacs> Eigenvector number: 26 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 27 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 29.90 Rdmodfacs> Eigenvector number: 28 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 31.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 29 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 32.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 30 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 33.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 31 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 34.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 32 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 35.38 Rdmodfacs> Eigenvector number: 33 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 34 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 37.91 Rdmodfacs> Eigenvector number: 35 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 41.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 36 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.21 Rdmodfacs> Eigenvector number: 37 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 42.46 Rdmodfacs> Eigenvector number: 38 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 39 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 43.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 40 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 45.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 41 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 46.94 Rdmodfacs> Eigenvector number: 42 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.28 Rdmodfacs> Eigenvector number: 43 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 47.64 Rdmodfacs> Eigenvector number: 44 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 45 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 49.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 46 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 50.81 Rdmodfacs> Eigenvector number: 47 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 51.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 48 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 52.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 49 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 53.77 Rdmodfacs> Eigenvector number: 50 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.24 Rdmodfacs> Eigenvector number: 51 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 55.52 Rdmodfacs> Eigenvector number: 52 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 57.23 Rdmodfacs> Eigenvector number: 53 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 58.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 54 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 59.84 Rdmodfacs> Eigenvector number: 55 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.42 Rdmodfacs> Eigenvector number: 56 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 60.87 Rdmodfacs> Eigenvector number: 57 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 62.48 Rdmodfacs> Eigenvector number: 58 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 63.63 Rdmodfacs> Eigenvector number: 59 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.05 Rdmodfacs> Eigenvector number: 60 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 67.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 61 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 62 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 69.66 Rdmodfacs> Eigenvector number: 63 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.04 Rdmodfacs> Eigenvector number: 64 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 71.60 Rdmodfacs> Eigenvector number: 65 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 72.76 Rdmodfacs> Eigenvector number: 66 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 73.80 Rdmodfacs> Eigenvector number: 67 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.08 Rdmodfacs> Eigenvector number: 68 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.53 Rdmodfacs> Eigenvector number: 69 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 74.95 Rdmodfacs> Eigenvector number: 70 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.02 Rdmodfacs> Eigenvector number: 71 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.20 Rdmodfacs> Eigenvector number: 72 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 79.67 Rdmodfacs> Eigenvector number: 73 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 80.41 Rdmodfacs> Eigenvector number: 74 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 82.79 Rdmodfacs> Eigenvector number: 75 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 83.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 76 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 84.55 Rdmodfacs> Eigenvector number: 77 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.22 Rdmodfacs> Eigenvector number: 78 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 85.47 Rdmodfacs> Eigenvector number: 79 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 87.61 Rdmodfacs> Eigenvector number: 80 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 88.54 Rdmodfacs> Eigenvector number: 81 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 89.34 Rdmodfacs> Eigenvector number: 82 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 90.82 Rdmodfacs> Eigenvector number: 83 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 91.15 Rdmodfacs> Eigenvector number: 84 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.09 Rdmodfacs> Eigenvector number: 85 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 92.88 Rdmodfacs> Eigenvector number: 86 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.13 Rdmodfacs> Eigenvector number: 87 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 94.89 Rdmodfacs> Eigenvector number: 88 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 95.86 Rdmodfacs> Eigenvector number: 89 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.43 Rdmodfacs> Eigenvector number: 90 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 96.92 Rdmodfacs> Eigenvector number: 91 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 98.06 Rdmodfacs> Eigenvector number: 92 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.11 Rdmodfacs> Eigenvector number: 93 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 99.70 Rdmodfacs> Eigenvector number: 94 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 101.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 95 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 102.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 96 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.0 Rdmodfacs> Eigenvector number: 97 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 103.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 98 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 104.8 Rdmodfacs> Eigenvector number: 99 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 106.2 Rdmodfacs> Eigenvector number: 100 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 107.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 101 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 102 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 109.5 Rdmodfacs> Eigenvector number: 103 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.1 Rdmodfacs> Eigenvector number: 104 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 110.9 Rdmodfacs> Eigenvector number: 105 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 112.3 Rdmodfacs> Eigenvector number: 106 Rdmodfacs> Corresponding eigenvalue: 113.6 Rtb_to_modes> 106 vectors, with 1182 coordinates in vector file. Norm of eigenvectors in projected coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99996 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 Rtb_to_modes> RTB block-file is being read. Rtb_to_modes> 210312 lines found in RTB file. Norm of eigenvectors in cartesian coordinates (one expected): 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00002 1.00002 1.00000 1.00000 1.00001 0.99999 0.99999 1.00000 0.99999 0.99998 0.99996 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 0.99996 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00002 1.00002 1.00002 1.00000 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 0.99999 1.00001 0.99998 1.00001 1.00001 0.99999 1.00003 1.00002 0.99998 1.00002 1.00001 1.00000 1.00002 1.00000 0.99999 1.00001 1.00002 1.00000 0.99998 0.99999 0.99999 1.00000 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99998 1.00000 1.00001 0.99997 0.99999 1.00000 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99999 1.00000 1.00000 0.99999 1.00002 0.99998 0.99998 1.00001 1.00000 1.00000 1.00000 1.00001 1.00000 0.99996 1.00001 1.00001 1.00000 0.99999 1.00000 0.99998 1.00002 1.00001 Orthogonality of first eigenvectors (zero expected): Vector 2:-0.000 Vector 3: 0.000-0.000 Vector 4: 0.000 0.000 0.000 Vector 5: 0.000-0.000-0.000-0.000 Vector 6:-0.000 0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 7:-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000-0.000 Vector 8: 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000-0.000 0.000 Vector 9:-0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 0.000 0.000 Vector 10: 0.000 0.000 0.000 0.000-0.000-0.000-0.000-0.000 0.000 Rtb_to_modes> 106 eigenvectors saved. Rtb_to_modes> Normal end. Diagrtb> Normal end. B-factor analysis Bfactors> Version 1.22, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2611051310012194214.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2611051310012194214.eigenfacs Getnam> Corresponding pdb filename ? Getnam> 2611051310012194214.atom Openam> file on opening on unit 11: 2611051310012194214.atom Getnum> Number of skipped eigenvectors ? Getnum> 0 Getnum> Number of usefull eigenvectors ? Getnum> 10000 %Getnum-Err: number larger than 106 This is not allowed. Sorry. Rdatompdb> Reading pdb file. Rdatompdb> End of file reached. Rdatompdb> Number of I/O errors: 0 Rdatompdb> Number of residues found = 788 First residue number = 1 Last residue number = 440 Number of atoms found = 11684 Mean number per residue = 14.8 Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9798E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 9.9976E-10 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0003E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0004E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 1.0005E-09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.1655 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 0.6406 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 2.055 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.353 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 3.403 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 4.003 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 8.973 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 11.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 14.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 15.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 16.37 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.12 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 17.74 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 20.14 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 22.50 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 24.36 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 25.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 26.58 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 27.62 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 29.90 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 31.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 32.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 33.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 34.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 35.38 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 37.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 41.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.21 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 42.46 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 43.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 45.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 46.94 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.28 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 47.64 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 49.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 50.81 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 51.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 52.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 53.77 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.24 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 55.52 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 57.23 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 58.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 59.84 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.42 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 60.87 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 62.48 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 63.63 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.05 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 67.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 69.66 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.04 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 71.60 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 72.76 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 73.80 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.08 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.53 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 74.95 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.02 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.20 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 79.67 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 80.41 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 82.79 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 83.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 84.55 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.22 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 85.47 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 87.61 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 88.54 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 89.34 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 90.82 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 91.15 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.09 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 92.88 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.13 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 94.89 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 95.86 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.43 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 96.92 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 98.06 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.11 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 99.70 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 101.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 102.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 103.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 104.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 106.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 107.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 109.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 110.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 112.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Valeur propre du vecteur en lecture: 113.6 Bfactors> 106 vectors, 35052 coordinates in file. Openam> file on opening on unit 12: bfactors.pred Bfactors> Best zero-eigenvalue found : 0.000000 Bfactors> 6 eigenvalues less than : 0.000000 Bfactors> Lowest non-zero eigenvalue : 0.165500 Bfactors> 100 eigenvectors will be considered. Bfactors> Rotation-Tranlation modes are skipped. Bfactors> Mass-weighted B-factors are computed. (CHARMM units assumed for eigenvalues) %Bfactors-Wn> Experimental B-factors are nearly constant ! Bfactors> = 0.014 +/- 0.01 Bfactors> = 0.000 +/- 0.00 Bfactors> Shiftng-fct= -0.014 Bfactors> Scaling-fct= 0.000 Bfactors> Predicted, Scaled and Experimental B-factors are saved. Bfactors> Normal end. check_modes Chkmod> Version 1.00, Bordeaux. Getnam> Eigenvector filename ? Getnam> 2611051310012194214.eigenfacs Openam> file on opening on unit 10: 2611051310012194214.eigenfacs Rdmodfacs> Old Blzpack file format detected. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 1 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4303E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 2 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4334E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 3 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 4 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4343E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 5 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4345E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 6 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 3.4347E-03 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 7 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 44.17 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 8 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 86.91 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 9 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 155.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 10 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 198.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 11 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 200.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 12 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 217.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 13 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 325.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 14 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 366.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 15 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 409.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 16 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 422.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 17 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 439.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 18 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 449.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 19 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 457.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 20 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 487.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 21 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 515.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 22 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 535.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 23 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 544.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 24 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 559.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 25 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 570.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 26 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 585.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 27 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 593.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 28 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 609.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 29 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 620.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 30 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 632.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 31 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 641.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 32 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 645.9 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 33 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 661.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 34 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 668.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 35 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 695.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 36 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 705.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 37 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 707.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 38 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 715.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 39 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 716.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 40 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 728.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 41 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 744.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 42 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 746.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 43 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 749.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 44 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 761.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 45 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 766.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 46 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 774.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 47 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 778.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 48 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 788.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 49 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 796.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 50 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 807.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 51 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 809.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 52 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 821.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 53 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 827.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 54 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 840.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 55 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 844.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 56 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 847.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 57 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 858.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 58 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 866.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 59 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 889.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 60 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 890.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 61 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 902.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 62 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 906.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 63 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 915.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 64 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 918.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 65 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 926.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 66 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 932.8 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 67 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 934.6 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 68 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 937.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 69 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 940.1 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 70 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 965.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 71 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 966.4 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 72 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 969.2 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 73 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 973.7 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 74 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 988.0 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 75 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 991.3 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 76 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 998.5 Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 77 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1002. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 78 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1004. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 79 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1016. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 80 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1022. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 81 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1026. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 82 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1035. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 83 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1037. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 84 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1042. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 85 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1046. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 86 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1054. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 87 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1058. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 88 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1063. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 89 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1066. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 90 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1069. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 91 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1075. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 92 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1081. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 93 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1084. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 94 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1092. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 95 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1097. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 96 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1102. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 97 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1103. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 98 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1112. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 99 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1119. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 100 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1128. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 101 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 102 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1136. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 103 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1139. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 104 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1144. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 105 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1151. Rdmodfacs> Numero du vecteur CERFACS en lecture: 106 Rdmodfacs> Frequence du vecteur en lecture: 1157. Chkmod> 106 vectors, 35052 coordinates in file. Chkmod> That is: 11684 cartesian points. Openam> file on opening on unit 11: Chkmod.res Chkmod> Collectivity=f(frequency) to be written in this file. Chkmod> Normal end. 0.0034 0.7207 0.0034 0.7831 0.0034 0.8728 0.0034 0.8979 0.0034 0.6868 0.0034 0.7661 44.1749 0.7554 86.9101 0.7467 155.6620 0.7278 198.8353 0.7994 200.3123 0.7294 217.2548 0.6751 325.2711 0.1576 366.3092 0.3716 409.1860 0.3057 422.2333 0.3568 439.3402 0.1943 449.2918 0.1732 457.3550 0.2085 487.3112 0.4741 515.0719 0.4482 535.9389 0.4849 544.3433 0.0836 559.8274 0.3859 570.6745 0.5158 585.2612 0.4565 593.7618 0.4600 609.6348 0.4275 620.2763 0.4957 632.0455 0.3683 641.8567 0.4542 645.8855 0.4642 661.6664 0.4368 668.5802 0.5446 695.4637 0.4313 705.4794 0.4916 707.5655 0.5270 715.4372 0.5440 716.5077 0.5527 728.5836 0.1837 743.9576 0.4577 746.6471 0.4928 749.4843 0.3221 760.9596 0.5377 765.9789 0.4433 774.0183 0.4944 778.6507 0.4184 788.8060 0.4538 796.2449 0.5287 807.0556 0.4356 809.0984 0.3977 821.4640 0.4148 827.1142 0.4287 839.9867 0.1858 844.0477 0.3671 847.1851 0.5057 858.3159 0.2909 866.1789 0.4125 889.1520 0.4017 890.2785 0.4425 902.5769 0.3671 906.2925 0.4153 915.2255 0.5055 918.8257 0.4651 926.2388 0.4380 932.8350 0.4613 934.6029 0.4848 937.4372 0.4904 940.0749 0.4342 965.2619 0.3517 966.3606 0.4463 969.2237 0.4284 973.7146 0.2925 988.0196 0.5065 991.2961 0.3511 998.4664 0.3898 1002.4146 0.4808 1003.8839 0.4905 1016.3738 0.3811 1021.7541 0.4490 1026.3597 0.3319 1034.8261 0.4877 1036.7045 0.5035 1042.0364 0.4533 1046.4964 0.4802 1053.5149 0.4363 1057.7593 0.3856 1063.1520 0.3442 1066.3081 0.4849 1069.0139 0.4829 1075.2825 0.5085 1081.0241 0.5361 1084.2370 0.2996 1092.3628 0.4901 1096.6719 0.4774 1102.0346 0.5181 1103.1041 0.4125 1111.6224 0.3203 1119.0227 0.5107 1127.9435 0.4092 1136.2756 0.3596 1136.2756 0.4466 1139.3845 0.4542 1143.5164 0.4584 1150.7117 0.4644 1157.3529 0.4442 getting mode 7 running: ../../bin/get_modes.sh 2611051310012194214 7 -600 600 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 7 calculating perturbed structure for DQ=-600 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-580 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-560 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-540 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-520 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-500 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-480 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-460 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-440 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-420 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom WARNING: max number of models (51) reached no more models will be calculated for this mode making animated gifs 51 models are in 2611051310012194214.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.7.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 8 running: ../../bin/get_modes.sh 2611051310012194214 8 -600 600 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 8 calculating perturbed structure for DQ=-600 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-580 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-560 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-540 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-520 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-500 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-480 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-460 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-440 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-420 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom WARNING: max number of models (51) reached no more models will be calculated for this mode making animated gifs 51 models are in 2611051310012194214.8.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.8.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.8.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 9 running: ../../bin/get_modes.sh 2611051310012194214 9 -600 600 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 9 calculating perturbed structure for DQ=-600 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-580 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-560 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-540 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-520 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-500 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-480 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-460 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-440 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-420 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom WARNING: max number of models (51) reached no more models will be calculated for this mode making animated gifs 51 models are in 2611051310012194214.9.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.9.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.9.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 10 running: ../../bin/get_modes.sh 2611051310012194214 10 -600 600 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 10 calculating perturbed structure for DQ=-600 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-580 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-560 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-540 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-520 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-500 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-480 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-460 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-440 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-420 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom WARNING: max number of models (51) reached no more models will be calculated for this mode making animated gifs 51 models are in 2611051310012194214.10.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.10.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.10.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 getting mode 11 running: ../../bin/get_modes.sh 2611051310012194214 11 -600 600 20 on 0 normal mode computation generate a series of perturbations for mode 11 calculating perturbed structure for DQ=-600 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-580 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-560 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-540 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-520 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-500 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-480 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-460 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-440 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-420 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=-20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=0 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=20 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=40 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=60 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=80 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=100 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=120 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=140 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=160 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=180 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=200 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=220 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=240 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=260 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=280 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=300 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=320 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=340 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=360 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=380 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom calculating perturbed structure for DQ=400 2611051310012194214.eigenfacs 2611051310012194214.atom WARNING: max number of models (51) reached no more models will be calculated for this mode making animated gifs 51 models are in 2611051310012194214.11.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.11.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 51 models are in 2611051310012194214.11.pdb, 9 models will be skipped MODEL 1 will be plotted MODEL 11 will be plotted MODEL 21 will be plotted MODEL 31 will be plotted MODEL 41 will be plotted MODEL 51 will be plotted making thumbnail 100x100 making small animated gif 100x100 making animated gif 300x300 2611051310012194214.10.pdb 2611051310012194214.11.pdb 2611051310012194214.7.pdb 2611051310012194214.8.pdb 2611051310012194214.9.pdb STDERR: Note: The following floating-point exceptions are signalling: IEEE_DENORMAL real 1m41.624s user 1m40.405s sys 0m1.158s rm: cannot remove '2611051310012194214.sdijf': No such file or directory pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format pstopnm: Writing ppmraw format




If you find results from this site helpful for your research, please cite one of our papers:

elNémo is maintained by Yves-Henri Sanejouand.
It was developed by Karsten Suhre.
Between 2003 and 2014, it was hosted by IGS (Marseille).
Between 2015 and 2025, it was hosted by US2B (Nantes).
Last modification: april 24th, 2026.